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【中文期刊】 吴建盛 谢建明 等 《生物化学与生物物理进展》 2007年34卷7期 724-731页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着各种生物基因组序列测定工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利.将基因序列特征分析和支持向量机技术结合起来,通过分析基因序列的特征差异发现水平转移基因.依据以前研究工作的基础,选取了绝对...
【中文期刊】 龙宇鹏 郑江 《中国药房》 2008年19卷18期 1363-1366页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:从传统抗炎中药中筛选具有拮抗细茵基因组DNA(Cytidine-phosphate-guanosine DNA,CpG DNA)活性的中药并对其进行活性物质含量的排序.方法:将CpG DNA包被于生物传感器的生物素样品池以建立靶点,测...
【中文期刊】 王玉飞 陈泽良 等 《微生物学报》 2008年48卷4期 532-538页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]细菌基因组大片段尤其是基因簇的克隆与操作,是细菌基因功能分析的一个难点.基因组测序工作的不断完成和序列信息的大量积累,为细菌基因组:DNA的操作提供了方便.本文报道了利用细菌的全基因组信息和质粒拯救法的原理建立的一种克隆细菌基因组大...
【中文期刊】 王沂蒙 刘艳 等 《中国免疫学杂志》 2008年24卷12期 1103-1107页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过两种免疫策略比较三类细菌基因组和 cpG ODN 对禽流感病毒(AIV) H5N1 灭活油乳苗的影响.方法:苯酚氯仿法抽提革兰氏阴性致病菌(大肠杆菌O2)、阳性致病菌(金黄色葡萄球菌)和阳性益生菌(粪链球菌FQ68)的基因组,并人...
【关键词】 CpG ODN； 细菌基因组； AIV H5N1灭活油乳苗；
【中文期刊】 余道军 童文娟 等 《中国微生态学杂志》 2007年19卷6期 519-520,523页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 优化细菌基因组DNA提取方法,使其适合临床细菌分子生物学检测需要.方法 分别采用专用DNA提取液法、热裂解法、溶菌酶法、热裂解法与碱性裂解法组合改良法,对纯培养细菌和临床标本中细菌基因组DNA进行提取.结果 专用DNA提取液法、溶菌酶...
【中文期刊】 刘加荣 边专 《国外医学（口腔医学分册）》 2005年32卷3期 190-192页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着遗传密码的发现,细菌基因组及重组DNA技术取得较大发展.200余种细菌基因组计划已经完成或正在进行,本文描述了几种口腔细菌基因组的特征,强调菌种间的亲缘关系,关注基因组学的比较,因为其对口腔致病菌的基础、临床研究都有广泛影响.
【中文期刊】 程实 刘文丽 等 《生物技术通讯》 2016年27卷3期 412-415页 ISTICCA
【摘要】 目的:比较并优化2种试剂盒提取以巨型球菌为代表的难提取细菌基因组DNA的方法,以获得高质量的DNA用于高通量测序,探索高通量测序样品的前期处理方法.方法:用Life Technologies公司的ChargeSwitch gDNA Mini...
【中文期刊】 赵尔樱 谭雪琴 等 《哈尔滨医科大学学报》 2014年1期 87-90页 ISTICCA
【摘要】 致病岛是负责编码细菌毒力相关基因的染色体片段，它一般具有相对分子量较大，处于染色体特定位置（如tRNA位点内或附近，或位于与质粒，噬菌体整合位点附近），其G＋C含量与宿主细菌有明显差异等特点［1］。大多数致病岛两端具有顺向重复序列或插入序列...
【中文期刊】 陈晨 张媛媛 等 《中国医药指南》 2013年14期 1-2页
【摘要】 目的评价454 GS Junior 测序平台在细菌基因组测序中的应用价值。方法利用454 GS Junior 测序平台测定1株霍乱弧菌的基因组序列，组装注释后，与参考序列霍乱弧菌 O1埃尔托生物型菌株 N16961基因组序列进行比对。结果共...
【关键词】 454 GS Junior 测序平台； 细菌基因组测序； 454 GS Junior Sequencing Platform；
【中文期刊】 刘晓颖 马敏 等 《现代临床医学》 2007年33卷4期 252-254页
【摘要】 目的:建立裂解液加热煮沸法抽提细菌基因组DNA.方法:选取大肠埃希菌、金葡菌分别应用五种不同方法抽提细菌基因组,Tagman荧光定量PCR检测抽提产物.并在两种细菌中验证chelex-100抽提方法的灵敏度.结果:对相同浓度的大肠埃希菌、金...
【关键词】 chelex-100裂解液加热煮沸； 细菌基因组； 血小板；
【中文期刊】 梁俊容 金东 等 《疾病监测》 2023年38卷5期 516-521页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 前噬菌体是细菌基因组中重要可移动原件,在细菌毒力和宿主适应性方面发挥着重要作用.由噬菌体介导的福氏志贺菌血清型转化频繁发生,给志贺菌的监测、诊断和预防工作带来不便.为了探究我国福氏志贺菌基因组进化与其前噬菌体相关的血清型别转换之间的关...
【中文期刊】 顾玲 李伟伟 等 《中国公共卫生》 2010年26卷5期 644-647页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用细菌基因组重复序列PCR技术(rep-PCR)微生物源追踪方法对江苏省盱眙县桂五水库中粪便污染来源进行追踪.方法 分别采集不同季节水库周边已知来源粪便标本,分离大肠埃希菌作为指示菌,建立已知污染源指示菌rep-PCR特征指纹库,用...
【关键词】 微生物源追踪； 大肠埃希菌； 细菌基因组重复序列PCR技术(rep-PCR)；
【中文期刊】 武虓 张淼 等 《环境与健康杂志》 2011年28卷12期 1100-1102页 ISTICCA
【摘要】 目的 探究以细菌基因组重复序列PCR技术(repetitive extragenic palindromic consensus sequence-PCR,REP-PCR)为手段的微生物源示踪技术对鉴别非点源污染中养殖动物粪便污染来源的应用...
【关键词】 非点源污染； 细菌基因组重复序列PCR技术； 大肠杆菌；
【中文期刊】 王宁 王占黎 等 《课程教育研究（新教师教学）》 2015年17期 298-300页
【摘要】 目的：比较两种方法提取粪便细菌基因组DNA的效果。方法收集30例健康人的粪便，采用改进的液氮冻融法及试剂盒法提取DNA，对总产量和纯度进行分析。PCR扩增细菌16SrDNA基因序列，比较不同方法提取人粪便基因组DNA效率的差异。结果采用改进...
【中文期刊】 代建国 谢海伟 等 《生物化学与生物物理进展》 2008年35卷5期 563-569页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 采用体外抑菌法测定鲎素的抑菌动力学特点,钼酸铵比色法和紫外吸收法分别检测细菌与鲎素共同孵育前后无机磷和大分子泄漏情况,扫描电镜和透射电镜观察细菌与鲎素共同孵育前后细菌形态和结构的变化,紫外吸收法和凝胶电泳法分别观察鲎素对细菌基因组DNA和质...
【中文期刊】 白欣茹 袁媛 等 《军事医学》 2022年46卷7期 487-492页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 建立基于实时荧光重组酶聚合酶扩增(RPA)的鼠疫耶尔森菌快速检测技术.方法 以鼠疫菌特异基因序列YPS723为靶标,设计实时荧光RPA引物探针并进行筛选;构建含有基因待检片段的重组质粒进行实时荧光RPA方法灵敏度的评价;将15种非鼠疫...
【中文期刊】 侯博 王晨燕 等 《畜牧兽医学报》 2022年53卷10期 3326-3334页
【摘要】 毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,T-A)系统广泛存在于细菌基因组和质粒中,调控细菌的多种生理活动.细菌生物被膜是细菌适应应激环境(不利环境)而采取的一种生存策略,其具有极强的耐药性及免疫逃逸性,广泛存在于自然界,具有广泛的危害...
【中文期刊】 叶远浓 梁定发 等 《电子科技大学学报》 2022年51卷3期 347-352页
【摘要】 细菌非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是近年来在细菌基因组内新发现的一类基因表达调控因子,与必需基因概念类似,有一部分ncRNA是生物体生存所必不可少的,称之为"必需非编码RNA".因此,细菌的必需ncRNA可以作为...
【中文期刊】 张翠真 袁小龙 等 《生物学杂志》 2019年36卷4期 97-101页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 采用纳米磁珠法对细菌基因组DNA、总RNA和质粒DNA进行提取纯化,并与试剂盒法和Trizol法提取效果进行比较,以期获得核酸最佳提取方法.结果发现,与试剂盒法和Trizol法相比,磁珠法在细菌基因组DNA和RNA提取、PCR产物检测及纯化...
【中文期刊】 葛林虎 苏汉福 《口腔医学研究》 2019年35卷10期 915-918页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 口腔菌群是口腔中所有细菌的集合,其不仅在牙周病、龋病等口腔炎症性疾病中具有关键作用,还与动脉粥样硬化、阿尔兹海默症、类风湿性关节炎等口腔外疾病相关.然而,口腔菌群在个体间存在很大的差异.这种差异既表现在群体组成上(多样性),又表现在细菌基因...
【中文期刊】 戴良香 康涛 等 《生态学报》 2019年39卷19期 7169-7178页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 花生属豆科固氮作物,具较强的抗旱耐盐性,土壤微生物在盐碱土生态系统中具有重要的生态功能.以花生平作、花生/棉花间作为对象,通过16S rRNA基因克隆文库技术分析了黄河三角洲滨海盐碱地花生旺盛生长期不同含盐量盐碱地和非盐碱地0-40cm根层...
【关键词】 土壤微生物群落； 16S rRNA基因； 系统发育分析；
【中文期刊】 蒙雨丹 刘爽 等 《中华烧伤杂志》 2019年35卷8期 587-594页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨实时荧光重组酶聚合酶扩增(RPA)在白色念珠菌检测中的初步应用效果.方法 (1)取1 mL白色念珠菌标准株及阴性对照菌铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、鲍氏不动杆菌、大肠杆菌、光滑念珠菌标准株菌液,使用酵母/细菌基因组试剂盒提取DNA...
【中文期刊】 宋国庆 李辉 等 《法医学杂志》 2019年35卷2期 187-193页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究不同土壤细菌群落的结构和差异,探索16S rRNA基因测序技术在不同土壤鉴定中的有效性.方法 采集上海市7个地区的土壤样本,提取土壤细菌基因组DNA,采用高通量测序技术对16S rRNA基因序列高变区片段进行测序,测序结果通过生物...
【中文期刊】 杨晨瑞 李君剑 等 《临床肝胆病杂志》 2019年35卷5期 1021-1026页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 分析肝内胆管结石抗生素耐药基因(ARG)在不同性别之间的分布,为临床合理使用抗生素提供参考.方法 收集2017年10月-2018年9月山西医科大学附属人民医院收治的肝内胆总管结石患者共120例,其中男60例,女60例,对所采集标本进行...
【中文期刊】 陈其冰 王燕 等 《听力学及言语疾病杂志》 2019年27卷3期 285-288页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 比较声带良性增生性疾病患者与正常人声带表面分泌物中菌群组成的异同.方法 以声带良性增生性疾病患者32例为实验组,33例声带正常的甲状腺肿物患者作为正常对照组,分别采集两组对象声带表面分泌物并提取细菌基因组DNA,经过对16 S rRN...
【中文期刊】 张保卫 魏辅文 等 《动物学报》 2004年50卷3期 452-458页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 采集了大熊猫和小熊猫的新鲜粪便样品,使用100%乙醇保存.通过重复离心富集研究动物的肠道脱落细胞,并使用乙醇和双蒸水洗涤以除去抑制物.用1%的SDS快速裂解细胞,离心除去残渣后,向裂解液中加入蛋白酶进行消化.消化结束后使用等体积的酚/氯仿抽...
【中文期刊】 钟东 赵贵军 等 《遗传学报》 2003年30卷2期 189-192页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 应用生物信息学方法,对已完成测序的76种细菌基因组进行比较,分析细菌基因组中编码区及密码子上碱基使用频率情况.结果显示:1.先导链与滞后链上在编码区的碱基使用频率无明显差异且显著正相关.2.先导链与滞后链在第一、第二、第三密码子碱基使用频率...
【中文期刊】 寿娟 谢青梅 等 《中华病理学杂志》 2018年47卷6期 465-467页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 结核病(tuberculosis)是严重的传染病之一,目前临床有多种方法检测结核分枝杆菌,如血清抗体检测法,痰涂片抗酸染色法、细菌培养法,荧光 PCR 法等. 每种方法都有其优缺点,如血清抗体检测灵敏度高但特异度差[1] ,细菌培养法耗时长...
【中文期刊】 桂国弘 徐娥 等 《微生物学杂志》 2018年38卷6期 84-91页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 缓冲蛋白胨水 (Buffered peptone water, BPW) 是常用于微生物分离培养的增菌液, 为了解BPW增菌对微生物结构的影响, 以冷鲜鸡污染微生物为研究对象, 在杭州超市采集20只冷鲜鸡样品, 分别用BPW增菌0、2、6、...
【中文期刊】 谢昆 李湘燕 等 《中国感染控制杂志》 2018年17卷7期 560-565页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨分子检测方法在中重度皮肤软组织感染(SSTI)病原诊断中的可行性.方法 收集2016年1-10月北京大学第一医院整形烧伤外科收治的中重度SSTI病例,符合入组标准共50例,留取伤口深部组织,分别行常规培养及细菌涂片检查;提取各标本...
【中文期刊】 何宇婷 陈茶 等 《中华检验医学杂志》 2017年40卷12期 979-982页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 细菌非编码小RNA(sRNA)是一类长度约为50~500个核苷酸,在细菌基因组中被转录但不翻译为蛋白质的RNA分子.sRNA开始于一段能折叠成稳定茎环结构的序列,终止于不依赖Rho的转录终止子.sRNA活力主要受控于其胞内的水平.sRNA通...
【中文期刊】 杨茜 李晓愚 等 《南方医科大学学报》 2016年36卷2期 238-243页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨水环境地塞米松污染对小鼠肠道菌群的影响.方法 将20只Balb/c小鼠随机分为对照组和实验组,每组5只.实验低剂量组灌喂含 0.035 ng地塞米松磷酸钠的饮用水,中剂量组为0.225 ng、高剂量组为2.25 ng,对照组灌喂不...
【中文期刊】 杨献伟 杨瑞馥 等 《遗传》 2016年38卷2期 137-143页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一.遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难.本文讨论了同源...
【中文期刊】 刘汉杰 付彬 等 《中国药理学通报》 2016年32卷9期 1249-1252,1253页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的：研究多吡啶钌配合物[(Phen)2Ru(dppz)]( PF6)2的抗菌活性，并进一步探讨其作用机制。方法采用最小抑菌浓度( MIC)以及最小杀菌浓度( MBC)，测定无机配合物[( Phen)2 Ru( dppz)]( PF6)2的...
【中文期刊】 陈瑾 王素英 等 《生物学杂志》 2016年33卷5期 87-89页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 成簇的规律间隔短回文重复( CRISPR)是一类广泛分布于细菌和古细菌基因组中的DNA重复结构。重复结构与前导序列、一系列相关蛋白一起，为原核生物提供抵御噬菌体和质粒等外源基因的获得性免疫能力。综述了CRISPR系统的结构、作用机制及应用，...
【中文期刊】 许泽仰 洪愉 等 《中国医科大学学报》 2016年45卷1期 7-11页 ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 构建携带氯霉素乙酰转移酶(CAT)的转座子自杀性质粒,通过接合转座获得甲型副伤寒沙门氏菌(副甲)启动子文库.方法 PCR扩增CAT的基因亚克隆至pMD-18T载体,鉴定正确后酶切插入转座子自杀性质粒pSC189,获得新的转座子载体pS...
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