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            【中文期刊】 叶华虎  袁菊芳  等 《中国比较医学杂志》 2014年11期 20-26页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:鉴定猴B病毒囊膜蛋白gD的抗原表位。方法利用生物信息学分析猴B病毒囊膜蛋白gD的二级结构、亲水性、表面可及性、抗原性指数以及柔韧性,得到可能的表位肽段;再利用合成肽与B病毒阳性血清进行ELISA验证,评价表位肽段的特异性和敏感性。结果...

            【关键词】 表位预测ELISA猴B病毒

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            【中文期刊】 李娜  李朝品  等 《中国血吸虫病防治杂志》 2014年4期 415-419页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:预测并鉴定粉尘螨3类变应原(Der f 3)的T细胞表位。方法运用生物信息学分析软件预测Der f 3的T细胞抗原表位,并人工合成所预测的T细胞表位肽。采用改良MTT法,用预测表位肽刺激致敏鼠脾淋巴细胞进行脾淋巴细胞增殖试验;酶联免疫...

            【关键词】 粉尘螨粉尘螨3类变应原T细胞表位

            浏览:204 被引:4 下载:33
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            【中文期刊】 李娜  李朝品  等 《中国血吸虫病防治杂志》 2014年3期 296-299,307页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:预测并鉴定粉尘螨3类变应原(Der f 3)中的B细胞线性表位。方法运用生物信息学技术,从抗原性、表面易接近性、柔韧性、亲水性、β转角等5个方面在线预测Der f 3的B细胞线性抗原表位。同时,采用人工合成法合成相应B细胞表位肽分别与...

            【关键词】 粉尘螨粉尘螨3类变应原B细胞表位

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            【中文期刊】 杨军  刘妮  等 《南方医科大学学报》 2013年33卷2期 253-257页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 预测并鉴定乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)的B细胞线性表位,为乙型肝炎的诊断和治疗提供新的依据.方法 采用生物信息学分析技术,利用NCBI数据库和免疫表位数据库提供的相应软件预测HBeAg的B细胞线性表位,采用人工合成法合成相应表位肽...

            【关键词】 乙型肝炎病毒乙肝e抗原乙型肝炎病毒抗原表位预测

            浏览:336 被引:14 下载:38
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            【中文期刊】 林巧爱  董海艳  等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷11期 1067-1071页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 预测解脲支原体(Ureaplasma urealyticum,Uu3和14血清型多带抗原(multiple banded antigen,MBA)的优势B细胞表位和Th表位.方法 利用GOR4和HNN方法预测Uu3和Uu14血清型MB...

            【关键词】 解脲支原体多带抗原B细胞表位

            浏览:140 被引:1 下载:18
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            【中文期刊】 陈飞  高艳锋  等 《郑州大学学报(医学版)》 2011年46卷6期 839-841页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:预测结核分枝杆菌( MTB)耐药相关药物外排抗原(Rv1634、Rv2846c、Rv2937、Rv2686c、Rv2687c 及Rv3065)的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位.方法:通过NCBI数据库获取目的蛋白的...

            【关键词】 结核分枝杆菌药物外排抗原表位预测

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            【中文期刊】 孙大康  安新业  等 《中国免疫学杂志》 2011年27卷10期 917-921页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:预测人Trim22的B细胞抗原表位,制备并鉴定其多克隆抗体.方法:利用生物信息学软件分析Trim22的氨基酸序列,确定抗原表位并人工合成多肽.将合成肽与牛血清白蛋白(BSA)偶联,免疫大白兔制备抗Trim22的抗体.经饱和硫酸铵沉淀法...

            【关键词】 三基序蛋白22表位预测多肽抗体

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            【中文期刊】 吕虹  高艳锋  等 《郑州大学学报(医学版)》 2010年45卷1期 78-80页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:预测结核杆菌分泌抗原CFP21/MTB12/Rv3881c的HLA限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位.方法:利用SYFPEITHI、BIMAS和NetCTL方法预测分析抗原CFP21/MTBl2/Rv3881c的HLA-A*020...

            【关键词】 结核杆菌CFP21MTB12

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            【中文期刊】 邵东华  冯新港  《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2008年26卷3期 228-233页MEDLINEISTICPKUCSCD

            【摘要】 细胞免疫在防御外来病原感染、自身免疫及肿瘤等疾病中发挥重要作用.随着分子免疫学研究的不断发展,对T淋巴细胞免疫分子机制的阐释,大量T细胞表位信息以及功能基因组学资料的积累,使得基于数据驱动的预测T细胞表位的研究受到重视,可能成为疫苗研发的重...

            【关键词】 辅助T细胞表位预测疫苗

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            【中文期刊】 姜久昆  林旭瑷  等 《浙江大学学报(医学版)》 2008年37卷6期 585-591,621页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:预测及筛选问号钩端螺旋体(简称钩体)属特异性外膜蛋白LipL41有效T和B细胞(T/B)联合表位,了解不同基因型LipL41s差异T/B联合表位的免疫反应性差别.方法:采用生物信息学方法预测LipL41/1和LipL41/2分子中T/...

            【关键词】 钩端螺旋体,问号/免疫学细菌外膜蛋白质类/生物合成细菌外膜蛋白质类/分离

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            【中文期刊】 郭大东  高雪芹  等 《生物医学工程学杂志》 2007年24卷5期 1123-1127页MEDLINEISTICPKUCA

            【摘要】 用Garnier-Robson和Chou-Fasman方案预测人巨细胞病毒融合蛋白pp150/MDBP的α-螺旋、β-折叠及转角的二级结构,用 Kyte-Doolittle及Hopp-Woods亲水性方案预测其B细胞表位.研究结果表明,pp...

            【关键词】 人巨细胞病毒融合蛋白二级结构

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            【中文期刊】 樊建勇  杨慧兰  等 《中国皮肤性病学杂志》 2007年21卷6期 330-333页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 预测并克隆单纯疱疹病毒2 gD蛋白T细胞抗原表位集中区.方法 根据相关计算机软件和互联网服务器进行表位预测;提取单纯疱疹病毒2基因组,用特异性引物扩增预测的gD蛋白T细胞抗原表位集中区基因,酶切后将目的 基因插入载体pGEX-4T-1...

            【关键词】 单纯疱疹病毒gD蛋白表位

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            【中文期刊】 何仰东  吴玉章  等 《第三军医大学学报》 2006年28卷9期 872-875页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测,并对其与MHC-Ⅰ亲和力进行分析,为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础.方法利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2.1限制性CTL表位预测软件,对SSX基因家族不同...

            【关键词】 SSX肿瘤基因表位预测HLA-A2.1限制性

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            【中文期刊】 孙仁山  刘荣卿  等 《第三军医大学学报》 2002年24卷10期 1213-1213,1221页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 <篇首> 人高亲和力IgE受体(FcεR1)由1条α链、1条β链和两条γ链构成.我们建立的编码膜外区α链的膜外区α链(αt cDNA)与文献对比[1,2],有两处发生碱基置换,该置换是否会导致αt 蛋白的抗原表位改变,是否会影响与IgE的结合,...

            【关键词】 IgE受体α链表位

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            【中文期刊】 邹强  谢佩蓉  等 《中国免疫学杂志》 2001年17卷7期 388-392页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:分析预测人衰变加速因子的二级结构特征及B细胞表位。方法:比较Chou & Fasman经典方案和基于多重序列比较的PHDsec二级结构预测方案的预测准确率,应用较优方案对DAF的二级结构进行预测分析;运用Hopp & Woods的亲水...

            【关键词】 衰变加速因子二级结构表位

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            【中文期刊】 赵建平  吴玉章  《第三军医大学学报》 2000年22卷10期 988-992页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 <篇首> CD8+αβT细胞在机体抗感染和抗肿瘤免疫中发挥着极为重要的作用.现已知,CD8+αβT细胞所识别的靶抗原需先经抗原递呈途径以"抗原肽-MHC Ⅰ类分子"复合物的形式呈现于抗原递呈细胞(Antigen presenting cells...

            【关键词】 GTL 表位预测方法MHCⅠ类分子

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            【中文期刊】 袁竞妍  王宇  等 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2017年10卷3期 257-262页ISTIC

            【摘要】 目的 应用生物信息学方法对人端粒酶逆转录酶(hTERT) HLA-A2+限制性细胞毒性T细胞(CTL)表位进行预测和鉴定,寻找诱导机体特异性杀伤肺癌肿瘤细胞的抗原表位.方法 应用生物信息学软件BIMAS、SYFPEITHI对hTERT蛋白进...

            【关键词】 支气管肺癌hTERT表位预测

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            【中文期刊】 羊红光  张立佳  等 《河北省科学院学报》 2019年36卷3期 21-27页

            【摘要】 B细胞表位的鉴定是研制疫苗、疾病诊断的关键步骤,表位预测是研究蛋白质表位一种筛选技术,能降低传统方法的大量投入,大幅降低研制时间、研发经费投入、研究人员精力花费等.表位预测的计算工具和方法不断推出,但预测性能却难言理想.回顾B细胞表位预测的...

            【关键词】 B细胞表位表位鉴定表位预测

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            【中文期刊】 侯逸琳  《河北省科学院学报》 2019年36卷2期 20-23页

            【摘要】 B细胞表位预测在蛋白抗体制备、疫苗设计中都具有重要的应用.基于支持向量机方法设计了一个B细胞线性表位预测模型,运用了多群集特征选择算法进行特征选择,有效提高了预测准确率.

            【关键词】 B细胞线性表位预测支持向量机

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            【中文期刊】 刘丽娜  潘渠  等 《成都医学院学报》 2012年7卷4期 558-562页ISTICCA

            【摘要】 预测金葡菌疫苗候选分子SirH的B细胞抗原表位.用PCR方法从金葡菌临床分离株的基因组DNA中扩增出sirH基因,插入表达载体pET-28a(+)中,构建重组表达载体pET28a-sirH,双酶切鉴定并测序,通过与GenBank中登录的金葡...

            【关键词】 金黄色葡萄球菌SirHB细胞抗原表位

            浏览:224 被引:1 下载:0
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            【中文期刊】 朱峰  李弘剑  等 《中国现代医学杂志》 2009年19卷21期 3231-3234页ISTIC

            【摘要】 目的 预测人巨细胞病毒UL23基因编码蛋白的B细胞表位.方法 应用互联网软件分析Hopp&Woods亲水性(Hydrophilicity)、可及性(Accessibility)、极性(Polarity)及柔韧性(Flexibility)、W...

            【关键词】 人巨细胞病毒UL23B细胞表位

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            【中文期刊】 刘光桥  宋立华  等 《微生物学免疫学进展》 2008年36卷3期 24-28页ISTICCA

            【摘要】 分析沙眼衣原体多形态膜蛋白D(PmpD)的基因序列并预测PmpD蛋白的B细胞抗原表位.在GenBank中检索沙眼衣原体不同血清型的PmpD基因序列,进行序列比对分析.以L2血清型PmpD基因序列为材料,采用Karplus-Schulz、Ch...

            【关键词】 沙眼衣原体多形态膜蛋白D二级结构

            浏览:163 被引:5 下载:20
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            【中文期刊】 高艳锋  翟明霞  等 《现代肿瘤医学》 2008年16卷11期 1850-1851页ISTICCA

            【摘要】 目的:预测肿瘤相关抗原CT45的HLA-A2/A3限制性CTL表位,为CTL表位肽的合成和活性筛选提供依据.方法:基于新近发现的CT45抗原的氨基酸序列,用NetCTL 1.2 Server人工神经网络法远程预测系统进行HLA-A2/A3限...

            【关键词】 抗原肽肿瘤CT45

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            【中文期刊】 周勇  马玲  《新疆医科大学学报》 2008年31卷8期 955-958页ISTICCA

            【摘要】 目的:预测并综合分析人卵透明带3(human zona pellucida 3, hZP3)蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位.方法:以hZP3蛋白的基因序列为材料,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus...

            【关键词】 人卵透明带3蛋白B细胞抗原表位二级结构

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            【中文期刊】 高艳锋  翟明霞  等 《现代肿瘤医学》 2008年16卷6期 893-895页ISTICCA

            【摘要】 目的:预测基于癌-睾丸抗原SSX-3的HLA-A2/A3限制性CTL广谱表位.方法: 采用MULTIPRED在线预测系统分别针对HLA-A2超型和HLA-A3超型对SSX-3序列进行CTL表位预测,其中对两种超型分值均较高的表位被初步认定为...

            【关键词】 癌-睾丸抗原SSX-3CTL表位

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            【中文期刊】 周游  王清明  《生命的化学》 2008年28卷6期 767-770页ISTIC

            【摘要】 B细胞表位预测对于多种免疫学研究是必不可少的重要工具.本文概括了计算机预测B细胞表位的现状,汇总了多种表位预测工具及其原理和应用,介绍了一些用于建立与评价预测工具的数据库和数据集,对各类预测工具和数据库的特点和网址进行整理列表.另外,还分析...

            【关键词】 B细胞表位表位预测算法

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            【中文期刊】 欧琴  朱珊丽  等 《温州医学院学报》 2007年37卷2期 114-118页ISTICCA

            【摘要】 目的:预测EB病毒(EBV)潜伏膜蛋白2(LMP2)的二级结构和B细胞表位.方法:以EBV标准株(B95.8)LMP2的完整氨基酸序列为基础,采用SOPMA、GOR、nnPredict和HNN四种方法分别预测LMP2的二级结构;并结合其跨膜...

            【关键词】 EBV潜伏膜蛋白2B细胞表位

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            【中文期刊】 王鹏飞  欧琴  等 《生物医学工程与临床》 2007年11卷5期 402-405页ISTICCA

            【摘要】 目的 分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,gen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础.方法 以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和James...

            【关键词】 癌胚抗原B细胞表位预测

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            【中文期刊】 单昊  徐进梅  等 《热带医学杂志》 2007年7卷6期 509-512,528页ISTICCA

            【摘要】 目的 预测微小隐孢子虫SA35和SA40蛋白的B细胞表位.方法 以单参数(亲水性、可及性、柔韧性及抗原性)预测为基础,通过二级结构预测初步筛选,并以ABCpred方案作为最终验证,预测微小隐孢子虫SA35和SA40蛋白的B细胞表位.结果 S...

            【关键词】 微小隐孢子虫SA35蛋白SA40蛋白

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            【中文期刊】 王昊亮  付晓岚  等 《免疫学杂志》 2006年22卷6期 593-596页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的 通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A * 0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础...

            【关键词】 CT抗原KM-HN-1表位预测

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            【中文期刊】 杨玓  姜曼  等 《免疫学杂志》 2006年22卷2期 158-161页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的鉴定骨髓瘤抗原Sp17的HLA-A*0201限制性CTL表位.方法采用超基序和量化基序法预测Sp17的HLA-A*0201限制性CTL表位;用T2细胞亲和力实验和稳定性实验对该表位进行初步鉴定.结果超基序和量化基序法预测得出Sp17抗原...

            【关键词】 肿瘤抗原Sp17CTL表位

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            【中文期刊】 田亚萍  张培因  等 《医学分子生物学杂志》 2004年1卷1期 10-14页ISTICCA

            【摘要】 目的定点诱变热休克蛋白-乳头瘤病毒表位融合蛋白的基因中编码半胱氨酸的密码子,解决下游纯化工作中产生多聚体蛋白的问题.方法在对蛋白质序列进行计算机表位预测及生物学特性分析的基础上,利用PCR的定点诱变技术,使原始基因序列中编码半胱氨酸的TGC...

            【关键词】 乳头瘤病毒表位融合基因定点诱变表位预测

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            【中文期刊】 沈柱  王刚  等 《中国麻风皮肤病杂志》 2004年20卷4期 309-311页ISTIC

            【摘要】 目的:预测和表达人角蛋白17 HLADR4、7限制性T细胞抗原表位区.方法:根据相关计算机软件和互联网服务器进行表位预测.从银屑病皮损表皮中提取总RNA,反转录成cDNA,常规方法将目的基因插入原核表达载体pGEX-4T-1和真核表达载体p...

            【关键词】 角蛋白表位预测

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            【中文期刊】 韩俊锋  吴玉章  等 《免疫学杂志》 2004年20卷4期 256-258页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的鉴定慢性白血病肿瘤抗原CMl28的HLA-A*0201限制性CrL表位.方法采用超基序和量化基序结合的方法初步预测CML28的HLA-A*0201限制性CTL表位;利用T2细胞亲合力实验初步验证预测结果.结果在预测的4个候选CTL表位中...

            【关键词】 肿瘤抗原CML28CTL表位

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            【中文期刊】 黄健  郭建巍  等 《微生物学免疫学进展》 2004年32卷2期 50-52页ISTICCA

            【摘要】 辅助性T细胞表位是由十几个连续的氨基酸残基构成的特殊肽段,在体液与细胞免疫中有重大作用.本文回顾了辅助性T细胞表位预测的原理与方法;同时也简要述评了有关研究成果及应用.

            【关键词】 辅助性T细胞表位预测

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            【中文期刊】 张秀敏  隋延仿  等 《第四军医大学学报》 2004年25卷24期 2222-2225页ISTICCA

            【摘要】 目的:预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的HLA-A2限制性CTL表位,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据.方法:用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA-A2限制性CTL表位预测,采用DNAstar...

            【关键词】 抗原,肿瘤MAGE-A亚家族T淋巴细胞,细胞毒性

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            【中文期刊】 吕燕波  万瑛  等 《免疫学杂志》 2003年19卷6期 407-410页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构.方法以SARS病毒基因组序列为基础,采用Gar-nier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测E蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittl...

            【关键词】 SARS病毒E蛋白B细胞表位

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            【中文期刊】 杨连君  司晓辉  《微生物学免疫学进展》 2001年29卷1期 8-10页ISTICCA

            【摘要】 为预测超抗原葡萄球菌肠毒素(SE)家族中的SEA、SEB和SEC1的HLAI和HLAⅡ抗原结合表位,并对其活化T细胞作用的机理进行探讨,根据已发表的SEA、SEB和SEC1基因全序列,用T细胞抗原表位预测软件Guotif 2.0对其进行T细...

            【关键词】 超抗原葡萄球菌肠毒素T细胞抗原表位

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            【中文期刊】 贾帅争  孙红琰  等 《生物技术通讯》 2001年12卷1期 15-17页ISTICCA

            【摘要】 应用网络生物信息资源查找丙型肝炎病毒基因组全序列,用软件Lasergene中的EditSeq将来自中国河北株mRNA序列翻译为氨基酸序列,尔后用程序Protean进行氨基酸序列分析,对HCV各区段的B细胞抗原指数进行预测。同时又在两个网站对...

            【关键词】 丙型肝炎病毒抗原表位预测

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            【中文期刊】 李云春  杨菊梅  等 《中国食品工业》 2016年2期 38-39页

            【摘要】 应用生物信息学软件DNAStar、DNAMAN及Bepipred线性表位预测(http://tools.immunee pitope.org/tools/bcell/iedb-input)在线工具对草莓皱缩病毒(Strawberry Cri...

            【关键词】 草莓皱缩病毒抗原表位预测基因克隆

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