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【中文期刊】 杨美洁 张兴 等 《医学信息学杂志》 2019年40卷4期 55-58页 ISTICCA
【摘要】 详细阐述基于本体技术的高血压知识库平台构建,包括本体库以及Web端界面等,指出该平台可以为高血压诊断和治疗提供依据,为其他慢病知识库平台构建提供借鉴.
【中文期刊】 王晓 罗二平 等 《医疗卫生装备》 2008年29卷4期 45-46页 ISTICCA
【摘要】 目的:研究检索结果更精确的电子病历检索算法,更好地促进电子病历在科研辅助方面的开发利用.方法:以基于关键字的全文检索技术为基础.通过对电子病历档案库的前期分析,自动学习相关领域词汇的语义关系并建立本体库,在此基础上对电子病历进行全文语义检索...
【中文期刊】 高娅娅 李妙雨 等 《海南医学院学报》 2024年30卷7期 515-525页 ISTICPKU
【摘要】 目的:探讨同种异体移植炎症因子-1(allograft inflammatory factor 1,AIF1)在急性髓系白血病(AML)免疫和预后中的价值.方法:利用生物信息学方法分析AIF1在AML中的表达及其与AML患者生存预后的关系....
【关键词】 AIF1； 急性髓系白血病； 京都基因与基因组数据库富集分析；
【中文期刊】 祖红月 于惠 等 《中国数字医学》 2024年19卷9期 37-43页 ISTIC
【摘要】 目的:整合中医领域知识,以辅助诊疗为应用导向,构建全领域中医本体及知识库,实现中医知识图谱的可视化和查询应用研究,为构建具有辨证思维的智能推理系统提供结构和方法基础.方法:以中医学教材等领域知识为知识源,采用本体构建七步法,基于网络本体语言...
【中文期刊】 齐文颖 邹翔云 等 《中西医结合肝病杂志》 2024年34卷10期 865-869页 ISTICCA
【摘要】 目的:为了给中西医结合治疗慢性乙型肝炎(CHB)提供更加全面、综合的治疗策略,形成系统化和结构化的知识体系,辅助实现知识的共享与交互,构建一个融合中西医结合治疗理念、方法和实践的CHB本体知识库.方法:基于斯坦福医学院本体七步法,以网络本体...
【中文期刊】 郭社卫 甄英伟 等 《中华神经外科疾病研究杂志》 2024年18卷5期 15-21页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于中国脑胶质瘤基因组图谱数据库(CGGA)资料分析,构建有效预测胶质母细胞瘤(GBM)患者预后的列线图模型,以期为临床治疗提供帮助.方法 从CGGA数据库获取下载全基因转录组_693(mRNAseq_693)测序数据及临床数据,应用...
【关键词】 胶质母细胞瘤； 中国脑胶质瘤基因组图谱数据库； 基因本体分析；
【中文期刊】 张思淼 任丽莉 《继续医学教育》 2024年38卷8期 188-192页
【摘要】 目的 阐明胃癌(gastric cancer,GC)组织与癌旁组织之间的基因表达差异,并评估其预后价值.方法 从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中选取 3 个GC微阵列数据集(GSE79973、G...
【中文期刊】 许博 郑福增 等 《中国医科大学学报》 2023年52卷8期 718-723,735页 ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 探寻能有效区分类风湿关节炎(RA)和骨关节炎(OA)的潜在生物标志物,并探讨二者在生物信息学方面差异的意义.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载2份RA和OA作为相互对照样品的公开可用基因表达谱(GSE55235、GSE55457...
【中文期刊】 任高 张伦伦 等 《湖南中医药大学学报》 2023年43卷9期 1664-1671页 ISTICCA
【摘要】 目的 系统梳理中医不寐知识,构建中医不寐知识图谱,实现知识关联、知识融合及深度挖掘,为智能化诊疗提供新的路径与方法.方法 以《景岳全书》《类证治裁》等中医古籍和《中医内科学》《针灸学》等国家规划教材为数据来源,通过本体构建、语义消歧等方法得...
【中文期刊】 郝惠娟 刘丹红 等 《中国卫生信息管理杂志》 2023年20卷2期 309-314页 ISTIC
【摘要】 目的 对《卫生信息数据元值域代码》(WS364—2011)中有关医学观察的信息进行整合,构建知识库,使内容分散、含义交叉或重叠的数据元表达明确的语义,进而判断并推理知识语义.方法 参照H L7参考信息模型,利用本体思想对数据元值域进行提炼、...
【中文期刊】 靳淑雁 王爽 等 《医学信息学杂志》 2023年44卷12期 65-70页 ISTICCA
【摘要】 目的/意义 创建乳腺癌知识图谱的本体模型,实现乳腺癌知识的结构化表达和可视化展示.方法/过程 对乳腺癌知识进行抽取和表示,利用Protégé软件创建乳腺癌知识图谱本体模型.模型包含患者、患者基本信息、检查、诊断、检查实体属性值5类实体,以及...
【中文期刊】 拉毛东只 拥措 等 《中国数字医学》 2023年18卷7期 92-95页 ISTIC
【摘要】 藏医三因学是藏医药领域的核心理论,构建藏医三因学本体知识库对藏医药相关领域知识库构建具有重要意义.以《藏医药基本术语标准》及相关的专业教材为知识范畴;使用Protégé5.5.0,Web本体语言(OWL)作为本体的语言描述,借助斯坦福大学医...
【中文期刊】 王秀峰 陈桂容 等 《医学研究杂志》 2023年52卷12期 83-88页 ISTIC
【摘要】 目的 通过多重生物信息学筛选慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)关键基因及通路,为ACLF分子生物学研究和生物学标志物筛选提供理论依据.方法 首先从基因表达数据集(Gene Express...
【中文期刊】 梅文健 郭永刚 《西藏科技》 2023年45卷12期 74-80页
【摘要】 为实现大坝强震领域的知识整合、共享和更新,针对该领域知识难以有效组织管理、复用和共享的问题,将基于本体的知识建模技术引入到大坝强震知识管理和知识服务中,对知识进行规范化的管理和存储.在实现大坝强震知识库的过程中,首先明确该库的构建流程,并对...
【中文期刊】 张平安 高娜 等 《广东药科大学学报》 2022年38卷3期 98-105页 ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学的方法探究IL-8在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的差异表达机制及其相关基因的功能.方法 使用基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)筛选慢阻肺患者和正常对照样本的mRNA、miRNA...
【中文期刊】 张百平 《中国数字医学》 2022年17卷9期 48-54页 ISTIC
【摘要】 本研究基于药品(包括化学药、中成药、中药饮片)领域不同层次的本体概念构建了基本的药品概念图谱骨架;然后从权威医学药学知识库中抽取药物与药物间重复、拮抗和配伍3种关系构建高质量中文DDI图数据库,并以具体的用药说明书为例,详细阐述药物匹配概念...
【中文期刊】 潘丁龙 陈明芬 等 《癌症进展》 2022年20卷6期 595-598,602页 ISTIC
【摘要】 目的 探讨C末端驱动蛋白1(KIFC1)在肝癌中的表达及其临床意义.方法 分别应用Oncomine、TPA及UALCAN数据库分析KIFC1在肝癌组织及正常肝脏组织中的表达情况,并探讨KIFC1表达与肝癌患者临床特征及预后的关系,通过STR...
【中文期刊】 刘东波 韦昌法 等 《数字中医药（英文版）》 2022年5卷4期 394-405页
【摘要】 目的 建立《伤寒论》"病-证-症-法-方"知识图谱,降低数据的模糊性和不确定性问题,为后期的知识推理及其应用奠定基础.方法 在中医经方专家指导下,采用"自顶向下为主,自底向上为辅"的方式,针对《伤寒论》原文从病、证、症、法、方五个方面进行知...
【中文期刊】 郭梦莹 周璐 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2019年21卷12期 2646-2651页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 中医辨证知识间高度的关联性导致在中医辨证智能化研究中,探索构建的中医辨证模型临床实用性不高.故探索一种可使辨证知识形成高度关联性的表达方法成为现阶段的一大研究方向."领域本体七步法"是将零散的知识结构化的一种方法,本体、语义网和知识图谱均可...
【中文期刊】 万润之 孙丽平 等 《中国医药导报》 2021年18卷36期 183-188页 ISTICCA
【摘要】 以中医儿科教材和小儿肺炎相关诊疗指南、规范、专家共识作为知识范畴,本文使用本体构建工具Protégé构建肺炎喘嗽本体的类和类目、类和类的关系以及类的实例,完成一致性检验,实现本体的推理功能.本文采用Java程序语言的数据驱动文档库实现本体知...
【中文期刊】 范宁 代增强 等 《肝胆胰外科杂志》 2021年33卷1期 25-31页 ISTICCA
【摘要】 目的 鉴定胆管癌(cholangiocarcinoma,CCA)甲基化与表达谱综合生物标志物,预测CCA患者预后.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载33例CCA样本和8例正常样本基因组甲基...
【中文期刊】 闫淼佳 陈之浩 等 《中国数字医学》 2021年16卷12期 38-42页 ISTIC
【摘要】 目的:通过REDCap系统构建医学本体资源库,用本体对元数据进行描述和标记,实现高效的数据索引、整合,并进行充分的数据挖掘与分析.方法:基于REDCap系统提供的"本体"模块,快速搭建医学本体资源库并予以应用.结果:通过REDCap系统构建...
【中文期刊】 郭靖文 杨晟 等 《中国生物医学工程学报》 2017年36卷5期 557-564页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中.本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加.为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台.通...
【中文期刊】 郑洁 《护理研究》 2017年31卷20期 2447-2449页 ISTICPKU
【摘要】 介绍了本体知识库的概念、组成内容及构建方法以及国内外关于本体知识库在护理实践领域的应用,并结合我国护理信息化基础,对构建本土化护理实践领域本体知识库的可行性进行了分析,旨在为临床护理信息化的进一步发展和应用提供新思路.
【中文期刊】 李星雨 李锴文 等 《中国数字医学》 2020年15卷10期 25-29页 ISTIC
【摘要】 膀胱癌作为泌尿系统最常见的恶性肿瘤,其复杂的诊断分级、治疗手段及应用指征限制了临床诊疗的决策有效性及高效性.从临床需求分析出发,进行了科学而全面的知识采集,基于本体建模原理并借助Protégé工具构建了膀胱癌专病知识库.在此基础上绘制知识图...
【中文期刊】 蔡斌 江华 等 《中华急诊医学杂志》 2013年22卷6期 591-596页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用系统生物学方法,研发一种基于转录组表达谱的基因网络可视化工具,以直观显示急性心肌梗死后早期的转录组和代谢调控的整体变化.方法 在美国国立卫生研究中心(NCBI) GEO数据库下载编号为GDS2331的一个急性心肌梗死后大鼠心脏左心...
【中文期刊】 张智 董晓文 《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 2013年34卷3期 286-291页 ISTICPKUCA
【摘要】 机构知识库是以资源共享为导向的学术交流渠道,具有很好的研究价值.本研究主要工作如下:①借助RRS的工作原理及技术,实现机构知识库中资源的有效整合；②引入本体概念以构建用户兴趣模型,用基于本体如权向量模型表示RSS源；③给出了显示和隐式两种信...
【中文期刊】 张治国 牛旭艳 等 《中国骨质疏松杂志》 2011年17卷4期 279-290页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,发现其中其中包含的分子复合物和未经研究或研究较少的与骨质疏松症相关的蛋白质.方法 基于OMIM数据库中与骨质疏松症发生相关的177个遗传基因,应用 Cytoscape软件及其插件Ag...
【关键词】 骨质疏松症； 在线人类孟德尔遗传数据库； 蛋白质相互作用网络；
【中文期刊】 郝丽 李和平 等 《遗传》 2011年33卷4期 371-377页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 文章通过对东北梅花鹿(Cervus nippon hortulorum)鹿茸尖端组织cDNA文库随机测序获得了906条高质量ESTs,906条ESTs拼接后代表了701个Unigenes,其中包括重叠群86个,单拷贝615个.Blast分析...
【中文期刊】 张晨 杨帆 等 《湖南师范大学学报（医学版）》 2019年16卷2期 176-180页 ISTIC
【摘要】 目的:探讨桂枝茯苓胶囊的药理网络及分子作用机制.方法:应用BATMAN-TCM数据库,依据Perlman的相似性方法预测桂枝茯苓胶囊各中药成分的潜在靶标,构建蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)...
【关键词】 桂枝茯苓胶囊； 生物信息学； BATMAN-TCM数据库；
【中文期刊】 王莹 郭雄 等 《山东医药》 2019年59卷21期 1-6页 ISTICCA
【摘要】 目的 筛选原发性骨性关节炎(OA)膝关节软骨细胞中差异表达的环状RNA(circRNA)及miRNA,并分析其生物学功能、相关代谢通路及相互作用.方法 首先用GeneSpring software V13.0软件筛选出5例OA及5例正常对照...
【中文期刊】 谢俞宁 仵红娇 等 《山东医药》 2019年59卷12期 18-21页 ISTICCA
【摘要】 目的 筛选食管癌甲基化驱动基因,并进行功能及调控通路分析.方法 搜集TCGA数据库中基因表达数据、DNA甲基化数据、临床信息完整的食管癌患者资料162例,记为肿瘤组;其中16例有癌旁对照资料,记为对照组.使用R语言MethylMix包综合分...
【中文期刊】 何熠 熊海风 等 《广西医学》 2019年41卷18期 2321-2325页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选骨关节炎相关的差异表达基因(DEGs),并分析其生物学功能.方法 从GEO数据库下载微阵列数据集GSE1919,其包括5个骨关节炎样品和5个匹配的对照样品.利用R语言的Limma工具包进行数据分析,筛选DEGs....
【中文期刊】 陈德彦 赵宏 等 《软件学报》 2020年31卷10期 3167-3183页
【摘要】 健康医疗领域是一个知识密集型的领域,临床诊断的质量主要依赖于医生所掌握的健康医疗知识以及临床经验.然而,单个医生的能力仍然非常有限,所以目前临床诊断的质量并不高.为此,提出一种基于领域语义知识库的疾病辅助诊断方法,基于Freebase中me...
【中文期刊】 陈德彦 赵宏 等 《软件学报》 2020年31卷9期 2855-2882页
【摘要】 由于本体具有强大的知识表示和推理能力,本体已经在很多领域得到了广泛应用.然而,本体的深入应用还面临着很多深层次的共性语义映问题,已有的本体建模方法仅仅提出了一些简单的指导原则和基本步骤,使得知识工程师仍然无从下手.在基于领域专家知识构建领域...
【中文期刊】 刘雷 王星 《中华医学图书情报杂志》 2018年27卷6期 1-9页 ISTICCA
【摘要】 根据"精准医学本体和语义表示标准",构建了"精准医学知识库"及"精准医学知识库管理与共享平台".该精准医学知识库体系具有标准规范、信息全面、开放共享、用户友好以及动态更新等特点,将全面支撑精准医学基础研究和临床应用,填补了国内精准医学知识库...
【中文期刊】 朱玲 李敬华 等 《湖南中医药大学学报》 2018年38卷10期 1154-1160页 ISTICCA
【摘要】 基于Web本体语言 (web ontology language,OWL)构建功能性胃肠病(functional gastrointestinal disorders,FGIDs)的领域本体,在此基础上扩充海量实例,建立包含本体库、规则库、...
【中文期刊】 王译 丁腊春 等 《医学信息学杂志》 2018年39卷6期 53-55页 ISTICCA
【摘要】 将本体、知识库与孕产疾病知识结合构建基于本体的孕产知识库,阐述具体构建步骤,包括明确本体领域范围,列举概念术语,定义类、属性及类之间的关系,创建本体实例等方面,促进孕产知识复用与共享.
【中文期刊】 高星 王岩 等 《中华医学图书情报杂志》 2018年27卷10期 8-13页 ISTICCA
【摘要】 以糖尿病相关的文献、防治指南和专家经验等知识为基础,通过本体技术构建糖尿病相关知识的领域建模,完成概念、关系、属性、约束和实例的知识梳理和表示,基本实现了糖尿病知识可视化展示、知识推理、知识检索和知识共享等应用,为构建更加完善的糖尿病管理知...
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