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            【中文期刊】 谭菊  王永娟  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 312-322页

            【摘要】 [目的]设计针对雏沙门菌(Salmonella Pullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitope vaccine,MEV),为净化鸡白痢提供新的疫苗.[方法]选用IEDB预测雏沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容...

            【关键词】 雏沙门菌免疫信息学表位

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            【中文期刊】 韩雪  寸怡娜  等 《贵州医科大学学报》 2022年47卷5期 530-535,541页ISTIC

            【摘要】 目的 通过免疫信息学技术对人类白细胞抗原(HLA)限制性甲型流感病毒T细胞表位进行预测,以期获得通用流感疫苗候选抗原肽.方法 以A/California/7/2009(H1 N1)为原始毒株,选取流感病毒保守的蛋白聚合酶复合物1(PB1)、...

            【关键词】 甲型流感病毒T细胞表位HLA-A*02

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            【中文期刊】 王书峰  吴玉章  等 《中国免疫学杂志》 2019年35卷13期 1636-1639页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 大数据背景下研究生教育必须转化教育观念和教育模式,以突出研究生创新实践能力以及科研思维的培养.结合当前生命科学的发展趋势、免疫学的自身特点以及作者单位的研究方向,对基础医学专业研究生开设免疫信息学课程.本文就该课程内容的架构、实施方案以及初...

            【关键词】 免疫信息学生物信息学研究生教学

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            【中文期刊】 WANG Guo-Qiang  罗予  等 《中国免疫学杂志》 2008年24卷8期 742-743页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:应用免疫信息学的方法寻找不同来源的H5N1型禽流感病毒血凝素(HA)的共同抗原决定簇,为发展H5N1型禽流感病毒的表位疫苗打基础.方法:从GeneBank下载不同来源的H5N1型禽流感病毒血凝素(HA)的氨基酸序列,先使用Clusta...

            【关键词】 禽流感病毒免疫信息学血凝素

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            【中文期刊】 冯新港  隋传宇  等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2007年25卷3期 237-247页MEDLINEISTICPKUCSCD

            【摘要】 近年发展起来的反向疫苗学,以"序列-结构-功能"思想为依据,以免疫信息学、计算机预测设计以及高通量的各种组学(包括基因组学、转录本组学、蛋白质组学等)综合集成技术为核心,可能为血吸虫疫苗候选分子的发现提供一条新途径.本文简要介绍了反向疫苗学...

            【关键词】 血吸虫病反向疫苗学免疫信息学

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            【中文期刊】 王月丹  谢雍  等 《北京大学学报(医学版)》 2003年35卷z1期 70-71页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 SARS病毒是一种新近发现的冠状病毒,其表面蛋白可与细胞上的相应受体结合,导致人类发生严重急性呼吸道综合征(SARS)等疾病.通过免疫信息学的方法,我们对该病毒的表面蛋白进行了分析.结果显示,SARS病毒与常见的人类冠状病毒相比,其编码的表...

            【关键词】 SARS冠状病毒免疫信息学

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            【中文期刊】 徐建华  黄宪章  等 《现代检验医学杂志》 2009年24卷1期 110-112页ISTICCA

            【摘要】 免疫信息学(Immunoinformatics)是计算机科学与免疫学、信息科学相结合的交叉学科,其利用计算机技术开展免疫学的生物信息学分析和计算.该文根据作者的实践经验.对因特网上免疫信息资源进行了整理和分类,总结了因特网上获取免疫信息资源...

            【关键词】 免疫信息学因特网数据库

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            【中文期刊】 王月丹  陈慰峰  《自然科学进展》 2004年14卷10期 1081-1085页

            【摘要】 免疫信息学是在21世纪初才被建立的一门以信息学与现代免疫学为基础的交叉学科.在中外科学家的共同努力下,免疫信息学的概念和理论体系正在逐步走向成熟,其自身的发展也促进了现代免疫学和新型疫苗研究工作的进步.文中对免疫信息学概念的建立过程及免疫信...

            【关键词】 免疫信息学抗原表位疫苗设计

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            【中文期刊】 黄平  许元生  等 《生物化学与生物物理进展》 2011年38卷10期 929-935页SCIISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 神经氨酸酶(NA)是一种具有唾液酸酶活性的流感毒粒表面糖蛋白,切断病毒HA与细胞膜上神经氨酸残基之间的连接,使病毒能够从宿主细胞表面释放.检测了新型H1N1流感NA基因核苷酸序列,用免疫信息学方法预测、筛选和鉴定B细胞表位;人工合成NA抗原...

            【关键词】 新型H1N1流感神经氨酸酶(NA)B细胞表位

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            【中文期刊】 朱丽容  郭乾  等 《器官移植》 2025年16卷1期 106-113页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探讨泛凋亡与肝脏缺血-再灌注损伤(HIRI)之间的关系,筛选HIRI的泛凋亡关键基因.方法 通过基因表达综合数据库和GeneCards数据库获得泛凋亡相关差异表达基因(PDG).通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG...

            【关键词】 肝移植缺血-再灌注损伤泛凋亡

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            【中文期刊】 田宇诗  付强  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6697-6707页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:线粒体在急性心肌梗死损伤和修复中具有重要意义,因此基于线粒体基因探索急性心肌梗死发病进展具有重要的临床意义.目的:探究线粒体基因是否可以作为评估急性心肌梗死进展的可靠生物标志物.方法:从高通量基因表达数据库下载急性心肌梗死数据集GSE...

            【关键词】 线粒体急性心肌梗死生物信息学

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            【中文期刊】 高志  吴傲  等 《南方医科大学学报》 2025年45卷4期 862-870页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探索类风湿关节炎中氧化应激和免疫浸润的作用.方法 从GEO数据库中获取类风湿关节炎数据集GSE55235(10例类风湿关节炎样本和10例健康对照样本)和GSE55457(13例类风湿关节炎样本和10例健康对照样本),将两个数据集作为实...

            【关键词】 类风湿关节炎氧化应激免疫浸润

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            【中文期刊】 蔡溦  朱御坤  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...

            【关键词】 骨关节炎滑膜组织枢纽基因

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            【中文期刊】 韩宜倩  胡楠  等 《海南医科大学学报》 2025年31卷9期 691-701页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:本研究旨在分析脆性X智力低下 1(Fragile X Mental Retardation 1,FMR1)基因在胃癌(gastric cancer,GC)和相邻非癌组织中表达的差异,并探讨其与胃癌患者临床病理特征和预后的相关性,分析了...

            【关键词】 胃癌FMR1免疫细胞浸润

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            【中文期刊】 熊永强  王博  等 《西安交通大学学报(医学版)》 2025年46卷2期 249-256页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学探讨双硫死亡相关基因(DRGs)在代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)病情进展中的作用及相关机制.方法 利用GEO数据库,筛选符合条件的MAFLD表达相关数据,进行差异基因分析,通过一致聚类识别DRGs并对MAFLD患者进行...

            【关键词】 代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)双硫死亡免疫状态

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            【中文期刊】 唐秋绒  冯旸  等 《中国医学科学院学报》 2025年47卷3期 354-365页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选急性心肌梗死(AMI)中差异双硫死亡相关基因(DRG),分析DRG在AMI中的分子模式并构建DRG相关预测模型.方法 从基因表达综合数据库下载AMI相关数据集,筛选AMI中差异表达DRG.采用CIBERSORT法...

            【关键词】 急性心肌梗死双硫死亡一致性聚类

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            【中文期刊】 王朴  胡敏  等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷4期 783-791,中插1页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于生物信息学方法分析皮肌炎基因芯片并利用CIBERSORT反卷积算法探究皮肌炎关键基因的免疫浸润机制,预测其中药治疗靶点.方法:在GEO数据库检索皮肌炎基因芯片,筛选出差异共表达基因并进行分析;运用R软件包对差异共表达基因进行GO分...

            【关键词】 皮肌炎CIBERSORT生物信息学

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            【中文期刊】 谢铱子  林雪莹  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6708-6716页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:线粒体自噬与特发性肺纤维化的发生发展关系密切,但其作用机制尚不清楚.目的:探讨线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制,为临床特发性肺纤维化风险预测及亚型区分提供思路.方法:通过GEO和Reactome Pathway数据库等获取特发...

            【关键词】 特发性肺纤维化线粒体自噬自噬关键基因

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            【中文期刊】 刘雅妮  杨静欢  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...

            【关键词】 纤维肌痛综合征生物信息学机器学习

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            【中文期刊】 庞金龙  赵新丽  等 《南方医科大学学报》 2025年45卷7期 1479-1489页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 采用生物信息学探讨多聚蛋白-2(MMRN2)抑制皮肤黑色素瘤(SKCM)生长和转移的影响.方法 从GEO数据库获得SKCM患者的临床信息,比较正常组织和黑色素瘤中MMRN2的表达差异;通过STRING数据库获得和MMRN2互相作用蛋白...

            【关键词】 多聚蛋白-2黑色素瘤预后

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            【中文期刊】 韩杰  潘成镇  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7690-7700页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:激素性股骨头坏死的发病机制尚未完全明确,深入了解激素性股骨头坏死的病理及分子机制,寻找高特异性和高灵敏性诊断标志物对于防治激素性股骨头坏死至关重要.目的:筛选激素性股骨头坏死的免疫诊断标志物,并通过药物富集分析和分子对接技术预测潜在药...

            【关键词】 生物信息学分析孟德尔随机化免疫相关基因

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            【中文期刊】 陈莹  郭晓婧  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7562-7570页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:研究表明,缺血性脑卒中的各个过程都有免疫细胞参与,其中铜死亡也起着关键作用.目的:通过生物信息学筛选出与缺血性脑卒中进展有关的诊断性生物标记物,并对与其发生发展密切相关的铜死亡基因进行分析及验证.方法:从GEO数据库中获取GSE165...

            【关键词】 缺血性脑卒中机器学习生物信息学

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            【中文期刊】 黄育刚  苏小敏  等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷4期 908-914页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨POLE基因突变型子宫内膜癌(EC)的免疫特征.方法:收集2020年12月至2022年10月十堰市太和医院病理科存档的104例EC石蜡包埋组织样本,包括11例POLE突变型和93例POLE野生型.免疫组化检测EC组织中CD4、CD...

            【关键词】 子宫内膜癌POLE突变免疫特征分析

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            【中文期刊】 石蕾  张红宾  《重庆医科大学学报》 2025年50卷1期 135-144页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:应用生物信息学技术探究多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)的遗传异质性以及免疫细胞在其病理生理中发挥的重要调节作用.方法:通过美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnolog...

            【关键词】 多发性骨髓瘤生物标志物生物信息学

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            【中文期刊】 罗倩  刘杰民  等 《中药新药与临床药理》 2025年36卷5期 770-779页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学及机器学习分析溃疡性结肠炎(UC)的免疫微环境特征及免疫相关生物标志物,并预测治疗UC的潜在中药.方法 基于GEO数据库训练集GSE87473 筛选UC的差异表达基因(DEGs),结合免疫浸润、加权基因共表达网络分析(W...

            【关键词】 溃疡性结肠炎免疫失衡免疫细胞代谢途径

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            【中文期刊】 张畅  刘慕仪  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2025年41卷3期 404-414页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 蛋白质-蛋白质相互作用在细胞的生化功能中扮演极为重要的角色,深入解析蛋白质相互作用关系是理解细胞生命活动的关键.本研究以高尔基体蛋白73(golgi protein 73,GP73)为研究对象,利用经典的免疫共沉淀联合质谱技术系统挖掘了 G...

            【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用高尔基体蛋白73免疫共沉淀联合质谱检测

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            【中文期刊】 巩月红  王梦君  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7679-7689页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:肺纤维化的早期诊断是及时开展抗纤维化药物治疗的基础,因此,探索并发现能够有效应用于肺纤维化早期诊断的理想生物标志物对疾病治疗至关重要.目的:通过生物信息学和机器学习技术对肺纤维化过程中涉及的与自噬相关关键基因进行深入分析,探究与自噬相...

            【关键词】 肺纤维化自噬机器学习

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            【中文期刊】 陈讯  陈雯昕  等 《南京医科大学学报(自然科学版)》 2025年45卷4期 509-522页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:探索焦亡相关基因在多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PC OS)发病机制中的作用,并构建PCOS的精确预测模型.方法:利用从基因表达公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)...

            【关键词】 多囊卵巢综合征细胞焦亡免疫浸润

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            【中文期刊】 王莹  李静  等 《南方医科大学学报》 2025年45卷9期 1967-1979页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 利用生物信息学方法构建原发性肝癌(PLC)的预后模型.方法 在The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库中纳入了404名PLC患者.使用单变量 Cox 回归及LASSO-Cox方法构建失巢凋亡和免疫相关基因(DA...

            【关键词】 肝癌失巢凋亡免疫相关基因

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            【中文期刊】 蔡文畅  刘雨齐  等 《吉林大学学报(医学版)》 2025年51卷2期 378-391页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:利用生物信息学技术探讨蛋白激酶D2(PRKD2)在膀胱癌(BLCA)组织中的表达及其表达对BLCA患者预后的影响,阐明PRKD2在BLCA发生发展中的作用.方法:从UCSC癌症基因组数据库下载9例正常膀胱样本、19例BLCA癌旁样本和...

            【关键词】 膀胱肿瘤蛋白激酶D2肿瘤免疫微环境

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            【中文期刊】 马嘉欣  郭之栋  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2025年41卷8期 1179-1192页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 本研究通过整合生物信息学分析与实验验证,系统探讨中胚层发育关键基因在黑色素瘤发生发展中的分子机制.基于基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)算法对406例皮肤黑色素瘤(skin cutaneous...

            【关键词】 皮肤黑色素瘤中胚层发育生物信息学

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            【中文期刊】 黄赛花  周锦涛  等 《中国当代儿科杂志》 2025年27卷8期 936-944页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 通过对数据集分析,探索儿童过敏性哮喘中潜在的环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)免疫调控网络.方法 从GEO数据库获得儿...

            【关键词】 过敏性哮喘环状RNA免疫浸润

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            【中文期刊】 柳可心  马超  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...

            【关键词】 骨关节炎葡萄糖代谢生物信息学

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            【中文期刊】 卢旭满  史正一  等 《实用医学杂志》 2025年41卷19期 3026-3033页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 旨在通过生物信息学分析结合实验验证,探讨PCBP1(Poly(rC)-Binding Protein 1)在胃癌组织中的表达特征及其临床意义,对其与铁死亡主要调控因子STUB1(STIP1 Homology and U-Box Con...

            【关键词】 胃癌PCBP1STUB1

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            【中文期刊】 尹福煜  张黎军  《中国免疫学杂志》 2025年41卷1期 169-175页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:通过生物信息学方法筛选肥厚型心肌病相关的特征基因并分析免疫细胞浸润特征.方法:从GEO数据库中下载数据集,通过R语言的多种算法分析差异表达基因,构建加权基因共表达网络获取临床相关性模块,筛选交集基因,确定特征基因,鉴定特征基因预测效能...

            【关键词】 肥厚型心肌病生物标志物免疫浸润

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            【中文期刊】 安梦婷  郭冠麟  等 《遗传》 2025年47卷5期 558-572页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位.双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关.为深入探索双微体在胃癌发展中的...

            【关键词】 双微体增强子胃癌

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            【中文期刊】 余春波  周俞  等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷1期 144-152,中插3页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:利用生物信息学方法联合多数据库分析铜死亡相关基因DLD在泛癌中的表达与预后、肿瘤微环境及肿瘤免疫浸润之间的关系.方法:使用TCGA、GTEx、TISDB、GEO、UCSC、TARGET、TIMER2.0、GEPIA2、SangerBo...

            【关键词】 二氢硫辛酰胺脱氢酶泛癌免疫浸润

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            【中文期刊】 曹俊杰  赵二川  等 《现代检验医学杂志》 2025年40卷4期 97-104页ISTICCA

            【摘要】 目的 通过生物信息学和机器学习筛选痛风程序性细胞死亡(PCD)关键基因以及免疫浸润分析.方法 从GEO数据库中下载痛风相关数据集,其中包括人源痛风相关的GSE160170 数据集及鼠源痛风相关的GSE190138 数据集作为训练集.以差异倍...

            【关键词】 痛风程序性细胞死亡免疫浸润

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            【中文期刊】 何敏  赵琳琳  等 《中国实验诊断学》 2025年29卷5期 497-507页ISTIC

            【摘要】 目的 利用公开的帕金森病(Parkinson's disease,PD)外周血的基因表达谱数据,通过免疫浸润分析其免疫差异,利用差异基因分析、构建蛋白-蛋白相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络,寻找...

            【关键词】 帕金森病微阵列技术免疫浸润

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            【中文期刊】 杨彦青  陈松  等 《激光生物学报》 2025年34卷4期 374-384页ISTICCA

            【摘要】 基于生物信息学分析构建预后预测模型,探讨特定溶质载体蛋白(SLC)相关基因与胃癌(GC)在免疫和预后方面的关系,从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达总库(GEO)数据库中下载RNA测序和临床数据,利用R软件提取差异表达的SLC相关基因.通...

            【关键词】 胃癌特定溶质载体蛋白预后模型

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