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【中文期刊】 柳可心 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 余帅江 沈鹏 等 《颈腰痛杂志》 2025年46卷1期 126-131页ISTIC
【摘要】 目的 分析坐骨神经痛患者的基因表达特征,探讨其发病机制中的潜在关键基因,为临床治疗提供新方向.方法 利用GEO数据库收集坐骨神经痛相关的基因表达数据,采用limma包进行差异表达基因分析,并通过基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晨曦 石婕 等 《生物信息学》 2025年23卷1期 71-80页ISTIC
【摘要】 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(Pigmented villonodular synovitis,PVNS)是一种可累及关节的腱鞘巨细胞瘤,类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)作为一种慢性自身免疫性疾病,二者都极少发生...
【关键词】 颞下颌关节；色素沉着绒毛结节性滑膜炎；类风湿性关节炎；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 马尧丹 俞晖 等 《中国兽医杂志》 2025年61卷5期 22-32页
【摘要】 为探究猪瘟病毒(CSFV)感染对猪睾丸支持细胞(ST)mRNA表达谱的影响,本试验以感染CSFV 24和48 h的ST细胞和未感染ST细胞为模型,通过蛋白免疫印迹试验(WB)和间接免疫荧光(IIF)染色检测CSFV E2蛋白的表达;构建4个...
【关键词】 猪瘟病毒(CSFV)；猪睾丸支持细胞；mRNA差异表达；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李亚晶 邓洪儒 等 《血管与腔内血管外科杂志》 2025年11卷2期 191-196页
【摘要】 目的 通过采用集成的生物信息学工具探索新的静脉血栓栓塞症(VTE)生物标志物和潜在的治疗靶点.方法 利用基因表达综合数据库(GEO)获取VTE患者和非VTE患者的基因数据.应用R4.2.0软件中的limma程序包筛选差异表达基因(DEG),...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙俊丽 王昭君 等 《中国医科大学学报》 2024年53卷9期 769-776页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 基于生物信息学方法筛选急性缺血性脑卒中(IS)后心功能不全的关键基因及信号通路.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE102558数据集,以P<0.05且|log2FC|>0.6筛选差异表达基因(DEG).Cytoscape软...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘国红 任雨轩 等 《山东医药》 2024年64卷12期 37-41页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能.方法 12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管、肝等组...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐聪聪 叶燕平 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷6期 42-49,79页ISTIC
【摘要】 目的 探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点.方法 对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(D...
【关键词】 心肌缺血-再灌注损伤；铁死亡；差异表达基因；
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 沈蓓蕾 李娜 等 《中国实验诊断学》 2024年28卷4期 455-462页ISTIC
【摘要】 目的 采用生物信息学方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中分析发掘有关多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)的重要基因并对其进行富集分析,为研究PCOS的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 布娅·米然别克 贺欢 等 《临床消化病杂志》 2024年36卷4期 239-244页ISTICCA
【摘要】 [目的]通过生物信息学方法挖掘溃疡性结肠炎(ulcerative colititis,UC)致病关键基因.[方法]从公共基因芯片数据平台下载GSE53306和GSE38713基因芯片数据集,对UC活动期患者、UC静止期患者和健康志愿者进行分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 崔永康 苟小军 等 《医学研究杂志》 2024年53卷12期 78-87页ISTIC
【摘要】 目的 探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证.方法 基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基...
【关键词】 非酒精性脂肪性肝病；差异表达基因分析；KEGG通路富集分析；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 申杨 段子博 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷5期 391-398页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选外阴鳞状细胞癌(VSCC)的关键基因及分析免疫浸润特征.方法:从GEO数据库中下载VSCC相关基因表达数据,应用差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析筛选出共同的DEGs,对DEGs进行富集分析.采...
【关键词】 外阴鳞状细胞癌；加权基因共表达网络分析；差异表达基因；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 田祚宁 邢凯 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷5期 1947-1957页
【摘要】 [目的]整合中国地方猪和瘦肉型猪的转录组测序数据,鉴定中国地方猪和瘦肉型猪背最长肌组织中的差异表达基因(DEGs),找出导致二者肉质性状差异的潜在候选基因,以期为猪肉品质研究提供参考.[方法]整合自测数据以及NCBI-SRA数据库下载的中国...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何茜 刘阳 等 《食品研究与开发》 2024年45卷5期 53-59页
【摘要】 以新资源食品蛹虫草作为富集载体,在培养基中添加不同浓度的铬元素,探究蛹虫草的耐铬能力和富铬作用,研究铬元素对蛹虫草产量和品质的影响,并基于转录组学分析蛹虫草富铬的作用机制.结果表明,当铬元素添加浓度为 400 μg/mL时,蛹虫草菌丝生物量...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王俊丽 郭纪敏 等 《中国卫生标准管理》 2024年15卷15期 144-148页
【摘要】 目的 研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白 2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制.方法 通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组...
【关键词】 毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A；差异表达基因；GO富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘晓雅 常孟孟 等 《中国现代医生》 2024年62卷14期 6-10,18页
【摘要】 目的 利用基因共表达权重网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索与尿道下裂发病相关的潜在基因.方法 利用WGCNA算法将数据集GSE35034 处理并构建基因共表达权重...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈菊萍 王雨璇 等 《皮肤病与性病》 2024年46卷5期 319-323页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出雄激素性脱发(AGA)的差异基因(DEGs)和可能与雄激素性脱发发病相关的通路,为AGA的发病机制和治疗方案提供新思路.方法 从GEO数据库下载雄激素性脱发相关基因芯片表达谱;筛选出DEGs并进行富集分析;基于...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 孙语新 龚晓娟 等 《法医学杂志》 2023年39卷5期 433-440页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选出经尸体检验确诊的婴儿猝死综合征(sudden infant death syn-drome,SIDS)和婴儿感染性猝死(infectious sudden death in infancy,ISDI)死者脑、心...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁悦 王雪妍 等 《微生物学杂志》 2023年43卷1期 20-31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为挖掘微杆菌(Microbacterium sp.)XT11在黄原胶降解过程中起关键作用的功能基因,预测黄原胶降解通路,利用转录组测序技术对该菌株在不同碳源培养条件下的转录本进行测序,对差异基因进行功能富集分析.结果表明,菌株XT11以葡萄...
【关键词】 Microbacterium sp.XT11；黄原胶降解；转录组；
- 概要：
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【中文期刊】 高雅宁 李健 等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晴晴 李小霞 等 《宁夏医科大学学报》 2023年45卷10期 987-993页ISTIC
【摘要】 目的 分析缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)基因表达芯片数据,筛选IS差异表达基因,利用生物信息分析其相关基因功能和信号通路,为IS发病机制提供分子理论基础.方法 从GEO数据库下载IS芯片表达数据,采用DESeq2、ed...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 任淑婷 等 《临床与病理杂志》 2023年43卷5期 888-899页ISTICCA
【摘要】 目的:对2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)测序数据进行生物信息学分析,分析长链非编...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陆洲成 钟树武 等 《中南医学科学杂志》 2023年51卷6期 839-844页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学筛选脓毒症中性粒细胞活化的关键基因.方法 从GEO数据库中下载4 个成人脓毒症芯片数据集(GSE69528、GSE28750、GSE57065、GSE95233),进行差异表达基因(DEG)筛选.基因本体论(GO)分析D...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李梁珊 赵虎 等 《检验医学》 2023年38卷9期 825-832页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析方法挖掘结直肠癌(CRC)关键基因,作为潜在的预后生物标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库获取与CRC相关的GSE33113数据集.采用R软件中的limma程序包获取CRC组织与癌旁组织的差异表达基因,采用D...
【关键词】 差异表达基因；加权基因共表达网络分析；EXO1；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱文娟 周菲 等 《山西医科大学学报》 2023年54卷12期 1600-1610页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学方法筛选和分析肠易激综合征的差异表达基因,为该疾病的发生发展提供可能的靶点,并在小胶质细胞中进行验证.方法 从GEO数据库下载GSE36701和GSE166869的基因表达芯片数据,分为肠易激综合征(ir-ritable...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王艳秋 周倩 等 《现代消化及介入诊疗》 2023年28卷1期 50-56页ISTIC
【摘要】 目的 探究铜死亡相关基因在慢加急性肝衰竭(Acute-on-chronic liver failure,ACLF)发生发展中的作用,从而进一步研究ACLF与铜死亡相关的发病机制.方法 从GEO(Gene Expression Omnibus...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 黄涛 崔泳 《中华骨与关节外科杂志》 2022年15卷1期 55-62页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的:探讨与激素性股骨头坏死(SONFH)相关的潜在关键基因,为进一步研究SONFH提供有效的生物学信息.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE74089和GSE123568的基因表达谱.使用Limma软件包鉴定差异表达基因(DEG...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张双 信瑞强 等 《磁共振成像》 2022年13卷6期 122-126页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学技术对骨关节炎(osteoarthritis,OA)差异表达基因进行识别和功能富集分析,并通过临床数据研究P53对基于MRI的OA间隙狭窄程度的影响.材料与方法 下载微阵列数据(GSE55235),利用GEO2R鉴别OA...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 修德健 高正文 等 《山东大学学报（医学版）》 2022年60卷10期 99-109页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过TCGA和GEO数据库筛选与宫颈癌相关的关键基因,探讨其分子机制及临床意义.方法 通过TCGA和GEO数据库获取宫颈癌的基因表达谱数据,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取宫颈癌与正常宫颈组织差异表达基因(DEGs),对D...
【关键词】 宫颈癌；差异表达基因；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王宇翔 杨斌 等 《四川动物》 2022年41卷6期 628-639页ISTICPKU
【摘要】 思茅松毛虫Dendrolimus kikuchii是我国南方针叶林的重大害虫之一,本研究利用DNBSEQ-T7测序平台分别对其卵、幼虫(1龄、4龄、7龄)、蛹、成虫等发育阶段进行转录组测序,并对转录组数据进行参考基因组比对、差异比较和功能富...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何明俊 白玲 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2022年43卷3期 395-406页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法探究扩张型心肌病潜在的生物标记物和相关富集通路.方法 搜索GEO数据库中与扩张型心肌病相关的数据集,提取人心肌细胞的两张芯片GSE42955和GSE1869,然后利用R语言进行差异基因分析、蛋白互作网络分析、鉴定差异...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高玉华 魏民 等 《中国老年学杂志》 2022年42卷21期 5359-5361页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 用生物信息学方法筛选出大鼠颅脑损伤后不同时间、不同区域的差异表达基因及信号通路,为后期研究提供线索.方法 运用R软件Bioconductor的limma包对大鼠颅脑损伤GEO数据进行差异表达基因筛选,再通过cluster-Profil...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 伦永志 孙杰 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2022年43卷2期 202-212页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性.方法 首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespi...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李方舟 郗雪艳 等 《现代医药卫生》 2023年39卷17期 2893-2898,2904页
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选阿尔茨海默病的关键基因.方法 从GEO数据库下载GSE5281和GSE138260数据集,用R语言对数据集进行去批次效应;WGCNA分析构建共表达网络,筛选与疾病相关基因模块并绘制基因聚类图和相关性图;以WGCN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨菁 关贵文 等 《石河子大学学报（自然科学版）》 2023年41卷6期 754-762页
【摘要】 目的 探究 NFATc3 基因敲除对肝癌细胞转录组的影响,并对 NFATc3 调控的靶基因进行初步筛选,以期为明确 NFATc3 靶基因及寻找新的抗肝癌治疗靶点提供依据.方法 利用敲除 NFATc3 的 SMMC7721 细胞,在有或无仙台...
【关键词】 RNA-seq；活化T细胞核因子c3；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周彦 江竞舟 《深圳大学学报（理工版）》 2023年40卷2期 171-178页
【摘要】 与系统性硬化症相关间质性肺病(interstitial lung disease associated with systemic sclerosis,SSc-ILD)类似,重症新型冠状肺炎疾病(corona virus disease 2...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 龚翠兰 周德生 等 《世界中医药》 2021年16卷9期 1406-1412页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:采用GE O芯片数据及网络药理学方法,分析脑梗死疾病基因,并对化痰通络汤治疗脑梗死风痰阻络证的作用机制进行探讨,为脑梗死的中医药防治提供理论依据.方法:采用多学科交叉方法对化痰通络汤治疗脑梗死风痰阻络证进行研究,整合GEO、GeneC...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 殷晓莎 田肃岩 《中国老年学杂志》 2021年41卷6期 1165-1170页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用转录组数据,从基因和通路探索阿尔茨海默病(AD)和食管癌(EC)的关联.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载AD数据集(GSE48350),分别对大脑4个区(海马、内嗅皮质、上额叶皮质、后中央回)的AD组与健康组使用Rlim...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 赵倩倩 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2021年42卷6期 829-836页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对炎症性心肌病进行生物信息学分析,筛选出与病因学及治疗靶点相关的核心基因.方法 使用GEO2R工具对来自基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)的炎症性心肌病基因芯片数据进行差异分析,通过STRIN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周艳杰 张莉莉 等 《中国实用神经疾病杂志》 2022年25卷3期 276-282页ISTIC
【摘要】 目的 对家族性偏瘫性偏头痛1型(FHM1)小鼠诱发皮质扩散性抑制(CSD)后皮质转录本中发现的差异表达基因(DEGs)进行生物信息学分析和治疗药物预测.方法 利用R软件中的Deseq2包从基因芯片公共数据库(GEO)发表的FHM1小鼠诱发C...
【关键词】 家族性偏瘫性偏头痛1型；差异表达基因；生物信息学；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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