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【中文期刊】 李雪萌 李梦凡  等 《军事医学》 2025年49卷1期 41-46页 ISTICCSCDCA

【摘要】 目的 构建毒物药物化学分子质谱信息数据库,为神经性毒剂、代谢产物等小分子化合物的质谱图信息管理、检索等提供支撑.方法 按照软件工程方法进行需求分析和功能设计,基于Spec2Vec算法实现了质谱图向量化表示,通过扩展连通性指纹(ECFP)实现...

【关键词】 Milvus向量数据库； 质谱信息； 质谱相似性检索；

【中文期刊】 刘金杰 黄湘龙  等 《天津中医药》 2025年42卷2期 204-215页 ISTICCA

【摘要】 [目的]采用机器学习结合网络药理学筛选的方法,预测中药党参促进机体低氧适应的潜在药效成分与作用机制.[方法]收集党参活性成分及潜在作用靶点;从GEO数据库中获取低氧下差异表达基因,整合GeneCards数据库中低氧适应相关的基因,获取低氧适...

【关键词】 低氧适应； 党参； 网络药理学；

【中文期刊】 张昊 李雪岩  等 《解剖学报》 2025年56卷1期 43-49页 ISTICCSCDCABP

【摘要】 目的 基于网络药理学结合生物信息学、分子对接技术,探究华蟾酥毒基(cinobufagin,CBG)治疗胃癌的作用机制.方法 利用PubChem数据库、TCMSP数据库和SwissTargetPrediction数据库,收集CBG治疗胃癌活性...

【关键词】 华蟾酥毒基； 胃癌； TCGA数据库；

【中文期刊】 陈新欢 耿辉  等 《中国循证心血管医学杂志》 2025年17卷1期 14-17页 ISTIC

【摘要】 目的 通过对铁死亡基因数据库(FerrDb数据库)组成进行简要介绍,结合具体示例展示其使用方法,旨在让更多研究人员认识、了解并应用该数据库开展疾病诊断、治疗和愈后等方面的研究.方法 探讨FerrDb数据库的子数据库铁死亡基因、诱导剂、抑制剂...

【关键词】 铁死亡； 铁死亡基因数据库； 分子机制；

【中文期刊】 杨淑贤 孙阿宁  等 《中国临床药理学杂志》 2024年40卷3期 435-439页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于网络药理学、基因表达综合数据库及分子对接技术,预测及初步验证脑安胶囊(NAC)治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制.方法 用中药系统药理学分析平台收集NAC中的活性成分,用基因表达综合数据库筛选疾病相关差异基因.筛选获得两者的共同靶...

【关键词】 脑安胶囊； 缺血性脑卒中； 基因表达综合数据库；

【中文期刊】 王瑾瑾 崔文飞  等 《南方医科大学学报》 2024年44卷7期 1243-1255页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 结合GEO数据库利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制.方法 通过TCMSP、PubChem及Swiss Target Prediction数据库获取鬼箭羽的活性成分和作用靶点.利用GE...

【关键词】 鬼箭羽； 糖尿病肾病； GEO数据库；

【中文期刊】 曹振 程路畅  等 《中国药理学通报》 2024年40卷4期 756-764页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 运用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TC-GA)基因组学数据挖掘潜在治疗胶质母细胞瘤的药物卤泛群(halofantrine),通过网络药理学方法探讨卤泛群防治胶质母细胞瘤的作用机制,并结合细胞实验对卤泛群...

【关键词】 TCGA数据库； 网络药理学； 胶质母细胞瘤；

【中文期刊】 宋子毅 杨超  等 《华西口腔医学杂志》 2024年42卷4期 444-451页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制.方法 基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾...

【关键词】 口腔黏膜下纤维化； 芒果苷； 基因表达综合数据库；

【中文期刊】 姚曼曼 路月亭  等 《海南医学》 2024年35卷24期 3613-3620页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选天然多酚类化合物原花青素(procyanidin,PC)与OSCC相关的核心靶点及其调控机制,并探讨其对患者预后的影响,为PC在OSCC中的临床应用提供理论依据.方法 通过网络药理学方法筛选PC与OSCC的交集靶点,构建蛋白-蛋白...

【关键词】 原花青素； 口腔鳞状细胞癌； 网络药理学；

【中文期刊】 樊丽华 王江雪  等 《食品科学》 2024年45卷7期 332-339页

【摘要】 在食品链中,粪便微生物污染是诱发食源性疾病的重要途径之一,也是食品安全领域备受关注的问题.利用微生物源示踪(microbial source tracking,MST)技术对粪便微生物来源和污染情况进行追踪是解决该问题的有效手段之一.MST...

【关键词】 微生物源示踪方法； 食源性疾病； 粪便污染；

【中文期刊】 唐毓婧 高永平  等 《中国医疗器械信息》 2024年30卷1期 25-30页

【摘要】 2021年3月,国家药品监督管理局发布了建立医疗器械主文档数据库的公告,该公告的发布将会促使医用材料与其他应用领域的材料严格区分开来.然而目前我国尚无标准来定义医用级材料的要求.因此,中国医疗器械行业协会医用高分子制品专业分会牵头,组织医用...

【关键词】 医疗器械用高分子材料； 一致性； 安全性；

【中文期刊】 魏泽坤 杨雨洁  等 《山东科学》 2024年37卷3期 39-47页

【摘要】 基于GEO(gene expression omnibus)数据库结合网络药理学及分子对接,从分子水平逆向挖掘具有抗肝癌活性的中药.通过GEO、GeneCards、OMIM和TTD等疾病靶点数据库获取肝癌的重要靶点.利用STRING平台获取...

【关键词】 葛根； 抗肝癌活性成分； 网络药理学；

【中文期刊】 徐穆妃 徐嘉悦  等 《广州医药》 2024年55卷3期 245-254页

【摘要】 目的 通过公共数据库筛选急性肺损伤(ALI)及急性呼吸窘迫综合征(ARDS)相关分子标志物,并探索其临床意义.方法 利用基因表达综合数据库(GEO)中有关ALI/ARDS基因表达芯片研究的两个数据集GSE76293和GSE10474,通过S...

【关键词】 急性肺损伤； GEO数据库； 关键基因；

【中文期刊】 周兰荠 刘天启  等 《陕西师范大学学报（自然科学版）》 2024年52卷5期 82-96页

【摘要】 滇黄精(polygonatum kingianum coll.et Hemsl.,PK)是我国传世经典食药两用食物,营养物质丰富,具有护肝等功效.九蒸九制是炮制滇黄精的经典方法,但其对滇黄精护肝作用及机制的影响尚无报道.基于LO2细胞酒精性...

【关键词】 食药同源； 滇黄精； LO2细胞酒精性损伤；

【中文期刊】 邓颖 熊安秀  等 《中国医科大学学报》 2023年52卷10期 910-916页 ISTICPKUCABP

【摘要】 目的 应用生物信息学方法对TARGET数据库进行分析,筛选儿童急性髓细胞白血病(AML)相关差异基因及信号通路.方法 从TARGET数据库下载AML患儿的临床信息和基因表达信息.采用R软件筛选低/中高危患儿的差异基因、初诊/复发患儿的差异基...

【关键词】 儿童急性髓细胞白血病； TARGET数据库； 生物信息学；

【中文期刊】 邓亮 段一镟  等 《临床军医杂志》 2023年51卷11期 1148-1153,1157页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过对GEO数据库中糖尿病心肌病(DCM)的基因芯片进行分析,筛选出DCM的关键基因并探索潜在的靶向药物.方法 从GEO数据库中下载基因表达数据集GSE161052和GSE161931.选取基因集进行差异基因分析,构建加权基因共表达网...

【关键词】 糖尿病心肌病； GEO数据库； 网络药理学；

【中文期刊】 杨玉雯 姚元谦  等 《中医药导报》 2023年29卷2期 127-132页 ISTIC

【摘要】 目的:研究茵陈活性成分6,7-二甲氧基香豆素(Scoparone)治疗肝癌的分子机制.方法:使用GEO数据库下载肝癌的芯片数据,从TCMSP数据库检索Scoparone的作用靶点,使用R软件获取肝癌差异基因;通过Jvenn和Cytoscap...

【关键词】 肝癌； 6,7-二甲氧基香豆素； 茵陈；

【中文期刊】 张红阳 莫殿军  等 《广州中医药大学学报》 2023年40卷10期 2519-2530页 ISTICCA

【摘要】 [目的]探讨启宫丸治疗多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗(PCOS-IR)痰湿证患者的临床疗效与安全性,同时应用网络药理学方法与分子对接技术探讨启宫丸治疗PCOS-IR的作用机制.[方法]将60例PCOS-IR痰湿证患者随机分为对照组和观察组,每组...

【关键词】 启宫丸； 多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗(PCOS-IR)； 痰湿证；

【中文期刊】 陈广芳 文昌晖  《西部中医药》 2023年36卷9期 25-34页 ISTIC

【摘要】 目的:通过基因表达数据库(GEO)芯片分析及分子对接方法探讨槲皮素对银屑病外周血中性粒细胞弹性蛋白酶(neutrophil elastase,NE)的分子机制.方法:从公共GEO下载GSE106087芯片数据,筛选差异靶点基因;收集中药系统...

【关键词】 银屑病； 基因表达数据库； 中性粒细胞；

【中文期刊】 陈松鹤 王燕  等 《浙江中西医结合杂志》 2023年33卷6期 551-555页

【摘要】 肝纤维化是由于各种原因引起的慢性肝损伤在创面愈合过程中,肝细胞再生、胶原活化和细胞外基质过度沉积导致的结果[1],属于病理学的概念.肝纤维化可进一步发展成为肝硬化、肝癌,甚至导致死亡.针对肝纤维化病因治疗后,肝纤维化是可逆转的,但临床上并未...

【关键词】 GEO数据库； 差异基因； 网络药理学；

【中文期刊】 石许群 王华禹  《中医临床研究》 2023年15卷11期 1-10页

【摘要】 目的:探讨桃红四物汤治疗膝骨关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的作用机制,并通过分子对接进行机制验证.方法:从TCMSP和Uniprot数据库中收集桃红四物汤的活性化合物和靶点;利用GenCards和及GSE11799...

【关键词】 桃红四物汤； 膝骨关节炎； 网络药理学；

【中文期刊】 许丽佳 李正文  等 《四川大学学报（自然科学版）》 2023年60卷6期 202-211页

【摘要】 为了深入研究燕麦多肽中可能发挥降血糖功能的活性多肽分子,本文首先从文献中调研了从燕麦中提取鉴定得到的多肽,构建了对应的燕麦多肽数据库,并基于DPP4蛋白对多肽数据库进行了虚拟筛选.随后,针对筛选获得的6个多肽分别进行了 100 ns的分子动...

【关键词】 燕麦多肽； 多肽数据库； 虚拟筛选；

【中文期刊】 邓晗 杨硕  《中医临床研究》 2023年15卷31期 19-25页

【摘要】 目的:基于网络药理学与分子对接研究人参-五味子药对治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索人参和五味子的化学成分,并进行筛选,通过PharmMapper和STRING数...

【关键词】 冠状动脉粥样硬化性心脏病； 人参-五味子； 网络药理学；

【中文期刊】 丁晓艳 何久香  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷7期 2964-2971页

【摘要】 本研究旨在初步筛选非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)感染过程中与宿主相互作用的调控基因以及毒力基因,为非洲猪瘟(African swine fever,ASF)特效药以及疫苗研发提供分子理论基础.利...

【关键词】 非洲猪瘟病毒； GEO数据库； 蛋白相互作用；

【中文期刊】 韩雪 杨正飞  等 《智慧健康》 2023年9卷4期 87-90页

【摘要】 目的 运用富集分析方法从腧穴、调控因子、疾病角度研究百会穴治疗相关疾病的作用机制,为进一步针灸临床实践提供理论基础.方法 通过检索CNKI数据库中百会穴相关文献,收集并整理百会穴可能影响的生物分子情况,运用DAVID 6.8在线分析工具,分...

【关键词】 富集分析方法； 百会； 知网数据库；

【中文期刊】 陈锋 章晓云  等 《中国骨质疏松杂志》 2021年27卷5期 727-734页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于网络药理学和生物信息学探讨"骨碎补-淫羊藿"治疗骨质疏松的分子机制,为骨质疏松治疗提供新的靶点.方法 通过TCMSP数据库筛选"骨碎补-淫羊藿"的活性成分,联合UniProt数据库预测其调控靶点,并根据GEO数据库预测治疗骨质疏松...

【关键词】 骨质疏松； 淫羊藿； 骨碎补；

【中文期刊】 陈锋 章晓云  等 《中国组织工程研究》 2021年25卷23期 3704-3710页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:现代药理学研究表明淫羊藿苷元具有雌激素样作用,对骨关节炎的治疗起着非常积极的作用.由于淫羊藿苷元在分子水平上治疗骨关节炎的机制尚不明确,因此利用网络药理学和生物信息学从分子水平来探究淫羊藿苷元治疗骨关节炎的作用机制,可为后期药物研发及...

【关键词】 骨关节炎； 骨； 淫羊藿苷元；

【中文期刊】 容伟明 袁长深  等 《中国组织工程研究》 2021年25卷26期 4223-4229页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:骨关节炎是最常见的慢性关节疾病,其发病机制与复杂的基因调控网络密切相关,但其潜在网络尚未完全明确.目的:利用生物信息学分析方法挖掘骨关节炎滑膜组织中的重要基因、通路、miRNA-mRNA调控网络和免疫浸润情况,以便更全面地阐明骨关节炎...

【关键词】 骨关节炎； 基因； 芯片；

【中文期刊】 李苇航 丁子毅  等 《吉林大学学报（医学版）》 2021年47卷6期 1570-1580页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:筛选骨肉瘤(OS)发生发展的核心驱动基因,从分子水平探讨OS的致病机制,并构建基因模型用于患者生存期的预测.方法:采用基因表达汇编(GEO)数据库下载OS芯片对应矩阵数据GSE12865、GSE14359和GSE36001.采用生物信...

【关键词】 骨肉瘤； 癌症基因组图谱数据库； 分子机制；

【中文期刊】 李磊 陈彦平  等 《口腔医学研究》 2021年37卷6期 514-518页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:探讨AKR1C3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其功能.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中筛选OSCC相关芯片数据集,利用R语言...

【关键词】 口腔鳞状细胞癌； 基因表达数据库； 分子标志物；

【中文期刊】 李笠 李轶凡  等 《临床药物治疗杂志》 2022年20卷5期 43-49页 ISTIC

【摘要】 目的 利用美国食品药品管理局不良事件报告系统(FAERS)数据库,挖掘低分子肝素类药物上市后安全警戒信号,探讨其潜在的不良事件,为临床安全用药提供参考.方法 检索FAERS数据库中低分子肝素类药物的不良事件报告,检索时间为从2014年1月1...

【关键词】 低分子肝素； 不良事件； FAERS数据库；

【中文期刊】 刘传 李丽娟  等 《临床肺科杂志》 2022年27卷2期 256-261页 ISTIC

【摘要】 目的 通过检测癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)在肺腺癌中的表达,探究其临床意义及预后.方法 回顾性分析2016年8月-2017年8月在本院确诊为肺腺癌的患者51例,取肺腺癌患者病变肺部组织作为实验组;从中选取42例取癌旁组织作为...

【关键词】 肺腺癌； 癌胚抗原相关细胞黏附分子5； UALCAN数据库；

【中文期刊】 翟芬芬 刘毓菲  等 《湖南中医药大学学报》 2022年42卷6期 958-965页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于网络药理学与生物信息学研究方法,探讨小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)和哮喘"异病同治"的疗效及其作用机制.方法 通过ETCM数据库、DisGeNE...

【关键词】 小青龙汤； 慢性阻塞性肺疾病； 哮喘；

【中文期刊】 刘娟 魏瑜  等 《新疆医科大学学报》 2022年45卷6期 581-587页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于生信数据挖掘整合素连接激酶(Integrin linked kinase,ILK)参与食管鳞癌的潜在机制,探讨ILK在食管鳞状细胞癌(简称食管鳞癌)中的表达及临床意义.方法 收集2008年7月—2015年4月在新疆医科大学第一附属...

【关键词】 整合素连接激酶； 食管鳞癌； 数据库；

【中文期刊】 孙彩虹 杨志城  等 《中国现代中药》 2022年24卷4期 676-686页 ISTICCA

【摘要】 目的:基于网络药理学与基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库挖掘初步揭示瘀血痹胶囊发挥抗类风湿性关节炎(RA)的潜在活性成分及作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneC...

【关键词】 类风湿性关节炎； 瘀血痹胶囊； 网络药理学；

【中文期刊】 赵格 黎昌学  等 《口腔疾病防治》 2022年30卷1期 27-32页 ISTIC

【摘要】 目的 探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析.方法 通过肿瘤与癌症基因图谱(t...

【关键词】 口腔鳞状细胞癌； 微小RNA； miR-135b-5p；

【中文期刊】 高洪亮 邢福成  《中国老年学杂志》 2020年40卷10期 2200-2203页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 采用生物信息方法探讨长链非编码RNA同源异型框基因翻译基因间RNA(HOTAIR)在乳腺癌患者中的表达及其与患者预后关系.方法 检索Oncomie数据库中乳腺癌患者HOTAIR基因表达的相关芯片数据.根据HO-TAIR表达水平分为高低...

【关键词】 乳腺癌； HOTAIR基因； TCGA数据库；

【中文期刊】 卞佳豪 杨广宇  《合成生物学》 2022年3卷3期 429-444页

【摘要】 蛋白质工程是合成生物学领域的重要研究方向之一.但目前人类对于蛋白质折叠、酶天然进化机制等基础生物学问题的理解仍很有限,因此基于理性设计方法进行蛋白质的功能从头设计(de novo design)仍然是一个难题.定向进化(directed e...

【关键词】 蛋白质工程； 合成生物学； 人工智能；

【中文期刊】 阳凌峰 张彧  等 《中国中医药图书情报杂志》 2022年46卷5期 9-14页

【摘要】 目的 应用网络药理学方法探讨真人养脏汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制.方法 利用TCMSP数据库及相关文献筛选真人养脏汤的活性成分及对应靶点,通过GEO、DisGeNET、GeneCards、PharmGKB、DrugBank数据库获取与溃疡性...

【关键词】 网络药理学； GEO数据库； 分子对接；

【中文期刊】 张硕 李道娟  等 《健康体检与管理》 2022年3卷3期 217-225页

【摘要】 目的:探讨影响≤35岁年轻原发性乳腺癌不同分子亚型患者临床病理特征及相关预后因素.方法:收集整理美国国立癌症研究所监测、流行病学和结果数据库SEER中的2010—2015年年轻(≤35岁)原发性乳腺癌病例,利用卡方检验、Fisher确切概率...

【关键词】 年轻乳腺癌； SEER数据库； 分子亚型；