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【中文期刊】 谷思雨 陈凯 等 《水生生物学报》 2024年48卷8期 1443-1458页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 水生态系统是保障国家生态安全的重要基础.水生生物在水生态系统中扮演着核心角色,是研究水体演变的重要依据,是维护水生态健康的关键.传统水生生物调查和监测通常采用形态学方法,但其存在专业知识要求高、难以标准化和自动化及费时耗力等缺陷.环境DNA...
【中文期刊】 梁羽 吴薇 《遗传》 2024年46卷10期 779-794页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 近十几年来,随着高通量测序技术的不断发展,越来越多针对不同类型DNA损伤的测序检测方法被开发并应用于相关研究.这些技术的发展不仅帮助解析不同损伤类型对应修复途径的动态调控过程,揭示关键作用因子及功能,发现新脆性热点,更极大促进了人们对于诸如...
【中文期刊】 罗晗睿 王罗云 等 《西北植物学报》 2024年44卷6期 891-903页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]探索胡颓子科叶绿体基因组演化趋势,为胡颓子科植物物种鉴定以及资源开发利用提供理论依据.[方法]该研究从头组装并注释了沙棘属和野牛果属共4个类群的叶绿体基因组,结合已发表的叶绿体基因组序列,比较了胡颓子科各类群叶绿体基因组的基因构成、...
【中文期刊】 高鑫祯 唐露 等 《广西植物》 2024年44卷1期 1-14页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 飘带兜兰(Paphiopedilum parishii)分布范围狭窄,仅在中国、缅甸、泰国以及老挝有少量分布.近年来,因生境破坏和人为滥采而导致飘带兜兰野生种群极度缩减.为开发种内多态性的分子标记用于保护生物学研究,该研究对飘带兜兰4个野生...
【中文期刊】 徐子健 江祉依 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 986-996页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在植物的生长、发育和逆境反应中发挥着至关重要的作用.全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)被认为是DNA甲基化研究的"金标准",并且广泛应用于...
【中文期刊】 古再丽努尔·穆萨 马骊 等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷12期 2122-2135页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了解析干旱处理对白菜型油菜生理指标及DNA甲基化水平的影响,本研究对白菜型油菜陇油7号进行正常供水(对照)、干旱胁迫、干旱后复水3个处理,分析不同处理后油菜生理指标及DNA甲基化水平的变化.结果表明,与正常供水相比,当白菜型油菜受到干旱胁...
【中文期刊】 徐斌丰 宋月莹 等 《中国骨与关节杂志》 2024年13卷1期 51-56页 ISTICCA
【摘要】 Knee osteoarthritis is a complex genetic joint disease,and epigenetic factors play an important role in its development....
【中文期刊】 李琳 张泽志 等 《湖北医药学院学报》 2024年43卷3期 247-251页 ISTICCA
【摘要】 目的:通过对虎耳草(Saxifraga stolonifera)进行物种鉴定和基因组大小测定,以更全面地开发其植物资源的遗传信息.方法:通过对虎耳草DNA条形码引物的筛选,发现ITS2+matK条形码可确认待测的植物样本为虎耳草.进一步利用...
【中文期刊】 张丽静 贾彦彦 等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷2期 149-154页 ISTICCA
【摘要】 目的 分析p53和DNA损伤调节基因1(p53 and DNA damage regulated gene 1,PDRG1)在结直肠癌中的表达及其临床意义.方法 检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)...
【关键词】 结直肠癌； p53和DNA损伤调节基因1； 癌症基因组图谱；
【中文期刊】 林亚茹 杨玺 等 《宁夏医科大学学报》 2024年46卷2期 146-152页 ISTIC
【摘要】 目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究SSBP1 基因在肝细胞癌(HCC)组织中的表达情况,并探讨SSBP1 基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性.方法 基于TCGA数据库提取 374 例HCC组织及 50 例正常肝组织中SS...
【关键词】 线粒体单链DNA结合蛋白； 癌症基因组图谱； 肝细胞癌；
【中文期刊】 孟文娜 浦香东 等 《中国现代中药》 2024年26卷10期 1645-1653页 ISTICCA
【摘要】 目的:基于败酱类药材基原植物的叶绿体基因组序列分析开发特定的DNA条形码,准确鉴别败酱草及其近缘种.方法:采用Illumina高通量测序技术对败酱科败酱属植物白花败酱、黄花败酱和异叶败酱的叶绿体基因组进行测序;采用生物信息学软件对基因组进行...
【中文期刊】 何静 王静 等 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2024年43卷6期 462-466页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨染色体拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)诊断1q21.1远端微缺失/微重复综合征合并先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)的临床应用...
【中文期刊】 罗湘胤 游磊 等 《湖北医药学院学报》 2024年43卷1期 13-17页 ISTICCA
【摘要】 目的:鉴定采集到的冷水花属植物样本并测定其基因组大小.方法:用聚合酶链式反应扩增样品的ITS2、rbcL和psbA-trnH序列并测序,通过比对Nr核酸数据库确定物种;以玉米Mo17 为对照,用流式细胞术测定其基因组大小.结果:本研究采集到...
【中文期刊】 纪桢 李晓洲 等 《天津医药》 2024年52卷5期 490-494页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 应用低深度全基因组拷贝数变异分析(CNV-seq)技术研究胚胎染色体异常在复发性流产(RSA)及偶发流产(SA)中的差异.方法 采集158例RSA患者(RSA组)和244例SA患者(SA组)的流产组织进行CNV-seq检测,对可疑染色...
【中文期刊】 张荣 张蕊 等 《中国计划生育学杂志》 2024年32卷11期 2645-2648页 ISTIC
【摘要】 目的:探讨染色体微阵列芯片技术(CMA)、低深度全基因组测序技术(CNV-seq)对引产胎儿DNA异常的诊断价值及病因检出情况.方法:将2021年1月-2023年12月于本院进行引产的150例孕妇作为研究对象,以产前无创基因筛查(NIPT)...
【关键词】 产前诊断； 胎儿DNA异常； 染色体微阵列芯片技术；
【中文期刊】 焦雪丽 张鑫 等 《中华卫生杀虫药械》 2024年30卷4期 354-358页 ISTICCA
【摘要】 目的 在保持褐黄血蜱Haemaphysalis flava寄生蜱虫体形态完整的前提下,综合比较 95℃水浴法、改良碱裂解法、离心柱法 3 种提取方法对蜱组织DNA提取质量的差异,筛选适用于蜱鉴定分型的高效稳定基因组DNA提取方法.方法 取蜱...
【中文期刊】 朱鑫超 陆定其 等 《浙江中医药大学学报》 2024年48卷5期 530-540页 ISTIC
【摘要】 [目的]评价益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的疗效,并通过全基因组甲基化测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术研究中医药疗效...
【中文期刊】 王学英 《罕少疾病杂志》 2024年31卷4期 54-56页
【摘要】 目的 探究乙型肝炎(HBV)前基因组RNA(pgRNA)联合共价闭合环状DNA(cccDNA)对慢性乙型肝炎(CHB)患者抗病毒疗效的预测价值.方法 收集2019年8月至2022年8月期间于本院进行抗病毒治疗的96例CHB患者的临床资料,根...
【中文期刊】 段春燕 王晓凌 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 2024年50卷3期 27-34页
【摘要】 采用Illumina HiSeq X Ten平台测序和生物信息法对唐古特扁桃叶绿体基因组序列特征进行解析.结果表明:唐古特扁桃叶绿体基因组为四分体式结构,完整叶绿体基因组序列全长158 166 bp,G+C含量 36.8%,注释131个基因...
【中文期刊】 陶莹 廖长秀 等 《广州化工》 2024年52卷2期 140-142页
【摘要】 对现有DNA提取试剂盒进行改良,减少DNA提取成本,寻找经济、稳定的提取方法.将96 份血液标本分为A、B两组,各48 份,组内按外周血体积分为250 μL、500 μL、750 μL三组.A组(试剂盒法)采用杭州倍沃医学科技公司的血液基因...
【中文期刊】 牛一凡 李崇阳 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷8期 3436-3445页
【摘要】 旨在通过二代测序技术评估不同单细胞全基因组扩增(single cell whole genome amplification,scWGA)体系对牛微量血液基因组DNA的扩增效果,建立微量DNA全基因组扩增体系.本研究分别采用MDA(mult...
【中文期刊】 陈南珠 李俊良 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷9期 3853-3863页
【摘要】 旨在探讨MKRN3基因在野生型猪和克隆猪中的印记状态及其DNA甲基化水平.本研究利用西方猪种(杜洛克猪)与本地猪种(巴马猪或荣昌猪)中存在的种间单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),检测MK...
【中文期刊】 黎环 林勇 《福建医药杂志》 2024年46卷4期 35-38页 CA
【摘要】 目的 研究血清乙肝病毒前基因组RNA(HBV pgRNA)检测结果与慢性乙型肝炎(CHB)低表面抗原患者不同乙肝病毒的血清学指标之间的相关性.方法 收集福建医科大学孟超肝胆医院慢性乙型肝炎低表面抗原患者共计148例纳入研究.临床样本进行HB...
【中文期刊】 亢春彦 王丹丹 等 《中国老年学杂志》 2023年43卷13期 3118-3122页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库探讨吸烟史肺鳞癌患者的DNA甲基化谱特点.方法 从TCGA数据库下载吸烟史肺鳞癌患者(213 例)及非吸烟史肺鳞癌患者(178 例)的临床数据、甲基化DNA芯片数据,首先分析两组患者总生存(OS)和...
【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)； 肺鳞癌； 吸烟；
【中文期刊】 王新华 杨延昕 等 《中国实验血液学杂志》 2023年31卷3期 746-752页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨一种新的基于血液的、多组学、多维度的疗效评估方法在淋巴瘤患者疗效监测中的作用.方法:抽取患者10 ml外周血,通过cfDNA的低深度全基因组测序来评估基因组拷贝数畸变(CNA)和片段化模式(FS),同时检测一组血浆蛋白标志物(PT...
【中文期刊】 吴欣仪 王蒙 等 《广西植物》 2023年43卷8期 1414-1427页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 物种的遗传多样性是决定物种适应性和生存能力的关键因素.生境片段化是造成生物多样性丧失的重要因素之一,对植物种群的遗传多样性有着重要影响.水角(Hydrocera triflora)作为一种濒危植物,其遗传多样性状况和濒危机制尚未有报道.该文...
【中文期刊】 江婷婷 林彦锋 《安徽医科大学学报》 2023年58卷2期 327-331页 ISTICPKUCA
【摘要】 病原体快速识别是感染性疾病临床诊断的关键环节.基于微生物游离DNA宏基因组测序是目前一种新兴的感染性疾病病原体检测技术,该技术相对无创、快速且可以同时识别多种病原体.本文对微生物游离DNA的特性及其在感染性疾病病原体识别中的应用进展进行了综...
【中文期刊】 江佳佳 杨伊 等 《中国神经精神疾病杂志》 2023年49卷3期 155-159页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 报告1例68岁男性,以头晕、走路不稳起病,起初考虑脑囊虫病,送检脑脊液宏基因组二代测序技术(metagenome next-generation sequencing,mNGS)未检测到脑囊虫,但检测到染色体发生重复改变,表明存在恶性肿瘤D...
【中文期刊】 杨慧娟 陈婷 等 《生物学杂志》 2023年40卷4期 48-53,75页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了解中气门亚目物种线粒体 16S rRNA基因全序列信息及系统发育关系,采用PCR方法对粪堆寄螨(Parasitus fimetorum)的线粒体基因组进行测序,并结合NCBI数据库中中气门亚目多数类群的序列信息.利用生物信息学软件对中气...
【中文期刊】 谢艳莉 赵洪军 等 《中南大学学报（医学版）》 2023年48卷6期 829-836页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析系统性硬化症(systemic sclerosis,SSc)合并肺间质病变(interstitial lung disease,ILD)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,P...
【中文期刊】 陈荟玉 赵素文 《遗传》 2023年45卷10期 887-903页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 噬菌体基因组中存在丰富的碱基修饰,主要用于逃避宿主内切酶的切割.40 多年前,在蓝藻噬菌体S-2L的DNA中,研究者发现 2-氨基腺嘌呤(Z)完全取代腺嘌呤(A),与胸腺嘧啶(T)形成具有三根氢键的互补配对,形成了特殊的 Z 基因组.近年来...
【中文期刊】 王玉龙 《生物学教学》 2023年48卷3期 95-96页 PKU
【摘要】 教师和学生对于"31.6亿个碱基对的人类基因组复制时可能产生多少个错误"的问题有不同答案和理解.通过分析细胞中碱基对数量与基因组中碱基对数量的关系,半保留复制时出现碱基错配情况,以及碱基错配后经过再次复制而稳定传代的过程,得出了31.6亿×...
【中文期刊】 张奕飞 李大伟 等 《神经损伤与功能重建》 2023年18卷3期 154-157页 ISTIC
【摘要】 周围神经损伤反应及影响再生的表观遗传学机制尚未被阐明.本文着眼于表观遗传学调控机制,从DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等方面对周围神经损伤后再生的表观遗传学调控机制进行综述,为优化周围神经损伤后再生的临床治疗提供基础知识.
【中文期刊】 袁瑞 王丽珍 等 《解放军医学院学报》 2023年44卷2期 191-196页 ISTICCA
【摘要】 帕金森病(Parkinson's disease,PD)是第二常见的神经退行性疾病,其病程长、致残率高,且发病机制和病因目前不明确.DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰方式之一,近些年成为PD等神经系统退行性疾病发病机制方面的研究热点.本文从...
【中文期刊】 朱玉青 朱琳 等 《临床检验杂志》 2023年41卷3期 161-166页 ISTICCA
【摘要】 目的 开发并评估一种基于线粒体分离纯化技术的线粒体DNA(mtDNA)深度测序方法.方法 探索从细胞中分离mtDNA的最适条件;基于该方法对外周血单个核细胞(PBMC)样本进行mtDNA深度测序,通过测序片段(reads)中mtDNA re...
【中文期刊】 吕承秀 陈梅 等 《现代检验医学杂志》 2023年38卷5期 133-137,184页 ISTICCA
【摘要】 目的 研究慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者接受核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogues,NAs]治疗下发生低病毒血症(low-level viremia,LLV)的危险因素及机制.方...
【关键词】 慢性乙型肝炎； 低病毒血症； 双链松弛环状脱氧核糖核酸；
【中文期刊】 杜威 李仁燕 等 《癌变.畸变.突变》 2023年35卷4期 320-324页 ISTICCA
【摘要】 细胞染色体非整倍体的出现是导致肿瘤发生发展的重要原因之一,常由细胞周期检查点、DNA损伤修复、染色体分离、核膜重塑等异常调控导致.细胞分裂周期相关因子2(CDCA2)是细胞周期分裂相关基因家族的成员之一.越来越多的文献报道,CDCA2在多种...
【中文期刊】 陈芬兰 程计林 等 《肝脏》 2023年28卷5期 607-611页 ISTIC
【摘要】 慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可导致诸多肝脏问题,共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的存在是造成HBV持续感染、难以清除的主要原因.cccDN...
【中文期刊】 张鑫 肖宇 等 《转化医学杂志》 2023年12卷2期 80-85页 ISTIC
【摘要】 目的 探究抗凝血离心后红细胞样本中基因组DNA(gDNA)的质量及不同处理方式对gDNA产量的影响.方法 血液样本均来自于武汉大学中南医院生物样本库,采用试剂盒分离柱纯化的方式提取冻存4年及未冻存的抗凝血红细胞样本中gDNA,使用Nanod...
【中文期刊】 王慧慧 吴情 等 《口腔疾病防治》 2023年31卷11期 768-773页 ISTIC
【摘要】 目的 寻找非综合征型先天缺牙(non-syndromic tooth agenesis,NSTA)家系的致病基因,探讨其发病机制.方法 获得医院伦理审批及患者与家属知情同意,收集先证者及其家系主要成员的临床资料,采集外周静脉血,提取DNA,...
【关键词】 外胚叶发育不全基因A； 非综合征型先天缺牙； 综合征型先天缺牙；
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