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【中文期刊】 郝琦蓉 刘二袅  等 《现代肿瘤医学》 2021年29卷15期 2662-2669页 ISTICCA

【摘要】 目的:通过587例TCGA子宫内膜癌(EC)转录组数据进行生物信息学分析,结合55例临床病理样本,寻找EC相关的基因,便于进一步研究.方法:对TCGA中587例EC的高通量测序数据集进行综合生物信息学分析,以确定EC发生发展的候选基因.采用...

【关键词】 子宫内膜癌； TCGA数据库； 生物信息学分析；

【中文期刊】 潘小舟 费西平  等 《海南医学》 2010年21卷14期 111-112页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨多层螺旋CT(MSCT)图像重建技术时,根据颌面两侧骨表面外形的对称性,得出健侧与患侧的具体生物学差异数据对修复颌面部复杂性骨折中的临床价值.方法 回顾23例颌面部复杂骨折患者的资料而且已做MSCT高分辨率CT(HRCT)扫描,采...

【关键词】 多层螺旋CT； 生物学差异数据； 复杂骨折；

【中文期刊】 毕得 肖华军  等 《深圳大学学报（理工版）》 2012年29卷6期 541-547页

【摘要】 采用BRB-ArrayTools分析GEO数据库中肺和心脏细胞在缺氧环境下不同时间段的差异表达基因,获得肺细胞差异表达基因39个,心脏细胞差异表达基因66个,其中,有部分差异表达基因相同,但更多是不同的响应基因；差异表达基因随缺氧时间延长达...

【关键词】 生物信息学； 缺氧； BRB-Array工具；

【中文期刊】 高原 李召水  等 《青岛大学学报（医学版）》 2021年57卷2期 265-270页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学方法分析GEO数据库中Stanford A型主动脉夹层(ATAAD)的差异表达基因(DEGs),探讨主动脉夹层疾病发生的分子机制.方法 检索GEO数据库中有关ATAAD芯片测序大数据,并通过生物信息学方法对其进行DEGs...

【关键词】 动脉瘤,夹层； 数据库,遗传学； 计算生物学；

【中文期刊】 陆必燊 晏峻峰  《生命科学研究》 2022年26卷2期 165-174页

【摘要】 利用生物信息方法筛选食管鳞状细胞癌的关键基因,并分析相关生物学途径.从GEO数据库下载GSE20347、GSE29001、GSE33426、GSE45168和 GSE70409基因芯片表达谱,利用 RobustRankAggreg 方法对数...

【关键词】 食管鳞状细胞癌(ESCC)； GEO数据库； 差异表达基因；

【中文期刊】 刘茂林 宋晓娜  等 《肿瘤防治研究》 2025年52卷2期 133-141页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学和孟德尔随机化分析口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的差异表达基因,探讨其与OSCC预后的相关性.方法 TCGA数据库和数据集GSE138206筛选OSCC共同的差异基因,并利用孟德尔随机化分析它们之间的关系,进一步通过Cox...

【关键词】 生物信息； 孟德尔随机化； 口腔鳞状细胞癌；

【中文期刊】 代圣民 马纯政  等 《辽宁中医药大学学报》 2025年27卷1期 28-35页 ISTICCA

【摘要】 目的 该研究旨在综合分析BATMAN-TCM数据库、TCGA数据库以及细胞生物学验证和裸鼠荷瘤实验,深入探讨大补元煎在食管癌治疗中的潜在作用机制,尤其关注其对顺铂治疗敏感性的影响.方法 首先通过BATMAN-TCM数据库对大补元煎的成分和对...

【关键词】 大补元煎； 食管癌； 靶蛋白；

【中文期刊】 刘漠 孙大中  等 《黑龙江医药科学》 2025年48卷1期 1-4页

【摘要】 目的:通过生物信息学方法筛选、分析潜在的与抑郁症具有相关性的免疫细胞浸润生物学标志物及进一步探讨其在抑郁症发生、发展过程中的生物学作用.方法:从GEO数据库中选取与抑郁症相关的GSE-98793和GSE-52790数据集,首先所得数据经背景...

【关键词】 抑郁症； 生物信息学； 免疫细胞浸润；

【学位论文】 作者： 王文娟 导师：陶士珩 袁志发  西北农林科技大学 西北农林科技大学  数学 应用数学（硕士） 2008年

【摘要】 多种哺乳动物基因组数据，尤其是人类基因组数据的完成，标志着当代生物学进入了后基因组时代。在基因组的以千兆为计量单位的序列中，蕴藏着丰富且未知的信息。将其中大量的信息提取并加以分析，成为后基因组时代挑战当代生物学家的一大难关。基因组研究的一个...

【关键词】 哺乳动物； 基因组进化；

【学位论文】 作者： 荀鹏程 导师：陈峰  南京医科大学  公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（博士） 2007年

【摘要】 微阵列技术的发展给生物科学研究带来了革命性的契机，成千上万的基因(或蛋白等)的同时测定成为现实，这很快产生了庞大的微阵列数据。另一方面，随着分子生物学相关学科的迅猛发展，基因序列数据亦呈现出迅猛增长的态势。本研究借助统计学的方法和手段，从应...

【关键词】 微阵列数据； 差异表达；

【学位论文】 作者： 李莉 导师：刘少扬 江大琼  武汉大学 武汉大学  临床医学 妇产科学（硕士） 2004年

【摘要】 目的:研究基质金属蛋白酶-2(MMP-2)及其组织抑制物(TIMP-2)在宫颈癌中的表达及其与宫颈癌生物学行为的关系.方法:采用免疫组化S-P法对57例宫颈癌组织、17例正常宫颈组织中MMP-2、TIMP-2进行染色,在光学显微镜下观察,并...

【关键词】 基质金属蛋白酶； 组织抑制物；

【中文期刊】 尚雪恬 董静  等 《中国防痨杂志》 2024年46卷4期 449-460页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:通过对比分析结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)者和健康人的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)经结核特异性抗原刺激...

【关键词】 分枝杆菌,结核； 分枝杆菌感染； 转录因子；

【中文期刊】 张丽娜 姜晓琳  等 《中华中医药学刊》 2024年42卷6期 179-182,后插28-后插31页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别肥胖型多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的关键基因,...

【关键词】 多囊卵巢综合征； 加权基因共表达网络； 差异表达基因；

【中文期刊】 赵凯 蔡文平  等 《中国免疫学杂志》 2024年40卷10期 2083-2090,中插1-中插4页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:借助生物信息学分析探究血管肉瘤细胞ISOHAS与血管肉瘤干细胞样细胞Sphere来源外泌体的关键差异表达基因(DEGs)及富集的生物学功能与信号通路,探寻血管肉瘤新的治疗靶点.方法:对ISOHAS与Sphere来源外泌体进行转录组测序...

【关键词】 血管肉瘤； 肿瘤干细胞； 外泌体；

【中文期刊】 李岩 王兴河  《中国临床药理学杂志》 2024年40卷2期 269-272页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 本文通过对美国国家生物技术信息中心的基因表达数据库(GEO)、肿瘤基因组数据库(TCGA)等数据库的乳腺癌数据进行生物学分析,筛选三阴性乳腺癌中相较于其他亚型差异表达的基因,探索三阴性乳腺癌这一亚型的基因表达层面的特征,从而根据其特征进行药...

【关键词】 三阴性乳腺癌； 生物信息学； 差异基因；

【中文期刊】 沈鹏 柴欣萍  等 《中国康复医学杂志》 2024年39卷10期 1430-1435,1442页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析正常人与坐骨神经痛患者数据,从而筛选出神经病理性疼痛(neuropathic pain,NP)的潜在差异基因.方法:从基因表达数据库下载芯片数据GSE150408.用R软件的limma包筛选差异表达基因(diff...

【关键词】 神经病理性疼痛； 差异表达基因； 生物信息学；

【中文期刊】 杨晢铭 李佳荫  等 《临床军医杂志》 2024年52卷7期 666-670页 ISTICCA

【摘要】 目的 探究胃癌及肝癌中差异表达的基因,并分析其生物学功能及其在临床应用中的潜在价值.方法 在基因表达综合数据库中选取胃癌相关数据集GSE79943 及肝癌相关数据集GSE84402 进行分析.通过对两个数据集的基因表达数据进行差异分析确定共...

【关键词】 胃癌； 肝癌； 差异基因表达；

【中文期刊】 马玉玉 张丽  等 《新疆医科大学学报》 2024年47卷3期 301-307页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学分析鉴定肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)与动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)的共表达基因.方法 下载基因表达数据库(Gene expression om-nibus,...

【关键词】 肝细胞癌； 动脉粥样硬化； 生物信息学；

【中文期刊】 张楠楠 田思思  等 《河北医科大学学报》 2024年45卷5期 573-579页 ISTICCA

【摘要】 目的 探索糖尿病(diabetes mellitus,DM)铜死亡(Cuproptosis)生物标志物以及进行药物筛选.方法 利用GEO数据库获取糖尿病GSE25724数据集作为训练集并筛选其差异表达基因,从文献获取19个铜死亡相关基因,两...

【关键词】 糖尿病； 铜死亡； 计算生物学；

【中文期刊】 乾静 赵国文  等 《实用临床医药杂志》 2024年28卷14期 1-6,43页 ISTICCA

【摘要】 目的 建立肺腺癌(LUAD)与双硫死亡(DS)通路相关的基因(DPRGs)预后模型,阐明其潜在的生物学机制.方法 LUAD相关基因测序及临床信息源于公共数据库.使用基因集变异分析(GSVA)结果与癌症基因组图谱(TCGA)数据集中mRNA表...

【关键词】 双硫死亡通路； 基因集变异分析； 预后模型；

【中文期刊】 张艳 谢斯炜  等 《临床肿瘤学杂志》 2024年29卷3期 287-291页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨宫颈鳞癌中SCGB2A1 的表达及其临床意义.方法 对GEO数据库GSE39001 数据集进行差异基因表达分析.分析TIMER数据库中不同SCGB2A表达患者预后情况.收集 2015 年至 2017 年在湖南中医药高等专科学校附属...

【关键词】 宫颈鳞癌； SCGB2A1； 生物学标志物；

【中文期刊】 李玲琴 周睿姣  等 《中国药师》 2024年27卷6期 1007-1018页 ISTICCA

【摘要】 目的 研究痛风致病的关键基因以及免疫生物标志物,挖掘潜在的靶向中药,为痛风的临床治疗提供新方向.方法 从GEO数据库下载痛风芯片数据集,使用R软件进行差异基因的筛选,并对这些差异基因进行GO及基因通路KEGG富集分析.应用STRING数据库...

【关键词】 痛风； 中药； 生物信息学；

【中文期刊】 夏桃 王忠丽  等 《云南中医药大学学报》 2024年47卷3期 13-20页 ISTIC

【摘要】 目的 通过对蠲痹颗粒治疗前后的寒证类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者和健康人的外周血CD4+T淋巴细胞进行转录组测序及差异基因表达分析,探讨蠲痹颗粒治疗RA的作用机制.方法 2021年7月至2022年6月期间...

【关键词】 类风湿关节炎； 蠲痹颗粒； 转录组学；

【中文期刊】 伊力亚斯·艾萨 阿米娜·苏建和  等 《广西医学》 2024年46卷2期 284-291页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制.方法 (1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表...

【关键词】 高原病； 微小RNA； 信使RNA；

【中文期刊】 李迪佳 王敏杰  等 《山西医科大学学报》 2024年55卷4期 455-465页 ISTICCA

【摘要】 目的 应用生物信息学方法探讨鞘氨醇-1-磷酸转运体2(sphingosine-1-phosphate transporter 2,SPNS2)在乳腺癌中的表达情况,并分析SPNS2对乳腺癌预后、诊断或免疫浸润的影响.方法 癌症基因组图谱(T...

【关键词】 鞘氨醇-1-磷酸转运体2(SPNS2)； 乳腺癌； 免疫浸润；

【中文期刊】 薛白 陈平  等 《临床检验杂志》 2024年42卷5期 337-342页 ISTICCA

【摘要】 目的 采用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)筛选并验证对食管癌(ESCA)发生和发展起关键作用的基因,以期寻找ESCA的新型生物学标志物.方法 检索TCGA数据库,利用韦恩图分析,初步确定ESCA样本中差异表达基因与对无病生存...

【关键词】 食管癌； 纤维连接蛋白1； 生物学标志物；

【中文期刊】 夏冉冉 徐剑  等 《心脑血管病防治》 2024年24卷10期 19-22,36页 ISTIC

【摘要】 目的 利用生物信息学方法综合分析扩张型心肌病(DCM)患者中衰老相关基因.方法 从CellAge数据库提取衰老细胞相关基因,GEO数据库中与DCM相关的数据集GSE19303、GSE17800 和GSE42955,然后利用R语言鉴定出GSE...

【关键词】 扩张型心肌病； 细胞衰老相关基因； 生物标志物；

【中文期刊】 张凯敏 黄玉洁  等 《中国癌症防治杂志》 2024年16卷1期 56-61页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨PI3K抑制剂林普利塞(Linperlisib,YY-20394)对弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)的体外抗肿瘤效应及其作用机制.方法 采用CCK-8法检测不同浓度YY-...

【关键词】 弥漫大B细胞淋巴瘤； PI3K抑制剂； YY-20394；

【中文期刊】 娄娇娇 王浩冉  等 《河南医学研究》 2024年33卷5期 772-779页 CA

【摘要】 目的 基于生物信息学研究介导特发性肺纤维化(IPF)和炎症性肠病(IBD)共存的潜在关键分子和通路.方法 通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合数据库(GEO)下载IPF(GSE110147)和IBD(GSE752141)数据...

【关键词】 特发性肺纤维化； 炎症性肠病； 核心基因；

【中文期刊】 苟彩霞 卢亚琼  等 《甘肃医药》 2024年43卷9期 792-797页

【摘要】 目的:使用生物信息学的方法,鉴别出与宫颈癌远处转移相关的潜在生物学标记物,并对其机制进行研究.方法:使用R语言分析,利用TCGA数据库,挖掘出宫颈癌远处转移患者与非远处转移患者之间的差异表达基因集,进一步筛选出两组基因集的共差异表达基因,对...

【关键词】 宫颈癌； 远处转移； 差异表达基因；

【中文期刊】 李丽香 陈幸  等 《右江医学》 2024年52卷12期 1062-1070页

【摘要】 目的 通过生物信息学分析,从基因表达数据库(GEO)数据集中筛选出肺动脉高压(PAH)的关键基因,并探索其潜在的生物学功能和信号通路.方法 下载GSE15197数据集,利用GE02R识别差异表达基因(DEGs),通过加权基因共表达网络分析(...

【关键词】 肺动脉高压； 生物信息学； CHUK；

【中文期刊】 张慧杰 曲洪美  等 《巴楚医学》 2024年7卷1期 44-49页

【摘要】 目的:本研究旨在通过对子痫前期(PE)患者基因数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),寻找PE的分子标志物.方法:从GEO数据库下载GSE10588表达数据集,该数据集包括17例PE患者和26例对照者的胎盘组织转录组数据.使用差异表...

【关键词】 子痫前期； 加权基因共表达网络分析； 生物标志物；

【中文期刊】 吴双丽 吴铁成  等 《现代医药卫生》 2024年40卷10期 1621-1626页

【摘要】 目的 探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型.方法 肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模...

【关键词】 肺腺癌； 自噬相关基因； 预后模型；

【中文期刊】 许珊 张万庆  等 《大医生》 2024年9卷14期 27-31页

【摘要】 目的 基于生物信息学分析溶质载体(SLC)15A1 基因表达与孤独症谱系障碍(ASD)的相关性,为临床治疗提供参考.方法 使用基因表达公共(GEO)数据库,检索溶质载体相关基因(SCRGs)和孤独症谱系障碍(ASD)患者血液RNA表达谱芯片...

【关键词】 溶质载体15A1基因； 孤独症谱系障碍； 差异基因；

【中文期刊】 薛增昇 闫喜中  等 《昆虫学报》 2023年66卷5期 642-652页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]建立菜粉蝶Pierisrapae成虫触角转录组数据库,利用生物信息学和分子生物学手段深入挖掘菜粉蝶基因数据信息.[方法]采用高通量测序平台(Illumina NovaSeq 6000)对菜粉蝶成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注...

【关键词】 菜粉蝶； 触角转录组； 高通量测序；

【中文期刊】 高贝贝 黄子慧  等 《中国感染控制杂志》 2023年22卷1期 23-30页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 通过生物信息学途径,挖掘结核性溃疡发生发展过程中的关键基因,为结核性溃疡的研究提供新思路.方法 选择课题组前期基因测序的数据集及基因表达综合数据库(GEO)下载的数据集GSE83456,利用R软件筛选出共同的差异表达基因,再对共同的差...

【关键词】 结核性溃疡； 生物信息学； 基因；

【中文期刊】 李树栋 梁学振  等 《中国骨质疏松杂志》 2023年29卷9期 1310-1314页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用生物信息学及机器学习方法研究潜在的诊断绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)的生物标志物,为诊断和治疗绝经后骨质疏松症提供新的思路.方法 使用GEO数据库下载绝经后骨质疏松症相关的芯片...

【关键词】 绝经后骨质疏松症； 免疫细胞浸润； 生物信息学；

【中文期刊】 程峰 彭诗晴  等 《江苏大学学报（医学版）》 2023年33卷6期 475-485页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨电压门控钾通道亚家族 G 成员 1(potassium voltage-gated channel subfamily G member 1,KCNG1)在人肺癌组织中的表达水平和临床意义以及其在肺癌细胞恶性生物学行为中的作用.方...

【关键词】 肺癌； 电压门控钾通道亚家族G成员1； 分子靶标；

【中文期刊】 高雅宁 李健  等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页 ISTICCA

【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...

【关键词】 重症哮喘； 支气管内膜； 差异表达基因；

【中文期刊】 高峰 蔺广荣  等 《中国现代普通外科进展》 2023年26卷12期 943-946页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨基质金属蛋白酶7(MMP7)和分泌型白细胞蛋白酶抑制剂(SLPI)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及意义.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中甲状腺癌基因表达数据下载样本567例,包括癌组织509例,正常组织58例.提取...

【关键词】 甲状腺乳头状癌； 肿瘤基因组图谱； 计算生物学；