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【中文期刊】 吴岳阳 周小燕 等 《遗传》 2024年46卷7期 540-551页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 无义介导的mRNA降解途径(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是细胞内一种关键的RNA质量控制途径,能够有效的降解细胞内错误的mRNA,以保持细胞内部环境的稳定与健康.本研究通过CRISPR/Cas9及ami...
【关键词】 无义介导的mRNA降解；水稻；可变剪接；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘国红 任雨轩 等 《山东医药》 2024年64卷12期 37-41页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能.方法 12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管、肝等组...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王馨 池文杰 《山西医科大学学报》 2024年55卷11期 1449-1455页ISTICCA
【摘要】 目的 建立基于细胞模型的抗人类表皮生长因子受体2(HER2)单抗耐药通路研究方法.方法 从低剂量开始分别使用原研药曲妥珠(Trastuzumab)或其生物类似药候选物对HER2阳性BT474细胞进行加压筛选至药物浓度60 μg/mL.利用流...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王俊丽 郭纪敏 等 《中国卫生标准管理》 2024年15卷15期 144-148页
【摘要】 目的 研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白 2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制.方法 通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组...
【关键词】 毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A；差异表达基因；GO富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张铁华 孟玲玲 等 《食品科学》 2022年43卷15期 275-282页
【摘要】 毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,TA)系统广泛存在于微生物中,由稳定的毒素和不稳定的同源抗毒素组成,参与应激反应并可调控微生物生长.活的非可培养(viable but non-culturable,VBNC)状态是某些微生物在...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱建国 林矫矫 等 《动物学报》 2002年48卷2期 240-244页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 研究了所克隆的日本血吸虫两个基因的性别间的表达差异性.分别将所克隆到的编码日本血吸虫抱雌沟蛋白的cDNA(SjGCP1)和肌动蛋白的cDNA(SjAct)制成DNA探针,利用Southern blotting,Northern blotti...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴奇桥 张树民 等 《中国当代医药》 2021年28卷36期 22-28页CA
【摘要】 目的 确定潜在和乳腺癌转移相关的基因标志物,并对其进行生存分析.方法 使用基因表达综合数据库(GEO),筛选乳腺癌转移部位和非转移部位之间的差异表达基因(DEGs).对DEGs进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书途径富集(KEGG...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李倩茹 张海俊 等 《广西医学》 2020年42卷19期 2533-2538页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法鉴定黏液样脂肪肉瘤(MLPS)中甲基化调控的差异表达基因(MeDEGs).方法 从GEO数据库中选取MLPS基因数据集GSE59568和DNA甲基化数据集GSE52391.采用GEO2R工具筛选差异表达基因(DEGs...
【关键词】 黏液样脂肪肉瘤；甲基化调控的差异表达基因；预后；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨立伟 施季森 《遗传》 2012年34卷4期 472-484页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了揭示吲哚-3-乙酸(Indole-3-acetic acid,IAA)参与杉木木材发育调控的遗传机制,文章分别以0、3mg.IAA/g.lanolin 处理不同阶段的杉木截顶茎秆作为驱动方(Driver)和测试方(Tester),利用抑...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王倩 袁莉莉 等 《中国应用生理学杂志》 2019年35卷3期 279-282页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的:通过分析GEO数据库结直肠癌相关芯片集,寻找差异基因,并在TCGA数据库和GEO数据库进行验证,为结直肠癌的早期诊断寻找标志物.方法:分析GEO数据库结直肠癌相关芯片集GSE21510、GSE25071、GSE32323.分别分析差异...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘涛 张雪竹 等 《山东医药》 2018年58卷48期 5-8页ISTICCA
【摘要】 目的 采用网络集成式细胞内特征的公共数据库(LINCS)分析快速老化痴呆小鼠海马组织差异表达基因的表达模式,并预测其潜在的治疗药物.方法 选择2月龄、8月龄SAMP8小鼠各20只,2月龄、8月龄SAMR1小鼠各20只,处死后取海马组织,制作...
【关键词】 阿尔茨海默病；老年痴呆；网络集成式细胞内特征的公共数据库；
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【中文期刊】 彭瑾瑜 朱勋 等 《中国动脉硬化杂志》 2005年13卷3期 259-262页ISTICCA
【摘要】 目的 利用差异表达基因克隆方法(抑制消减杂交)获得大量的动脉粥样硬化相关候选基因和表达序列标签后,探讨如何进行后续基因表达及功能的研究.方法 利用Internet网络上的数据库及生物学分析软件对胆固醇损伤内皮细胞后获得的差异表达基因进行核酸...
【关键词】 病理学与病理生理学；胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的分析；生物信息学分析；
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- 方法：
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- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李勇慧 押辉远 等 《郑州大学学报（理学版）》 2015年47卷1期 107-111页
【摘要】 用不同注量的低能N+离子束辐照水稻种子并培养发芽,根据培养7d时发芽率、苗高和根长的结果,将辐照后的材料分为非生长抑制组(NGI)和生长抑制组(GI).为探讨水稻应答N+离子束辐照过程中转座子的转录强度,用RNA-seq技术对对照组、NGI...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 胡军勇 金卉 等 《农业生物技术学报》 2009年17卷2期 189-194页
【摘要】 通过对靶DNA的种类和浓度、探针浓度、紫外交联时间等反向斑点杂交条件优化,建立了一种从选择性捕获的转录序列(selective capture of transcribed sequences,SCOTS)库中筛选副猪嗜血杆菌在体内、外差异...
【关键词】 副猪嗜血杆菌；差异表达基因；转录序列的选择性捕获；
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【中文期刊】 杨圣 董俊杰 等 《复旦学报（自然科学版）》 2008年47卷5期 639-646页
【摘要】 为了探讨枸杞多糖对D-半乳糖致亚急性衰老模型小鼠的药理作用,利用Illumina基因芯片研究使用枸杞多糖灌胃的衰老模型小鼠的基因差异表达情况.实验表明D-半乳糖诱导的亚急性衰老模型是可靠的衰老实验动物模型.通过分析找到了枸杞多糖在延缓衰老、...
【关键词】 枸杞多糖；D-半乳糖亚急性衰老模型；Illumina基因芯片；
- 概要：
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【中文期刊】 程优 刘影 等 《生物技术》 2024年34卷6期 707-714,787页ISTICCA
【摘要】 [目的]探究艾塞那肽治疗糖尿病的机制和靶基因.[方法]下载数据集筛选差异表达基因,构建疗效相关的共表达网络筛选加权基因,选取两组数据交集基因并使用蛋白互作网络确立核心基因,使用糖尿病模型小鼠验证核心基因.[结果]共获取15个交集基因,综合G...
- 概要：
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【中文期刊】 孙强 雷娜 等 《病毒学报》 2020年36卷3期 415-420页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 干扰素诱导的跨膜蛋白3 (Interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM3)敲除小鼠(Ifitm3-/-小鼠)感染流感病毒后,表现出更为严重的病理损伤和死亡率.最近的研究发现,IFITM3蛋...
【关键词】 流感病毒；干扰素诱导的跨膜蛋白3(IFITM3)；纵膈淋巴结；
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【中文期刊】 何文容 许荣 《现代妇产科进展》 2019年28卷6期 431-433,437页ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析NCBI公共数据库的4个队列数据集,阐明宫颈癌中潜在的关键候选基因和信号通路.方法:筛选差异表达的基因(DEG)并分析候选基因和途径富集.利用在线数据库STRING进行DEG编码的相关蛋白质-蛋白质相互作用网络(...
- 概要：
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【中文期刊】 钱雯 李敏 等 《中国皮肤性病学杂志》 2025年39卷3期 265-272页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究中波紫外线(UVB)诱导的光老化成纤维细胞及正常细胞中mRNA的N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰水平的差异表达.方法 体外培养人成纤维细胞,用UVB照射建立光老化模型.将细胞分为对照组和照光组,对照组给予常规培养,照光组给予多次...
【关键词】 光老化；成纤维细胞；N6-甲基腺苷甲基化；
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【中文期刊】 李宇琴 张惠 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷1期 163-168页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过分析急性痛风(AG)患者、间歇期痛风(IG)患者、健康人群(HC)外周血单个核细胞(PBMCs)中mRNA的表达差异,探讨差异表达的mRNA在痛风发病中的作用及其机制.方法:选取10例AG患者、10例IG患者、10例健康体检者,采...
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【中文期刊】 于思佳 于太飞 等 《植物遗传资源学报》 2025年26卷7期 1398-1415页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 菜豆是我国重要的可食用豆类,具有丰富的营养成分和广泛的使用价值.盐胁迫对菜豆的生长发育影响显著.本研究以菜豆F0006591为材料,用0.2 mol/L NaCl溶液对苗期菜豆进行盐胁迫处理.利用RNA-seq测序技术,对盐胁迫处理0h、6...
- 概要：
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【中文期刊】 马军羽 张春梅 等 《中国医科大学学报》 2025年54卷6期 493-499页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 研究膳食补充四氢姜黄素(THC)改善2型糖尿病(T2DM)肾损伤的效应,并基于转录组测序技术(RNA-seq)探讨其作用机制.方法 将C57BL/6J小鼠随机分为对照组、模型组(T2DM组)、T2DM+THC组.采用高脂饲料+注射链脲...
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【中文期刊】 马竹萍 陈淼娟 等 《中国医科大学学报》 2025年54卷4期 340-345页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 通过分析纳尔逊海湾病毒(NBV)感染小鼠巨噬细胞RAW264.7转录物组测序结果,筛选差异表达基因,探讨固有免疫应答在呼肠孤病毒感染中的作用机制.方法 用感染复数为30的NBV-Miyazaki病毒株感染小鼠巨噬细胞RAW264.7,...
- 概要：
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【中文期刊】 陈昊 董瑞 等 《遗传》 2025年47卷9期 1032-1041页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 义乌小鲵(Hynobius yiwuensis)是中国特有的易危小鲵科动物,仅分布于浙江省的部分丘陵山地.本研究采用体式显微镜观察了义乌小鲵断肢再生的过程,并利用转录组测序技术,分析再生过程差异表达基因.结果表明:义乌小鲵肢体具有较强的再生...
- 概要：
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【中文期刊】 阮珍 寇久社 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3767-3774页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:医用臭氧局部注射作为一种新的治疗方法,对损伤的骨骼肌组织具有抗炎、镇痛及免疫调节等作用,但其作用机制尚缺乏系统的研究.目的:观察医用臭氧对兔骨骼肌挤压伤模型的干预效应,通过转录组测序与标记定量蛋白技术分析损伤的兔胫骨前肌在经过臭氧治疗...
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【中文期刊】 侯明双 徐静 等 《中药药理与临床》 2025年41卷8期 13-19页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过网络药理学和转录组测序(RNA-seq)技术分析武威汉简瘀方对高血压肾损伤大鼠的保护作用机制.方法:16 周龄WKY和SHR大鼠随机分为正常对照组、模型对照组、缬沙坦7.14 mg/kg组和武威汉简瘀方7.14、14.29、28....
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【中文期刊】 喻鹏 董世惠 等 《肾脏病与透析肾移植杂志》 2025年34卷2期 138-146页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:阐明永生化足细胞与活体足细胞的基因表达差异.方法:本研究基于人类活体足细胞的单细胞RNA测序数据库以及我们对人永生化足细胞的RNA测序,比对两者基因表达谱以发现差异表达的基因.为修正人永生化足细胞的基因变化,体外足细胞转染WT1 质粒...
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【中文期刊】 陈丽娟 张雨晴 等 《中国现代中药》 2025年27卷6期 1059-1071,前插1-前插2页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:获得枸杞红瘿蚊Gephyraulus lycantha Jiao&Kolesik的触角转录组数据,挖掘其嗅觉相关基因.方法:采用Illumina NovaSeq 6000 测序平台对枸杞红瘿蚊雌、雄成虫触角转录组进行测序,比对非冗余蛋...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 许秋雨 严国锋 等 《实验动物与比较医学》 2025年45卷2期 119-129页ISTICCA
【摘要】 目的 通过对青春期前小鼠进行来曲唑缓释片皮下给药和高脂饮食处理,构建小鼠多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)模型,比较模型小鼠与安慰剂对照小鼠的肝脏转录组差异,以探索PCOS发病过程中肝脏的作用机制...
- 概要：
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【中文期刊】 黄师琼 何鸽飞 等 《湖南师范大学学报（医学版）》 2025年22卷3期 73-81页ISTIC
【摘要】 目的:筛选肝细胞癌(hepatellular carcinoma,HCC)的特征基因,构建有效的HCC预后模型,为HCC患者的预后提供更准确的评估.方法:基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 舒若 罗华友 等 《昆明医科大学学报》 2025年46卷9期 15-22页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学和细胞实验阐述APOE在结肠癌耐药中的潜在机制.方法 从GEO数据库下载微阵列数据集GSE196900,利用在线工具GEO2R分析耐药组和对照组之间的差异表达的基因,差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 魏唯 金玉青 等 《河北医科大学学报》 2025年46卷7期 808-817页ISTICCA
【摘要】 目的 识别结核病患者中关键的代谢基因,并探讨这些基因的诊断价值.方法 使用GEO数据库下载数据集GSE83456和GSE42834.通过差异分析、通路富集分析、机器学习算法等方法,对结核病中关键代谢基因进行了挖掘与分析.结果 在结核病患者和...
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【中文期刊】 罗嫚 马强 等 《川北医学院学报》 2025年40卷5期 545-550页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨抗抑郁症药物沃替西汀对食管鳞癌细胞增殖和转移的作用和分子机制.方法:使用不同浓度(0、2、4、6、8、10 μmol/L)的沃替西汀处理食管鳞癌细胞系Eca109 和KYSE150,采用CCK-8 实验检测细胞活力,Transwe...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 杨菲 王芳 《生殖医学杂志》 2025年34卷7期 1005-1009页ISTICCA
【摘要】 复发性流产(RSA)在育龄妇女中的发生率约占1％～5％.虽然研究表明RSA与子宫内膜蜕膜化失败、胎盘功能障碍和母胎界面免疫微环境障碍等有关,但确切的发病机制尚不清楚.随着高通量技术的发展,对RSA的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的...
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【中文期刊】 潘季伟 高月颖 等 《海南医学》 2025年36卷14期 1981-1990页ISTICCA
【摘要】 目的 识别RNA结合蛋白(RBP)在新型冠状病毒感染(COVID-19)发展过程中的动态变化,并构建基于RBP调控子的分类模型用于预测COVID-19进程及区分疾病感染进程中的细胞类型.方法 从GEO数据库下载2022年10月更新的有关CO...
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【中文期刊】 杨杨 李良远 等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷3期 1264-1277页
【摘要】 旨在筛选与季节性发情相关的核心基因和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA).本研究选取2～3岁空怀的中国美利奴羊和湖羊母羊(乏情期、发情期和发情间期各3只),采集卵巢组织样本,采用RNA-seq技术筛选差异...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 岳山 赵秀华 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷11期 5254-5264页
【摘要】 [目的]以浙东白鹅(♂)与浙籽鹅F1代(♀)杂交产生的浙籽鹅F2代母鹅为研究对象,分析浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液转录组数据,筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关的候选基因,为杂交鹅的繁殖调控提供参考.[方法]采集浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液样...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 张心慈 孙宇晴 等 《淮海医药》 2025年43卷3期 259-262页CA
【摘要】 目的:探讨 MAX 二聚化蛋白 1(MXD1)基因在食管癌细胞和癌旁组织中的表达情况,及其对食管癌患者预后的影响.方法:利用GEO表达谱数据库下载基因芯片GSE20347 数据,利用R语言分析食管癌与配对癌旁组织中差异表达的基因,并绘制火山...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘嗣睿 刘洪飞 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷4期 1468-1477页
【摘要】 [目的]利用北京鸭(Pekin duck)与绿头野鸭(Mallard duck)基因组重测序数据、转录组数据以及血浆生化指标筛选调控北京鸭脂肪沉积相关候选基因.[方法]分别选取3只42日龄北京鸭公鸭与绿头野鸭公鸭,采集翅下静脉血并分离血浆,...
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