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【中文期刊】 许星月 郭依琳 等 《肿瘤基础与临床》 2024年37卷3期 256-261页
【摘要】 目的 通过高通量测序及生信分析,挖掘子宫颈癌淋巴结转移调控机制.方法 收集 3 例淋巴结转移、3 例无淋巴结转移的子宫颈癌组织,全转录组高通量测序筛选差异表达信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 石田培 张莉 《遗传》 2019年41卷3期 193-205页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 RNA作为一种大分子参与基因编码、解码、调控、表达等多种生物学过程.目前,对RNA的功能研究主要通过全转录组测序方法来完成.全转录组研究可以对基因结构与功能进行更深层次地分析和探究,揭示基因表达与生命现象之间的内在联系.现阶段,基于高通量测...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杜宇 祝智威 等 《中国农业科学》 2021年54卷4期 864-876页
【摘要】 [目的]利用第三代纳米孔(nanopore)长读段测序技术对蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)的纯化菌丝(Aam)和孢子(Aas)进行测序,构建和注释球囊菌的高质量全长转录组.[方法]通过Oxford Nanopor...
【关键词】 第三代高通量测序技术；纳米孔测序；全长转录本；
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【中文期刊】 李桂澜 匡华 《食品安全质量检测学报》 2019年10卷15期 5091-5097页
【摘要】 微生物超标及食源性致病菌引发的生物污染是影响国家公共卫生的主要因素.新一代的高通量测序技术因其高覆盖度、高灵敏度、高准确性和低成本等特点,已经作为食品安全检测最重要技术逐渐替代常规DNA诊断和微生物分型方法.本文通过综述测序的发展历史和二代...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱翔 浦春 等 《分子诊断与治疗杂志》 2016年8卷1期 61-65页ISTIC
【摘要】 常规的转录组分析方法通常需要103个细胞,所以无法揭示单个细胞之间基因表达的异质性,也难以对诸如早期胚胎及异质性的组织干细胞和肿瘤干细胞等极少量细胞进行分析,而单细胞转录组测序技术的出现为此提供了有效的研究工具.单细胞转录组测序技术是在单细...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周帆 林标扬 《生命科学研究》 2012年16卷5期 451-456页ISTICCA
【摘要】 很多的人类疾病与基因突变有关,基因突变在疾病的诊断和治疗中起到了至关重要的作用.第二代高通量测序,其特点为通量高、速度快、成本低,给检测基因突变带来了革命性的变化.该技术检测基因突变的流程简单,研究人员运用全基因组从测序,目标基因组测序以及...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 孙淼 许钦奕 等 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷6期 1286-1304页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 耳叶牛皮消(Cynianchum auriculatum)为萝藦科(Asclepiadaceae)植物,具有较高的营养价值和药用潜力,是中国传统的药食同源兼用植物.当前耳叶牛皮消的相关研究以活性物质的提取和分类为主,但分子水平的研究较少.本...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐媛媛 俞翰炳 等 《中国生物工程杂志》 2017年37卷6期 114-123页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 林木的分子病理学研究长期以来落后于农业作物病理学.随着高通量测序技术的问世,林木的分子病理学研究迎来了一个崭新的时代.从2006年至今,杨树、云杉等重要森林树种的全基因组测序相继完成,这为全面解析林木的抗病过程提供了遗传背景.同时,转录组学...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：瞿锡垚导师：刘学军 南京航空航天大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2018年
【摘要】 转录组表达水平测量计算是基因功能研究的重要手段，而真核生物选择性剪切的存在给准确计算基因异构体表达水平带来了困难。近几年诞生的第三代测序技术是转录组研究的一种新的实验方法，其显著特点是可以获得超长读段，弥补了第二代测序技术中的读段过短，异构...
【关键词】 高通量全长转录组测序数据 ； ISO-seq技术 ；
- 概要：
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- 结论：
【学位论文】 作者：刘叶文导师：李伟 温州医科大学 临床医学 临床检验诊断学（硕士） 2017年
【摘要】
研究背景:
近期研究表明，长链非编码RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）参与了有机体生命活动的各个方面，并且发挥着重要的调控作用。人肝癌细胞株HepG2是一种常见的细胞株，被广泛用于细胞代谢的研究，是生命...
- 概要：
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【中文期刊】 张宁 李自辉 等 《中华中医药学刊》 2024年42卷4期 35-39,后插15-后插17页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 研究玄参干预对大鼠基因表达谱的影响,探讨玄参干预对大鼠的潜在保护和毒性作用及其机制.方法 将20只雄性SD(Sprague-Dawley)大鼠随机分为玄参组和空白组,每组10只.玄参组大鼠给予玄参提取物1350 mg· kg-1灌胃,...
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【中文期刊】 王纪龙 李青 等 《遗传》 2024年46卷8期 589-602页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 自转录活性调节区测序(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq)是一种可发现并同时验证全基因组增强子活性的高通量测序方法.其原理为:将待验证序列插入质粒载...
- 概要：
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【中文期刊】 张德安 杨若渚 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷1期 232-244页
【摘要】 旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50％青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果.试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平均体重...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 党蕾 董盈盈 等 《世界中医药》 2023年18卷24期 3500-3507页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:通过转录组与生物信息学结合解析滋肾育胎丸防治早发性卵巢功能不全的关键机制.方法:滋肾育胎丸对早发性卵巢功能不全小鼠模型行预防给药,采用二代高通量测序技术对模型组和给药组小鼠卵巢组织行转录组测序,应用基因本体(GO)富集分析和京都基因和...
【关键词】 滋肾育胎丸；防治早发性卵巢功能不全；转录组学；
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【中文期刊】 黄丽容 郭晓云 等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1428-1440页ISTICCA
【摘要】 目的:通过高通量测序技术获得香附子Cyperus rotundus L.全长转录组的信息特征,为深入挖掘香附子功能基因奠定基础.方法:通过PacBio Sequel高通量测序系统,对香附子根、茎、叶、花 4 个部位的混样进行全长转录组测序及...
- 概要：
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【中文期刊】 黄丽容 欧夏莲 等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1486-1495页ISTICCA
【摘要】 目的:利用高通量测序技术获得马鞭草Verbena officinalis L.的全长转录组基因信息.方法:通过PacBio Sequel高通量测序平台,对马鞭草根、茎、叶 3 个部位的混合样品进行全长转录组测序,并基于序列同源性对转录本进行...
- 概要：
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【中文期刊】 黄素华 韦范 等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1473-1485页ISTICCA
【摘要】 目的:获得天仙藤全长转录组数据库,挖掘天仙藤功能基因.方法:采用PacBio SequeⅠ高通量测序系统,对天仙藤的茎、叶、果 3 个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析.结果:共获得 176 354 条环形一致性序列(CCS),获得 1...
- 概要：
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【中文期刊】 梁莹 韦桂丽 等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1396-1406页ISTICCA
【摘要】 目的:获得越南槐Sophora tonkinensis Gagnep.全长转录组数据,为深入挖掘越南槐功能基因提供参考.方法:采用PacBio Sequel高通量测序系统,对越南槐根、茎、叶、果 4 个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析...
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【中文期刊】 舒明雨 龚一富 等 《水生生物学报》 2022年46卷9期 1310-1318页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为研究6种外源因素处理对三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)基因表达的影响,通过高通量转录组测序技术获得三角褐指藻dxs基因cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析...
【关键词】 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶；岩藻黄素；生物信息学；
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【中文期刊】 许艺兰 文露婷 等 《河南农业科学》 2023年52卷6期 150-159页
【摘要】 为探究全州禾花鲤乌褐色、半透明的经济体色性状,发掘全州禾花鲤的皮肤基因信息,以全州禾花鲤的皮肤组织为研究对象,利用高通量测序技术进行转录组比较分析.结果显示,全州禾花鲤和建鲤(对照)的皮肤组织转录组测序获得37066778～58708166...
- 概要：
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【中文期刊】 杨晚铃 白芷懿 等 《江西师范大学学报（自然科学版）》 2023年47卷1期 99-110页
【摘要】 为获得鹿茸草的全长转录组信息,挖掘鹿茸草次生代谢化合物生物合成途径相关酶的基因,该文基于单分子测序技术,利用Pacbio高通量测序平台,对鹿茸草进行全长转录组测序,共获得48005条去冗余的高质量转录本,与NR、Swiss-Prot、GO、...
- 概要：
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【中文期刊】 黄璐 戴杰 等 《国际口腔医学杂志》 2020年47卷1期 68-75页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 唾液含有丰富的DNA、RNA、蛋白质、微生物及代谢产物.它作为一种无创、安全的来源,可以替代血液用于疾病的诊断和预后.随着微阵列技术、全基因组测序、全转录组测序等高通量技术的快速发展,研究发现唾液是一个潜在的巨大生物标志物储存库,已有多种疾...
- 概要：
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【中文期刊】 向丽娟 汪圣毅 等 《安徽医科大学学报》 2019年54卷1期 5-9页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨胃癌(GC)脂代谢(LM)通路的基因表达情况.方法 转录组测序筛选8例GC及4例癌旁组织之间的差异表达基因,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析GC脂代谢相关通路中的关键基因(KGS).结果高通量测序获得3 198个长度大...
- 概要：
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【中文期刊】 姚尧 王丹丹 等 《胃肠病学》 2021年26卷12期 762-766页ISTICCA
【摘要】 炎症性肠病(IBD)为病因复杂的慢性非特异性肠道炎症,其具体的发病机制仍不完全清楚.随着高通量测序技术的不断更新和发展,其中基于单细胞水平的单细胞转录组测序技术的应用大大推进了对IBD发病机制、治疗等的认识.本文就近年单细胞转录组测序技术在...
【关键词】 炎症性肠病；单细胞转录组测序技术；肠上皮细胞；
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【中文期刊】 赖晓娟 陈海敏 等 《遗传》 2013年35卷6期 735-744页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 藻类具有复杂多样的进化历史和生物学特征,不仅在生态系统中扮演着重要角色,而且具有许多独特的基因和生物过程.高通量测序技术在藻类研究领域中的应用,大大促进了藻类基因组学和转录组学的发展,丰富了藻类基因信息.文章对近年来藻类基因组和转录组的研究...
- 概要：
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【中文期刊】 杨旭 焦睿 等 《遗传》 2011年33卷8期 829-846页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 近年来,包括第二代测序技术和蛋白质谱技术等在内的新一代高通量技术越来越多的应用于解决生物学问题尤其是人类疾病的研究.这种以数据为导向,大规模、工业化的研究模式,使得从基因组水平、转录组水平、蛋白质组水平等角度对疾病展开全方位、多层次的研究成...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 王谦 陈苏宁 等 《临床检验杂志》 2019年37卷11期 815-819页ISTICCA
【摘要】 多数急性淋巴细胞白血病(ALL)患者可检出染色体易位及分子遗传学异常,部分遗传学异常对指导治疗和判断患者的预后有重要意义.随着全基因组测序、全外显子测序、转录组测序等高通量分子生物学技术的广泛应用,ALL中一些新的分子遗传学异常逐渐被揭示....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陶谦 刘鑫 《口腔疾病防治》 2018年26卷4期 211-217页ISTIC
【摘要】 唾液中有丰富的DNA、RNA、蛋白质、微生物及代谢产物,蕴含着与血液相似的反映机体生理病理状态的巨大生物学信息,且唾液具有取材方便无创、携带安全、储存运输成本低等优势,可望作为理想的血液替代品用于疾病的筛查,近年来受到学者的广泛关注.随着微...
- 概要：
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【中文期刊】 倪倩雯 《胃肠病学》 2012年17卷1期 39-42页ISTICCA
【摘要】 近年胰腺癌的发病率呈逐年上升趋势,本病恶性程度较高,与其早期局部侵犯和转移有关,因此早期诊断胰腺癌是实施根治性切除、延长患者生存期的关键.目前临床上尚缺乏有效的非创伤性早期筛查手段,多数患者确诊时已不能行手术切除.随着近年分子生物学和高通量...
- 概要：
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【中文期刊】 胡于东 堵国成 等 《食品与生物技术学报》 2016年35卷6期 623-628页
【摘要】 G.oxydans WSH-003能够高效地将D-山梨醇氧化为L-山梨糖,是工业VC生产的重要菌株.全基因组测序显示,该菌中存在3种不同的D-山梨醇脱氢酶基因簇(sldh),但这3种基因簇在菌株氧化D-山梨醇过程中的表达情况还未确定.WYL...
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【中文期刊】 杜玲 刘刚 等 《中国畜牧兽医》 2014年41卷12期 109-116页
【摘要】 DNA测序技术从以Sanger法为代表的第一代测序技术到如今的高通量测序(HTS)技术,经历了漫长而曲折的发展过程,如今该技术在动植物基因组的研究中获得了很大的成功,它的问世可以使人们以更低廉的价格,更全面、更深入地对全基因组进行分析.作者...
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【中文期刊】 曹盈 《北京农业》 2013年6期 6-6,7页
【摘要】 新一代高通量测序技术相比于传统测序技术具有周期短、准确性高及成本低等优点，目前已广泛应用到植物转录组的研究中。对已完成全基因组测序的物种进行转录组测序，可得到基因表达差异、基因结构优化、可变剪接、单核苷酸多态性等分析结果并发现新基因。对无参...
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【中文期刊】 孙健冬 《生物技术进展》 2012年02卷1期 11-15页
【摘要】 近几年飞速发展的高通量测序技术(next generation sequencing,NGS)在生命科学研究的各个领域充分展现了其低成本、高通量和应用面广等优势.在现代农业生物技术领域,利用高通量测序技术,科学家们不仅能更经济而高效对农作物...
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【中文期刊】 田韦韦 严志祥 等 《中国中药杂志》 2023年48卷4期 939-950页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 WRKY转录因子家族在植物生长发育、次生代谢产物合成、生物和非生物胁迫响应等过程发挥着重要的作用.该研究采用PacBio SMRT高通量测序技术对多花黄精进行全长转录组测序,利用生物信息学手段从多花黄精全长转录组中鉴定WRKY家族成员,分析...
【关键词】 多花黄精；全长转录组；WRKY转录因子家族；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 苏思 崔梦宇 等 《现代预防医学》 2023年50卷24期 4509-4514页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 了解内蒙古阿尔山地区全沟硬蜱(Ixodes persulcatus)携带蜱媒病原体的群落组成及新塔拉塞维奇立克次体(Candidatus Rickettsia tarasevichiae,CRT)和北极内罗病毒(Beiji nairo...
【关键词】 全沟硬蜱；新塔拉塞维奇立克次体；北极内罗病毒；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘卓航 《中国生物制品学杂志》 2022年35卷6期 748-751页ISTICCSCDCABP
【摘要】 随着高通量测序技术的快速发展,全转录组测序技术的应用更加广泛.本文结合近年来临床医学的研究,对全转录组测序在探索一些复杂疾病的发病机制和诊断标志物方面应用的最新进展作一综述.
- 概要：
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【中文期刊】 王洪祥 秦荣 等 《第二军医大学学报》 2017年38卷8期 1046-1052页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 脑胶质瘤是一类高度致死性恶性肿瘤,目前有关其在基因组学的研究及临床治疗存在诸多挑战.二代测序技术具有高通量优势,能通过对肿瘤全基因组、外显子组、转录组及表观遗传组全面分析加深对肿瘤基因组学的认识,并已成功应用于部分肿瘤的临床研究中,为肿瘤个...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 谷文静 张磊 《国际输血及血液学杂志》 2018年41卷5期 431-436页ISTICCA
【摘要】 由于血液系统恶性疾病具有高度异质性,传统批量测序技术难以识别异质性细胞群体,可能丢失在疾病克隆演变中起重要作用的信息.单细胞测序技术的迅速发展,使其可在单个细胞水平进行全基因组、转录组及表观遗传组学分析,有利于揭示肿瘤异质性,追踪细胞谱系,...
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