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【中文期刊】 张润泽 薛付忠 等 《山东大学学报(医学版)》 2025年63卷8期 51-60页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中 5 种癌症的多组学数据,提出一种融合图卷积网络、自注意力机制与解耦对比学习的癌症亚型聚类模型.方法 模型以TCGA数据库中 5 种癌症的 4 种组学数据...
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【中文期刊】 戴伟 张浩轩 等 《集成技术》 2025年14卷3期 87-101页
【摘要】 癌症是一种与基因密切相关的疾病,具有多种亚型,各亚型在遗传、表型和治疗反应上存在显著差异.准确的癌症亚型分类对个性化治疗至关重要,有助于提高治疗效果.然而,基于患者基因表达数据的癌症亚型分类方法在样本不均衡的情况下,往往难以有效区分稀有亚型...
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【中文期刊】 蒿花 王馨笛 等 《中国循证心血管医学杂志》 2024年16卷2期 144-148页ISTIC
【摘要】 随着21世纪分子生物学技术蓬勃发展,高通量测序技术识别了大量的癌症突变基因和分子标志物.面对庞大数量级基因的相互作用,各种非编码RNA及其复杂调控功能,使现代医学从分子角度揭示癌症潜在的作用方式和发生发展过程,难以准确阐述目标癌症的分子机制...
- 概要:
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【中文期刊】 邱杭 朱晓娟 等 《医学研究与战创伤救治》 2023年36卷6期 638-643页ISTICPKU
【摘要】 Chemerin是一种能够趋化未成熟的树突状细胞和巨噬细胞向炎症部位发生聚集的炎症因子,通过与其受体CMKLR1、GPR1、CCRL2 结合,从而产生促炎或抗炎的作用.目前发现chemerin与多种疾病之间都存在联系,其中对炎症及癌症的研究...
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【中文期刊】 吕德官 CHEN Linxi 《国际病理科学与临床杂志》 2011年31卷5期 424-429页ISTICCA
【摘要】 14-3-3蛋白家族在真核细胞中广泛表达且高度保守,据报道其与心血管疾病、神经元损伤、帕金森病以及支气管哮喘等疾病有关联,近年来研究发现14-3-3蛋白与癌症的发生和发展也密切相关,而涉及的癌症包括胆管癌、肝癌、肺癌、鼻咽癌、口腔癌、食管癌...
【关键词】 14-3-3蛋白家族;亚型;癌症;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 王晓曦 李晓琴 等 《生物化学与生物物理进展》 2021年48卷10期 1233-1242页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 从分子层面对泛癌进行研究已经得到了很大的进展,但是对宫颈鳞状细胞癌的分子分类研究仍然需要更多的探索.为了找到宫颈鳞状细胞癌潜在的子类,本文提出了一个基于多维组学数据的癌症亚型分类分析流程.通过统计学方法对癌症基因组图谱(The Cancer...
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【中文期刊】 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2020年21卷2期 122-136页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)在多种疾病,尤其是在某些癌症中发挥作用.为明确PTBP1在人体的生物学功能,本文汇总了调控PTBP1相关的miRNA、长链非编码RNA(lncRNA)和RNA结合蛋白.另外,我们重点阐述了PTBP1充当糖酵...
【关键词】 多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1);选择性剪接;糖酵解;
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- 结论:
【中文期刊】 王硕 郑新宇 《中国实用外科杂志》 2021年41卷11期 1238-1243页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 乳腺癌在组织学、流行病学和分子特性层面是一种高度异质性的疾病.目前,基于免疫组化的乳腺癌分类方法,根据雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体-2(HER-2)的检测结果将乳腺癌分为临床亚型,显然与基于基因表达谱的固有亚型分类不一致.这...
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【中文期刊】 姚宏伟 张忠涛 《中国实用外科杂志》 2018年38卷1期 68-71页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 结直肠癌的治疗目前仍以手术切除和综合治疗为主,随着AJCC第8版结直肠癌分期系统的更新,将MSI、KRAS、NRAS、BRAF等分子检测进行了基于高级别“循证医学”证据的重点推荐,结直肠癌已经从传统的基于“群体化”诊治进入了精准的“个体化”...
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【中文期刊】 吴豫 刘榕 等 《现代生物医学进展》 2017年17卷26期 5185-5188页ISTICCA
【摘要】 Calponin(类肌钙蛋白)是一个肌动蛋白细肌丝相关的调节蛋白,表达在平滑肌细胞和许多类型的非肌细胞中.哺乳动物有Calponin 1、Calponin 2和Calponin 3三个亚型,分别由三个同源基因CNN1、CNN2和CNN3编码...
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【中文期刊】 顾健人 《肿瘤》 2016年36卷1期 1-2页ISTICCA
【摘要】 2015年1月,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学(precision medicine)”计划,希望精准医学可以引领一个医学新时代,使人类更接近于治愈癌症和糖尿病等疾病的目标.他同时呼吁,美国应推动个体化基因组学研究,依据个人基因信...
- 概要:
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【外文期刊】 Unoki M ; Kumamoto K ; 等 《Current drug targets-The International journal for timely in-depth reviews on drug targets》 2009年10卷5期 442-454页SCISCIEMEDLINE
- 概要:
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【中文期刊】 施想 李靖华 等 《现代肿瘤医学》 2025年33卷8期 1405-1410页ISTICCA
【摘要】 肺癌在发病率上是全球第一大癌症,在我国,原发性肺癌也是最常见的癌症之一,是我国30年来发生率增长最快的恶性肿瘤,也是我国癌症死亡最常见的原因.非小细胞肺癌是其中重要的组织学亚型,尽管人们为促进肺癌的早期诊断做出了各种努力,但大多数患者仍然在...
- 概要:
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【中文期刊】 冯友亮 孙复正 等 《现代检验医学杂志》 2025年40卷4期 159-163页ISTICCA
【摘要】 目的 研究铁代谢的关键调节因子和铁死亡的抑制因子、铁蛋白重链 1(FTH1)在膀胱癌组织中的表达及其与免疫浸润和预后的关系.方法 选取 2016 年 1 月~2018 年 1 月佳木斯市中心医院接收的 60 例膀胱癌患者为研究对象.收集患者...
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【中文期刊】 牛日雨 王益杰 等 《实用肝脏病杂志》 2025年28卷1期 128-131页ISTICCA
【摘要】 目的 鉴定与双硫死亡相关长链非编码RNA(DRLs)相关的肝细胞癌(HCC)预后特征并构建预后模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取HCC数据,基于单因素COX回归、套索回归(LASSO)和多因素COX回归筛选DRLs,构建H...
- 概要:
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【中文期刊】 崔迪 《现代检验医学杂志》 2025年40卷4期 35-42,49页ISTICCA
【摘要】 目的 评估基于同种异体移植排斥相关基因(ARRGS)的风险评分模型对肝细胞癌(HCC)患者的预后预测能力,并验证关键基因血管球蛋白(GLMN)在HCC中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TC...
【关键词】 肝细胞癌;风险评分模型;同种异体移植排斥相关基因;
- 概要:
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【中文期刊】 薛新宽 褚华鲁 《山西医药杂志》 2025年54卷13期 998-1001页ISTICCA
【摘要】 氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描/计算机断层扫描(FDG PET/CT)对于检测原发性胃肠道(GI)肿瘤及其淋巴结、肝脏和腹膜转移具有不同的灵敏度.某些组织学亚型(例如黏液性和印戒细胞肿瘤)的肿瘤细胞密度较低以及代谢和增殖率较低,是导致FDG...
【关键词】 成纤维细胞活化蛋白;正电子断层扫描/计算机断层扫描;成像;
- 概要:
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【中文期刊】 王雪飞 牛日雨 等 《肝胆外科杂志》 2025年33卷3期 219-226页ISTIC
【摘要】 目的 基于内质网应激(ERS)相关长链非编码RNAs(LncRNAs)构建肝细胞癌(HCC)预后模型,为HCC患者预后评估和个体化治疗提供分子标志物和理论依据.方法 通过癌症基因组图谱数据库获取HCC患者的转录组和临床数据.通过分子标志物数...
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【学位论文】 作者:陈文澜 导师:梁成 山东师范大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2024年
【摘要】 癌症的异质性给探索精确治疗策略带来了前所未有的挑战。每个癌症患者体内肿瘤的独特分子特征,使得实施行之有效的治疗方案变得极为困难。癌症亚型识别旨在发现具有不同分子特征的患者群体,以便为其量身定制更加精准和有效的治疗策略。因此,癌症亚型识别研究...
- 概要:
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【学位论文】 作者:王泓 导师:魏珍 杨梦圆 郑州大学 药学 生物与医药(硕士) 2024年
【摘要】 癌症在世界范围内严重威胁着人类的健康,其发病率和死亡率每年都在稳步上升。癌症是一种复杂且高度个体化的,包含了多种亚型的异质性疾病,同种癌症的不同亚型反映了不同的分子致癌过程和不同的临床结果。准确识别癌症亚型对精准诊断、靶向药物研发、癌症个体...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:秦阳 导师:罗天娥 山西医科大学 公共卫生与预防医学 公共卫生与预防医学(硕士) 2024年
【摘要】
目的:
本文为了确定癌症患者的预后亚型,整合癌症多组学数据,利用四种自动编码器,即普通自动编码器(AE)、稀疏自动编码器(SAE)、去噪自动编码器(DAE)、变分自动编码器(VAE)和主成分分析(PCA)对多组学数据进行降维,借助...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:李阳 导师:易东 陆军军医大学 公共卫生与预防医学 公共卫生(硕士) 2024年
【摘要】
研究背景及目的
癌症作为一种高度复杂的疾病,其发生和发展涉及多个层面的调控失常,包括基因组、转录组、蛋白质组及代谢组等。针对癌症的异质性,精准医疗的理念应运而生,旨在根据患者的具体病情制定个性化的治疗方案。近年来,随着高通量测序技...
- 概要:
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【学位论文】 作者:赵南南 导师:季玉陈 郑州大学 临床医学 外科学(神经外科)(硕士) 2024年
【摘要】 胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)是中枢神经系统中最常见的恶性肿瘤,其在成人中枢神经系统肿瘤中的占比达到三分之一,患者的中位生存期通常为16个月。GBM的治疗策略通常包括手术切除以及术后放化疗。然而,GBM的高度异质性是影响治...
- 概要:
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【中文期刊】 张挺 管波 等 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2024年16卷1期 21-27,32页ISTIC
【摘要】 目的 筛选膀胱尿路上皮癌(BLCA)甲基化驱动基因,并基于其甲基化程度构建分子亚型和预后分子模型,探索其在BLCA中的预后作用.方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载BLCA转录组数据、DNA甲基化数据以及 BLCA患者的临床资料,...
- 概要:
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【中文期刊】 罗瑞晨 孙琦 等 《吉林医学》 2024年45卷11期 2616-2619页CA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法研究分泌球蛋白家族 2A成员 2(SCGB2A2)基因在子宫内膜癌中的诊断价值.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取子宫内膜癌(UCEC)组织中SCGB2A2 mRNA表达水平及患者临床信息,正常细胞组织的基...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 赵伟 《医学理论与实践》 2024年37卷20期 3451-3453,3456页
【摘要】 子宫内膜癌是女性生殖系统常见的恶性肿瘤,临床工作根据形态学特点及激素依赖性将其分为两个亚型,即激素依赖型和非激素依赖型.2013年癌症基因组图谱网络根据不同的分子特征将子宫内膜癌分为4个分子亚型,即POLE突变型、微卫星不稳定型、低拷贝数变...
- 概要:
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【中文期刊】 孙敬杰 卢鹏 等 《南方医科大学学报》 2023年43卷9期 1567-1576页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法,鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因.方法 分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据,初步聚类后,根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞,再聚类、分群后鉴定特征基...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:葛曙光 导师:王雪松 中国矿业大学(江苏) 中国矿业大学 控制科学与工程 控制理论与控制工程(硕士) 2023年
【摘要】 集成多个组学数据的信息实现癌症亚型的精准识别,能够为个性化治疗和临床预后提供指导和帮助,是生物信息学重要的课题之一。由于当前的组学数据的一个突出特点是样本数量远远小于特征数量,基于多组学相似性的方法在数据集成步骤中只需要考虑样本间的相似度值...
- 概要:
- 方法:
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【学位论文】 作者:曹青青 导师:郑春厚 赵建平 新疆大学 数学 数学(硕士) 2023年
【摘要】 随着科学技术的进步,癌症相关的生物医学数据体系也逐渐完善,这些数据的产生为癌症进一步研究提供了机遇.在癌症研究领域,可以整合来自不同组学水平的表达值数据,通过聚类方法对癌症患者进行子类型划分,继而为发现癌症发病机理,提高患者治疗方案质量和延...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:练佳婷 导师:杜红丽 华南理工大学 药学 药学(硕士) 2023年
【摘要】 免疫检查点抑制剂(Immune checkpoint inhibitors, ICIs)在多种肿瘤的治疗中表现出良好的疗效,但只有部分患者从中获益,远未满足临床需求。肿瘤微环境( Tumor microenvironment,TME)在肿瘤...
- 概要:
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【中文期刊】 石敏洁 谢宝国 《中国医药导报》 2023年20卷1期 65-67,89页ISTICCA
【摘要】 子宫内膜癌(EC)严重威胁女性的身体健康,近些年来,随着经济、环境等众多因素的影响,EC逐渐朝着发病率升高、年轻化的趋势发展,已经超过宫颈癌、卵巢癌成为一些欧洲发达国家发病率最高的妇科恶性肿瘤.目前临床对肿瘤的各项研究已迈入了分子分型时代,...
【关键词】 子宫内膜癌;传统分型;肿瘤与癌症基因组图谱分子分型;
- 概要:
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【学位论文】 作者:刘浩然 导师:张化祥 山东师范大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2022年
【摘要】 癌症亚型的识别对个性化医疗的应用具有重要意义。它致力于使用无监督聚类方法将癌症患者划分为不同的亚型,并为后续的治疗方案提供有价值的参考。近年来,随着测序技术的快速发展,其产生的丰富的多组学数据为在整体水平上发现癌症亚型带来了前所未有的机遇。...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:宋阔 导师:高琳 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2022年
【摘要】 癌症是一种由于病变细胞失去正常的调控机制从而不停自我繁殖的疾病,诱发癌症的病因并未被医学研究人员从根本上发现,所以癌症很难有效地预防。并且因为癌症是由于体内细胞异常导致的,与常见的大部分疾病不同,无法使用常规的医疗手段治疗,而目前常用于治疗...
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- 结论:
【学位论文】 作者:钟连鑫 导师:陈月辉 孟庆芳 济南大学 信息与通信工程 信息与通信工程(硕士) 2022年
【摘要】 深度学习在各个领域的兴起,使得多种深度神经网络模型得到了广泛应用。而神经网络中过多的超参数,学习性能对参数调整的依赖性,以及需要提前设定模型结构的复杂度等问题,让模型的构建过程变得非常棘手。且因为神经网络几乎有无限种结构组合,所以对神经网络...
【关键词】 癌症亚型分类 ; 级联柔性神经森林模型 ;
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【学位论文】 作者:杨英群 导师:王鹏 中国科学院大学 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2022年
【摘要】 RNA可变剪接使一个基因产生不同剪接亚型并发挥不同功能。生物体内的剪接受到复杂缜密的调控,剪接异常可能伴随着疾病的发生发展。因此,异常剪接的研究对疾病的诊断与治疗具有重要意义。本课题组前期发现癌症中存在大量基因剪接改变的现象,其中SLK基因...
- 概要:
- 方法:
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【学位论文】 作者:黄明凤 导师:高琳 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2022年
【摘要】 癌症,是一类严重危害人类生命健康的复杂疾病,具有高度异质性。癌症亚型识别问题是癌症研究领域中最重要的问题之一,同一种癌症的患者在生存风险、对药物的敏感性等多个方面存在明显差异,这意味着癌症存在多种不同的亚型,因此研究癌症的亚型划分,能够为癌...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 焦鸿丽 叶平 等 《生物化学与生物物理进展》 2001年28卷4期 478-481页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 过氧化体增殖剂激活的受体(PPARs)是1990年发现的核激素受体家族的一个新成员.其三种亚型α、β、γ具有配体特异性和组织分布的特异性.PPARs在控制炎症反应、脂质代谢、细胞增生和分化等方面发挥重要作用,研究表明PPARs与一些慢性疾病...
【关键词】 过氧化体增殖剂激活的受体;氧应激;脂质代谢;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:段然 导师:高琳 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术;计算机应用技术(博士) 2021年
【摘要】 癌症,泛指恶性肿瘤,是一种复杂、异质且严重危害人类健康的复杂疾病。研究人员对癌症的研究已经持续了数十年。随着高通量测序技术的不断发展及其成本的不断下降,目前已经产生了大量不同组学的数据。人们普遍认为,不同层面的生物数据共同影响和调控多个生物...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:曹金龙 导师:田俊强 兰州大学 临床医学 临床医学·外科学(硕士) 2021年
【摘要】
目的:本研究旨在利用机器学习相关原理对膀胱癌的免疫分子亚型及免疫逃逸的潜在分子机制进行研究,并探索亚型与免疫相关特征的相互联系。
方法:从癌症基因组图谱(TheCancerGenomicAtlas,TCGA)数据库中下载膀胱癌转录...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【学位论文】 作者:ALI ABDULLAH SALEH 导师:Hongmin Cai 华南理工大学 其他 Computer Science(硕士) 2021年
【摘要】 癌症亚型对于轻松了解疾病以及通过多个组学数据集集成提供精确而个性化的治疗。随着数据生成技术的进步,多组学的数量和类型不断增加,为研究人员提供了获得非常有价值的癌症研究和临床生物标志物发现信息的绝佳机会。然而,多组学数据庞大而复杂的性质给提取...
- 概要:
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