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            【中文期刊】 杨振华  《河北北方学院学报(自然科学版)》 2025年41卷1期 30-36页

            【摘要】 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据.为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要.综述了 4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布...

            【关键词】 非比对算法基因组序列k-mer特征集合

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            【中文期刊】 潘颖佳  夏思杨  等 《合成生物学》 2023年4卷1期 225-240页

            【摘要】 酿酒酵母是工业生物技术最常用的底盘细胞之一,被广泛应用于生物基化学品和高附加值产品的大规模生产.鉴于生物体系代谢和调控网络的复杂性,由多基因协同控制的复杂生理性状的改造通常需要采取全基因组进化来实现.为实现酿酒酵母基因组的快速进化,本研究采...

            【关键词】 基因增变器酿酒酵母基因组连续进化

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            【中文期刊】 贾荣荣  汪祥斌  等 《华南农业大学学报》 2023年44卷3期 382-390页

            【摘要】 [目的]分析广东省牛流行热病毒(Bovine ephemeral fever virus,BEFV)分离株JM 2020 与其他地区毒株的进化关系,阐明遗传进化与全基因组的特征,为中国乃至世界对牛流行热疾病的流行情况以及预防该疾病提供有用信...

            【关键词】 牛流行热病毒G基因进化分析

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            【中文期刊】 贾鑫淼  肖盟  等 《协和医学杂志》 2019年10卷5期 505-513页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 格特隐球菌属于新生隐球菌复合体,既往被认为是新生隐球菌复合体的变种,但最终被确立为独立的物种.与新生隐球菌不同,格特隐球菌多感染免疫力正常人群,目前致病机制尚未明确.格特隐球菌的基因组学研究不仅可全面了解其基因组成、分子进化、毒力因子以及致...

            【关键词】 格特隐球菌基因组比较基因组

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            【中文期刊】 刁现民  Damon Lisch  《遗传学报》 2006年33卷6期 477-487页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Mutator(Mu)转座子是植物中已发现的转座最活跃的转座子,其高的转座频率及趋向于单拷贝功能基因转座的特性,使该转座子成为玉米功能基因克隆的主要方法.Mu转座子的同源类似因子广泛存在于被子植物基因组中,而且同一基因组中往往具有多种变异类...

            【关键词】 Mutator 转座子基因组进化MuLE

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            【中文期刊】 刘爱华  王建波  等 《植物分类学报》 2003年41卷6期 520-530页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 多倍化是促进高等植物发生进化的重要力量。为了更清楚地了解多倍体在形成之后其基因组是如何进化的,利用38个随机引物对芸薹属Brassica L.禹氏三角(U'Triangle)中的多倍体物种及其祖先二倍体物种进行了研究。根据扩增出的273条带...

            【关键词】 芸薹属多倍体基因组进化

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            【中文期刊】 张婧  张毅波  等 《环境昆虫学报》 2017年39卷2期 431-443页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 Rickettsia隶属于变形菌纲Proteobacteria的α亚群立克次体科Rickeusiaceae革兰氏阴性菌,是形态多样的次生真核细胞内共生菌.Rickettsia的功能是多样的,在一些宿主中为营养共生菌,在另一些宿主中为生殖调控...

            【关键词】 Rickettsia传播分布

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            【中文期刊】 郭稳杰  俞小牧  等 《水生生物学报》 2014年4期 664-668页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 利用简并引物SoxN和Sox9在鳙基因组DNA中进行PCR扩增和产物克隆测序,并对序列进行同源性比较和系统进化分析。结果表明本文鉴定出鳙15个Sox基因HMG盒序列,分别属于 SoxB、SoxC和 SoxE组,依据斑马鱼同源基因将其分别命名...

            【关键词】 Sox基因基因组加倍

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            【中文期刊】 董长征  《遗传》 2011年33卷3期 189-197页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 流感病毒先后造成了1918、1957、1968和2009年等多次全球性大流感,对人类的生命健康和社会生活形成了巨大的威胁.流感病毒的基因组进化研究为揭示病毒致病机理、疫情监测、准备疫苗和研发抗病毒药物提供了巨大的帮助.文章以流感病毒基因组进...

            【关键词】 流感病毒大流感基因组进化

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            【中文期刊】 王雪峰  姜成刚  等 《病毒学报》 2008年24卷6期 443-450页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 为阐明马传染性贫血白细胞弱毒疫苗株(EIAVDLV)的致弱和免疫保护机理,对EIAVDLV121及其亲本驴强毒株(E1AVDV117)前病毒全基因组序列进行了测定,并结合准种理论,分析了EIAV疫苗致弱过程中基因组进化特点.利用LA-PCR...

            【关键词】 马传染性贫血病毒弱毒疫苗株前病毒

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            【中文期刊】 李志江  李海权  等 《遗传》 2008年30卷9期 1108-1114页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 基因水平转移是不同物种之间或细胞器间基因的交流.基因水平转移现象在原核生物中普遍存在,在真核生物中近年来也发现了众多例证,说明水平转移是生物界的普遍现象.文章着重对基因水平转移的概念、评判基因水平转移的标准,水平转移的特点和转移方式,以及基...

            【关键词】 基因水平转移基因组进化

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            【中文期刊】 陈玲玲  彭贵子  等 《遗传》 2006年28卷5期 631-638页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 在漫长的进化历史中,各物种间和物种内基因组的差异是如何形成、积累乃至保留下来的,不仅是进化生物学中需要解决的核心问题,也是整个生命科学面临的基本问题之一.对该问题的探求必然要通过对突变的深入了解,因为突变不仅是基因组进化的重要驱动力,还是基...

            【关键词】 碱基突变插入/缺失突变基因组

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            【中文期刊】 杨俊宝  彭正松  《遗传》 2005年27卷2期 335-342页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 表观遗传现象是指基因表达发生改变但不涉及DNA序列的变化,它存在于许多植物的多倍体化过程中,而且能够在代与代之间传递.表观遗传变异包括基因沉默、DNA甲基化、核仁显性、休眠转座子激活和基因组印记等方面.这种现象可能是由于基因组间的相互作用直...

            【关键词】 表观遗传基因沉默DNA甲基化

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            【中文期刊】 周冬生  韩延平  等 《解放军医学杂志》 2004年29卷3期 204-210页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系.方法对36株鼠疫耶尔森菌和7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析,鉴定差异区段(DFR),并对260株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证,分析各DFR在这些鼠疫耶...

            【关键词】 耶尔森氏菌,鼠疫DNA芯片基因组进化

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            【中文期刊】 杨瑞馥  黄培堂  《解放军医学杂志》 2004年29卷3期 189-191页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 鼠疫菌是鼠疫的病原体,曾经引起3次世界范围的鼠疫大流行.从基因组角度认识鼠疫菌在不同疫源地的演化对鼠疫的检验、鉴定和防治具有重要意义.本文论述了目前对鼠疫菌基因组进化的认识,并讨论了这些研究成果的实际意义.

            【关键词】 耶尔森氏菌,鼠疫基因组进化

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            【中文期刊】 周冬生  杨瑞馥  《微生物学杂志》 2004年24卷1期 34-41页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 论述了细菌基因组进化的 4 个分子策略:点突变,基因组内重排,基因水平转移,基因缺失.从经典的达尔文进化论角度探讨了细菌基因组进化与表型进化的关系.

            【关键词】 细菌基因组进化表型进化

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            【中文期刊】 朱孝先  杨镇  等 《生物信息学》 2016年14卷4期 195-202页ISTIC

            【摘要】 基因组序列k-mer的非随机使用规律及包含的生物学意义一直是人们关注的问题,目前还没有根本性进展。本文以七个物种的全部基因序列为样本,得到各物种基因组序列的8-mer频谱分布。发现狗和牛的频谱有三个峰,而斑马鱼、青鳉鱼、秀丽线虫和酿酒酵母的...

            【关键词】 基因组序列8-mer频谱CG二核苷分类

            浏览:143 被引:5 下载:4
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            【中文期刊】 王芳平  王志坚  等 《生物信息学》 2011年09卷1期 88-92页ISTIC

            【摘要】 以密码对使用偏好性和密码对中二核苷酸频率分别构建了系统发育树.发现用 40 种模式生物编码序列中密码对的二核苷酸频率构建的系统发育树,明显将生物按进化分成细菌,古菌,真核生物;用密码对使用偏好性指标构建的系统发育树与基于密码对中二核苷酸频率...

            【关键词】 密码对使用基因组进化系统发育树

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            【中文期刊】 唐萍  彭程  《生物学通报》 2010年45卷6期 8-10页ISTICCA

            【摘要】 叶绿体是植物细胞重要的细胞器,叶绿体基因组被广泛用于系统进化的研究.对叶绿体基因组进化的速度和方式进行了介绍,并对造成其特异的点突变的原因进行了一定的分析.

            【关键词】 叶绿体基因组核苷酸替代进化

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            【中文期刊】 王芳平  李宏  等 《生物信息学》 2009年7卷2期 150-154,158页ISTIC

            【摘要】 以5种真核、15种细菌、10种古菌生物基因组为样本,对密码对使用偏好性指标r与密码对随基因组进化的指标α之间作线性分析,发现部分密码对的r值与α之间有显著的线性关系;密码子第三位点与紧邻密码子第一位点的双碱基(cP3cA1)使用与基因组进化...

            【关键词】 密码对基因组进化线性回归

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            【中文期刊】 王芳平  李宏  《生物物理学报》 2007年23卷3期 176-184页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布,验证了这种分布符合г(α,β)分布.发现分布形状参数α值与生物基因组进化存在明显的相关性;编码序列与基因间序列的进化...

            【关键词】 基因组进化密码对三联体对

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            【中文期刊】 冯立芹  李宏  《生物物理学报》 2004年20卷5期 375-381页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(open reading frame,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性.用各种分布模型进行拟合比较,结果显示每种生物的这类分布均符合Г(α,β)分布...

            【关键词】 基因组ORFГ(α,β)分布

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            【中文期刊】 周光金  余龙  等 《生命科学》 2004年16卷4期 210-214,230页ISTICCSCD

            【摘要】 假基因是基因组上与编码基因序列非常相似的非功能性基因组DNA拷贝,一般情况都不被转录,且没有明确生理意义.假基因根据其来源可分为复制假基因和已加工假基因.迄今为止,明确鉴定的人类假基因多为已加工假基因,有8 000个之多.在Swiss-Pr...

            【关键词】 已加工假基因复制假基因基因组

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            【中文期刊】 赵云蛟  钱爱东  《动物医学进展》 2009年30卷11期 83-86页

            【摘要】 狂犬病病毒基因进化研究能够揭示病毒流行病学特点和规律,为有效防控狂犬病提供科学依据.狂犬病病毒基因组5个基因中,目前对N基因和G基因研究比较多,N基因序列分析可用于基因分型,G基因序列分析可用于病毒免疫原性、毒力、宿主转换等相关研究.多株狂...

            【关键词】 狂犬病病毒基因组进化

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            【中文期刊】 袁志辉  《湖南科技学院学报》 2008年29卷12期 77-81页

            【摘要】 整合子是一个能够通过自身编码的整合酶来获取保外游离基因或基因片段并使之表达的遗传元件系统.根据整合子整合酶基因及其所捕获的基因盒功能的不同,整合子有两大类:抗性整合子和超级整合子.基因盒是能被整合酶整合到整合子上或是从整合子上切除的移动元件...

            【关键词】 整合子基因盒抗生素抗性

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            【中文期刊】 袁红雨  李恒  《信阳师范学院学报(自然科学版)》 2000年13卷2期 245-248页

            【摘要】 哺乳动物基因组中整合了大量反转录转座子.根据它们的结构特点和起源,对反转录转座子的分类、扩增途径和扩增酶学进行了探讨,提出了反转录转座子本身的进化方向及其在基因组进化中的作用.依据原祖7SLRNA演化为人类Alu家族的过程,讨论了Alu序列...

            【关键词】 基因组反转录转座子进化

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            【中文期刊】 宛宝山  张秋芬  等 《生物化学与生物物理进展》 2012年39卷7期 595-604页SCIISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 在后基因组时代,特别是在新的测序理论和设备大发展的背景下,一些重大传染性致病微生物基因组序列正在被逐一测定,并且随后的基因功能注释,蛋白质三维结构重建等工作也正在开展,以期对致病微生物的生物学特性、诊断策略和治疗方法等有突破性的认识.作为对...

            【关键词】 结核分枝杆菌基因组比较基因组

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            【中文期刊】 杨慧萍  潘明  等 《国际病毒学杂志》 2018年25卷3期 154-158页ISTICPKU

            【摘要】 目的 了解2014—2016年四川省B型流感病毒的流行特点,明确流行株与国际疫苗株的匹配情况及流感病毒全基因组进化特征.方法 选取2014—2016年四川省分离的29株B型流感病毒,全基因组测序后完成序列拼接,采用Bioedit、MEGA5...

            【关键词】 流感病毒B型基因组关联研究血凝素

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            【中文期刊】 刘雨菁  吴清华  等 《现代预防医学》 2017年44卷12期 2264-2271页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 通过构建寨卡病毒基因进化树以及比较氨基酸序列差异,了解寨卡病毒进化及基因变异情况.方法 从GenBank获取1947年后各来源、各地区的寨卡病毒全基因组序列以及氨基酸序列,构建进化树并对氨基酸序列进行比较与分析.结果 寨卡病毒非洲型与...

            【关键词】 寨卡病毒基因组进化分析

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            【中文期刊】 杨婷婷  柴青  等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2014年4期 269-277页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 目的:了解2006-2011年间青岛地区流行的B型流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2006-2011年间青岛地区分离的B型流感病毒,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应( RT-PCR)扩增各基因片段,并进行序列测定;Sequench...

            【关键词】 流感病毒B型基因组抗原变异

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            【中文期刊】 陶玲  李慧君  等 《新乡医学院学报》 2017年34卷9期 779-785页ISTICCA

            【摘要】 2013年3月至今,我国多个省市地区发生了人感染H7N9禽流感疫情并引起较高的病死率,而从2016年秋季开始的第5波疫情显得尤为严重,这使得人感染H7 N9禽流感作为严重危害我国人民健康的重大急性传染性呼吸道疾病而备受关注.本文综述了近年来...

            【关键词】 H7N9禽流感病毒基因组进化

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            【中文期刊】 方馨  周玉洁  《国际遗传学杂志》 2017年40卷5期 261-267页ISTICCA

            【摘要】 目的 分析保守序列CTAG在S.typhimurium DT 104的含量及分布情况,比较4个主要插入片段之间的相对进化时间规律,探究在所有沙门菌全基因组中CTAG所反映出的进化关系.方法 统计S.typhimurium DT104菌株4个...

            【关键词】 沙门菌CTAG插入片段

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            【中文期刊】 杨培灿  韩学凯  等 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷2期 144-156页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 墨脱新光唇鱼(Neolissochilushexagonolepis)属于雅鲁藏布江下游特有土著鱼类,具备良好的产业化开发前景.本研究测定了墨脱新光唇鱼的线粒体基因组全序列,并对其进行系统发育分析.结果表明:墨脱新光唇鱼线粒体基因组的大小为...

            【关键词】 墨脱新光唇鱼线粒体基因组序列分析

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            【中文期刊】 晏曼琳  赵权宇  《生物学杂志》 2025年42卷3期 87-93页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 面向碳中和等重大战略需求,微藻细胞工厂将提供可持续的解决方案.针对微藻细胞工厂在高附加值产品生产、环境修复和生物燃料合成中存在的一些瓶颈问题,需要构建能快速生长、环境耐受性强、目标产物含量高的藻株.系统介绍适应性实验室进化、随机诱变、基因组...

            【关键词】 微藻诱变基因组重排

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            【中文期刊】 杨明寰  王齐  等 《昆虫学报》 2025年68卷1期 36-48页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]离子型受体(ionotropic receptors,IRs)在昆虫的嗅觉、味觉、温度和湿度感受等方面起到重要的作用.本研究结合转录组数据在全基因组水平上对橘小实蝇 Bactrocera dorsalis离子型受体基因家族进行鉴定,...

            【关键词】 橘小实蝇离子型受体基因组鉴定

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            【中文期刊】 曾宇灵  朱明玉  等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷1期 84-97页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 为深入探究药用阴地蕨属植物的系统发育关系、分子鉴定方法和光合作用关键酶RuBisCO的进化规律,采集阴地蕨(Botrychium ternatum(Thunb.)Sw.)和蕨萁(Botrychium virginianum(L.)Sw...

            【关键词】 RuBisCO酶阴地蕨属叶绿体基因组

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            【中文期刊】 张祖铭  周豪  等 《遗传》 2025年47卷6期 681-693页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)是引发烈性传染病炭疽的病原体,也是一种典型生物战剂,主要感染牛、羊等牲畜以及人类,对畜牧业造成严重经济损失,威胁人类社会安全.深入了解该物种遗传多样性和进化推动力,是研究致病机制、开展炭疽...

            【关键词】 炭疽芽孢杆菌基因组测序遗传变异

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            【中文期刊】 杨瑾冬  房振西  等 《药学实践与服务》 2025年43卷6期 275-282页ISTIC

            【摘要】 丹参为唇形科鼠尾草属植物,是中医临床治疗心脑血管疾病的常用药物之一.叶绿体是植物细胞中由双层膜构成的含有叶绿素并能进行光合作用的一类细胞器.叶绿体基因组的结构信息,是实现外援基因精准导入、插入位点选择和叶绿体基因组改造的基础.该研究对丹参及...

            【关键词】 丹参鼠尾草叶绿体基因组

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            【中文期刊】 章益蜻  刘高雯  《合成生物学》 2025年6卷3期 685-700页

            【摘要】 合成生物学作为一门通过设计、构建和改造生物系统来实现其特定功能的学科,被广泛应用于生物制造、环境保护和药物合成等领域.基因功能的系统性探索和工程菌株文库的构建是推动合成生物学发展的重要手段.本文重点介绍了不同酵母文库在合成生物学中的构建方法...

            【关键词】 酵母文库功能基因组

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            【中文期刊】 张娟  任鹏飞  等 《中国预防兽医学报》 2025年47卷1期 96-101页

            【摘要】 为了解山西地区鸽圆环病毒(PiCV)的遗传演化特征,本研究从山西太原、晋中等地区鸽养殖场采集10份疑似感染PiCV的病料样品经常规处理后进行Cap基因的PCR检测.结果显示,从10份病料样品中检测到1份PiCV阳性样品,将鉴定的PiCV命名...

            【关键词】 鸽圆环病毒基因组遗传进化分析

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