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            【中文期刊】 刘钊  刘睿  等 《精准医学杂志》 2025年40卷1期 60-64页

            【摘要】 目的 筛选和鉴定胃癌预后相关的关键基因和通路,探讨胃癌发生发展的机制.方法 从基因表达数据库中下载胃癌基因表达谱芯片数据集(GSE2685、GSE29272),通过在线分析工具GEO2R对胃癌组织和正常组织中的差异表达基因(DEGs)进行筛...

            【关键词】 胃肿瘤预后COL3A1基因

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            【中文期刊】 郭妮  贾亚春  等 《西安交通大学学报(医学版)》 2024年45卷2期 244-249页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值.方法 利用3个基因表达数据库(gene expre...

            【关键词】 基因表达数据库(GEO)癌症基因组图谱(TCGA)视神经病变诱导反应蛋白(OPTN)

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            【中文期刊】 马玉玉  张丽  等 《新疆医科大学学报》 2024年47卷3期 301-307页ISTICCA

            【摘要】 目的 通过生物信息学分析鉴定肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)与动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)的共表达基因.方法 下载基因表达数据库(Gene expression om-nibus,...

            【关键词】 肝细胞癌动脉粥样硬化生物信息学

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            【中文期刊】 曲艳平  贺文廷  等 《大医生》 2024年9卷5期 41-43页

            【摘要】 目的 基于高通量基因表达(GEO)数据库及生物信息学筛选坐骨神经痛相关差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能,为临床治疗坐骨神经痛提供参考.方法 通过GEO数据库获取坐骨神经痛基因芯片(GSE124272)数据集,经仙桃学术软件异质性分...

            【关键词】 高通量基因表达数据库生物信息学坐骨神经痛

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            【中文期刊】 陈广芳  文昌晖  《西部中医药》 2023年36卷9期 25-34页ISTIC

            【摘要】 目的:通过基因表达数据库(GEO)芯片分析及分子对接方法探讨槲皮素对银屑病外周血中性粒细胞弹性蛋白酶(neutrophil elastase,NE)的分子机制.方法:从公共GEO下载GSE106087芯片数据,筛选差异靶点基因;收集中药系统...

            【关键词】 银屑病基因表达数据库中性粒细胞

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            【中文期刊】 陈慧  陈光辉  等 《检验医学》 2023年38卷3期 276-281页ISTICCA

            【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选妊娠糖尿病(GDM)关键基因,并探讨其诊断价值.方法 从基因表达数据库(GEO)下载与GDM相关的微阵列数据(GSE103552数据集).采用R软件中的"limma"程序包筛选对照组和GDM组差异表达基因,使用R...

            【关键词】 妊娠糖尿病基因表达数据库关键候选基因

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            【中文期刊】 秦浩  方春华  等 《实用肝脏病杂志》 2023年26卷5期 694-697页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能.方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18 水平.应用UALCAN网站研究不同临床和病理...

            【关键词】 肝细胞癌Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因细胞衰老

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            【中文期刊】 王佳敏  初冬美  等 《中国医科大学学报》 2022年51卷10期 865-869页ISTICPKUCABP

            【摘要】 目的 应用基因表达数据库 (GEO) 和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库联合分析硫酸酯酶1 (SULF1) 在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率 (OS) 的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性.方法 从GEO数据库选取...

            【关键词】 基因表达数据库癌症基因组图谱硫酸酯酶1

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            【中文期刊】 范吉林  朱婷婷  等 《吉林大学学报(医学版)》 2022年48卷6期 1535-1545页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:采用生物信息学方法挖掘公共数据库,构建房颤(AF)的内源性RNA(ceRNA)免疫调节网络,了解AF的发生发展机制.方法:从基因表达数据库(GEO)中下载AF患者和健康对照者环状RNA(circRNA)(GSE129409)、微小RN...

            【关键词】 房颤基因表达数据库免疫浸润

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            【中文期刊】 赵格  黎昌学  等 《口腔疾病防治》 2022年30卷1期 27-32页ISTIC

            【摘要】 目的 探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析.方法 通过肿瘤与癌症基因图谱(t...

            【关键词】 口腔鳞状细胞癌微小RNAmiR-135b-5p

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            【中文期刊】 王维  林雷  等 《武警医学院学报》 2011年20卷2期 147-150页ISTICCA

            【摘要】 <篇首> 基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)是美国国立生物技术信息中心(NationalCenter for biotechnology information,NCBI)在2000年7月首次公布的基因表达...

            【关键词】 基因表达基因表达数据库ZFP580

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            【中文期刊】 裴珍珍  张珊  等 《中国糖尿病杂志》 2025年33卷1期 28-35页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探讨程序性细胞死亡(PCD)对DKD发生发展的作用机制.方法 检索基因表达综合数据库,获取数据集GSE30529和GSE30122,分析DKD差异表达基因(DEGs).通过基因集富集分析网站、铁死亡数据库、自噬数据库并结合既往相关文献...

            【关键词】 糖尿病肾脏疾病程序性细胞死亡基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 刘金瑛  马培  等 《中华中医药学刊》 2025年43卷11期 168-171,后插37-后插39页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 通过生物信息学方法筛选与帕金森病(Parkinson's disease,PD)相关的关键基因、功能富集及信号通路.方法 从基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)下载帕金森病芯片数据集GSE762...

            【关键词】 帕金森病基因表达数据库加权基因共表达网络

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            【中文期刊】 石长玉  李勇  等 《吉林大学学报(医学版)》 2025年51卷3期 703-715页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于生物信息学方法分析补体替代途径对小鼠结直肠癌(CRC)肝转移模型的调控作用,并进行实验验证.方法:以"CRC肝转移"为关键词在基因表达综合(GEO)数据库中进行检索,获取GSE81558 GEO数据集,包括正常结肠组织样本、CRC...

            【关键词】 结直肠癌肝转移基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 郭奥奥  周贤  等 《世界中医药》 2025年20卷2期 198-210页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:探讨四土汤中的抗炎活性成分及其作用机制.方法:采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术检测四土汤中的化学成分.利用网络药理学筛选活性成分与核心靶点,预测四土汤抗炎作用机制.运用分子对接技术验证活性成分与核心靶点的...

            【关键词】 四土汤抗炎超高效液相色谱-串联质谱

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            【中文期刊】 郭智  谢意  等 《四川大学学报(医学版)》 2025年56卷1期 41-50页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 通过高通量基因表达数据库(GEO)和网络药理学方法探讨汉黄芩苷对高血压所致肾损伤的潜在治疗作用、靶点及通路,并通过体内外实验验证汉黄芩苷干预对自发性高血压大鼠(spontaneously hypertensive rats,SHR)肾...

            【关键词】 高通量基因表达数据库网络药理学汉黄芩苷

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            【中文期刊】 俞松松  尹京兆  等 《天津医药》 2025年53卷2期 124-128页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 目的 探讨Gli1、Gli2和Gli3基因及蛋白在肝细胞癌(HCC)组织中的表达特征及其与预后的关系.方法利用cBioportal数据库分析315例HCC样本中Gli基因的表达情况,并通过免疫组织化学方法检测40例HCC及其他肝脏组织中Gl...

            【关键词】 肝肿瘤转录因子基因表达

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            【中文期刊】 徐珊珊  严林  等 《癌症进展》 2025年23卷15期 1745-1749页ISTIC

            【摘要】 目的 基于生物信息学分析肿瘤相关成纤维细胞(CAF)的关键基因,筛选对CAF有潜在抑制作用的药物,并分析这些药物的毒性及其作用机制.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载CAF和正常成纤维细胞的基因表达数据,通过R软件limma包获得CA...

            【关键词】 肿瘤相关成纤维细胞基因表达综合数据库BRD-K14340046

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            【中文期刊】 朱宇  蒋宁兰  等 《西部医学》 2025年37卷6期 806-811页ISTIC

            【摘要】 目的 基于GEO数据库探讨银屑平丸改善寻常型银屑病(Ps)患者的分子作用机制.方法 将48只小鼠随机分为正常对照组、银屑病样模型对照组、阿维A药物组、银屑平丸高、中、低剂量组,每组8只.正常对照组使用凡士林涂抹小鼠背部暴露皮肤作对照,其余5...

            【关键词】 银屑病银屑平丸基因表达数据库

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            【中文期刊】 虎亚男  孙中毅  等 《临床内科杂志》 2025年42卷5期 396-400页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨重度急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引发的新型冠状病毒感染(COVID-19)急性肾损伤(AKI)的生物学关联.方法 从基因表达综合数据库(GEO)获取COVID-19和AKI的数据集(GSE171110和G...

            【关键词】 重度急性呼吸综合征冠状病毒2型感染新型冠状病毒感染急性肾损伤

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            【中文期刊】 朱芳丽  马晓莹  等 《安徽医药》 2025年29卷8期 1618-1622,后插8页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于基因表达综合数据库(GEO)分析急性胰腺炎(AP)病人基因表达差异,并进行验证.方法 2023年9-12月从GEO数据库下载基因表达综合系列(GSE)24279基因数据,使用Bioconductor中的Limma包筛选差异表达基因...

            【关键词】 急性胰腺炎差异基因表达基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 陈尚金  钟双泽  等 《安徽医药》 2025年29卷1期 74-78,后插2-后插4页ISTICCA

            【摘要】 目的 探索肾透明细胞癌(ccRCC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值.方法 该研究于2022年11月始通过CEO2R在线分析工具对GEO数据库中的GSE6344和GSE53757进行差异表达基因(DEGs)的筛选并取...

            【关键词】 肾肿瘤差异基因表达基因改变

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            【中文期刊】 邹孟晓  葛树旺  《临床肾脏病杂志》 2025年25卷9期 735-746页ISTIC

            【摘要】 目的 利用生物信息学探究狼疮肾炎(lupus nephritis,LN)中细胞因子-细胞因子受体通路的关键基因,并探讨其在LN中的机制及提供潜在治疗靶点.方法 研究通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GE...

            【关键词】 基因表达综合数据库狼疮肾炎细胞因子-细胞因子受体通路

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            【中文期刊】 曹晓东  项承  《精准医学杂志》 2025年40卷2期 153-157页

            【摘要】 目的 探讨血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶-9(ADAMTS9)对甲状腺癌(thyroid can-cer,THCA)患者预后的影响及其潜在作用机制.方法 从TCGA数据库获取THCA组织中ADAMTS9表达水平及患者临床资料,HP...

            【关键词】 甲状腺肿瘤ADAMTS9蛋白质基因表达

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            【中文期刊】 李晓宇  卢慧敏  等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷4期 448-454页

            【摘要】 目的 采用生物信息学方法筛选下肢深静脉血栓(DVT)相关的差异表达基因(DEG),探讨下肢DVT形成的病理机制.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE48000数据集进行样本分析,样本来源为GSE48000数据集中的132个样本,包括D...

            【关键词】 基因表达综合数据库静脉血栓栓塞差异表达基因

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            【中文期刊】 丁美林  缪春润  等 《临床合理用药》 2025年24期 28-32,封3页

            【摘要】 目的 基于基因表达综合数据库(GEO)基因芯片结合网络药理学及分子对接技术探讨清热通腑化瘀方治疗急性胰腺炎(AP)的作用机制.方法 通过GEO数据库获取AP的芯片数据,通过R语言数据包获得AP差异表达基因,采用加权基因共表达网络分析、蛋白质...

            【关键词】 急性胰腺炎清热通腑化瘀方基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 赵启  杭丽玮  等 《实用检验医师杂志》 2025年17卷2期 110-115页

            【摘要】 目的 研究内蒙古自治区鄂尔多斯市体检人群的肿瘤标志物水平及应用价值.方法 选择2022 年 6 月—2023 年 8 月在鄂尔多斯市东胜区人民医院体检的 11 765 例体检者作为研究对象,其中男性4 262例,女性7 503例;年龄20~...

            【关键词】 肿瘤标志物癌胚抗原糖类抗原

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            【中文期刊】 梅雨婷  周宙  等 《中国现代医生》 2025年63卷30期 20-25,101页

            【摘要】 目的 基于多维度生物信息学技术,系统解析急性低血压的分子病理机制.方法 整合基因表达综合数据库(GSE2401)的基因表达谱,采用limma包(R软件)筛选差异基因,通过数据降维[log2(FC)>1,P<0.05]优化靶点;进一步结合基因...

            【关键词】 急性低血压基因表达综合数据库生物信息学

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            【中文期刊】 邱丽浈  姚雨江  等 《医师在线》 2025年15卷10期 16-19页

            【摘要】 目的 基于人类蛋白质图谱(HPA)和基因表达谱交互式分析(GEPIA)数据库,探讨核呼吸因子1(NRF1)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其临床意义.方法 通过HPA数据库分析NRF1在HCC组织中的mRNA和蛋白表达水平与生存预后的相关...

            【关键词】 肝细胞癌核呼吸因子-1公共数据库

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            【中文期刊】 杨淑贤  孙阿宁  等 《中国临床药理学杂志》 2024年40卷3期 435-439页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于网络药理学、基因表达综合数据库及分子对接技术,预测及初步验证脑安胶囊(NAC)治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制.方法 用中药系统药理学分析平台收集NAC中的活性成分,用基因表达综合数据库筛选疾病相关差异基因.筛选获得两者的共同靶...

            【关键词】 脑安胶囊缺血性脑卒中基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 宋子毅  杨超  等 《华西口腔医学杂志》 2024年42卷4期 444-451页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制.方法 基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾...

            【关键词】 口腔黏膜下纤维化芒果苷基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 梁国新  郭畅  等 《西安交通大学学报(医学版)》 2024年45卷4期 567-574页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 评估miR-30a-5p作为急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)新诊断指标的潜力和潜在的分子机制.方法 下载GEO数据库中AMI相关microRNAs(miRNAs)和mRNA芯片数据集.qR...

            【关键词】 基因表达数据库(GEO)急性心肌梗死(AMI)microRNAs(miRNAs)

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            【中文期刊】 范丽妃  鲁玉辉  等 《中药药理与临床》 2024年40卷7期 20-26页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于基因芯片数据挖掘和网络药理学研究芪归抵挡汤治疗糖尿病肾病(DKD)分子机制.方法:利用相关数据平台,挖掘芪归抵挡汤治疗DKD的活性成分和作用靶点,并进行GO功能和KEGG通路富集分析.最终,通过体内实验验证芪归抵挡汤调控糖尿病肾病...

            【关键词】 芪归抵挡汤糖尿病肾病代谢记忆

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            【中文期刊】 克德尔亚·艾山江  傅怡  等 《上海交通大学学报(医学版)》 2024年44卷1期 1-12页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型.方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas...

            【关键词】 核编码线粒体基因肝细胞癌癌症基因组图谱(TCGA)

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            【中文期刊】 李妮  吴文娟  《东南大学学报(医学版)》 2024年43卷4期 540-547页ISTICCA

            【摘要】 目的:分析热休克蛋白家族 H(Hsp110)成员 1[heat shock protein family H(Hsp110)member 1,HSPH1]在宫颈癌组织中的表达及其与预后的相关性.方法:收集2018年2月至2021年1月首次确...

            【关键词】 热休克相关蛋白宫颈癌预后

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            【中文期刊】 张琳  毛伟  等 《中国药业》 2024年33卷6期 48-55页ISTICCA

            【摘要】 目的 预测类风湿关节炎(RA)生物标志物及RA潜在治疗中药.方法 从GPL96平台的相关数据集中采集33例RA患者(RA组)和 20 例健康者(HC组)的mRNA表达谱,使用limma R包筛选差异表达基因(DEGs),以基因本体论(GO)...

            【关键词】 类风湿关节炎生物标志物CKAP2

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            【中文期刊】 缪涛声  李逸婷  等 《安徽医药》 2024年28卷5期 883-888页ISTICCA

            【摘要】 目的 采用生物信息学和网络药理学分析香参丸对溃疡性结肠炎(UC)的分子机制.方法 2023年1―5月通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集香参丸的有效成分及其相关靶点,利用基因表达综合(GEO)数据库筛选UC相关靶点,将香参丸...

            【关键词】 结肠炎,溃疡性香参丸网络药理学

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            【中文期刊】 卫鑫  吴波  等 《安徽医药》 2024年28卷9期 1801-1805页ISTICCA

            【摘要】 目的 构建基于铜代谢相关基因和临床病理学特征的新型肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型.方法 2022年6月至2023年1月从基因集数据库(MSigDB)5.1版整理出铜代谢相关基因,应用癌症基因组图谱(TCGA)中ccRCC数据对获取的铜代...

            【关键词】 肾透明细胞癌铜代谢基因组

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            【中文期刊】 张宏  展淑琴  《实用临床医药杂志》 2024年28卷19期 22-26,32页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选阿尔茨海默病(AD)的核心基因,并对可能的致病信号通路进行分析.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载AD相关基因芯片数据,筛选出GSE227221和GSE162873数据集.应用GEO2R在线分析软件筛选A...

            【关键词】 阿尔茨海默病生物信息学分析免疫功能紊乱

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            【中文期刊】 马小静  郭志祥  《中国医药导刊》 2024年26卷11期 1149-1154页ISTIC

            【摘要】 目的:通过分析基因表达综合数据库(GEO)中系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血单个核细胞(PBMC)的基因数据集,探索新的能够辅助诊断SLE的生物标志物.方法:从GEO数据库中下载诊断为SLE的患者和健康志愿者的基因芯片数据,筛选出两者差异...

            【关键词】 基因表达综合数据库系统性红斑狼疮差异表达基因

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