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【中文期刊】 郭妮 贾亚春 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2024年45卷2期 244-249页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值.方法 利用3个基因表达数据库(gene expre...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 克德尔亚·艾山江 傅怡 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2024年44卷1期 1-12页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型.方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas...
【关键词】 核编码线粒体基因；肝细胞癌；癌症基因组图谱(TCGA)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 卫鑫 吴波 等 《安徽医药》 2024年28卷9期 1801-1805页ISTICCA
【摘要】 目的 构建基于铜代谢相关基因和临床病理学特征的新型肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型.方法 2022年6月至2023年1月从基因集数据库(MSigDB)5.1版整理出铜代谢相关基因,应用癌症基因组图谱(TCGA)中ccRCC数据对获取的铜代...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李妮 吴文娟 《东南大学学报（医学版）》 2024年43卷4期 540-547页ISTICCA
【摘要】 目的:分析热休克蛋白家族 H(Hsp110)成员 1[heat shock protein family H(Hsp110)member 1,HSPH1]在宫颈癌组织中的表达及其与预后的相关性.方法:收集2018年2月至2021年1月首次确...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏丹 阮玉莉 等 《哈尔滨医科大学学报》 2024年58卷4期 389-395页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选与SUMOylation过程密切相关的基因,并构建结直肠癌的预后基因表达模型.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载与结直肠癌相关的转录组数据和临床资料,结合基因集富集分析(...
【关键词】 结直肠癌；SUMOylation相关基因；预测模型；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 武寒 徐磊 等 《滨州医学院学报》 2024年47卷6期 495-503页
【摘要】 目的 应用加权基因共表达网络对癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)进行联合分析,探究参与结肠癌发生发展的免疫相关基因.方法 ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李健 刘阳 等 《中国现代普通外科进展》 2023年26卷12期 933-938页ISTICCA
【摘要】 目的:建立并验证一种基于N7甲基鸟苷(m7G)RNA甲基化修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型.方法:检测31种m7G RNA甲基化相关的关键调控因子在乳腺癌组织中的表达模式.下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的乳腺...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李睿哲 薛军帅 等 《肝胆胰外科杂志》 2022年34卷7期 406-413页ISTICCA
【摘要】 目的 构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性.方法 从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫...
【关键词】 肝细胞肝癌；肿瘤预后；癌症基因组图谱数据库(TCGA)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 范宁 代增强 等 《肝胆胰外科杂志》 2021年33卷1期 25-31页ISTICCA
【摘要】 目的 鉴定胆管癌(cholangiocarcinoma,CCA)甲基化与表达谱综合生物标志物,预测CCA患者预后.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载33例CCA样本和8例正常样本基因组甲基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王唯斯 梅雯 等 《生物技术通讯》 2019年30卷2期 163-169页ISTICCA
【摘要】 目的:探究人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在胰腺癌中的表达及临床意义.方法:检索Oncomine数据库中的MTERF2信息,对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析;从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载胰腺癌数据集MTER...
【关键词】 线粒体转录终止因子2(MTERF2)；胰腺癌；Oncomine数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陶润 李文永 等 《蚌埠医学院学报》 2024年49卷3期 335-339,343页ISTICCA
【摘要】 目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析.利用S...
【关键词】 前列腺肿瘤；癌症基因组图谱；Oncomine数据库；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李引 林青雨 等 《消化肿瘤杂志（电子版）》 2024年16卷3期 327-333页ISTIC
【摘要】 目的 探讨富含亮氨酸重复序列/Ⅲ型纤维连接蛋白 4(leucine-rich repeat and fibronectin type Ⅲ domain-containing protein 4,LRFN4)在胃癌组织中的表达情况,并分析LR...
【关键词】 胃癌；富含亮氨酸重复序列/Ⅲ型纤维连接蛋白4；癌症基因组图谱数据库；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 吴双丽 吴铁成 等 《现代医药卫生》 2024年40卷10期 1621-1626页
【摘要】 目的 探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型.方法 肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘双环 马怡茗 等 《中华肿瘤杂志》 2023年45卷1期 64-73页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨蛋白酶活化受体2(PAR2)在卵巢上皮性癌中的表达及意义。方法:收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库(410例卵巢上皮性癌患者)和组织基因型表达(GTEx)数据库(88例正常人)中PAR2 mRNA的表达水平。收集2009—201...
【关键词】 卵巢恶性肿瘤；蛋白酶活化受体2；癌症基因组图谱数据库；
- 概要：
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【中文期刊】 吴杨 张小敏 等 《癌症进展》 2023年21卷14期 1533-1538页ISTIC
【摘要】 目的 探究NOD样受体家族含CARD结构域5(NLRC5)在胃癌中的相互作用蛋白,并明确其对胃癌的诊断价值.方法 采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库探究NLRC5在胃癌组织和癌旁组织中的差异,结合STRING网站分析NLRC5的相互作用蛋...
【关键词】 癌症基因组图谱；基因表达综合数据库；NOD样受体家族含CARD结构域5；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周涛 王笑天 等 《疑难病杂志》 2023年22卷1期 49-53,66页ISTICCA
【摘要】 目的 分析SERPINE1 在胃癌组织中的表达及其临床意义.方法 通过检索肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,了解SERPINE1 在33 种癌症组织中的表达情况.通过检索癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载375 例胃癌组织和32 例...
【关键词】 胃癌；SERPINE1；癌症基因组图谱数据库；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 汪洋 朱娅 《中国基层医药》 2023年30卷1期 21-29页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨N6-甲基腺嘌呤（m 6A）在结直肠癌组织中表达及临床意义。 方法:2021年9月至2021年12月，利用癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）对结直肠癌中m 6A相关调控因子的表达进...
【关键词】 结直肠肿瘤；n6-呋喃甲基腺嘌呤；蛋白甲基转移酶类；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 高幸福 关翰 等 《中华全科医学》 2023年21卷7期 1243-1247页ISTIC
【摘要】 目的 探讨肉碱棕榈酰转移酶2(CPT2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的差异化表达以及与临床预后的相关性,为ccRCC的诊治提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法 首先筛选肿瘤基因组图谱(TCGA)数据,从中获得目的基因CPT2.随后利用R软...
【关键词】 肾透明细胞癌；肉碱棕榈酰转移酶2；癌症基因组图谱数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林雪莲 肖又德 等 《生物医学工程与临床》 2021年25卷6期 749-756页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基因组学分析建立肺鳞癌免疫分型,并进一步探索其临床应用价值.方法 通过检索下载分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中所有肺鳞癌数据包括患者基因表达谱及临床数据(检索时间:建库到2021年1月4日),通过单样本基因集富集分析(ssG...
【关键词】 肺鳞癌；癌症基因组图谱(TCGA)数据库；免疫分型；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 杨维清 杨庞 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2024年16卷1期 15-20页ISTIC
【摘要】 目的 CD276 的异常表达已被证实与肿瘤的发生有关.但其在肌层浸润性膀胱癌(MIBC)中的作用知之甚少.方法 从癌症基因组图谱数据库中下载 MIBC患者的相关数据,通过研究CD276 在膀胱正常组织和肿瘤组织中的表达差异,同时评估临床变量...
- 概要：
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【中文期刊】 李海昆 《首都食品与医药》 2024年31卷20期 8-11页
【摘要】 目的 探讨FBLIM1基因在人脑胶质瘤组织中表达、相关生物学功能、信号通路及其与患者预后的相关性.方法 癌症基因组图谱数据库(TCGA)中检索FBLIM1在人脑胶质瘤组织中表达情况,分析比较胶质瘤患者肿瘤组织与正常脑组织中FBLIM1 mR...
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【中文期刊】 常晴 刘佳 等 《现代妇产科进展》 2023年32卷4期 248-253,257页ISTIC
【摘要】 目的:筛选在子宫内膜癌(UCEC)中具有预后价值的细胞焦亡相关基因并构建风险评分模型,进一步构建整合细胞焦亡基因表达谱和临床病理参数的UCEC预后列线图(Nomogram).方法:基于癌症基因组图谱数据库(TCGA)筛选UCEC细胞焦亡相关...
- 概要：
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【中文期刊】 蒋逆立 张蝶 等 《数理医药学杂志》 2023年36卷9期 641-649页CA
【摘要】 目的 探索结核通路相关基因表达差异与肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)预后及肿瘤免疫微环境的关系,判别结核合并LUSC的预测基因和免疫因子,寻找新的治疗靶点.方法 基于京都基因与基因组百科全书...
- 概要：
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【中文期刊】 吴琼 丁寿鹏 等 《医学信息》 2025年38卷7期 10-17页
【摘要】 目的 探索GAS2L3 在肝癌中的表达,探讨其潜在的机制.方法 通过qRT-PCR技术检测GAS2L3 在肝正常组织和肝癌组织中的表达差异,用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)进行验证,利用ROC曲线评价GAS2...
- 概要：
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【中文期刊】 韩珺 仲维莉 等 《继续医学教育》 2025年39卷1期 176-179页
【摘要】 目的 分析N6-甲基腺苷(N6-methylladenosine,m6A)修饰基因对甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)生存预后的影响,为PTC的免疫治疗提供理论依据.方法 下载人类癌症基因组图谱...
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【中文期刊】 邢龙 吴双丽 等 《海南医学》 2024年35卷10期 1374-1379页ISTICCA
【摘要】 目的 探究肺腺癌(LUAD)差异表达的衰老相关基因(ARGs),并构建LUAD衰老相关基因的预后模型.方法 LUAD的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,Aging Atlas数据库获取ARGs,并基于LUAD中衰...
- 概要：
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【中文期刊】 申展铭 李向东 等 《长治医学院学报》 2024年38卷2期 81-86页
【摘要】 目的:探讨染色质开放状态对食管癌相关通路的影响及对关键基因进行分析.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管癌染色质开放性高通量测序(ATAC-seq)数据,使用R4.2.1 对 2组数据分别进行基因注释,并进行KEGG通路富集分析...
- 概要：
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【中文期刊】 曾艳 祝恒成 等 《生物技术进展》 2024年14卷3期 486-491页
【摘要】 肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)患者在手术后对放疗、化疗和靶向治疗均不敏感.前期研究证明,在肝癌中,脱氧核糖核酸酶1(deoxyribonuclease 1-like 3,DNASE1L3)可以分解包膜内的单链和...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 李鹏 《首都食品与医药》 2024年31卷23期 14-17页
【摘要】 目的 采用生物信息分析方法探讨SHP-1基因在卵巢癌中的表达、信号通路和预后关系.方法 在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索SHP-1基因,分析SHP-1基因在人实体肿瘤中的表达情况.应用相互作用基因/蛋白在线检索工具(STRING)建...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 魏丽春 《福建医药杂志》 2024年46卷8期 35-40,后插1页CA
【摘要】 目的 本研究旨在通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析非小细胞肺癌(non-small cell lung ca...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵雅 赵楠 等 《安徽医科大学学报》 2023年58卷8期 1354-1360页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 运用癌症基因组图谱(TCGA)测序数据研究钾离子通道四聚体结构域7(KCTD7)基因在肝细胞癌(HCC)中的表达、作用机制及其临床意义.方法 TCGA数据库中下载HCC患者的RNA测序数据及临床信息.单因素和多因素Cox回归分析探究K...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁金容 张雅文 等 《安徽医科大学学报》 2023年58卷1期 37-41页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 研究CD155/TIGIT在骨肉瘤患者中的表达及其意义.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析骨肉瘤远处转移患者和非转移患者肿瘤组织中CD155及TIGIT的表达差异,并收集骨肉瘤患者手术切除组织制备病理切片和组织芯片,采用H...
【关键词】 骨肉瘤；CD155/TIGIT；TCGA数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐龙文 聂元华 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2023年44卷5期 755-763页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选和鉴定具有预测胃癌肿瘤突变负荷(TMB)分类的微小 RNA(microRNAs),从而为胃癌患者免疫治疗提供参考依据.方法 从TCGA数据库中下载胃癌肿瘤样本的 mRNA、microRNA 表达谱数据和体细胞突变数据.利用 R语言...
- 概要：
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【中文期刊】 徐涛 朱泽民 等 《肿瘤药学》 2023年13卷2期 187-193页ISTICCA
【摘要】 目的 通过TCGA数据库深入挖掘胆囊癌发生的关键基因,寻找胆囊癌的预后基因.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载胆囊癌及癌旁正常组织转录组数据,采用R软件中的edgeR包对数据进行差异表达分析,将获取的差异表达基因进行GO和KEG...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄奔 柳家翠 等 《分子诊断与治疗杂志》 2023年15卷3期 378-382页ISTIC
【摘要】 目的 本研究利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分别构建结肠癌和直肠癌的lncRNA?miRNA?mRNA的ceRNA调控网络,寻找网络中与患者总体生存率相关的基因,为结直肠癌提供新型预后分子标志物.方法 在TCGA数据库分别下载结肠癌和直...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张文君 陈清江 等 《新乡医学院学报》 2023年40卷8期 721-728页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨胸苷酸合成酶(TYMS)基因在食管癌(ESCA)患者中的表达及其与临床特征和预后的关系.方法 从癌症基因组图谱数据库下载ESCA患者的原始转录组测序数据、临床信息及临床病理学资料,应用t检验和χ2 检验评估TYMS基因在食管癌组织...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁伟 李娟 等 《国际检验医学杂志》 2023年44卷1期 116-120页ISTICCA
【摘要】 目的 研究肝细胞肝癌(HCC)患者组织中前mRNA加工因子3(PRPF3)和检查点激酶1(CHEK1)的表达水平,探讨两者的临床意义.方法 应用R语言分析癌症基因组图谱数据库中HCC癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1 mRNA表达水平...
【关键词】 肝细胞肝癌；前mRNA加工因子3；检查点激酶1；
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