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【中文期刊】 宋姝熠 蒋开秀 等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 190-201页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]基于全基因组鉴定'红阳'猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础.[方法]利用生物信息学方法分析'红阳'猕猴桃T...
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【中文期刊】 苑苏凯 罗莉 等 《饮食科学》 2025年2期 190-193页
【摘要】 目的 基于生物信息学分析方法探究国医大师刘尚义经验方凤膏基础组成药物治疗乳腺癌机制.方法 从TCGA数据库中下载临床乳腺癌的组学数据,将药物和疾病的交集导入DAVID(v2021)数据库中进行KEGG注释和GO富集;另使string(v11...
- 概要：
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【中文期刊】 刘畅 刘思章 等 《中草药》 2024年55卷8期 2723-2733页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)挖掘人参皂苷Rh1生物合成相关基因.方法 以种植于吉林省人参主产区304个农家品种的转录组测序数据为基础...
- 概要：
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【中文期刊】 朱毅 柳唐镜 等 《生物技术通报》 2024年40卷1期 243-249页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]蛋白磷酸酶 2C(protein phosphatase 2C,PP2C)是动植物中均存在的一类蛋白磷酸酶,拟探究其在西瓜果实成熟过程中发挥的重要作用.[方法]通过逆转录PCR(reverse transcription-polym...
- 概要：
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- 结论：
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- 方法：
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- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 张路阳 韩文龙 等 《生物技术通报》 2023年39卷6期 248-258页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 TCP基因是植物特有的转录因子,对植物的生长发育起到重要的作用.鉴定烟草TCP基因家族,为烟草TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据.基于烟草全基因组数据,通过BLAST对烟草TCP基因家族进行鉴定,利用生物信息学的方法分析了该家族成员的...
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【中文期刊】 杨志晓 侯骞 等 《生物技术通报》 2023年39卷9期 202-212页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究以抗、感烟草品系JYH、CBH为试验材料,分析赤星病胁迫对光合作用和核酮糖-1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Rubisco)、核酮糖-1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶活化酶(RCA)活性及基因表达的影响.结果表明,胁迫 9 d,...
【关键词】 烟草赤星病；光合作用；1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶；
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【中文期刊】 汪向海 朱玉 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷3期 281-287,344页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过对女性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)相关基因的生物信息学分析和功能预测,探讨女性NSCLC的发病机制和预后生物标志物.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression O...
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【中文期刊】 孔腾 程灵婧 等 《中华疾病控制杂志》 2023年27卷10期 1193-1203页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法分析确定原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)患者和健康对照者的特征基因,在转录组学水平上为pSS的发病机制提供思路和理论依据.方法 从基因表达综合(gene express...
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【中文期刊】 周馨蓓 张伟 等 《环境与职业医学》 2022年39卷12期 1350-1358页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)和空间转录组测序技术的兴起使得肺部疾病得以深入研究,但这两者在矽肺中的研究甚少.[目的]利用scRNA-seq联合空间转录组测序技术探索矽肺巨噬细胞中差异表达基因(DEGs)和潜在诊断基因....
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【中文期刊】 凌华云 吴玲玲 等 《中华疾病控制杂志》 2022年26卷6期 715-722页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)和原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)的共同基因表达特征和分子机制.方法 利用基因表达综合数据库(G...
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- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 韩康 甘富元 等 《每周文摘·养老周刊》 2023年18期 16-18页
【摘要】 目的:旨在基于生物信息学分析肝癌Hub基因与差异基因的筛选与鉴定,并进行相关基因的突变序列分析.方法:我们首先获取了与肝癌相关的基因表达数据和临床数据,并对其进行了质控和预处理.接着,利用网络分析方法构建肝癌基因网络,并识别了网络中的Hub...
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【中文期刊】 宋厚盼 刘恒铭 等 《中草药》 2021年52卷22期 6939-6952页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法分析与胃癌发病密切相关的基因调控网络,探讨其在胃癌预后中的价值,并进一步挖掘靶向治疗胃癌的中药活性成分.方法 通过GEO数据库获取GSE103236胃癌芯片数据,对芯片数据进行均一化处理,分析胃癌组织与正常胃组织的差...
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【中文期刊】 陈正启 余金凤 等 《生物技术通报》 2021年37卷6期 73-84页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探讨金耳菌丝体时期和子实体时期基因表达变化,利用高通量测序技术进行RNA-Seq分析.差异基因分析显示,两个时期共有10 992个差异表达基因,其中在子实体时期上调、下调的基因数分别为9 988和1 004个.GO功能聚类分析显示,差异表...
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【中文期刊】 刘炘 朱勇 等 《环境与职业医学》 2021年38卷12期 1356-1362页ISTICPKUCSCD
【摘要】 [背景]六价铬[Cr(Ⅵ)]能够诱导肺上皮细胞恶性转化,但其分子机制仍不十分明确.[目的]运用生物信息学分析方法挖掘Cr(Ⅵ)诱导肺上皮细胞恶性病变的关键基因并探讨其发生机制.[方法]从公共基因表达数据库(GEO)中下载与Cr(Ⅵ)毒效应相...
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【中文期刊】 李铂 彭亮 等 《中草药》 2020年51卷21期 5579-5589页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过分析30％聚乙二醇(PEG)模拟的干旱胁迫处理下半夏茎段转录组数据,挖掘响应干旱胁迫的相关基因,探索干旱胁迫下半夏发生"倒苗"的分子机制.方法 以干旱胁迫下半夏发生"倒苗"时的茎段作为研究材料,采用Illumina Hiseq 2...
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【中文期刊】 王慧慧 萨建 等 《中华疾病控制杂志》 2020年24卷3期 274-278,289页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)不同融合基因的时间序列基因表达数据的网络差异,识别靶基因.方法 采用网络差异分析的方法,针对AML的不同融合基因相关的基因表达数据构建网络,对联合网络的全...
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【中文期刊】 孙文 马天骏 等 《特别健康》 2022年7期 293-295页
【摘要】 目的:本研究采用生物信息学分析方法筛选骨肉瘤关键基因,预测骨肉瘤潜在治疗靶点.方法:选取GEO数据库中骨肉瘤数据集"GSE16088"和"GSE36001",利用GEO2R进行筛选差异基因.通过DAVID和KOBAS对差异基因进行生物过程分...
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【中文期刊】 廖佳 《康颐》 2022年5期 281-286页
【摘要】 目的：食管癌是常见的消化道肿瘤，晚期食管癌恶性程度极高，且缺乏有效的靶向药物控制肿瘤，本文以食管癌表达谱芯片数据为基础，通过生物信息技术分析食管癌基因差异的表达，筛选与食管癌发生发展的关键基因，从而靶向治疗提供新的研究方向。方法：通过GEO...
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【中文期刊】 安森玲 石丽媛 等 《中国热带医学》 2019年19卷2期 182-187页ISTICPKUCA
【摘要】 鼠疫是由鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)引起的烈性传染病.鼠疫菌质粒是鼠疫菌染色体外的遗传物质,3种常规质粒中,pMT1质粒序列变化最大,结构组成最复杂,目前对其研究相对较少.应用BLAST和Mauve软件对已有36株菌株的pMT1质粒序列比对,...
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【中文期刊】 杜志兴 魏孔孔 等 《中国普外基础与临床杂志》 2021年28卷12期 1604-1611页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨丙肝相关肝细胞癌(HCV-HCC)和乙肝相关肝细胞癌(HBV-HCC)的基因表达差异及其潜在的分子机制.方法 从公共基因表达数据库下载并整合HCV-HCC和HBV-HCC基因表达矩阵并使用limma包对HCV-HCC和HBV-HC...
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【中文期刊】 奥伟 殷德涛 《中国普外基础与临床杂志》 2021年28卷3期 329-335页ISTICCA
【摘要】 目的 进一步了解甲状腺乳头状癌(papillarythyroidcarcinoma,PTC)发生发展的生物分子机制,寻找新的临床病理特征判断依据以及预后评价和靶向治疗的新分子靶点.方法 通过分析基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯...
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【中文期刊】 汪丽 陈醒 《世界最新医学信息文摘》 2021年21卷100期 822-824,827页
【摘要】 目的 筛选子宫内膜异位症患者在位子宫内膜和异位子宫内膜的差异表达基因和信号通路并对其行生物信息学分析，进一步探索子宫内膜异位症的发生机制。方法 通过基因表达综合（Gene Expression Omnibus, GEO）数据库中搜索子宫...
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【中文期刊】 王惠 陈醒 《世界最新医学信息文摘》 2021年21卷103期 733-735页
【摘要】 目的 筛选子宫肌瘤差异表达基因和信号通路，并做生物信息学分析，进一步探索子宫肌瘤的发生机制。方法 在基因表达综合（Gene Expression Omnibus, GEO）数据库中选取GSE 68295和GSE 64763两个数据集，用...
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【中文期刊】 江秀玲 胡有根 等 《世界最新医学信息文摘》 2021年21卷44期 37-42页
【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选结直肠癌靶基因及评估预后价值。方法 利用加权相关网络(weighted correlation network analysis，WGCNA) 分析TCGA数据库中结肠癌差异表达基因，然后与结肠癌ceRNA中...
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【中文期刊】 山瑞荣 王凤霞 等 《特别健康》 2021年23期 247-248页
【摘要】 子宫肌瘤是一种中年女性常见的妇科良性肿瘤,其发病机制尚不明确,可能与激素代谢紊乱、干细胞异常增殖、遗传因素等相关.为了探究子宫肌瘤发生和进展的内在分子机制,我们对子宫肌瘤患者的mRNA转录组进行生物信息学分析,试图找到子宫肌瘤中特定的关联基...
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【中文期刊】 李富骏 孙博 等 《母婴世界》 2021年28期 14-15页
【摘要】 目的:基于GEO数据库分析IGFBP7在雌激素受体α(ERα)阴性耐药乳腺癌患者中的表达及与患者预后的关系.方法:从GEO数据库下载数据集GSE26459和GSE27473,筛选出两个数据集中的DEGs,利用GO分析对DEGs进行功能注释,...
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【中文期刊】 罗斯琦 娄世锋 《世界最新医学信息文摘》 2021年21卷67期 30-40,44页
【摘要】 目的 通过全反式维甲酸(ATRA)处理后急性早幼粒细白血病(APL)NB4细胞基因表达谱分析寻找差异基因富集的信号途径，探讨全反式维甲酸治疗急性早幼粒细白血病的可能分子作用机制，同时筛选出信号通路中高表达提示预后不良的关键基因，为寻找AP...
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【中文期刊】 朱珏 石雨荷 等 《中草药》 2025年56卷3期 966-974页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨黄精属Polygonatum Mill.6个产区3个种质的遗传多样性及亲缘关系.方法 以34份黄精属种质资源为供试材料,采用正交设计方法,优化黄精属目标起始密码子多态性-PCR(start codon targeted polym...
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【中文期刊】 李艳伟 杨妍妍 等 《生物技术通报》 2025年41卷2期 187-201页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]通过对洋葱发育不同阶段的鳞茎组织进行转录组比较分析,为研究植物激素在洋葱鳞茎形成过程中的分子调控机制提供依据.[方法]分别取洋葱出苗后33、47、61和75 d的鳞茎部位为试验材料,通过酶联免疫吸附法和气相色谱法检测,了解生长素、细...
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【中文期刊】 乐慧娟 吴瑾 《临床儿科杂志》 2025年43卷2期 112-119页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨坏死性小肠结肠炎(NEC)患儿外周血髓源性抑制细胞(MDSCs)数量变化与疾病进程的关系并分析患儿MDSCs的生物学特征.方法 下载GEO数据库NEC患儿外周血单个核细胞单细胞测序数据集并进行质控、批次矫正、降维聚类及细胞类群注释...
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【中文期刊】 苏雪华 朱亚欣 等 《中国医院药学杂志》 2025年45卷5期 561-568页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:探讨糖尿病肾病的病理机制及津力达颗粒的治疗潜力.方法:通过R4.4.2软件分析GSE30122数据集来获取差异表达基因,结合GeneCards等数据库筛选出与糖尿病肾病相关的靶点并提取交集基因,使用CytoScape 3.10.2软件...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晶晶 胡进红 等 《生物技术通报》 2025年41卷2期 202-209页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]探究盐胁迫下'宁杞1号'(Lycium barbarum Ningqi 1)信号转导途径相关基因差异表达规律,为深入解析'宁杞1号'耐盐碱的分子机理奠定基础.[方法]基于转录组测序技术,对不同浓度NaCl胁迫下'宁杞1号'叶片信号转...
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王斌 王玉昆 等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 255-270页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]丁香罗勒(Ocimum gratissimum)同时具有修复和安全利用镉(cadmium,Cd)污染土壤的潜力,解析丁香罗勒响应Cd胁迫的分子机制,鉴定与Cd耐受性密切相关的调控因子,为耐受Cd胁迫的丁香罗勒种质资源创新提供候选基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李旭娟 李纯佳 等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 202-218页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]发掘甘蔗腋芽形成发育关键代谢通路和调控基因,为甘蔗优良品种选育及遗传改良策略制定提供基因资源.[方法]以甘蔗品种'新台糖22号(XTT22)'为材料,分别选取其幼嫩、半大、成型、成熟腋芽,以茎尖生长点为对照.首先通过RNA-seq获...
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