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【中文期刊】 李荷莲 水利平 等 《中华医院感染学杂志》 2025年35卷8期 1141-1146页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析在宏基因组二代测序技术(mNGS)检测背景下,非人类免疫缺陷病毒(HIV)感染耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)患者在不同基础疾病下的临床特点.方法 回顾性分析2018年12月—2023年12月重庆医科大学附属第一医院49例接受mNGS检...
【关键词】 耶氏肺孢子菌肺炎；耶氏肺孢子菌定植；宏基因组二代测序技术；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王飞 张双明 等 《中国病原生物学杂志》 2025年20卷5期 670-673,682页ISTICPKUCSCD
【摘要】 脊柱感染性疾病是由特定病原菌引发脊柱不同部位疾病,分类包括化脓性、肉芽肿性、寄生虫性感染等,且不同病原体有特定感染方式与表现.临床表现有背痛、发热等,免疫抑制患者症状可不典型.影像学检查中,X线逐渐被CT、MRI等取代,CT对骨质结构评估有...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙景巍 李娜 等 《中华医院感染学杂志》 2025年35卷8期 1177-1181页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨宏基因二代基因测序(mNGS)在肺炎支原体肺炎病原体检测中的应用价值.方法 对蚌埠市第一人民医院2023年1-12月期间住院治疗的120例肺炎支原体肺炎患儿进行回顾性分析,收集患者临床资料,采集患者支气管肺泡灌洗液(BALF)、血...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵华 张彬 等 《中国热带医学》 2024年24卷11期 1424-1428页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨急性Q热的临床特征,以提高对该病的认识.方法 收集2020年11月—2023年12月南通大学附属医院收治的10例急性Q热患者的临床资料,回顾性分析一般资料、流行病学特点、临床表现、实验室检查结果、影像学表现、治疗方案及转归.结果 ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邢佳 余艳丽 等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2024年42卷6期 820-822,826页MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 患者,女,55岁,因"发现血细胞异常9月余"于2024年4月17日入陕西省核工业二一五医院血液科.多次检查血常规见血细胞进行性减低,白细胞最低1.4× 109/L,血红蛋白最低90g/L,血小板最低90×109/L,间断给予"地榆升白片、粒...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高世勇 魏新瑞 等 《中药药理与临床》 2024年40卷3期 115-119页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 数以亿计的微生物在肠道内构成了肠道微生态系统,该系统在维持人体生理功能,参与营养物质吸收,调节人体健康等方面发挥重要作用.宏基因组学在肠道微生物中的应用可以追溯到20世纪末和21世纪初,其工作集中在测定不同人群之间的微生物组成差异.早期的肠...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 马纪志 《中国城乡企业卫生》 2024年39卷4期 69-71页
【摘要】 目的 探析宏基因组二代测序技术(mNGS)在假体周围感染(PJI)病原菌检测中的作用.方法 选取2020年1月-2021年12月天津金匙医学检验实验室收治的行关节翻修手术患者200例,其中包括膝关节126例,髋关节74例,对患者关节液或滑膜...
【关键词】 关节假体周围感染；宏基因组二代测序技术；病原菌；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴玲 《应用与环境生物学报》 2019年25卷6期 1470-1476页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 沉积物是水生态系统重要的组成部分,研究沉积物中的微生物多样性及群落结构有助于从侧面了解水体的水质状况.采集太湖中具有不同富营养化水平的梅梁湾(ML)与湖心区(HX)表层沉积物(0--2 cm),测定沉积物样品中的总有机碳(TOC)、总氮(T...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙丹 袁文亮 等 《生命科学》 2018年30卷8期 896-905页ISTICCSCD
【摘要】 由于很多微生物无法单独分离培养,研究微生物群落整体的宏基因组学是目前揭示微生物多样性的重要方法.长读长测序技术可以覆盖重复序列和复杂结构,获得短读长无法检测的基因组信息.现着重介绍了两类长读长测序技术,即基于第三代测序技术的单分子长读长测序...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：冀培丰 导师：赵方庆 中国科学院大学 基础医学 遗传学（博士） 2016年
【摘要】 宏基因组的生物学分析大都建立在已知参考基因组序列基础上，由于这些参考基因组的数目只占了整体非常小的一部分，因此获取未知细菌的基因组序列对了解整个微生物群体、功能都至关重要。但是重复序列、测序深度高度不均一以及宏基因组样品的复杂度，都会使宏基...
- 概要：
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【学位论文】 作者：覃俊杰 导师：王俊 中国科学院研究生院 中国科学院大学 生物学 生物信息学（博士） 2010年
【摘要】 据估计，自然界中99％上的可观测微生物是难以通过常规实验技术分离培养的。宏基因组学(metagenomics)的诞生为研究此类微生物提供了新的思路和方法。以Illumina为代表的第二代测序技术，对宏基因组学的研究，无论在广度上，还是深度上...
- 概要：
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【中文期刊】 邹悦 窦青瑜 等 《现代预防医学》 2025年52卷14期 2645-2650,2669页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探究藏族地区代谢性脂肪肝病(MAFLD)人群的肠道菌群组成和功能组成差异,为藏族人群代谢性脂肪肝病的预防和治疗提供研究基础.方法 基于西南区域自然人群队列拉萨地区的随访数据,依据《代谢相关(非酒精性)脂肪性肝病防治指南(2024年版)...
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【中文期刊】 刘婷婷 吴亮 等 《疾病监测》 2025年40卷5期 581-587页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析人类免疫缺陷病毒(HIV)合并肺部感染患者在不同免疫水平状态下的病原谱特征,为HIV人群精准诊治及防控提供科学依据.方法 利用宏基因组测序技术,对2021年7月至2022年1月收治于首都医科大学附属北京地坛医院的50例HIV合并肺...
- 概要：
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【中文期刊】 袁文怡 窦青瑜 等 《现代预防医学》 2025年52卷13期 2450-2458页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探究藏族地区高尿酸血症人群和正常人群的肠道微生物的物种构成及差异,可为藏族人群防治高尿酸血症来提供研究基础.方法 基于西南地区自然人群队列拉萨地区的随访调查数据,根据纳排标准选择108名拉萨藏族居民作为研究对象,收集其人口学和人体测量...
- 概要：
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【中文期刊】 奚斌 孟晓 等 《热带医学杂志》 2025年25卷2期 245-249页ISTICCA
【摘要】 目的 应用宏基因组二代测序(mNGS)技术探究不同严重程度的肺部感染患者下呼吸道感染病原谱,以指导临床诊断及治疗.方法 选取2020年7月-2022年6月就诊于徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科的肺部感染患者,根据是否符合重症肺炎诊断标...
- 概要：
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【中文期刊】 陆炳团 吕天富 等 《热带医学杂志》 2025年25卷5期 713-715页ISTICCA
【摘要】 本例患者以肺部感染相关临床表现起病,抗感染治疗后咳嗽、咳痰缓解,但恶心始终缓解不明显,仍反复发热,通过脑脊液宏基因二代检测明确诊断单纯疱疹病毒性脑膜炎,予抗病毒、糖皮质激素使用及对症支持治疗后,病情缓解.当肺部感染患者经积极抗感染治疗后仍反...
- 概要：
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【中文期刊】 田家林 楚栋良 等 《微生物学报》 2024年64卷12期 4936-4951页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]揭示江汉平原人口稠密区地表水和地下水细菌群落在旱季和雨季之间的动态变化,探究产生时间动态差异的原因.[方法]于江汉平原人口稠密区的地表水、地下水采集水样,利用宏基因组测序技术,分析地表水和地下水细菌群落在环境条件、群落结构、群落构建...
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【中文期刊】 魏茹楠 毕云娇 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷11期 1336-1339页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着基于细菌DNA分析的宏基因组测序技术的发展,人们对肠道菌群的认知有了质的飞跃.肠道菌群在时间和空间上个体差异很大,这对肠道菌群在医学应用上的进展造成了障碍.肠型概念的提出实现了对人类肠道菌群进行降维分析的第一步,为临床的应用研究带来便利...
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【中文期刊】 王兵 金慧 等 《中国公共卫生》 2024年40卷9期 1088-1094页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用宏基因组测序技术分析水苏糖对腹泻儿童肠道菌群的结构组成和代谢通路的影响.方法 采集2021年12月—2022年3月某三甲医院收治的腹泻儿童粪便样本6份,利用体外模拟发酵技术接种于水苏糖培养基(STS组)和对照培养基(Ctrl组),...
- 概要：
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【中文期刊】 陶锋 李一荣 等 《中国病原生物学杂志》 2024年19卷11期 1290-1294页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨靶向宏基因组测序(tNGS)技术在不明原因肺部感染病原学诊断中的价值.方法 选取2023年3月-11月114例于本院就诊的不明原因肺部感染患者为研究对象.采集患者支气管肺泡灌洗液或痰液标本,分别进行tNGS测序及传统的病原学检测....
- 概要：
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【中文期刊】 严卓彦 谭宇翔 等 《中国药学杂志》 2024年59卷11期 1041-1046页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:评价宏基因组测序法在药品污染细菌鉴定和溯源中的应用.方法 利用宏基因组测序法和分离培养法同时对两批中成药及检测实验室环境取样中的细菌进行鉴定和分型.宏基因组测序结果通过MetaPhlan和StrainSifter软件进行菌株水平的分析...
【关键词】 宏基因组测序；蜡样芽孢杆菌特异性PCR；多位点序列分型；
- 概要：
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【中文期刊】 李维苹 王兴蕾 等 《中国血吸虫病防治杂志》 2024年36卷2期 215-218页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 1例患者因"反复高热、肝脾肿大、伴全血细胞减少待查"收住入院,排除细菌、病毒、真菌感染及血液系统疾病后,采集患者外周血行宏基因组二代测序,结果显示婴儿利什曼原虫感染.rk39快速诊断试剂检测显示抗利什曼原虫抗体阳性,骨髓涂片检出利什曼原虫无...
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【中文期刊】 张鹏航 张晓嫒 等 《职业与健康》 2024年40卷11期 1486-1491页ISTICCA
【摘要】 目的 分析北京市部分零售预包装冷藏膳食微生物污染情况以及细菌群落特征.方法 2022年7月,从北京市零售环节采集65件预包装冷藏膳食,采用食品微生物检验国家标准方法分别对金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、蜡样芽孢杆菌进行计数,对沙门菌、单核细胞增...
- 概要：
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【中文期刊】 白冰 阿瓦汉·吐尔迪 等 《现代生物医学进展》 2024年24卷9期 1686-1691,1677页ISTICCA
【摘要】 目的:研究宫颈癌疾病中女性阴道菌群的构成变化,探索具有预防宫颈癌发生的阴道益生菌.方法:选取新疆医科大学附属肿瘤医院和社区募集的24例健康女性和43例宫颈癌女性.采用16S rDNA和宏基因组测序技术分析其阴道菌群构成.结果:两组女性阴道菌...
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【中文期刊】 夏宇 考吾沙尔·巴合提江 《中国呼吸与危重监护杂志》 2024年23卷6期 414-422页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过宏基因组二代测序(mNGS)分析单纯肺炎和慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)合并下呼吸道感染支气管肺泡灌洗液(BALF)中微生物菌群差异.方法 纳入新疆医科大学第一附属医院2021年12月-2023年3月间住院的肺炎患者,根据是否合并...
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【中文期刊】 叶福强 韩一芳 等 《中国国境卫生检疫杂志》 2024年47卷5期 534-539页ISTICCA
【摘要】 宏基因组测序依赖于二、三代高通量测序技术,已广泛应用于检验医学、环境学、生态学、微生物学等诸多学科,特别是在感染性疾病病原检测领域发挥了关键作用.其应用局限之一是样本高宿主背景可导致检测灵敏度降低,在组织、血液、拭子、唾液、胆汁、脓液等样本...
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【中文期刊】 徐志伟 陈学梅 等 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷2期 305-314页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 病毒广泛分布于自然环境中,随着高通量测序技术的快速发展,对病毒遗传多样性研究也越来越多,但是高原湿地病毒研究相对较少.本文利用病毒宏基因组学方法开展纳帕海高原湿地病毒种群结构和遗传多样性的研究,发现纳帕海高原湿地中DNA病毒占99.4％,R...
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【中文期刊】 陈慧娟 刘琪琦 《中国生物化学与分子生物学报》 2022年38卷7期 865-874页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 细菌耐药已成为威胁全球人类公共健康的重要因素之一,快速、准确明确细菌耐药的特性、机制及传播特征对疾病治疗及控制耐药菌的传播具有重要意义.高通量测序技术可以同时平行检测多个基因序列的状态,已广泛应用于细菌耐药检测.目前高通量测序技术在细菌耐药...
- 概要：
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【中文期刊】 屈爱娜 吴德 《病毒学报》 2022年38卷6期 1488-1494页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,与人体共生的微生物群成为当今研究的热点.肠道微生物群是人体最庞杂且重要的微生态系统,与人体健康密切相关.其中,肠道菌群与疾病的研究是热点,但是人们对肠道病毒群的关注较少.该文对人体肠道病毒宏基因组学的研究进行综述,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯水平 周勇 等 《中国病原生物学杂志》 2022年17卷7期 852-856,867页ISTICPKUCSCD
【摘要】 布鲁氏菌病是遍布全球170多个国家和地区的人兽共患传染病.人感染布鲁氏菌后临床表现多样,其诊断方法备受关注.近年来,免疫磁珠分离、飞行时间质谱鉴定以及宏基因组测序等新技术应用于对布鲁氏菌的检测.本文将对目前国内外对布鲁氏菌分离培养、生化鉴定...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵昌会 陈华海 等 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷11期 2120-2129页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 磷酸奥司他韦(oseltamivir phosphate,OP)是治疗甲型和乙型病毒性感冒的特效药.本文通过宏基因组测序、气相色谱和高效液相色谱技术,研究磷酸奥司他韦对人体肠道微生物群落的体外影响,为磷酸奥司他韦的临床应用提供肠道菌群方面的...
- 概要：
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【中文期刊】 乔薇 《临床急诊杂志》 2022年23卷9期 660-663页ISTICCA
【摘要】 目的:利用宏基因组二代测序(mNGS)检测社区获得性肺炎(CAP)患者的感染病原体,分析其分布特征,为此类患者初始经验性抗感染策略的制定提供依据.方法:分析2020年7月-2022年2月我院呼吸内科、ICU收治的CAP患者痰液及支气管肺泡灌...
- 概要：
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【中文期刊】 薛智丰 王超 等 《微生物学免疫学进展》 2022年50卷3期 50-56页ISTICCA
【摘要】 目的 分析咽拭子中存在多种少量的机会致病性微生物(即病原体本底),为测序数据提供初步分析结果.方法 利用牛津纳米孔测序技术(oxford nanopore technologies)对 12个健康人的咽拭子样本进行测序并分析微生物序列.结果...
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【中文期刊】 陆思芬 周永召 等 《中国呼吸与危重监护杂志》 2022年21卷6期 403-411页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术分析肺部感染患者下呼吸道微生物特征,提高临床对于肺部感染患者病原学特征的认识.方法 纳入在2020年8月-2021年10...
【关键词】 肺部感染；宏基因组二代测序(mNGS)；肺泡灌洗液；
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【中文期刊】 苏楠 汪泱 等 《中国呼吸与危重监护杂志》 2022年21卷9期 665-667页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 探讨鹦鹉热衣原体肺炎的临床诊疗特点.方法 收集2020年9月-2021年12月由苏州大学附属第一医院和附属独墅湖医院呼吸与危重症医学科收治的12例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,进行总结分析.结果 12例患者均以高热、咳嗽为主要表现起...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 郑恒 吴刚 等 《中国呼吸与危重监护杂志》 2022年21卷7期 505-508页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 阐述以听力下降为首发症状的鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点、诊治要点及可能机制.方法 报道以听力下降为首发症状的鹦鹉热衣原体肺炎1例.以"鹦鹉热衣原体"和"听力"为检索词,检索中国知网、万方数据库、维普数据库;以"psittacosis"或...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 肖冰冰 《中国实用妇科与产科杂志》 2017年33卷8期 795-800页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 女性阴道是一个复杂、独特、动态变化的微生态体系.阴道微生态茵群(vaginal microbiota, VM)是微生态研究的核心内容.近年来,分子生物学技术的快速发展为阴道微生态研究提供了全新的方法和思路,尤其是基于高通量测序技术的宏基因组...
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- 方法：
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【中文期刊】 周如玉 平逸帆 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2017年37卷4期 452-457页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:采用细菌培养技术与Miseq测序技术检测牙科综合治疗台水路系统(dental unit waterlines,DUWLs)中的假单胞菌属,以综合评估假单胞菌属在DUWLs中的污染情况.方法:选择南京医科大学附属口腔医院25台口腔综合治...
【关键词】 口腔综合治疗台水路系统；假单胞菌属；Miseq测序技术；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 郑小玲 王知坚 等 《药物分析杂志》 2016年36卷1期 46-52页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探索多种测序技术在药品检测环境微生物鉴定分析中的应用.方法:从药品微生物实验室环境中连续7个月采样收集获得248株细菌和6株霉菌,并对收集的细菌采用全自动微生物生化鉴定仪(Vitek 2 Compact)进行鉴定.根据生化鉴定结果选择...
- 概要：
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