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【中文期刊】 刘玲杰 林孟宣  等 《临床口腔医学杂志》 2025年41卷2期 95-100页 ISTIC

【摘要】 目的:通过生物信息学分析及实验验证与牙周炎相关的昼夜节律枢纽基因,探究昼夜节律相关基因在牙周炎发生发展中的作用.方法:利用R软件筛选牙周炎的差异表达昼夜节律相关基因并进行富集分析,以寻找关键通路和基因,并通过临床收集牙周炎和健康患者唾液样本...

【关键词】 牙周炎； 昼夜节律； 加权基因共表达网络分析(WGCNA)；

【中文期刊】 卢星杉 何纱虹  等 《免疫学杂志》 2024年40卷3期 250-258页 ISTICCSCDCA

【摘要】 目的 急性肾损伤(AKI)是一种可逆但可能危及生命的状况,可由多种基因改变引起.本实验旨在探讨AKI免疫组分中调控炎症性细胞死亡(PANoptosis)的关键基因.方法 本研究使用来自NCBI基因表达组织公共数据库的单核RNA测序数据,分析...

【关键词】 急性肾损伤； 炎症性细胞死亡； 枢纽基因；

【中文期刊】 左旭 李津  《天津医科大学学报》 2023年29卷3期 243-251页 ISTIC

【摘要】 目的:通过生物信息学方法识别系统性红斑狼疮(SLE)疾病进展中与先天免疫细胞相关的的关键基因.方法:在GEO数据库中下载了GSE50772、GSE81622、GSE99967 数据集的表达谱,并对其进行整合.应用CIBERSORT工具对疾病...

【关键词】 系统性红斑狼疮； 加权基因共表达网络分析； 先天免疫细胞；

【中文期刊】 窦承贤 郭菲  等 《天津师范大学学报（自然科学版）》 2023年43卷5期 8-14,43页

【摘要】 为了筛选出潜在的肝癌检测标志物,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus database,GEO)中选择GSE14520、GSE36376、GSE25097数据集,筛选出公共差异表达基因,利用DAVID平台进行富集...

【关键词】 肝癌； 标志物； 差异表达基因；

【中文期刊】 龚道星  《医学信息》 2023年36卷7期 9-16页

【摘要】 目的 利用生物信息学方法探究A型急性主动脉夹层(AAAD)的病理机制、关键靶点以及诊断生物标志物.方法 GEO数据库下载GSE52093数据集,基于差异分析和WGCNA算法,构建基因共表达模块,对关键模块基因进行功能富集分析及PPI网络分析...

【关键词】 A型急性主动脉夹层； 枢纽基因； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 罗东阳 毕国善  等 《吉林医学》 2023年44卷4期 859-869页 CA

【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析方法筛选参与腹主动脉瘤(AAA)免疫反应机制的关键基因.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载人AAA组织基因芯片数据集(GSE7084),其中包含10个正常主动脉样本和9...

【关键词】 腹主动脉瘤； 加权基因共表达网络分析； 免疫浸润；

【中文期刊】 薛继国 刘静  等 《南方医科大学学报》 2021年41卷12期 1752-1762页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法 从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以...

【关键词】 阿尔茨海默病； 加权基因共表达网络分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 王高洁 卢芳  等 《现代肿瘤医学》 2022年30卷13期 2342-2346页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨甲状腺乳头状癌的潜在发病机制、治疗靶点及预后生物标志物.方法:使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)基于来自Gene Expression...

【关键词】 甲状腺乳头状癌； 加权基因共表达网络； 枢纽基因；

【中文期刊】 刘馨璥 范苗苗  等 《牡丹江医学院学报》 2022年43卷3期 60-63,84页

【摘要】 目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因.方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和...

【关键词】 乳腺癌； 枢纽基因； HMMR；

【中文期刊】 刘鑫 朱浩彦  等 《武汉大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 27-35页 ISTICCABP

【摘要】 目的:研究实验性自身免疫性心肌炎(EAM)的分子机制,确定EAM的新生物标记物和靶点,为心肌炎的诊断和治疗提供新的见解.方法:通过差异表达分析GEO数据库中EAM相关数据集GSE155423,筛选出差异表达基因(DEGs).利用STRING...

【关键词】 实验性自身免疫性心肌炎； 枢纽基因； 生物标志物；

【中文期刊】 蔡溦 朱御坤  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...

【关键词】 骨关节炎； 滑膜组织； 枢纽基因；

【中文期刊】 徐菲 刘健萍  等 《中国实验动物学报》 2024年32卷3期 297-306页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨母体葡萄膜炎暴露对子代小鼠受光感受器间视黄醇结合蛋白(interphotoreceptor retinoid-binding protein,IRBP)诱导的实验性自身免疫性葡萄膜炎(experimental autoimmune...

【关键词】 实验性自身免疫性葡萄膜炎； 胚胎炎性暴露； 子代；

【中文期刊】 刘洋 杨俊华  等 《中国卒中杂志》 2024年19卷4期 431-439页 ISTICPKU

【摘要】 目的 本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制.方法 本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象.利用...

【关键词】 烟雾病； 生物信息学分析； 基因表达数据；

【中文期刊】 胡世陈 李婉雯  等 《四川医学》 2024年45卷9期 1008-1018页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学分析、鉴定枢纽基因(hub gene),寻找可以作为肺癌的生物标志物或预后标志物并探讨潜在的分子机制.方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)的数据,鉴定肺癌肿瘤样本与正常样本之间差异表达的基因;利用R软件包中的"Limma...

【关键词】 肺癌； 加权基因共表达网络； 枢纽基因；

【中文期刊】 周彤 赵倩  《天津医科大学学报》 2024年30卷2期 132-137,156页 ISTIC

【摘要】 目的:整合多组学数据筛选胰腺癌进展中的关键基因.方法:在GEO数据库中下载GSE149103数据集,对正常胰腺导管细胞系(HPNE)、原发性胰腺癌细胞系(PANC)以及转移胰腺癌细胞系(Capan)的基因表达及染色质开放性测序数据进行差异分...

【关键词】 胰腺癌； 生物信息学分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 翟梁好 计春敏  等 《蚌埠医学院学报》 2024年49卷12期 1556-1561页 ISTICCA

【摘要】 目的:从基因网络层面挖掘与子宫内膜癌(EC)发生发展过程相关的关键模块及枢纽基因.方法:基于癌症基因组图谱计划(TCGA)中的EC的标本数据,从表达水平和功能水平分析EC与正常组织的差异表达基因(DEGs).利用基因本体(GO)分析进行DE...

【关键词】 子宫肿瘤； 生物信息学； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 崔道林 陈春丽  等 《昆明医科大学学报》 2024年45卷12期 105-114页 ISTICCA

【摘要】 目的 旨在筛选与LN相关的潜在生物标志物,以期用于早期诊断、病情监测和更精准的治疗方案制定.方法 从基因表达谱数据库(gene expression omnibus,GEO)下载了GSE22221、GSE112943、GSE99967和GS...

【关键词】 狼疮肾炎； 系统性红斑狼疮； 生物标志物；

【中文期刊】 林建立 陈耀琦  等 《创伤与急诊电子杂志》 2024年12卷4期 268-277页

【摘要】 目的 利用基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)及Affymetrix人类基因组U133A阵列探索绝经后骨质疏松症女性骨折创伤相关基因和调节基因的相关药物.方法 选择GEO中GSE56815 数据集,通过对...

【关键词】 绝经后骨质疏松症； 病理性骨折创伤； 破骨细胞；

【中文期刊】 张云 徐争元  等 《牡丹江医学院学报》 2024年45卷4期 5-10,129页

【摘要】 目的 旨在揭示结直肠癌与肥胖的关系,为进一步探讨结直肠癌的发病机制提供思路.方法 分别从TCGA和GeneCards数据库中筛选结直肠癌差异表达基因(DEGs)和肥胖相关基因集,利用韦恩图获取共表达基因.通过DAVID数据库对共表达基因进行...

【关键词】 结直肠癌； 肥胖； 枢纽基因；

【中文期刊】 王明霞 马学琳  等 《中国免疫学杂志》 2023年39卷9期 1878-1884,1892页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:筛选并分析浸润性乳腺癌(BRCA)发生发展过程中与免疫浸润有关的预后基因,为进一步寻找BRCA潜在的预后生物标志物及治疗靶点奠定基础.方法:从TCGA数据库下载BRCA患者的mRNA表达信息数据和临床数据,并进行预处理,ESTIMAT...

【关键词】 浸润性乳腺癌； 免疫浸润； 枢纽基因；

【中文期刊】 吴娓娓 王建军  等 《神经疾病与精神卫生》 2023年23卷8期 550-556页 ISTIC

【摘要】 目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别强迫症的共表达模块和枢纽基因.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE60190数据集,对15例强迫症患者和14名健康对照者的尸脑背外侧前额叶皮质(DLPFC)基因表达数据进行分析.通过W...

【关键词】 强迫性障碍； 加权基因共表达网络分析； 功能富集分析；

【中文期刊】 李伟伟 殷秀荣  等 《临床检验杂志》 2023年41卷10期 787-792,798页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学研究梗阻性无精子症(OA)和非梗阻性无精子症(NOA)患者的睾丸组织差异基因的表达,为NOA的诊断提供新的标志物.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载无精子症相关基因的芯片数据(GSE45885和GSE9210)并进...

【关键词】 非梗阻性无精子症； 基因表达综合数据库； 枢纽基因；

【中文期刊】 刘伟 魏晓玲  等 《生物信息学》 2023年21卷1期 60-67页 ISTIC

【摘要】 葡萄转录组已在各种组织、发育阶段、生物胁迫、非生物胁迫和其他条件下被测定.目前,仍没有简单实用的网络工具来探索这些宝贵的数据.本文从美国国立生物技术信息中心的基因表达数据库(NCBI GEO)下载1019个基因表达芯片数据,进行权重基因共表...

【关键词】 基因共表达； 枢纽基因； 连接度；

【中文期刊】 熊华朝 严明权  等 《实用临床医药杂志》 2023年27卷19期 1-6,11页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨线粒体自噬相关基因(MRGs)在胃腺癌(STAD)中的差异表达并挖掘核心基因.方法 从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得STAD患者的临床样本信息,基于基因集富集分析(GSEA)网站和基因卡片(Ge...

【关键词】 胃腺癌； 生物信息学分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 娄海波 毛玉巧  等 《现代消化及介入诊疗》 2023年28卷10期 1238-1244页 ISTIC

【摘要】 目的 通过生物信息学分析HBV感染相关免疫机制,找出定位于HBV感染相关免疫微环境的潜在治疗靶点.方法 从基因表达综合数据库下载GSE121248和GSE55092数据集.使用limma R软件包筛选HBV阳性肝组织样本与正常肝组织样本间的...

【关键词】 乙型肝炎病毒； 生物信息学； 枢纽基因；

【中文期刊】 杨炯 张明华  等 《中国药理学通报》 2022年38卷9期 1408-1415页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析探索抗癫痫药物丙戊酸钠疗效相关的基因模块及核心枢纽基因.方法 从GEO数据库下载表达谱数据,构建基因共表达网络;采用Pearson相关性检验筛选与抗癫痫药物丙戊酸钠疗效显著相关的基因模块,根据模块内的连接性筛...

【关键词】 癫痫； 丙戊酸钠； 疗效；

【中文期刊】 徐磊 马涛  《牡丹江医学院学报》 2023年44卷3期 35-39,31页

【摘要】 目的 通过生物信息学的方法筛选及验证骨肉瘤的枢纽基因.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载与骨肉瘤相关的GSE16088 及GSE36001 基因表达数据集,采用生物信息学的方法获取以上两个数据集中骨肉瘤样本及正常对照样本的共表达差异...

【关键词】 骨肉瘤； 生物信息学； 枢纽基因；

【中文期刊】 庄伟霞 郑冰  等 《中国现代医药杂志》 2023年25卷5期 11-17页

【摘要】 目的 通过生物信息分析发现与肝细胞癌(HCC)预后密切相关的枢纽(Hub)基因,并探讨其临床意义.方法 从基因表达数据库GEO中筛选出 443 个差异表达基因(DEGs);通过GO和KEGG进行功能和通路富集分析;通过STRING数据库对D...

【关键词】 肝细胞癌； 差异表达基因； 预后；

【中文期刊】 袁牧 邢伟  等 《医学信息》 2023年36卷15期 12-18页

【摘要】 目的 研究高原肺水肿的发生和早期进展潜在生物标志物,进一步为高海拔肺水肿的发病和早期进展机制提供理论基础.方法 从GEO数据库中提取出人类基因表达谱GSE52209,使用R软件在数据集中筛选急进入高原48～72 h内高原适应组和高原肺水肿组...

【关键词】 高原肺水肿； 发病机制； 诊断；

【中文期刊】 杨柳 李岗  《长治医学院学报》 2023年37卷2期 81-87,96页

【摘要】 目的:基于在线数据库分析膀胱癌有差异的关键枢纽基因(Hub基因)临床表达意义.方法:运用在线数据库(GEO)下载膀胱癌基因芯片数据集及GEO2R筛选共同差异表达基因(DEGs).通过R软件的"cluster profiler"软件包对共同D...

【关键词】 膀胱癌； 生物信息学； GEO；

【中文期刊】 丁志祥 史兵伟  等 《中国免疫学杂志》 2021年37卷2期 201-205页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:利用生物信息学方法挖掘结肠癌的枢纽基因及潜在标志物.方法:利用GEO2R分析结肠癌相关芯片集GSE41258、GSE41328和GSE44861中的差异基因;DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析;STRING在线软件分析...

【关键词】 结肠癌； 枢纽基因； 生物信息学；

【中文期刊】 郭黎彦 马南  等 《中国免疫学杂志》 2021年37卷6期 700-705页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法识别与支气管哮喘临床症状关系密切的基因模块并提取关键节点基因.方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBl)的基因表达综合数据库(GEO)中下载支气管哮喘患者外周血单个核细胞的基因表达模型和表...

【关键词】 支气管哮喘； 加权基因共表达网络分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 张河元 陈南辉  等 《南方医科大学学报》 2021年41卷11期 1631-1640页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘并验证前列腺癌转移的关键枢纽基因.方法 对前列腺癌全基因组芯片GSE6919进行主成分分析(PCA),通过R语言分析差异表达基因(DEGs);利用WGCNA构建基因共表达网络并筛选关键基因;...

【关键词】 前列腺癌； 转移； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 耿瑞杰 姚琳  等 《上海交通大学学报（医学版）》 2021年41卷6期 724-731页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的·采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索抑郁症相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法·在之前对8例抑郁症患者...

【关键词】 抑郁症； 加权基因共表达网络分析； 差异表达基因；

【中文期刊】 张薇 孙琳  等 《中国卫生统计》 2021年38卷3期 322-326页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据.方法 收集Ig...

【关键词】 加权基因共表达网络分析； 共表达网络分析； IgG介导西红柿不耐受；

【中文期刊】 唐乐婷 曹卜子  等 《湖南师范大学学报（医学版）》 2022年19卷3期 196-201页 ISTIC

【摘要】 目的:应用生物信息学方法筛选睾丸生殖细胞肿瘤(TGCT)预后相关的枢纽基因,为TGCT的预后评估和药物治疗提供新的生物标志物.方法:从GEO数据库下载GSE3218、GSE1818数据集,通过R语言limma程序包和韦恩图筛选差异表达基因(...

【关键词】 睾丸生殖细胞肿瘤； 生物信息学； 生物标志物；

【中文期刊】 王成吕 聂玉洁  等 《山东医药》 2022年62卷1期 15-19页 ISTICCA

【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选结肠癌进展相关的差异表达基因(DEGs).方法 从GEO数据库下载GSE127069、GSE145626数据集,运用GEO在线分析工具GEO2R提取这两个数据集的原始数据,利用韦恩图在线分析工具筛选DEGs.利用...

【关键词】 结肠癌； 差异表达基因； 枢纽基因；

【中文期刊】 周红 吴梅  等 《天津医科大学学报》 2022年28卷2期 123-128页 ISTIC

【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别胆道闭锁(BA)发病相关的枢纽基因.方法:从基因表达汇编(GEO)数据库下载BA基因芯片数据集GSE46960,利用WGCNA构建基因共表达网络,识别与BA相关的模块与枢纽基因,对关键模块进...

【关键词】 胆道闭锁； 加权共表达网络分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 刘会平 刘湘茹  等 《中国卫生统计》 2020年37卷6期 878-882页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析久坐影响成年人胰岛素敏感性的关键基因及其相关功能和机制.方法 针对下载于NCBI的人类基因表达汇编(...

【关键词】 胰岛素敏感性； 运动； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 陈思 刘春良  等 《上海交通大学学报（医学版）》 2020年40卷3期 294-302页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 ·利用生物信息学分析,将基因表达数据与临床生存分析相结合,以筛选乳腺癌的枢纽基因和关键通路.方法 ·从GEO数据库(Gene Expression Omnibus)下载了3个乳腺癌基因表达数据集,筛选出乳腺癌中的差异表达基因.Kapl...

【关键词】 乳腺癌； 生物信息学； 枢纽基因；