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            【中文期刊】 李俊霖  郭淑红  等 《中草药》 2024年55卷7期 2366-2374页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以蒙古黄芪Astragalus membranaceus var.mongholicus为材料,解析其叶绿体基因组的序列特征,并进行系统发育分析.方法 利用Illumina NovaSeq测序平台对蒙古黄芪叶绿体全基因组进行测序,完成...

            【关键词】 蒙古黄芪叶绿体基因组序列比对

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            【中文期刊】 梁莹莹  吴文如  等 《中草药》 2024年55卷19期 6721-6729页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 分析苹婆Sterculia monosperma的叶绿体基因组结构信息,以及苹婆属的种间亲缘关系,为苹婆属的系统发育和物种鉴定研究提供参考.方法 基于DNBSEQ测序平台,对苹婆叶绿体基因组进行测序,利用生物信息学手段进行组装、注释和...

            【关键词】 苹婆假苹婆苹婆属

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            【中文期刊】 龚秋怡  董姝洁  等 《中草药》 2024年55卷12期 4150-4158页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以牛茄子Solanum capsicoides新鲜叶片为材料,对叶绿体基因组序列进行组装、注释和分析,探究牛茄子的序列特征和同属其他物种的系统发育关系.方法 基于Illumina HiSeq高通量测序,获得牛茄子完整叶绿体基因组序列,...

            【关键词】 牛茄子茄属叶绿体基因组

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            【中文期刊】 廖海  喻心怡  等 《中国药学杂志》 2024年59卷15期 1393-1399页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 建立基于插入缺失(Indel)标记的常规聚合酶链反应(PCR)方法对太白贝母及其近缘种开展分子鉴定研究.方法 从GenBank下载103条来自不同贝母来源植物的叶绿体基因组序列,序列比对筛选太白贝母的特异性Indel标记.在该Inde...

            【关键词】 叶绿体基因组太白贝母accD-psaI

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            【中文期刊】 李昕怡  郭华  等 《中国中药杂志》 2024年49卷24期 6685-6691页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 茵陈来源于菊科植物滨蒿Artemisia scoparia或茵陈蒿A.capillaris.为了科学准确地鉴定批量茵陈样品的基原及混伪情况,该研究采用了一种基于多种分子标记联合应用的综合方法.研究基于GenBank上茵陈蒿、滨蒿及其他常见蒿...

            【关键词】 茵陈基原鉴定叶绿体基因组

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            【中文期刊】 高娜娜  倪梁红  等 《药学学报》 2022年57卷8期 2520-2527页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 粗茎秦艽Gentiana crassicaulis Duthie ex Burk.为中药"秦艽"的基原植物之一,而同为龙胆属秦艽组的西藏秦艽 Gentiana tibetica King ex Hook.f.、粗壮秦艽 Gentiana r...

            【关键词】 粗茎秦艽西藏秦艽粗壮秦艽

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            【中文期刊】 杜清  王立强  等 《药学学报》 2022年57卷7期 2206-2215页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 研究欧地笋Lycopus europaeus Linn.叶绿体基因组的结构特征,比较与欧地笋具有相近药理作用和临床功效的唇形科物种的系统进化关系.利用Illumina Hiseq 4000测序平台对欧地笋全基因组DNA进行测序、使用NOVO...

            【关键词】 唇形科欧地笋硬毛地笋

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            【中文期刊】 丁彦强  方扬  等 《应用与环境生物学报》 2017年23卷2期 215-219页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 由于浮萍形态高度退化,其系统进化研究较为困难,基于叶绿体基因组研究浮萍亚科系统进化对解决该问题具有重要意义.通过过滤全DNA数据(即包含细胞内的核DNA、叶绿体DNA和线粒体DNA的测序数据)和直接提取叶绿体DNA测序两种方法组装叶绿体基因...

            【关键词】 浮萍少根紫萍叶绿体基因组

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            【中文期刊】 荣正普  王杰敏  等 《中草药》 2025年56卷1期 269-281页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 为探究黄芩属药用植物叶绿体基因组密码子的使用偏好性及其影响因素,为黄芩属药用植物遗传育种、资源保护等研究提供理论依据.方法 从美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中下载了16种黄芩属药用植物的叶绿体基因组,使用Codon W 1...

            【关键词】 黄芩属药用植物叶绿体基因组

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            【中文期刊】 陈秋霞  马志国  等 《中国药学杂志》 2025年60卷10期 1033-1038页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 应用DNA条形码对竹茹及其混伪品进行准确鉴定,保证临床用药安全性和有效性,为含竹茹药物的研发与质量评价提供参考.方法 以基原准确的竹子样本为参照,在筛选通用条形码的基础上,寻找其叶绿体基因组的变异区域或位点,设计特异性DNA条形码序列...

            【关键词】 竹茹DNA条形码叶绿体基因

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            【中文期刊】 赵艳林  陈渊  等 《中草药》 2025年56卷5期 1731-1746页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以药用植物宽叶十万错Asystasia gangetica为研究对象,解析其叶绿体基因组结构特征,探究宽叶十万错在爵床族中的系统发育关系;方法 利用Illumina NovaSeq 6000测序平台对宽叶十万错叶绿体基因组进行测序,对...

            【关键词】 宽叶十万错叶绿体基因组密码子偏好性

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            【中文期刊】 李斌  苏香萍  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 240-254页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]探究玄参科(Scrophulariaceae)叶绿体基因组(chloroplast DNA,cpDNA)的特征及其系统发育关系.[方法]对湖北玄参进行DNA测序,通过组装与注释获得了其叶绿体基因组序列,并从GenBank下载46条玄...

            【关键词】 玄参科叶绿体基因组序列特征

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            【中文期刊】 刘佳升  周丽娜  等 《中草药》 2025年56卷10期 3637-3650页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 解析各5个产地的小构树Broussonetia monoica和藤构Broussonetia kaempferi的叶绿体基因组序列特征与系统进化关系.方法 基于深圳华大BGISEQ-500测序平台,对各5个产地的小构树和藤构个体进行高...

            【关键词】 小构树藤构叶绿体基因组

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            【中文期刊】 马海霞  张亚颖  等 《中草药》 2024年55卷17期 5972-5981页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 研究角蒿属Incarvillea Juss.药用植物叶绿体基因组特征、变异程度及系统发育关系,为角蒿属物种分子鉴定、系统发育及药用植物资源保护等研究提供参考.方法 以5种角蒿属药用植物为研究对象,通过高通量测序获取密生波罗花叶绿体基因...

            【关键词】 角蒿属密生波罗花两头毛

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            【中文期刊】 张晶晶  袁庆  等 《中草药》 2024年55卷9期 3085-3097页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 揭示忍冬属囊管组16种植物叶绿体基因组特征及系统发育关系.方法 以16种囊管组植物为研究材料,利用CodonW、EMBOSS、Excel等软件分析其叶绿体基因组密码子使用偏好性;利用IRscope、mVISTA、DNAsp进行叶绿体基...

            【关键词】 忍冬属囊管组叶绿体基因组

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            【中文期刊】 徐荣  宋文政  等 《中草药》 2024年55卷20期 7093-7100页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 分析药用植物富民枳Poncirus polyandra叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素.方法 以富民枳叶绿体基因组53个蛋白编码基因为材料,利用CodonW软件、CUSP在线程序和R语言等整理并分析基因密码子使用偏性参...

            【关键词】 富民枳叶绿体基因组密码子偏好性

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            【中文期刊】 余鑫莲  李新  《基因组学与应用生物学》 2024年43卷5期 788-802页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 野生六棱大麦(Hordeum agriocrithon)广泛分布在青藏高原上,被认为是六棱栽培大麦的野生祖先.为揭示野生六棱大麦叶绿体基因组(chloroplast DNA,cpDNA)结构特征和系统发育关系,利用Illumina Hise...

            【关键词】 野生六棱大麦叶绿体基因组重复序列

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            【中文期刊】 房振西  季倩  等 《药学学报》 2024年59卷5期 1484-1493页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 白鼠尾草(Salvia apiana Jepson)是唇形科鼠尾草属多年生亚灌木植物,具有悠久的药用历史.本研究采用PacBio HiFi三代测序技术对白鼠尾草叶绿体基因组进行了测序,完成了物理图谱绘制,对其基因组序列结构特征、密码子偏好性...

            【关键词】 白鼠尾草叶绿体基因组序列特征

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            【中文期刊】 代国娜  尚明越  等 《中草药》 2024年55卷11期 3835-3844页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探究百合属Lilium药用植物叶绿体基因组密码子使用偏性及影响因素,为百合属药用植物育种提供理论参考.方法 使用CodonW1.4.2、CUSP、SPSS等软件分析9种百合属药用植物的密码子偏好性.结果 9种百合属植物密码子不同位点的...

            【关键词】 百合属叶绿体基因组密码子偏好性

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            【中文期刊】 向妮艳  陈喜棠  等 《植物科学学报》 2024年42卷4期 423-430页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 报道了在中国吉林省延边市发现的虎耳草科金腰属一中国新记录种——宽卵叶金腰(Chrysosplenium fallax Koldaeva).该物种是2021年发表的新物种,原产于俄罗斯远东地区,本次在中国为首次发现.本文结合野外考察和标本研究...

            【关键词】 宽卵叶金腰金腰属新记录

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            【中文期刊】 尹明华  范馨月  等 《中草药》 2024年55卷21期 7444-7461页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 解析广丰千金薯Dioscorea opposite叶绿体基因组信息序列特征和确定其在薯蓣属的系统位置.方法 利用高通量测序技术对广丰千金薯叶片进行核基因组重测序,并利用生物信息学相关工具对组装得到的叶绿体基因组进行注释、序列特征和系统...

            【关键词】 广丰千金薯叶绿体基因组序列特征

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            【中文期刊】 刘珊瑚  张志飞  等 《药学学报》 2024年59卷7期 2171-2178页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 刺五加Acanthopanax senticosus(Rupr.et Maxim.)Harms是我国东北道地药材之一,本研究根据之前的叶绿体基因组测序结果,选取atpI和atpB_rbcL基因片段对市售刺五加样品进行种质资源鉴定,并利用HP...

            【关键词】 刺五加DNA条形码分子鉴定

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            【中文期刊】 李昕娟  刘丽娥  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷5期 767-787页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 沙棘属(Hippophae)植物具有丰富的经济价值和生态价值,但对于沙棘属植物的分类和系统发育研究还存在不足和争论.本研究基于西藏沙棘(Hippophae tibetana)和肋果沙棘(Hippophae neurocarpa)的叶绿体基因...

            【关键词】 西藏沙棘肋果沙棘叶绿体基因组

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            【中文期刊】 柏国清  卢元  等 《药学学报》 2023年58卷5期 1364-1371页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 本研究通过Illumina高通量测序技术对细辛属药用植物尾花细辛(Asarum caudigerum Hance)和花叶细辛(A.cardiophyllum Franchet)进行了叶绿体基因组测序,利用生物信息学分析方法进行组装、注释和结...

            【关键词】 细辛属尾花细辛花叶细辛

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            【中文期刊】 严卓彦  夏瑛瑛  等 《现代中药研究与实践》 2023年37卷2期 23-27页ISTICCA

            【摘要】 目的 研究海风藤原植物风藤和山蒟的分子鉴定方法.方法 提取31份来自全国各地药材植物及不同医药企业生产饮片的基因组,对psbA-trnH、matK、petA-psbJ等叶绿体基因片段以及核糖体间隔序列ITS进行PCR扩增测序及进化树构建.从...

            【关键词】 风藤山蒟DNA条形码

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            【中文期刊】 刘亚男  华中一  等 《中国实验方剂学杂志》 2022年28卷17期 133-139页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:冷背药材作为宝贵的药材资源,但因其本身的特殊性和复杂性,导致其鉴别成为中药鉴定中的难题,因此亟需建立冷背药材的鉴别方法.该研究利用DNA特征序列(DSS)标记,建立一种冷背药材木槿皮基原植物木槿及其混伪品的特异性聚合酶链式反应(PCR...

            【关键词】 DNA特征序列标记木槿皮混伪品

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            【中文期刊】 郑长远  苏旭  等 《药学学报》 2022年57卷7期 2224-2233页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 葵花大蓟(Cirsium souliei)是菊科(Compositae)、蓟属(Cirsium)的一种多年生药用草本植物,具有重要的药用和生态价值.基于高通量测序技术,本研究通过对葵花大蓟的叶绿体基因组测序、组装、注释和特征分析,结果发现葵...

            【关键词】 叶绿体基因组系统发育简单重复序列

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            【中文期刊】 刘志浩  陈梓媛  等 《中国实验方剂学杂志》 2022年28卷17期 127-132页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于特异性聚合酶链式反应(PCR)建立了一种中亚苦蒿药材的鉴别方法,可以准确、便捷地鉴别中亚苦蒿及其近缘种.方法:利用Chloroplast Genome Information Resource(CGIR)数据库查找中亚苦蒿及其近源...

            【关键词】 蒿属中亚苦蒿聚合酶链式反应

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            【中文期刊】 杨小英  刘畅  等 《药学学报》 2022年57卷10期 3229-3239页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 八角枫为八角枫科Alangiaceae八角枫属Alangium常用药用植物,是贵州特色苗药之一,该属植物分化强烈、形态变异复杂,各药材活性成分和药效存在显著差异.本文利用Illumina高通量测序技术对八角枫亚种(稀花八角枫、伏毛八角枫)和...

            【关键词】 八角枫亚种叶绿体基因组

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            【中文期刊】 邓港  吴田泽  等 《药学学报》 2022年57卷10期 3240-3253页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 红花龙胆(Gentiana rhodantha)为特色苗族药材,在治疗湿热黄疸、小便不利、肺热咳嗽等方面具有显著疗效,但在物种进化关系及分类鉴定方面存在争议.本研究对红花龙胆叶绿体基因组进行了二代、三代测序,并分析其结构特点及适应性进化分析...

            【关键词】 红花龙胆叶绿体基因组系统发育

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            【中文期刊】 陈梓媛  赵玉洋  等 《中国实验方剂学杂志》 2022年28卷17期 106-112页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:建立一种同时鉴别九里香药材两基原九里香Murraya exotica和千里香M.paniculata的DNA分子鉴别方法.方法:通过比较九里香、千里香的叶绿体基因组序列差异,根据叶绿体基因组上的单核苷酸多态性(SNP)变异位点分别设计...

            【关键词】 九里香千里香多重位点特异性聚合酶链式反应(PCR)

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            【中文期刊】 蒋礼玲  王琳超  等 《应用与环境生物学报》 2022年28卷5期 1255-1261页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 高等植物的叶绿体基因组主要遗传自母本,具有基因组小、结构简单、序列高度保守等特点.利用系统的生物信息学方法,对4种藜属植物的叶绿体基因组进行编码基因组成、基因组结构、重复序列、变异位点在内的比较基因组学研究,以及基于叶绿体基因组序列的藜亚科...

            【关键词】 藜属叶绿体基因组变异位点

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            【中文期刊】 张明英  张雨曲  等 《药学学报》 2021年56卷2期 618-629页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 柴胡属(Bupleurum L.)是伞形科(Apiaceae)中具有重要经济价值的药用类群.本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台测序获得北柴胡(B.chinense DC.)和紫花阔叶柴胡(B.boissieuanum H...

            【关键词】 柴胡属叶绿体基因组简单重复序列

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            【中文期刊】 原晓龙  陈伟  等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷3期 1278-1283页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 密码子偏好性(codon usage bias)是指同义密码子的使用频率不同的现象,该现象广泛存在于植物中.本研究利用Codon W 1.4.2和CUSP软件分析思茅松(Pinus kesiya var.langbianensis)叶绿体基...

            【关键词】 思茅松叶绿体基因组密码子偏好性

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            【中文期刊】 蔡苗苗  刘梦云  等 《中药新药与临床药理》 2021年32卷5期 709-715页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以来自道地药材产区规范化种植基地的巴戟天叶绿体基因组为参考,通过对比不同产地巴戟天叶绿体基因组的碱基变异和遗传距离的差异,探讨巴戟天药材的道地性.方法 利用Illumina Hiseq 2500测序平台进行高通量测序,利用CMA V1...

            【关键词】 巴戟天产地道地性

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            【中文期刊】 陈玉凯  杨勇  等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷1期 365-374页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 了解濒危植物坡垒(Hopea hainanensis)的叶绿体基因组结构,对揭示龙脑香科植物的系统进化关系具有重要意义.本研究通过高通量测序技术对坡垒叶绿体基因组的结构特征及与其近缘种的系统进化关系进行了分析.结果 表明:坡垒叶绿体基因组具...

            【关键词】 濒危植物坡垒叶绿体基因组

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            【中文期刊】 董博然  赵志礼  等 《药学学报》 2021年56卷9期 2584-2591页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 藏药"解吉"为多来源品种之一,基原涉及龙胆科龙胆属(Gentiana)秦艽组(Sect.Cruciata)长梗秦艽Gentiana waltonii Burk.及全萼秦艽Gentiana lhassica Burk.等多种植物.在课题组前期...

            【关键词】 藏药长梗秦艽全萼秦艽

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            【中文期刊】 杨嘉鹏  朱紫乐  等 《药学学报》 2020年55卷11期 2736-2745页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 石豆兰属(Bulbophyllum)植物具有极高的观赏和药用价值,然而有关其系统发育关系和物种鉴定仍缺乏研究.因此,本研究对石豆兰属3种药用植物(赤唇石豆兰、长足石豆兰、富宁卷瓣兰)的叶绿体基因组进行了测序分析,并以此为基础开展了相应研究....

            【关键词】 石豆兰属叶绿体基因组系统发育关系

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            【中文期刊】 张明英  王西芳  等 《药学学报》 2020年55卷1期 168-176页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 本研究利用Illumina HiSeqX Ten测序平台对芍药属药用植物美丽芍药进行了叶绿体全基因组测序,通过生物信息学分析方法进行序列组装、注释和特征解析,并将其与芍药属其他11种植物的叶绿体全基因组进行了比较基因组学和系统发育分析.结果...

            【关键词】 芍药属美丽芍药叶绿体基因组

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            【中文期刊】 武立伟  崔英贤  等 《药学学报》 2020年55卷5期 1056-1066页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 细茎石斛是药用石斛的重要来源,也是正品枫斗的主要来源之一.本研究利用Illumina高通量测序技术对细茎石斛叶绿体全基因组进行测序,完成了其物理图谱绘制和基因组结构特征解析,并与近缘物种进行了比较和系统发育分析.细茎石斛叶绿体基因组全长为1...

            【关键词】 细茎石斛叶绿体基因组细茎石斛复合种

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