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【中文期刊】 曾娇 莫显刚 等 《癫痫与神经电生理学杂志》 2024年33卷4期 193-198,封2,封3页ISTIC
【摘要】 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨芬氟拉明治疗癫痫的潜在作用机制.方法 从GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库中对癫痫的相应疾病靶点进行筛查,利用drug-bank、pharmmapper、swisstarget等数据库...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄泳清 陈颖 等 《岭南急诊医学杂志》 2022年27卷2期 117-119,128页
【摘要】 目的:应用生物信息学方法对GSE34198基因表达谱进行重新分析,挖掘年龄小于60岁的急性心肌梗死(AMI)患者潜在的致病和治疗基因.方法:根据GSE34198的临床资料,将患者分为年龄小于60岁的健康对照组(n=19)和急性心肌梗死组(A...
【关键词】 急性心肌梗死；通路富集分析；蛋白相互作用网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周平秀 胡济安 等 《华西口腔医学杂志》 2012年30卷5期 518-521页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 系统地认识核因子KB受体活化因子配体(RANKL)联合巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)诱导破骨细胞分化成熟过程中的分子机制.方法 利用小鼠蛋白-蛋白相互作用数据库NIA和公共基因芯片数据GES16749,构建并分析了RANKL联合M...
【关键词】 正畸牙移动；破骨细胞；核因子κB受体活化因子配体；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘威 袁芳艳 等 《动物医学进展》 2015年11期 20-24页
【摘要】 病原菌的相互作用组学研究是揭示潜在信号转导通路和新型药物靶标的有力工具。通过同源蛋白映射的方法构建了牛支原体的蛋白-蛋白相互作用网络，所构建的互作网络包含138个蛋白和693个相互作用关系。通过蛋白的互作频率分析，确定了在牛支原体中互作频率...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李珊珊 《医药前沿》 2012年02卷12期 370-371页
【摘要】 许多疾病是由于信号转导通路分子发生功能障碍所导致的,后基因组时代可以通过对这些分子进行调控来控制信号转导通路,达到治疗和预防疾病的目的:.EGFR 是哺乳动物细胞中参与生长、增殖和分化通路中的重要信号分子,本文以乳腺癌作为研究对象,采用功能...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 沈庆航 徐加豹 等 《畜牧兽医学报》 2011年42卷1期 8-17页
【摘要】 旨在对牛蛋白质相互作用网络进行研究,除了为牛的后基因组学提供研究基础外,其研究成果还可运用到牛的生产实践中.本研究通过系统发育谱法,利用线虫、酵母和人的蛋白相互作用数据对牛的蛋白相互作用进行预测.结果,得到了一个包含2 953个蛋白、3 0...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵嘉诚 任诗齐 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷8期 1741-1750页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:原发性骨质疏松症的发病率高,但发病机制尚不完全清楚,目前尚缺乏有效的早期筛查指标和治疗方案.目的:通过综合生物信息学分析,进一步探索原发性骨质疏松症的发生机制.方法:原发性骨质疏松症数据来自公共基因表达数据库,筛选差异基因分别进行GO...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕刚 唐燕娣 《中华神经外科疾病研究杂志》 2025年19卷4期 66-72页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨家族性高胆固醇血症(FH)和阿尔茨海默病(AD)共同的病理生理机制.方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载FH和AD的表达矩阵,分别为GSE13985和GSE5281.通过limma包分析鉴定共同的差异表达基因(DEG).随后对...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 岳温恒 黄鲲 等 《疑难病杂志》 2025年24卷5期 601-607页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学方法研究益心饮对心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的改善作用及其潜在的分子机制.方法 通过TCMSP和BATMAN数据库筛选益心饮的活性成分,并收集其相关靶点基因.同时,从GeneCards、OMIM和HPO数据库中收集MI...
【关键词】 益心饮；心肌缺血再灌注损伤；蛋白—蛋白相互作用网络；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郑炜 马琳 等 《天津师范大学学报（自然科学版）》 2025年45卷4期 14-22页
【摘要】 为了解犀角地黄汤(RHRD)治疗糖尿病足溃疡(DFU)的分子机制,应用网络药理学和分子动力学模拟方法,通过TCMSP数据库、BATMAN-TCM和文献检索搜索犀角地黄汤中药成分的活性成分及其靶点,然后从GeneCards、CTD、OMIM、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Zohra Fekhikher Nabila Benariba 等 《数字中医药（英文版）》 2025年8卷2期 219-233页
【摘要】 目的 评价泻根根部水-丙酮提取物及其乙酸乙酯组分和丁醇组分,以及氯仿-甲醇提取物的体外抗糖尿病作用.方法 分别用福-乔试剂、三氯化铝和香草醛试剂采用比色法测定泻根提取物(氯仿-甲醇提取物、水-丙酮提取物及其乙酸乙酯和丁醇组分)中的总酚、黄酮...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张郝男 林鹏程 《齐齐哈尔医学院学报》 2025年46卷8期 707-713页
【摘要】 目的 本研究基于网络药理学方法探讨甘松的抗抑郁作用机制.方法 NCBI、IMIM等主流药物研究数据库收集抑郁相关分子通路靶点,TCMSP数据库筛选甘松生物—中医药的利用度(OB)≥30%且药物相似性≥0.15 的活性成分,通过Swiss T...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴丹 高耀 等 《中草药》 2019年50卷8期 1818-1827页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 构建逍遥散单味药-成分-共有靶点网络、蛋白相互作用网络,探究逍遥散“异病同治”抑郁症和糖尿病的共同作用机制.方法 通过TCM database@Taiwan、TCMID、Batman-TCM数据库结合文献挖掘获取逍遥散的化学成分和作用...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘森 沈野 等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷4期 1280-1287页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究基于RNA-seq数据分析了胶质母细胞瘤中的差异表达基因,并对差异表达基因进行了功能(GO term和通路KEGG)富集分析.进一步通过蛋白相互作用网络挖掘了胶质母细胞瘤的调控机理.结果表明,405个基因在肿瘤组织中差异表达(p-va...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁超 练庆海 等 《器官移植》 2024年15卷1期 90-101页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选酒精性肝炎(AH)的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点.方法 采用基因表达综合数据库(GEO)中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕艳华 钟小云 等 《护理研究》 2024年38卷21期 3768-3778页ISTICPKU
【摘要】 目的:基于临床生物信息学探讨白藜芦醇对自闭症谱系障碍(ASD)的潜在治疗作用.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据;分别对白藜芦醇和ASD的全基因组表达谱数据进行差异基因分析、基因本体(GO)富集分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 沈懿珍 丁永生 等 《生物医学工程学杂志》 2011年28卷4期 658-662页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 膜蛋白及其相互作用网络已经成为现在生物信息学领域研究的一个新方向.本文提出了一种基于协同智能的膜蛋白相互作用及其网络的研究方法.这里所说的协同智能指的是谱分析、模糊K近邻(KNN)算法等方法的集成.我们将生物系统看作是一系列的计算组件,这些...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 章广能 张育芳 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 287-295页ISTIC
【摘要】 化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要.本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型.首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征输入构建图神...
【关键词】 化合物-蛋白质相互作用；表示学习；图神经网络；
- 概要：
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【中文期刊】 徐聪聪 叶燕平 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷6期 42-49,79页ISTIC
【摘要】 目的 探索心肌缺血-再灌注(I/R)损伤中铁死亡相关基因的表达及功能,通过构建分子网络及其验证分析,为心肌I/R损伤的治疗提供新的分子靶点.方法 对GSE108940数据库中的基因表达数据进行标准化处理,利用火山图和热图筛选差异表达基因(D...
【关键词】 心肌缺血-再灌注损伤；铁死亡；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 姚紫婷 杨彦铭 等 《癌症》 2024年43卷12期 563-588页MEDLINEISTICCA
【摘要】 近年来,随着蛋白质组学和表观遗传学的发展,大量RNA结合蛋白(RNA-binding Proteins,RBPs)被发现,长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)和RBPs之间的相互作用也受到越来越多关注...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 夏明燕 谢鹏 等 《贵州医科大学学报》 2024年49卷10期 1417-1427页ISTIC
【摘要】 目的 利用生物信息学分析筛选与缺血性脑卒中(IS)相关的microRNA(miRNA)和mRNA,通过实验鉴定关键基因、利用Cytoscape构建miRNA-mRNA相互作用网络,探讨其在IS中的作用及其主要调控的相关信号通路.方法 从基因...
【关键词】 微小RNA；蛋白质-蛋白质相互作用网络；生物信息学分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 韩秀涛 范秀照 等 《临床肾脏病杂志》 2024年24卷9期 751-759页ISTIC
【摘要】 目的 基于基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中的基因芯片、网络药理学、分子对接和体外实验探讨虫草素治疗急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的作用机制.方法 从GEO(GSE8...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘莉 杨娇娇 等 《中国免疫学杂志》 2023年39卷3期 520-524页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于生物信息学探索糖尿病肾病(DKD)肾小管差异表达基因(DEGs)与相关信号通路,结合蛋白互作(PPI)网络分析与比较毒理基因组学数据库(CTD)筛选在DKD肾小管病变中发挥关键作用的基因.方法:选取基因表达公共数据库(GEO)中芯...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 鄢雯 李囡 等 《基础医学与临床》 2023年43卷11期 1685-1692页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)数据库分析筛选出结肠癌(CC)组织差异表达基因,同时通过体外实验进行验证,挖掘潜在的结肠癌差异关键基因.方法 从 GEO 数据库获取人 CC 数据集 GSE10950 和 GSE74602,利用GEO2R和韦...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨宝乐 王小娟 等 《转化医学杂志》 2023年12卷4期 149-154,163页ISTIC
【摘要】 目的 基于网络药理学、分子对接技术探究三七干预肝癌的潜在作用靶点及机制.方法 采用网络药理学的方法,通过TCMSP、CNKI、PubMed筛选三七的活性成分;通过GeneCard、SwissTarget Prediction获取三七活性成分...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 程雨 张磊 等 《安徽医药》 2023年27卷1期 36-41,后插4页ISTICCA
【摘要】 目的 通过网络药理学与分子对接技术,分析芪藤消浊颗粒治疗慢性肾小球肾炎(CGN)的物质基础及作用机制.方法 2021年3—10月,运用TCMSP、TCMID、HERB数据库收集芪藤消浊颗粒的活性成分及靶点信息,应用DrugBank、Gene...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 汪居安 王居义 等 《安徽医药》 2023年27卷6期 1083-1087,后插1-后插2页ISTICCA
【摘要】 目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制.方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台(TCMSP)获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李明 吴岚 等 《中国急救医学》 2023年43卷7期 525-532页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学及分子对接探究五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的作用机制.方法 使用 TCMSP、SwissTargetPrediction、GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选五苓散治疗脓毒...
【关键词】 五苓散；脓毒症相关急性肾损伤；网络药理学；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴娓娓 王建军 等 《神经疾病与精神卫生》 2023年23卷8期 550-556页ISTIC
【摘要】 目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别强迫症的共表达模块和枢纽基因.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE60190数据集,对15例强迫症患者和14名健康对照者的尸脑背外侧前额叶皮质(DLPFC)基因表达数据进行分析.通过W...
【关键词】 强迫性障碍；加权基因共表达网络分析；功能富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李钰鑫 阎美卉 等 《世界中医药》 2022年17卷16期 2251-2257页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:采用网络药理学及分子对接研究"黄芪-附子"药对治疗慢性心力衰竭的作用靶点及其相关信号通路,并进一步分析其治疗慢性心力衰竭的潜在机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot数据库等获取黄芪-附子药对的活性...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 马馨蕊 吕晓东 等 《世界中医药》 2022年17卷11期 1560-1564页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:运用网络药理学的研究方法探讨三子养亲汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对三子养亲汤中药物的化学成分、作用靶标进行检索与筛选;利用GeneCards数据库对COPD的相关...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏思维 姜雯君 等 《中国免疫学杂志》 2022年38卷21期 2628-2633页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息技术分析探讨类风湿关节炎(RA)发病机制中性别间生物学差异的关键基因和通路.方 法:从GEO数据库中获取GSE55457、GSE55584、GSE12021中正常男女性滑膜样本和RA男女性患者滑膜样本的基因表达数 据,将数...
【关键词】 类风湿关节炎；差异表达基因；蛋白质-蛋白质相互作用网络；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李煜 孟平平 等 《石河子大学学报（自然科学版）》 2023年41卷1期 87-92页
【摘要】 目的 对Neuritin的理化性质及结构组成,蛋白质相互作用网络进行生物信息学预测分析,为进一步研究Neu-ritin 的功能和作用机制提供新的思路与方向.方法 应用 Protscale 和 ProtParam、TMHMM、SignalP、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李龙 唐志锋 等 《中医临床研究》 2023年15卷19期 54-58页
【摘要】 目的:基于网络药理学探讨八味柴芍汤治疗糖尿病胃轻瘫(Diabetic gastroparesis,DGP)的潜在机制.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)数据库,查找中药复方八味...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 章鲁瑶 张洋 等 《牡丹江医学院学报》 2023年44卷1期 44-50页
【摘要】 目的 通过分析类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)及相关信号通路,探究RA发生发展过程中的分子免疫机制.方法 从基因表达综合数据...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 唐紫涵 《山东化工》 2023年52卷5期 43-49页
【摘要】 目的:采用网络药理学方法和分子对接技术探讨分析中药决明子治疗干眼的作用机制.方法:通过TCMSP、UniProt获得决明子有效成分、靶点,通过疾病数据库DrugBank、OMIM、GeneCards、Disgenet获得干眼的作用靶点.利用...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 田天 周丹 等 《临床医学研究与实践》 2023年8卷7期 5-9页
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨飞扬肠胃炎胶囊治疗胃溃疡的作用机制.方法 采用文献法检索收集飞扬肠胃炎胶囊的化合物成分,并通过SwissADME对成分进行筛选.使用SwissTargetPrediction数据库对化合物成分进行靶点预测.借助Gen...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕薇 李翠萍 等 《中医临床研究》 2023年15卷25期 67-71页
【摘要】 目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 裴薇 汪鹏刚 等 《医学信息》 2023年36卷11期 1-9,15页
【摘要】 目的 筛选并鉴定肝母细胞瘤(HB)的关键基因,并进行综合分析.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载人类肝母细胞瘤表达谱基因芯片数据,筛选肝母细胞瘤发生发展相关的候选基因,使用GEO2R筛选出差异表达基因(DEGs),鉴定并进行GO和K...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨天濠 王新赠 《计算机与数字工程》 2023年51卷5期 1108-1112页
【摘要】 肿瘤转移通常发生在癌症晚期,是一个复杂且致命的过程,发现与肿瘤转移相关的基因对肿瘤的治疗和预后有着至关重要的作用.通过计算方法发现肿瘤转移基因,相对于昂贵且耗时的生物学方更加高效.基于蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIN),论文提出了一种结...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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