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【中文期刊】 朱雪坤 刘恒 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷3期 637-644页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:目前骨关节炎成为影响老年人生活质量的主要疾病,治疗效果欠佳,临床治疗措施主要集中在阻止疾病的进程,同时骨关节炎的发病机制尚不完全清楚.为了探索骨关节炎的主要发病机制和基因编码调控的相关机制,进行生物信息学分析.目的:通过基因表达谱筛选...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 于思佳 于太飞 等 《植物遗传资源学报》 2025年26卷7期 1398-1415页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 菜豆是我国重要的可食用豆类,具有丰富的营养成分和广泛的使用价值.盐胁迫对菜豆的生长发育影响显著.本研究以菜豆F0006591为材料,用0.2 mol/L NaCl溶液对苗期菜豆进行盐胁迫处理.利用RNA-seq测序技术,对盐胁迫处理0h、6...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张燕 梁隆钰 等 《中国运动医学杂志》 2025年44卷1期 29-43页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于生物信息学探讨大负荷运动后骨骼肌炎症反应基因的时间窗效应,鉴定运动性骨骼肌损伤(exercise-induced muscle damage,EIMD)炎症反应的关键基因与信号通路.方法:48只SD大鼠随机分为对照组(C组,n=8...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 柳可心 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高梦瑶 穆华夏 等 《中国卫生统计》 2025年42卷2期 191-196页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,筛选与肺腺癌(lung adenocarcino-ma,LUAD)患者死亡或预后相关的关键基因及临床特征,构建并验证肺腺癌风险预测模型的效果.方法 ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙露 李想 等 《陆军军医大学学报》 2025年47卷7期 701-707页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法分析玫瑰痤疮(rosacea,RA)毛细血管增生相关差异表达基因,筛选关键基因并验证其在RA中的表达水平.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取基因芯片数据集GSE6...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈帅豪 牛莉萍 等 《生物学杂志》 2025年42卷1期 9-15,23页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 青稞是重要的禾本科作物,具有较强抗旱性,在青藏高原等地具有很高的经济和生态价值,为研究其抗旱机制,对两个抗旱性不同的青稞品种进行模拟干旱及转录组分析.从敏感品种YC85 和抗旱品种ZY1100 中分别筛选出 85 和 186 个差异表达基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晨曦 石婕 等 《生物信息学》 2025年23卷1期 71-80页ISTIC
【摘要】 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(Pigmented villonodular synovitis,PVNS)是一种可累及关节的腱鞘巨细胞瘤,类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)作为一种慢性自身免疫性疾病,二者都极少发生...
【关键词】 颞下颌关节；色素沉着绒毛结节性滑膜炎；类风湿性关节炎；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 金庆 尚士宣 等 《医学研究杂志》 2025年54卷6期 26-33页ISTIC
【摘要】 目的 筛选结肠癌相关的核心基因,为结肠癌分子诊断、靶向治疗、预后评价等提供新的研究方向.方法 从基因表达数据库中下载与结肠癌相关的数据集(GSE62932、GSE110224)并筛选出结肠癌差异表达基因(differentially exp...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 黄兴 冯一鹏 等 《东南大学学报（医学版）》 2025年44卷4期 525-533页ISTICCA
【摘要】 目的:筛选与肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)转移和生存预后密切相关的循环肿瘤细胞(circu-lating tumor cells,CTCs)差异表达基因,构建基于CTCs的LCD风险评分模型,并评估其在LUAD患...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭文涛 郜赵伟 等 《现代检验医学杂志》 2025年40卷1期 38-42,58页ISTICCA
【摘要】 目的 基于基因表达综合数据库(GEO),筛选系统性红斑狼疮(SLE)和干燥综合征(又称舍格伦综合征,SS)中共有的差异表达基因,进行功能分析并鉴定其表达水平,探索SLE和SS的潜在发病机制.方法 在GEO数据库中检索SLE和SS全血样本基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王晓博 王育梅 等 《神经疾病与精神卫生》 2025年25卷7期 465-473页ISTIC
【摘要】 目的 探讨双相障碍(BD)患者外周血单个核细胞(PBMC)中mRNA的整体表达情况并进行免疫浸润分析.方法 选取2022年10月—2023年7月河北医科大学第一医院精神卫生中心就诊的24例BD患者和12名健康对照(HC)者为研究对象.使用微...
- 概要：
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【中文期刊】 余帅江 沈鹏 等 《颈腰痛杂志》 2025年46卷1期 126-131页ISTIC
【摘要】 目的 分析坐骨神经痛患者的基因表达特征,探讨其发病机制中的潜在关键基因,为临床治疗提供新方向.方法 利用GEO数据库收集坐骨神经痛相关的基因表达数据,采用limma包进行差异表达基因分析,并通过基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 郭峰 王晨宇 等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄芳畅 朱鑫 等 《浙江医学》 2025年47卷8期 828-833,后插5页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析探索基底细胞癌(BCC)中差异表达的铁死亡相关基因(DE-FRGs).方法 在基因表达综合数据库中筛选目标基因芯片GSE7553,并从FerrDb数据库下载铁死亡相关基因(FRGs)数据集.利用GEO2R分析识别GS...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 范淑敏 吴垣儒 等 《中华卫生杀虫药械》 2025年31卷4期 437-445页ISTICCA
【摘要】 目的 了解台湾乳白蚁Coptotermes formosanus Shiraki工蚁和兵蚁的转录组特征,为阐明工蚁和兵蚁品级分化的分子机制提供理论依据.方法 对工蚁和兵蚁的头部组织进行转录组测序,对比两者之间的差异表达基因(DEGs),并进...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郭倩 陈婕 等 《临床荟萃》 2025年40卷7期 608-618页ISTICCA
【摘要】 目的 利用微阵列数据集确定多囊卵巢综合征(PCOS)新的遗传靶点,并揭示导致PCOS发生发展的分子基础.方法 对来自基因表达综合数据库的3个独立PCOS数据集进行了全面分析,使用R软件进行数据处理和规范化.对差异表达基因(DEG)与PCOS...
- 概要：
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【中文期刊】 马尧丹 俞晖 等 《中国兽医杂志》 2025年61卷5期 22-32页
【摘要】 为探究猪瘟病毒(CSFV)感染对猪睾丸支持细胞(ST)mRNA表达谱的影响,本试验以感染CSFV 24和48 h的ST细胞和未感染ST细胞为模型,通过蛋白免疫印迹试验(WB)和间接免疫荧光(IIF)染色检测CSFV E2蛋白的表达;构建4个...
【关键词】 猪瘟病毒(CSFV)；猪睾丸支持细胞；mRNA差异表达；
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【中文期刊】 王莉 孙园 等 《包头医学院学报》 2025年41卷2期 1-5,12页CA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法探索盆腔器官脱垂(pelvic organ prolapse,POP)进展的关键基因和信号通路.方法:自公共数据库GEO下载数据集GSE12852和GSE28600,通过在线工具GEO2R分析获取差异基因,通过DAV...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 龙海晨 廖新华 等 《医学信息》 2025年38卷11期 1-6,21页
【摘要】 目的 通过生物信息学方法,利用R语言编程进行数据挖掘,寻找宫颈癌中有意义的基因.方法 从TCGA数据库下载宫颈癌患者临床信息以及RNA-seq数据.使用R语言limma包进行差异表达分析,筛选差异表达基因.使用STRING数据库和Cytos...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 吴天意 伍祎 等 《粮油食品科技》 2025年33卷1期 238-245页
【摘要】 锈赤扁谷盗是世界范围内重要的储粮害虫之一,通过转录组测序分析,初步研究锈赤扁谷盗响应低温胁迫的分子机制.采用三代测序结合二代测序技术对锈赤扁谷盗进行转录组测序,共获得锈赤扁谷盗全长转录本10 508 个,并对其中 9 523 个转录本进行注...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张舟 黄碧 等 《岭南现代临床外科》 2025年25卷1期 12-18页
【摘要】 目的 本研究旨在通过比较不完全射频消融(IRFA)处理肝细胞癌(HCC)患者与HCC的基因表达谱,识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因,并提供潜在治疗靶点.方法 从GEO数据库中下载GSE212604数据集,根据是否接受IRFA治疗分...
- 概要：
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【中文期刊】 李亚晶 邓洪儒 等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷2期 191-196页
【摘要】 目的 通过采用集成的生物信息学工具探索新的静脉血栓栓塞症(VTE)生物标志物和潜在的治疗靶点.方法 利用基因表达综合数据库(GEO)获取VTE患者和非VTE患者的基因数据.应用R4.2.0软件中的limma程序包筛选差异表达基因(DEG),...
- 概要：
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【中文期刊】 高志强 袁野 《中医临床研究》 2025年17卷14期 35-42页
【摘要】 目的:从微观维度系统挖掘虚、实体质的基因表达模式,归纳其在虚、实体质内部的联系,为辨体、调体提供参考.方法:基于"体质可分论",根据《中医体质分类与判定》标准,将体质归纳为虚性体质(包括气虚质、阳虚质、阴虚质)和实性体质(包括痰湿质、血瘀质...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王建茹 李兴渊 等 《中国病理生理杂志》 2024年40卷3期 473-483页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:运用生物信息学分析方法挖掘参与心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的关键基因.方法:首先,从数据库中下载大鼠MIRI相关数据集GSE122020、E-MEXP-2098和E-GEOD-4105.其次,一方面利用微阵列数据线性模型(limma...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁一豪 赖颖君 等 《南方医科大学学报》 2024年44卷3期 605-616页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标.方法 从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEG...
- 概要：
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【中文期刊】 高玉广 钟洁 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷20期 3182-3189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:急性脑出血中存在差异表达的基因,这些基因与脑出血发生发展有关.目的:筛选急性脑出血大鼠模型脑组织中差异表达的基因和关键基因,并采用qPCR进行验证,分析关键基因与脑出血后神经功能、脑组织含水量的关系.方法:78只SD大鼠随机分为2组:...
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【中文期刊】 陆晓铃 刘斌 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷32期 5116-5121页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:研究表明,脂肪酸代谢基因与类风湿关节炎发展紧密相关,因此基于脂肪酸代谢基因探索类风湿关节炎发病进展具有重要的临床意义.目的:探究脂肪酸代谢基因是否可以作为预测类风湿关节炎进展的可靠生物标志物.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载与...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张丽娜 姜晓琳 等 《中华中医药学刊》 2024年42卷6期 179-182,后插28-后插31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别肥胖型多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的关键基因,...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈文潇 陈晶 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 1039-1053页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 通过对中华大蟾蜍(Bufo bufo gargarizans)5个不同发育时期的耳后腺和腹皮进行转录组测序分析,挖掘参与毒素合成的关键因子,为深入研究毒素合成调控机理提供理论依据.分别取3月龄、6月龄、12月龄、24月龄、36月龄等5个发育...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙俊丽 王昭君 等 《中国医科大学学报》 2024年53卷9期 769-776页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 基于生物信息学方法筛选急性缺血性脑卒中(IS)后心功能不全的关键基因及信号通路.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE102558数据集,以P<0.05且|log2FC|>0.6筛选差异表达基因(DEG).Cytoscape软...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 景凯 徐志伟 等 《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷1期 21-30页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用生物信息学分析方法,结合 GEO 数据库,探讨获取结直肠肿瘤关键基因的差异表达情况.方法 使用GEO数据库分析结直肠肿瘤患者的肿瘤组织和正常组织基因表达数据,使用GEO2R筛选差异表达基因(differential express...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 钭张琪 杨华 等 《中国防痨杂志》 2024年46卷z1期 9-12页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法挖掘抗中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)相关性血管炎(AAV)与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的关键表达基因,寻找潜在治疗靶点.方法:在GEO数据库中下载GSE104948数据集,利用R语言筛选AAV的差异表达基因...
【关键词】 抗中性粒细胞胞浆抗体相关性血管炎；新型冠状病毒肺炎；GEO数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯洁欣 戴吉 等 《中国血液流变学杂志》 2024年34卷2期 202-207页ISTICCA
【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定与病毒性脓毒症儿童患者相关的关键基因.方法 使用GSE119217数据集进行差异表达基因(DEGs)分析,筛选病毒性脓毒症儿童患者相关的DEGs.采用WGCNA筛选与脓毒症临床特征相关性最高...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张冠 杨登科 《联勤军事医学》 2024年38卷11期 966-970页ISTIC
【摘要】 目的 研究肾结石的关键差异基因、信号通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,从而寻找潜在的诊疗靶点,为难治性、复发性、遗传高风险性结石提供新的诊疗思路.方法 基于生物信息学方法和R...
- 概要：
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【中文期刊】 丁宁 杨青山 等 《中国医学物理学杂志》 2024年41卷4期 512-520页ISTICCSCD
【摘要】 目的:通过生物信息分析探索骨性关节炎中滑膜组织的基因变化.方法:从GEO数据库中获取GSE55235和GSE12021数据,分析数据得到差异表达基因(DEGs).再对DEGs进行功能富集分析、蛋白互作网路分析、hub基因分析等.最后分析预测...
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【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 徐聪聪 叶燕平 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷6期 42-49,79页ISTIC
【摘要】 目的 探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点.方法 对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(D...
【关键词】 心肌缺血-再灌注损伤；铁死亡；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐茜 王文婷 等 《医学研究杂志》 2024年53卷11期 39-45页ISTIC
【摘要】 目的 基于生物信息学视角探索糖尿病(diabetes mellitus,DM)和动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的共病机制.方法 通过分析GEO数据库中DM和AS基因表达谱,筛选差异表达基因(differentially...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 胡芮绮 郭元彪 《中国医药导报》 2024年21卷21期 8-17页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学分析探索腹泻型肠易激综合征(IBS-D)的关键基因及通路,为其诊断与治疗提供潜在的分子靶标.方法 分析基因表达综合数据库中GSE212719数据集,使用GEO2R识别差异表达基因(DEGs);通过DAVID数据库进行基因...
- 概要：
- 方法：
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