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【中文期刊】 田宇诗 付强 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6697-6707页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:线粒体在急性心肌梗死损伤和修复中具有重要意义,因此基于线粒体基因探索急性心肌梗死发病进展具有重要的临床意义.目的:探究线粒体基因是否可以作为评估急性心肌梗死进展的可靠生物标志物.方法:从高通量基因表达数据库下载急性心肌梗死数据集GSE...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 丘博元 刘飞 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷26期 5608-5620页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:激素性股骨头坏死与衰老紧密相连,但调控靶点和机制尚不明确.通过生物信息学联合机器学习分析并加以实验验证,确定细胞衰老介导激素性股骨头坏死发生发展的关键基因,将为激素性股骨头坏死的防治提供新思路.目的:使用生物信息学分析筛选激素性股骨头...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈讯 陈雯昕 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2025年45卷4期 509-522页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探索焦亡相关基因在多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PC OS)发病机制中的作用,并构建PCOS的精确预测模型.方法:利用从基因表达公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 柳可心 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郝茂辰 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷26期 5632-5641页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:内质网应激和骨关节炎的发生、发展密切相关,但其关键基因及调控机制尚不明确.目的:基于生物信息学筛选骨关节炎内质网应激关键基因,并加以细胞模型实验验证,以期从内质网应激角度为防治骨关节炎提供新策略.方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 韦洪建 王鑫 等 《海南医科大学学报》 2025年31卷11期 849-862页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨TIE1在人体肿瘤组织中的表达谱及其潜在的临床意义.方法:利用TIMER2、GEPIA2、cBioPortal、UALCAN和STRING等在线网站和数据库,分析不同类型癌症中TIE1的表达与预后、遗传改变、肿瘤免疫及甲基化状态之...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王耀彬 陈柳燕 等 《南方医科大学学报》 2025年45卷1期 137-149页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用.方法 综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘源 渠源 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷25期 5486-5500页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:基底膜基因与类风湿关节炎的发生发展密切相关,但不同中医证型下基底膜相关基因在其发病机制中的作用尚不明确.目的:基底膜基因联合转录组学分析探讨类风湿关节炎5种不同中医证型的发病机制差异,并进行潜在治疗药物预测.方法:基于GEO数据库整理...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谢铱子 林雪莹 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6708-6716页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:线粒体自噬与特发性肺纤维化的发生发展关系密切,但其作用机制尚不清楚.目的:探讨线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制,为临床特发性肺纤维化风险预测及亚型区分提供思路.方法:通过GEO和Reactome Pathway数据库等获取特发...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨定燕 余振球 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷36期 7909-7920页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:精确的早期诊断和及时的再灌注治疗是挽救急性心肌梗死患者的生命并改善预后的重要前提条件.因此,寻找能够早期诊断急性心肌梗死的理想生物标志物尤为重要.目的:拟通过生物信息学和机器学习分析急性心肌梗死与中性粒细胞相关的关键基因,以探寻新的生...
- 概要：
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【中文期刊】 张瑜 李海涛 等 《南方医科大学学报》 2025年45卷9期 2006-2018页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨边缘区B细胞及B1细胞特异性蛋白(MZB1)在泛癌中的表达水平及其与患者预后、肿瘤微环境的关系.方法 利用UCSC数据库提取MZB1在33种癌症中的表达数据、临床病理参数和生存数据.利用R软件分析MZB1与临床分期、患者预后、免疫...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 巩月红 王梦君 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7679-7689页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:肺纤维化的早期诊断是及时开展抗纤维化药物治疗的基础,因此,探索并发现能够有效应用于肺纤维化早期诊断的理想生物标志物对疾病治疗至关重要.目的:通过生物信息学和机器学习技术对肺纤维化过程中涉及的与自噬相关关键基因进行深入分析,探究与自噬相...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晨曦 石婕 等 《生物信息学》 2025年23卷1期 71-80页ISTIC
【摘要】 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(Pigmented villonodular synovitis,PVNS)是一种可累及关节的腱鞘巨细胞瘤,类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)作为一种慢性自身免疫性疾病,二者都极少发生...
【关键词】 颞下颌关节；色素沉着绒毛结节性滑膜炎；类风湿性关节炎；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹俊杰 赵二川 等 《现代检验医学杂志》 2025年40卷4期 97-104页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学和机器学习筛选痛风程序性细胞死亡(PCD)关键基因以及免疫浸润分析.方法 从GEO数据库中下载痛风相关数据集,其中包括人源痛风相关的GSE160170 数据集及鼠源痛风相关的GSE190138 数据集作为训练集.以差异倍...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何敏 赵琳琳 等 《中国实验诊断学》 2025年29卷5期 497-507页ISTIC
【摘要】 目的 利用公开的帕金森病(Parkinson's disease,PD)外周血的基因表达谱数据,通过免疫浸润分析其免疫差异,利用差异基因分析、构建蛋白-蛋白相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络,寻找...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘恒燊 董娜 等 《广东药科大学学报》 2025年41卷1期 125-135页ISTICCA
【摘要】 目的 本研究旨在识别膀胱癌(bladder cancer,BLCA)中差异表达的失巢凋亡相关基因(ARGs),构建预后模型并开发免疫评分系统,以评估患者预后及治疗效果,为膀胱癌精准治疗提供理论依据.方法 获取TCGA中膀胱癌患者的数据后识别...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈宇翔 赵安娜 等 《中华老年口腔医学杂志》 2025年23卷1期 37-46页ISTIC
【摘要】 目的 本研究旨在揭示代谢综合征(metabolic syndrome,MetS)与种植体周炎(peri-implantitis,PI)之间潜在共同生物标志物及相关免疫细胞浸润,并构建PI诊断模型.方法 从GEO数据库下载MetS与PI的转录...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 徐红敏 吕文斐 《现代医学》 2025年53卷6期 980-986页ISTIC
【摘要】 目的:探究溃疡性结肠炎(UC)中双硫死亡相关基因表达及免疫浸润相关性分析.方法:从GEO数据库中获取数据集GSE38713,筛选差异基因后与双硫死亡相关基因取交集并进行富集分析,通过机器学习方法(LASSO回归和随机森林模型)确定双硫死亡关...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何雨霖 周韶璋 等 《现代生物医学进展》 2025年25卷17期 2729-2739页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨衰老相关基因(ARGs)在肺鳞癌(LUSC)预后中的作用并构建新的预测模型.方法:整合TCGA的LUSC转录组数据、临床信息及Aging Atlas的ARGs,通过差异分析、生存分析筛选关键基因构建预后模型,评估模型性能并进行临床...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭倩 陈婕 等 《临床荟萃》 2025年40卷7期 608-618页ISTICCA
【摘要】 目的 利用微阵列数据集确定多囊卵巢综合征(PCOS)新的遗传靶点,并揭示导致PCOS发生发展的分子基础.方法 对来自基因表达综合数据库的3个独立PCOS数据集进行了全面分析,使用R软件进行数据处理和规范化.对差异表达基因(DEG)与PCOS...
- 概要：
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【中文期刊】 张振 赵新丽 等 《南昌大学学报（医学版）》 2025年65卷2期 14-22,60页ISTIC
【摘要】 目的 探讨铜死亡相关基因(CRGs)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达特征,以及与免疫浸润、患者预后的关系.方法 由GeneCards数据库获得CRGs列表,从TCGA下载的RNAseq数据经TPM标准化,剔除非口腔癌样本后保留362例(...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 胡国帆 谭若柳 等 《浙江医学》 2025年47卷7期 700-705,733,后插4-后插5页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学和孟德尔随机化方法探索肾透明细胞癌(KIRC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值.方法 通过R语言分析来自基因表达综合(GEO)数据库的数据集GSE66272、GSE40435,获取与KIRC相关的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 蒋曼妃 王宝锋 等 《海南医学》 2025年36卷7期 913-918页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨hsa-miR-17-3p在膀胱癌(BLCA)中的表达及其与预后、免疫浸润及免疫治疗效果的关系.方法 从TCGA数据库(截至2024年)下载418例BLCA组织样本和19例正常组织样本的miRNA表达数据以及相应的临床数据.首先,...
【关键词】 hsa-miR-17-3p；膀胱癌；癌症基因组图谱；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 葛茹茹 方潇 等 《肿瘤学杂志》 2025年31卷1期 51-58页ISTICCA
【摘要】 [目的]分析泛癌中的COL5A1基因及蛋白表达水平,并探讨其与临床预后和肿瘤免疫浸润的关系.[方法]分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中肿瘤患者的数据,采用 TIMER2.0、GEPIA2、...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 杨鹏 邱子奕 等 《肿瘤防治研究》 2025年52卷4期 305-312页ISTICCA
【摘要】 目的 从免疫浸润角度探讨细胞周期蛋白A2(CCNA2)与结肠癌预后的关系及可能机制.方法 从癌症基因组图谱数据库下载结肠癌患者转录组数据.根据CCNA2表达情况进行临床病理特征分析及生存分析.收集75例结肠癌患者术后肿瘤组织和正常组织标本,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王晓博 王育梅 等 《神经疾病与精神卫生》 2025年25卷7期 465-473页ISTIC
【摘要】 目的 探讨双相障碍(BD)患者外周血单个核细胞(PBMC)中mRNA的整体表达情况并进行免疫浸润分析.方法 选取2022年10月—2023年7月河北医科大学第一医院精神卫生中心就诊的24例BD患者和12名健康对照(HC)者为研究对象.使用微...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 白雪 王启彤 等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页
【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵莹莹 张毅 等 《淮海医药》 2025年43卷4期 331-335,340页CA
【摘要】 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法识别正常人群和冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)患者心外膜脂肪组织(EAT)中基因表达特征.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载获得GSE64554、GSE120774、GSE...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯健 李静 《锦州医科大学学报》 2025年46卷1期 56-64页CA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析核受体亚家族6A组成员1(nuclear receptor subfamily 6 group A member 1,NR6A1)在胃癌中的作用,旨在阐明NR6A1 在胃癌中诊断和预后价值,也包括其与免疫细胞浸润的关...
【关键词】 胃癌；核受体亚家族6A组成员1；生物信息学；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 廖恒渐 莫显伟 《贵州科学》 2025年43卷2期 18-24页
【摘要】 目的:本研究通过分析单细胞数据集和bulk数据集,确认结直肠癌中的主要免疫细胞群及其功能特性.方法:将来自GEO数据库的数据集GSE87211、GSE29638、GSE143985 和GSE110224 分别按照已知免疫元基因分为两个免疫浸...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 甄秋来 马洪波 等 《医学检验与临床》 2025年36卷4期 1-8页
【摘要】 目的:利用生物信息学技术筛选与结肠癌发展及预后密切相关的潜在关键基因.方法:访问癌症基因组图谱(TCGA)并下载结肠癌患者的RNA表达数据和临床信息.利用R软件筛选结肠癌差异表达基因(DEGs)并对其进行KEGG通路富集分析,筛选在Wnt信...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王博文 杨坤鹏 等 《吉林医学》 2025年46卷5期 1020-1024页CA
【摘要】 目的:探讨血管内皮生长因子A(VEGFA)在结肠腺癌中的表达特征、临床意义及其与免疫细胞浸润的关系,进一步为VEGFA作为潜在治疗靶点提供理论支持.方法:利用TCGA数据库分析结肠腺癌患者VEGFA基因表达情况,并评估其与临床特征(如预后、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈曼娜 温悦 《海峡药学》 2025年37卷7期 17-27页
【摘要】 目的 通过生物信息学的方法挖掘免疫球蛋白A肾病(IgA Nephropathy,IgAN)的关键基因,为IgAN提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征,并预测IgAN治疗的有效药物.方法 从GEO数据库下载合并GSE73953和GSE9379...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王瑞伟 李凤杰 等 《陆军军医大学学报》 2024年46卷10期 1132-1141页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨干扰素诱导基因IFIT1与卵巢癌免疫浸润及预后的相关性.方法 通过GEO数据库筛选肿瘤免疫相关基因,Kaplan-Meier与Prognoscan预后数据库筛选与卵巢癌预后显著相关的差异基因.GEPIA、Human Protein...
【关键词】 卵巢癌；干扰素诱导的四肽重复蛋白1；生信分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐文飞 明春玉 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷30期 4909-4914页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:铁死亡与骨关节炎发生、发展密切相关,但具体特征基因及调控机制尚不清楚.目的:运用WGCNA及多种机器学习方法识别骨关节炎铁死亡特征基因及免疫浸润分析.方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数据集,同时在FerrDb网站中获取铁死亡相关基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 兰垚 陈浏阳 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷35期 5591-5597页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:氧化应激与椎间盘退变的发生发展息息相关,但其发病机制和有效治疗方法仍不明确.目的:运用生物信息学及3种机器学习算法识别与椎间盘退变伴氧化应激相关的关键基因及免疫浸润分析,并进行实验验证.方法:从GEO数据库获得椎间盘退变基因表达谱以及...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙皓 赵志娟 等 《安徽医科大学学报》 2024年59卷3期 506-514页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨胶质母细胞瘤(GBM)中铁死亡的分子机制,为确定新的治疗靶点提供思路.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中选取数据集GSE108474 并通过 GEO2R获取GBM差异表达基因,与铁死亡数据库(FerrDb)中基因集对比,获得铁...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谢越 翟伟峰 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷21期 3438-3444页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:椎间盘退变早期诊断和治疗尤为重要,髓核细胞焦亡在早期椎间盘退变过程中发挥着重要作用,但髓核细胞焦亡相关分子在早期椎间盘退变中发挥的作用及相关分子标志物仍不明确.目的:探讨焦亡相关差异表达基因在椎间盘退变过程中的诊断及治疗价值.方法:整...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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