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【中文期刊】 陈慧娟 刘琪琦  《中国生物化学与分子生物学报》 2022年38卷7期 865-874页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 细菌耐药已成为威胁全球人类公共健康的重要因素之一,快速、准确明确细菌耐药的特性、机制及传播特征对疾病治疗及控制耐药菌的传播具有重要意义.高通量测序技术可以同时平行检测多个基因序列的状态,已广泛应用于细菌耐药检测.目前高通量测序技术在细菌耐药...

【关键词】 高通量测序技术； 测序平台； 细菌耐药；

【中文期刊】 张国林 景荣先  等 《药物分析杂志》 2021年41卷1期 1-12页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 基因测序技术的发明和广泛应用促进了医学和生命科学的革命性发展.自以Sanger测序法和化学降解法为代表的第1代测序技术发明以来,基因测序技术已发展至第4代.第1代测序平台主要为Sanger测序法和化学降解法,测序长度长,准确性高,但成本高,...

【关键词】 核酸测序技术； 测序平台； 药品质量保障；

【中文期刊】 何亿镇 王芳  等 《中国现代医生》 2024年62卷7期 9-12页

【摘要】 目的 建立基于二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术对人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)基因进行分型的自动化操作平台,并评估其在HLA常规检测中的应用.方法 根据试...

【关键词】 人类白细胞抗原； 二代测序； 自动化平台；

【中文期刊】 李健雄 施勇  等 《实验与检验医学》 2024年42卷2期 131-133页 CA

【摘要】 目的 探索快速识别新型冠状病毒的方法,为新冠肺炎防控提供技术支撑.方法 分别运用基于三代纳米孔测序技术平台MinION Mk1C和基于二代测序技术平台Ion Torrent S5的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)靶向全基因组测序技术对1...

【关键词】 纳米孔测序技术； MinION Mk1C测序平台； 靶向测序；

【中文期刊】 韩娜 黄蕾  等 《江苏大学学报（医学版）》 2023年33卷6期 498-501,508页 ISTICCA

【摘要】 脱氧核糖核酸(DNA)存储是一种以人工合成的生物大分子DNA作为信息载体的新型存储技术,具有存储密度高、存储量大、存储时间长、损耗率低等优点,有望成为一种新的数据存储介质.随着DNA合成技术(数据写入)和DNA测序技术(数据读取)的快速发展...

【关键词】 纳米孔； 测序； DNA；

【中文期刊】 闫振飞 何勇  等 《中国草地学报》 2023年45卷4期 74-81页

【摘要】 以紫花苜蓿种子为材料,研究了不同的酶解液浓度、渗透压、离心力对叶和根原生质体分离的影响,旨在获得高产量、高活性的原生质体悬浮液,以便能够使用10×Genomics平台进行单细胞转录组测序,进而了解植物细胞分化的轨迹.结果表明:适用于根的最佳...

【关键词】 紫花苜蓿； 原生质体分离； 单细胞转录组测序；

【中文期刊】 郭翠 徐祎敏  等 《上海中医药杂志》 2022年56卷2期 54-60页 ISTICCSCDCA

【摘要】 目的 利用二代测序技术探讨蚕梅方在转录组学层面上抗结直肠癌活性的作用机制.方法 将来源于《本草纲目》中治疗肠风的核心药物乌梅及僵蚕组方为蚕梅方,对RKO细胞(肠癌细胞)进行干扰,采用二代高通量测序平台(Illumina Hi-Seq)测序技...

【关键词】 蚕梅方； 结直肠癌； 转录组学；

【中文期刊】 吴艳茹 陈巧玲  等 《中国预防兽医学报》 2022年44卷7期 704-711,717页

【摘要】 脂多糖(LPS)是多杀性巴氏杆菌(Pm)关键的毒力因子,在其致病机制中发挥重要作用.为了探究不同血清型Pm LPS对宿主细胞的致病机制,本实验将从D型和A型Pm中提取的LPS(D-LPS和A-LPS)分别以1 μg/mL刺激羊支气管上皮细胞...

【关键词】 多杀性巴氏杆菌； 脂多糖； Illumina HiSea测序平台；

【中文期刊】 黄珊珊 方春生  等 《种子》 2022年41卷2期 101-104,111页

【摘要】 利用Illumina平台对见血封喉的完整叶绿体基因组进行测序.结果表明,见血封喉叶绿体基因组呈环状双链,存在2个反向重复序列(IR),即IRA和IRB,分别由大、小单拷贝区(LSC和SSC)分离;质体总长度为161699 bp,总GC含量为...

【关键词】 见血封喉； 叶绿体基因组； Illumina测序平台；

【中文期刊】 王博 刘芳  等 《遗传》 2019年41卷8期 761-772页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 基因资源是国家的重要战略资源,保存、保护和合理利用基因资源将成为未来维护国家安全、打造核心竞争力的坚实基础和有效保障,然而我国在基因数据存储、样本存储等方面均起步较晚,无法满足国内日益增长的生命科学相关领域的研究发展需求.针对上述问题,20...

【关键词】 基因库； 样本库； 数据库；

【中文期刊】 谷小杰 毕良佳  《医学研究杂志》 2021年50卷8期 8-11页 ISTIC

【摘要】 高通量测序技术即下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)或深度测序,广泛应用于全基因组和转录组的测序、基因组修饰的鉴定和蛋白质相互作用的分析.高通量测序技术不仅可以全面认识口腔微生物群落在健康和疾病状态...

【关键词】 高通量测序； 测序平台； 口腔疾病；

【中文期刊】 于丽丽  《医学理论与实践》 2021年34卷19期 3320-3322页

【摘要】 目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况.方法:选择2019年11月—2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因...

【关键词】 高通量测序平台； 非小细胞肺癌； 基因突变；

【中文期刊】 杨琳 王慧君  等 《中国循证儿科杂志》 2013年8卷3期 210-215页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 在PCR产物定量混合构建文库方法的基础上,探讨Ion Torrent PGMTM平台二代测序应用于儿科常见遗传性疾病诊断的价值.方法 采集临床诊断的2例肌营养不良、1例胆汁酸合成障碍和1例甲基丙二酸血症患儿的外周血,提取基因组DNA,...

【关键词】 二代测序； Ion Torrent PGMTM平台； 遗传性疾病；

【中文期刊】 梁烨 陈双燕  等 《遗传》 2011年33卷12期 1317-1326页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 随着DNA测序技术的发展,新一代测序技术以其高通量、低成本的特点,成为越来越多的生物学研究者在开展工作时的首选.在所有的新一代测序技术中,454测序系统是最早实现商业化且发展相对成熟的一种,目前被广泛的应用于各个领域的生物学研究中.文章以4...

【关键词】 新一代测序平台； 454测序技术； 植物转录组；

【中文期刊】 卢红霞 黄晗  等 《临床研究》 2020年28卷8期 3-4页

【摘要】 目的?分析儿童迁延性细菌性支气管炎(PBB)呼吸道菌群的特征,以便为临床诊治提供参考.方法 ?选择2017年10月-2019年10月郑州大学附属儿童医院收治的PBB患儿90例作为观察组,同期收治的气管软化(TM)患儿100例作为对照组.两组...

【关键词】 儿童迁延性细菌性支气管炎； 呼吸道菌群特征； 高通量测序平台；

【中文期刊】 李玲果 洪艳云  《激光生物学报》 2018年27卷5期 393-398页 ISTICCA

【摘要】 高通量测序技术的快速发展推动了生命科学领域的研究进程,已广泛应用于动植物病原物抗药性分析、肿瘤研究、遗传育种、病原学诊断、微生物学、分子流行病学和细菌分类学等多个领域.RNA-seq即"转录组测序技术",是高通量测序的一项重要内容,也是基因...

【关键词】 褐飞虱； 转录组测序； 测序平台；

【中文期刊】 吴丹丹 阮伋  等 《生物信息学》 2017年15卷3期 196-200页 ISTIC

【摘要】 尽管二代基因组测序技术日渐流行,Sanger测序依旧是SNP识别和分析的金标准.传统对于Sanger测序结果的分析多依赖SeqMan等软件进行.然而这类软件大多依靠人工操作来识别和记录测序结果中的SNP位点,效率低下且容易发生错误.此外,当...

【关键词】 polyphred； 类Unix平台； 测序数据管理；

【中文期刊】 吴成 王春晓  等 《食品科学》 2019年40卷3期 348-355页

【摘要】 高通量测序技术是分析研究酿酒微生物多样性的重要手段,与其他方法相比,具有测序方法简单、通量高、速度快和准确度较高等特点.本文在阐述高通量测序技术特点和测序平台的基础上,着重介绍其在酿酒微生物多样性研究领域中常用的数据分析方法和应用现状,旨在...

【关键词】 高通量测序平台； 主成分分析； 相对丰度热图；

【中文期刊】 黄方亮  《生物信息学》 2015年2期 116-119页 ISTIC

【摘要】 为了探索加快细菌基因组研究的方法，利用ABI PGM测序平台测定了1株单细胞硫还原地杆菌的基因组序列。测序共获得1．4 Gbp 数据，平均读长为177 bp。通过多个拼接软件并采用合适的组装策略，得到一个完整细菌基因组3．55 Mbp和一条...

【关键词】 PGM测序平台； 细菌基因组测序； ABI PGM Sequencing Platform；

【中文期刊】 陈晨 张媛媛  等 《中国医药指南》 2013年14期 1-2页

【摘要】 目的评价454 GS Junior 测序平台在细菌基因组测序中的应用价值。方法利用454 GS Junior 测序平台测定1株霍乱弧菌的基因组序列，组装注释后，与参考序列霍乱弧菌 O1埃尔托生物型菌株 N16961基因组序列进行比对。结果共...

【关键词】 454 GS Junior 测序平台； 细菌基因组测序； 454 GS Junior Sequencing Platform；

【中文期刊】 李慧颖 刘庆  等 《生物工程学报》 2022年38卷8期 3049-3061页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 胞嘧啶甲基化是DNA表观遗传修饰的主要类型之一,在维持正常细胞功能和调控基因表达中具有重要作用.重亚硫酸盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)是特异性位点DNA甲基化检测的通用方法,能明确目的片段中每一个CpG...

【关键词】 5-甲基胞嘧啶； 甲基化特异位点检测； 高通量测序平台；

【中文期刊】 薛清 杜虹锐  等 《生物技术通报》 2021年37卷7期 98-106页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 苜蓿滑刃线虫(Aphelenchoides medicagus)是一种兼性植物寄生线虫,可在多种真菌上完成生活史,同时对大豆和苜蓿具有弱寄生性.本研究采用Illumina平台对苜蓿滑刃线虫进行低覆盖全基因组测序,从获得的全基因组序列中提取线...

【关键词】 苜蓿滑刃线虫； 滑刃线虫科； 线粒体基因组；

【中文期刊】 魏婕 程悦  等 《中国微生态学杂志》 2021年33卷10期 1117-1125,1133页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 将两个不同的二代测序平台及其生物信息学流程进行的相同标本的微生物群分析结果的异同进行比较.方法 在同一实验室采用相同的生物信息学分析方案,使用两个不同的测序平台(Ion Torrent S5-xl和Illumina HiSeq 250...

【关键词】 16S rDNA测序； 二代测序平台； 母婴；

【中文期刊】 李晓然 张若鸿  等 《中国食品卫生杂志》 2020年32卷3期 339-344页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 随着用于监测食源性致病菌和暴发调查的分子分型技术迅猛发展,全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)正逐渐显露出其重要性.在食品贸易全球化背景下,急需建立食源性致病菌与人类感染间联系的详尽认识,从而精确监测并减少...

【关键词】 食源性致病菌； 暴发； 全基因组测序；

【中文期刊】 覃福礼 赵亮  等 《中草药》 2020年51卷4期 1003-1015页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用二代测序技术筛选出具有显著性变化的基因,并探讨月腺大戟素A在转录组学层面上抗乳腺癌活性的作用机制.方法 从月腺大戟药材中提取乙酰间苯三酚类化合物月腺大戟素A,对MCF-7细胞(乳腺癌细胞的luminalA型)进行干扰,观察被干扰后...

【关键词】 月腺大戟素A； 乳腺癌； RNASeq；

【中文期刊】 叶丹丹 樊萌萌  等 《动物学研究》 2012年33卷6期 574-585页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 由Handelsman et al (1998)提出的宏基因组(metagenome)泛指特定环境样品(例如:人类和动物的肠道、母乳、土壤、湖泊、冰川和海洋等环境)中微生物群落所有物种的基因组.宏基因组技术起源于环境微生物学研究,而新一代高...

【关键词】 宏基因组学； 扩增子测序； 全基因组测序；

【中文期刊】 何雨琦 李桂梅  等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷11期 4607-4615页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 RNA-seq是利用深度测序进行转录组分析的技术,并且在新一代测序的主流平台Illumina上运用广泛.针对Illumina平台的RNA-Seq建库,目前有多个不同类型的建库方法支持该技术,但是在操作步骤和成本上有很大差距.本研究分别试验了...

【关键词】 新一代测序； Illumina测序平台； RNA-seq建库；

【中文期刊】 康菊清 孙田舒  等 《植物学报》 2016年51卷5期 659-666页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 对模式植物的研究不仅能揭示众多具有普遍规律的生物现象,而且能为其它植物物种,特别是与人类生活紧密相关的经济植物提供具有借鉴与参考意义的研究方法.QTL遗传作图是寻找那些影响不同地域植物自然变异等位基因的传统且有效的工作方法.对不同分化时长和...

【关键词】 野生拟南芥种群； 二代重测序技术； QTL遗传作图平台；

【中文期刊】 司锘 王蓉蓉  等 《国际遗传学杂志》 2018年41卷1期 1-6页 ISTICCA

【摘要】 目的 应用 Illumina MiSeq 和Ion Torrent PGM 两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平台各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效...

【关键词】 台式高通量测序平台； MiSeq测序仪； PGM测序仪；

【中文期刊】 陈健 岳巧云  等 《中国媒介生物学及控制杂志》 2017年28卷2期 124-130页 ISTICCA

【摘要】 目的 研究高通量测序技术在医学媒介生物携带细菌检测中的应用,建立一种操作简便、经济高效和鉴定准确的检测方法.方法 优化样本处置和细菌提取等前处理方法、优化PCR反应体系和条件;以大头金蝇为研究材料,利用Illumina高通量测序平台,以二代...

【关键词】 Illumina测序平台； V3可变区； 细菌；

【中文期刊】 张自冠 施静艺  等 《现代生物医学进展》 2016年16卷9期 1606-1609,1618页 ISTICCA

【摘要】 目的:针对斑马鱼高通量测序数据,通过一系列质量控制和突变过滤,构建一套有效隐性遗传突变筛选系统.方法:A)经过与斑马鱼参考基因组比对,利用GATK获得初始的VCF格式突变信息.B)使用perl语言编写本地脚本,对突变信息进行过滤,注释等.C...

【关键词】 二代测序； Illumina测序平台； 突变点富集；

【中文期刊】 周剑 柳青  等 《国际遗传学杂志》 2016年39卷6期 295-299,305页 ISTICCA

【摘要】 目的：使用 Ion AmliSeq 多重 PCR 定制序列捕获系统及 Ion Torrent PGM 高通量测序平台对散发肌张力障碍患者进行肌张力障碍致病基因变异检测，以优化检测流程，探讨应用靶序列捕获结合高通量测序进行遗传病遗传诊断辅助临...

【关键词】 高通量测序； PGM 测序平台； panel 测序；

【中文期刊】 王理 上官少方  等 《现代生物医学进展》 2011年11卷4期 618-623页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法.方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点.结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列...

【关键词】 MassArray分子量阵列技术平台； 甲基化； 重亚硫酸盐测序；

【中文期刊】 宋琳琳 顾朝辉  等 《现代生物医学进展》 2009年9卷15期 2899-2902,2912页 ISTICCA

【摘要】 目的:针时下一代测序数据量大、序列长度短的特点,研究数据分析和质量评估方法.方法:选择已发布的Illumina-Solexa平台测序数据为研究对象,通过MAQ软件将测序数据与人类全基因组序列进行比对,并以外显子区域为例,在位点水平时测序数据...

【关键词】 下一代测序； Illumina-Solexa测序平台； MAQ比对软件；

【中文期刊】 彭鑫 范航  等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷10期 928-934页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 比较MGISEQ-2000、Illumina NextSeq 2000和Ion GeneStudio S5 Plus三种宏基因组测序平台之间的性能差异.同时,针对血流感染样本微生物浓度低的问题,对痕量样本测序流程进行优化.方法 采用上...

【关键词】 MGISEQ-2000； Illumina NextSeq 2000； Ion GeneStudio S5 Plus；

【中文期刊】 杨涵 郭巧梅  等 《中国感染控制杂志》 2023年22卷1期 59-67页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 对三家宏基因组测序(mNGS)平台开展性能评估.方法 三家平台(A、B和C)对18个参考品和8个临床标本进行mNGS,分析检测灵敏度、特异度、阴性预测值和阳性预测值.结果 A、B和C平台对于参考品的灵敏度分别为97.8％、100％、4...

【关键词】 宏基因组； 感染性疾病； 性能评估；

【中文期刊】 王鑫 崔扬  等 《中国法医学杂志》 2022年37卷4期 362-364,368页 ISTICCSCD

【摘要】 目的 基于二代测序平台对生物检材的微单倍型遗传标记进行检验,并探讨微单倍型遗传标记在法医物证学中的应用价值.方法 使用MHseq Typer47微单倍型试剂制备文库,MiSeq FGx平台进行测序,MHTyper微单倍型数据分析软件进行数据...

【关键词】 法医物证； 二代测序； 微单倍型；

【中文期刊】 彭海 方慧  等 《中国法医学杂志》 2022年37卷3期 273-277,282页 ISTICCSCD

【摘要】 目的 利用分子特异的条形码(Unique Molecular Identifiers,UMIs)研究二代测序平台中STR的复制滑脱现象.方法 采用探针捕获与高通量测序技术对12个中国汉族无关个体进行STR靶标基因座的富集与测序,并利用自己开...

【关键词】 法医物证学； STR stutters； 分子特异的条形码；

【中文期刊】 董丽娜 陈男英  等 《中国输血杂志》 2023年36卷1期 1-7页 ISTICCA

【摘要】 目的 统计分析AllType NGS11位点测序试剂在Ion Torrent S5和Illumina Miseq 2种二代测序平台对HL4-DPB1基因进行分型检测时的模棱两可结果情况.方法 采用One Lambda公司AllType NG...

【关键词】 二代测序； HLA-DPB1基因； 模棱两可；

【中文期刊】 郑小玲 王知坚  等 《药物分析杂志》 2016年36卷1期 46-52页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:探索多种测序技术在药品检测环境微生物鉴定分析中的应用.方法:从药品微生物实验室环境中连续7个月采样收集获得248株细菌和6株霉菌,并对收集的细菌采用全自动微生物生化鉴定仪(Vitek 2 Compact)进行鉴定.根据生化鉴定结果选择...

【关键词】 药品检测环境； 一代测序； 宏基因组测序；