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【中文期刊】 蓝锶菡 冯敏 《协和医学杂志》 2024年15卷6期 1364-1371页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于全长序列分析人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)53不同分离株的进化关系,并对代表性分离株病毒蛋白(E1、E2、E4、E6、E7、L1和L2)的理化性质、二级结构及B细胞与T细胞抗原表位进行预测.方法 ...
- 概要:
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【中文期刊】 刘晓轩 吴帆 等 《黑龙江畜牧兽医》 2021年8期 130-133页
【摘要】 为分析以色列急性麻痹病毒(Israeli acute paralysis virus,IAPV)LN株VP2 蛋白的序列并预测B淋巴细胞抗原表位,试验以IAPV-LN株RNA为模板,采用RT-PCR 扩增VP2 基因,通过BLAST序列比对...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 夏宏林 何颖 等 《中国免疫学杂志》 2012年28卷1期 57-61页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:预测苹果过敏原Mal d 4蛋白B细胞和T细胞抗原表位,探讨Mal d 4蛋白与其同源蛋白之间的交叉反应性.方法:以苹果过敏原Mal d 4蛋白的氨基酸序列为基础,采用生物信息软件HNN预测二级结构;运用DNAStar和Bcepred...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 陈勤 张国庆 等 《国际医学寄生虫病杂志》 2011年38卷3期 140-143页ISTICCA
【摘要】 目的 对恶性疟原虫MAL13P1.129基因的抗原表位进行预测,表达其重组蛋白并进行免疫学鉴定.方法 利用生物信息学分析方法对MAL13P1.129基因的线性抗原表位进行预测,从亲水性、表面可及性、柔韧性及二级结构等方面对抗原表位进行筛选....
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 周胜 高歌 等 《黑龙江农业科学》 2012年3期 25-29页
【摘要】 为了获得PRRSV非结构蛋白2-半胱氨酸结构域的高纯度原核表达蛋白以及了解该蛋白的抗原表位,试验以从PRRSV-VR2332毒株上提取的病毒全基因组RNA为模板,通过RT-PCR扩增非结构蛋白2-半胱氨酸结构域(Nsp2pro)基因,连接构...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李丽竹 周必英 《中国血吸虫病防治杂志》 2022年34卷3期 286-291页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对猪囊尾蚴排泄分泌抗原中差异表达蛋白富含亮氨酸重复序列结构域15(leucine-rich repeat containing 15,LRRC15)进行真核表达,并预测其抗原表位.方法 通过在线软件ExPASy-PortParam和P...
【关键词】 猪囊尾蚴;排泄分泌抗原;富含亮氨酸重复序列结构域15;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 王国戗 牛菊霞 等 《中国病原生物学杂志》 2009年4卷12期 890-892,895页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 预测甲型H1N1流感病毒血凝素可能的B细胞抗原表位.方法 以甲型流感病毒血凝素的氨基酸序列一级结构为基础,用生物信息学手段预测血凝素氨基酸序列的二级结构并分析其序列的亲水性指数、柔韧性指数、可及性参数、极性参数以及抗原指数,推测B细胞...
【关键词】 甲型H1N1流感病毒;血凝素;预测;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 欧阳玉梅 《生命科学》 2010年22卷9期 946-951页ISTICCSCD
【摘要】 抗原表位预测是免疫信息学研究的重要方向之一,可以给实验提供重要的线索.B细胞表位或抗原决定簇是抗原中可被B细胞受体或抗体特异性识别并结合的部位.实际上,近90%的B细胞表位是构象性的.即使抗原蛋白质三级结构已知,B细胞表位预测仍然是一大挑战...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 黄转青 孙琦 等 《中国医药导报》 2023年20卷18期 15-19页ISTICCA
【摘要】 目的 通过免疫信息学方法预测针对中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)的T/B细胞抗原表位.方法 从NCBI获取S蛋白序列后,运用MEGA11进行多序列比对及系统发育树构建,Expasy Protparam分析其理化性质,SOPMA预测...
【关键词】 中东呼吸综合征冠状病毒;T/B细胞表位;抗原表位;
- 概要:
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【中文期刊】 郝红云 王晓曼 等 《中国食品药品监管》 2023年2期 12-27页
【摘要】 现代生物技术的快速发展使生物医药行业发生了革命性的变化.疫苗的开发虽已取得了诸多成果,但仍有很多疾病不能预防,新兴技术加快了疫苗的研发速度,有望成为开发针对这些疾病疫苗的有效手段.随着全基因组测序的迭代更新和生物信息学的兴起,反向疫苗学技术...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 翟文杰 吴亚红 等 《郑州大学学报(医学版)》 2017年52卷5期 544-549页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:设计针对癌睾抗原PLAC1、PL2L60、MAGE-3的长肽,并检测其免疫活性.方法:利用在线数据库预测PLAC1、PL2L60、MAGE-3的CTL表位,在表位集中区域选取适当长度的长肽,化学合成并纯化后,通过体外和体内活性实验验证...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 朱伟峰 陈露 等 《养殖与饲料》 2021年20卷11期 16-19页
【摘要】 首先通过多序列比对分析不同血清型菌株GAPDH的一级结构保守性,然后使用在线软件Bepipred-2.0预测巴氏杆菌GAPDH线性B细胞表位,并通过人工化学合方式合成GAPDH表位对应的多肽.最后使用间接ELISA法检测这些多肽与巴氏杆菌G...
【关键词】 巴氏杆菌;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;保护性抗原;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 朱伟峰 陈露 等 《江苏农业科学》 2021年49卷22期 171-174页
【摘要】 为预测并鉴定猪丹毒丝菌甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)分子线性B细胞表位,首先通过多序列比分析已经全基因组测序的10株菌株的GAPDH一级结构保守性;然后使用在线软件Bepipred-2.0预测猪丹毒丝菌GAPDH线性B细胞表位,接下来...
【关键词】 猪丹毒丝菌;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;保护性抗原;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 崔瑞娜 白雪娟 等 《中国人兽共患病学报》 2015年31卷6期 541-546页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 预测结核分枝杆菌Rv3134c的抗原表位,了解其免疫学特性.方法 利用DNAStar软件包中Protean软件对Rv3134c氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、表面可能性、柔韧性等多参数预测其二级结构及T细胞和B细...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 杨军 刘妮 等 《南方医科大学学报》 2013年33卷2期 253-257页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 预测并鉴定乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)的B细胞线性表位,为乙型肝炎的诊断和治疗提供新的依据.方法 采用生物信息学分析技术,利用NCBI数据库和免疫表位数据库提供的相应软件预测HBeAg的B细胞线性表位,采用人工合成法合成相应表位肽...
【关键词】 乙型肝炎病毒;乙肝e抗原乙型肝炎病毒;抗原表位预测;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 林巧爱 董海艳 等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷11期 1067-1071页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 预测解脲支原体(Ureaplasma urealyticum,Uu3和14血清型多带抗原(multiple banded antigen,MBA)的优势B细胞表位和Th表位.方法 利用GOR4和HNN方法预测Uu3和Uu14血清型MB...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 赵文娟 田亮 等 《生物技术通报》 2012年1期 139-144页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 旨在扩增牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的编码基因,并预测OmpH蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH在免疫保护中所起的作用.对牦牛多杀性巴氏杆菌的外膜蛋白OmpH基因进行PCR扩增及序列测定.应用生物...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 陈飞 高艳锋 等 《郑州大学学报(医学版)》 2011年46卷6期 839-841页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:预测结核分枝杆菌( MTB)耐药相关药物外排抗原(Rv1634、Rv2846c、Rv2937、Rv2686c、Rv2687c 及Rv3065)的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位.方法:通过NCBI数据库获取目的蛋白的...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 姜久昆 林旭瑷 等 《浙江大学学报(医学版)》 2008年37卷6期 585-591,621页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:预测及筛选问号钩端螺旋体(简称钩体)属特异性外膜蛋白LipL41有效T和B细胞(T/B)联合表位,了解不同基因型LipL41s差异T/B联合表位的免疫反应性差别.方法:采用生物信息学方法预测LipL41/1和LipL41/2分子中T/...
【关键词】 钩端螺旋体,问号/免疫学;细菌外膜蛋白质类/生物合成;细菌外膜蛋白质类/分离;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 董永生 段义农 等 《现代预防医学》 2008年35卷18期 3605-3607,3612页ISTICPKUCA
【摘要】 [目的]预测卡氏肺孢子虫主要表面抗原(MSG)片段的B细胞和T细胞抗原表位. [方法]运用Sig-nalp3.0、EMBOSS等网络服务器推测卡氏肺孢子虫MSG抗原片段的B细胞和T细胞抗原表位,分析预测结果. [结果]MSG抗原片段存在3个...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 耿淼 贾正才 等 《第三军医大学学报》 2000年22卷10期 934-936页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的预测黑色素瘤抗原MAGE-2的HLA-A2限制性CTL表位.方法采用超基序法与量化基序法的联合应用.结果发现8个HLA-A2限制性CTL表位.结论超基序法与量化基序法联合应用可以提高预测效率.
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 高瞻 邵军军 等 《中国兽医杂志》 2020年56卷1期 13-17页
【摘要】 为了预测非洲猪瘟病毒2018/AnhuiXCGQ株p72蛋白的T、B淋巴细胞抗原表位,并完成多表位疫苗的构建.试验采用生物信息学技术ExPASy、SOMPA、PSIPRED Server、DNASTAR及Phyre对该蛋白的理化性质、二级结...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 郭富城 金丽 等 《浙江农业学报》 2020年32卷5期 762-769页
【摘要】 本研究旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)N基因进行克隆构建、表达与其B细胞抗原表位性质的预测.将PEDV的N基因进行PCR扩增,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,经酶切...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张誉小 杨一娟 等 《中华实验和临床病毒学杂志》 2025年39卷1期 9-17页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 目的:分析人乳头瘤病毒(Human papillomavirus, HPV)39基因组遗传变异特征,并对病毒早期蛋白(E1、E2、E6、E7)和晚期蛋白(L1、L2)的T、B细胞优势抗原表位进行预测和筛选。方法:从临床样本和NCBI数据库中...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘振卫 曲章义 等 《哈尔滨医科大学学报》 2015年49卷1期 8-12页ISTICCA
【摘要】 目的 预测人腺病毒55型六邻体蛋白B细胞抗原表位.方法 使用DNAStar软件Protean模块,PSIPRED在线服务器和SWISS-MODEL在线服务器联合预测人腺病毒55型六邻体蛋白B细胞抗原表位.结果 构建了人腺病毒55型六邻体蛋白...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 王文龙 赵学亮 等 《畜牧兽医学报》 2018年49卷3期 644-651页
【摘要】 为分析并预测斯氏副柔线虫免疫相关基因CTPK编码蛋白结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,通过提取斯氏副柔线虫组织RNA,反转录合成cDNA,设计特异性引物以扩增CTPK基因的CDS区,并利用生物信息学软件对CTPK进行蛋白质结构分析和...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李艳秋 鲍布和 等 《武警后勤学院学报(医学版)》 2012年21卷7期 494-498,封2页ISTICCA
【摘要】 [目的]从理论上分析预测肿瘤抗原MAGE- 12(melanoma antigen- 12)的HLA-A2(histocompatility leukocyte antigen-A2)限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lym...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘丽娜 潘渠 等 《成都医学院学报》 2012年7卷4期 558-562页ISTICCA
【摘要】 预测金葡菌疫苗候选分子SirH的B细胞抗原表位.用PCR方法从金葡菌临床分离株的基因组DNA中扩增出sirH基因,插入表达载体pET-28a(+)中,构建重组表达载体pET28a-sirH,双酶切鉴定并测序,通过与GenBank中登录的金葡...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 张秀敏 王军伟 等 《现代肿瘤医学》 2009年17卷10期 1839-1842页ISTICCA
【摘要】 目的:预测肝癌肿瘤抗原AFP新的HLA-A2/A24限制性CTL表位,为肝癌CTL表位肽的筛选及鉴定提供依据.方法:选择与肝癌密切相关的肿瘤抗原AFP为研究目标,采用NetCTL 1.2 Server远程预测系统进行HLA-A2/A24限制...
【关键词】 甲胎蛋白;HLA-A2/A24抗原;细胞毒性T淋巴细胞表位;
- 概要:
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【中文期刊】 高艳锋 翟明霞 等 《现代肿瘤医学》 2008年16卷6期 893-895页ISTICCA
【摘要】 目的:预测基于癌-睾丸抗原SSX-3的HLA-A2/A3限制性CTL广谱表位.方法: 采用MULTIPRED在线预测系统分别针对HLA-A2超型和HLA-A3超型对SSX-3序列进行CTL表位预测,其中对两种超型分值均较高的表位被初步认定为...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 高艳锋 翟明霞 等 《现代肿瘤医学》 2008年16卷11期 1850-1851页ISTICCA
【摘要】 目的:预测肿瘤相关抗原CT45的HLA-A2/A3限制性CTL表位,为CTL表位肽的合成和活性筛选提供依据.方法:基于新近发现的CT45抗原的氨基酸序列,用NetCTL 1.2 Server人工神经网络法远程预测系统进行HLA-A2/A3限...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 周勇 马玲 《新疆医科大学学报》 2008年31卷8期 955-958页ISTICCA
【摘要】 目的:预测并综合分析人卵透明带3(human zona pellucida 3, hZP3)蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位.方法:以hZP3蛋白的基因序列为材料,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 王鹏飞 欧琴 等 《生物医学工程与临床》 2007年11卷5期 402-405页ISTICCA
【摘要】 目的 分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,gen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础.方法 以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和James...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 陈燕 娄加陶 等 《临床军医杂志》 2007年35卷1期 18-20页ISTICCA
【摘要】 目的 预测及鉴定新的HLA-A*0201结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)抗原Ag85A中的CD8+CTL优势表位.方法 应用数据库SYFPEITHI预测可能存在的HLA-A*0201的限制性CD8...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 王昊亮 付晓岚 等 《免疫学杂志》 2006年22卷6期 593-596页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A * 0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 杨玓 姜曼 等 《免疫学杂志》 2006年22卷2期 158-161页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的鉴定骨髓瘤抗原Sp17的HLA-A*0201限制性CTL表位.方法采用超基序和量化基序法预测Sp17的HLA-A*0201限制性CTL表位;用T2细胞亲和力实验和稳定性实验对该表位进行初步鉴定.结果超基序和量化基序法预测得出Sp17抗原...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李静 刘建华 等 《中国畜牧兽医》 2017年44卷5期 1484-1490页
【摘要】 试验旨在应用生物信息学技术综合分析马疱疹病毒1型(equine herpesvirus 1,EHV-1)gB糖蛋白,预测B细胞表位,筛选出具有潜在诊断价值的线性B细胞表位.将EHV-1 gB糖蛋白的基因序列输入DNAStar软件中的Prot...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 杨菊梅 马建忠 等 《食品科学》 2017年38卷16期 71-78页
【摘要】 应用IEDB、DNAStar、DNAMAN和SnapGene等生物信息学工具对草莓轻型黄边病毒外壳蛋白的氨基酸残基序列进行分析.选择一段抗原性较强的肽段(位于外壳蛋白27~38氨基酸残基处),依据大肠杆菌(Escherichia coli)...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张秀敏 隋延仿 等 《现代肿瘤医学》 2005年13卷2期 149-151页ISTICCA
【摘要】 目的预测黑色素瘤抗原MAGE-12的HLA-A2限制性CTL表位.方法采用SYFPEITHI超基序远程预测系统与量化基序多项式法、延展基序联合应用,筛选MAGE-12抗原HLA-A0201限制性CTL表位.结果共预测出5个MAGE-12抗原...
【关键词】 肿瘤抗原;MAGE-12;细胞毒性T淋巴细胞表位;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 韩俊锋 吴玉章 等 《免疫学杂志》 2004年20卷4期 256-258页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的鉴定慢性白血病肿瘤抗原CMl28的HLA-A*0201限制性CrL表位.方法采用超基序和量化基序结合的方法初步预测CML28的HLA-A*0201限制性CTL表位;利用T2细胞亲合力实验初步验证预测结果.结果在预测的4个候选CTL表位中...
- 概要:
- 方法:
- 结论: