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【中文期刊】 杨淞月 张美霞 《山东大学耳鼻喉眼学报》 2025年39卷1期 162-170,178页 ISTICCA
【摘要】 视网膜是充满异质性的组织,其结构复杂,由多种细胞构成,且每个细胞都拥有其独特的转录组信息.以往传统的RNA测序技术实现了对视网膜细胞整体的转录组测序研究.近年来,单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scR...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘宁宁 苏运芳 等 《中国老年学杂志》 2024年44卷23期 5758-5763页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨高浓度胰岛素(INS)诱导海马神经元(HT22)细胞的转录组学变化及熟地黄醇提物(熟地)的可能干预机制.方法 采用高浓度INS诱导HT22细胞产生INS信号通路异常,通过转录组测序(RNAseq)分析差异表达基因,并进行基因本体论...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王智超 张雪 等 《中国现代应用药学》 2024年41卷11期 1464-1475页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对金天格胶囊治疗骨关节炎的药效进行确证,基于高通量测序技术探讨滑膜间充质干细胞外泌体(synovial mesenchymal stem cell exosomes,SMSC-Exos)与关节软骨细胞(articular chondr...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏秀秀 龙法宁 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷2期 241-249页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 深度模型在单细胞转录组测序(single-cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)中以单细胞分辨率提取基因的特征表达,但是scRNA-seq采集过程中存在"dropout"(数据缺失)问题,造成基因表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 秦健 李振月 等 《生物技术通报》 2024年40卷6期 330-342页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]基于单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)揭示牛肌源性细胞分化中的基因表达谱变化,并探究介导细胞间通讯的配体-受体互作机制,为构建成肌分化的动态调控网络奠定基础.[方法]利用Se...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 白志元 徐菲 等 《生物技术通报》 2024年40卷6期 134-142页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]探索大豆细胞质雄性不育弱恢复型杂种F1 育性转变在RNA水平上的分子机制,以期从育性转变的角度为大豆细胞质雄性不育的分子机理提供有价值的信息.[方法]以弱恢复型杂种F1(H3A×SXTH3)为研究对象,设置苗期短光照(植株育性不育)...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梁俊超 赵云燕 等 《植物生理学报》 2023年59卷2期 393-403页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 利用两个对铝胁迫耐受性表现显著差异的芝麻(Sesamum indicum)品种'金黄麻'(耐铝)和'竹山白'(铝敏感)为实验材料,进行了铝胁迫下芝麻根系的高通量RNA测序和比较转录组分析,筛选响应铝胁迫的潜在候选基因,研究芝麻响应铝胁迫的分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曾渝 陈磊 《现代免疫学》 2023年43卷3期 189-196页 ISTIC
【摘要】 研究从大规模单细胞转录组测序数据出发,获得结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中肠道内分泌细胞(enteroendocrine cell,EEC)的单细胞转录组图谱;对此转录组测序数据作差异表达、功能以及拟时序分析,结果提...
【关键词】 单细胞转录组测序数据分析； 结直肠癌； 组学数据挖掘；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张哲雯 冯燕 等 《中药药理与临床》 2022年38卷1期 103-110页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨金荞麦水提物体外抗甲型流感病毒H1N1的效果及其作用机制.方法:考察金荞麦水提物抗H1N1感染犬肾(Madin-Darby canine kidney,MDCK)细胞的活性及作用方式;转录组测序(RNA-sequencing,RN...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 叶雨轩 涂艺声 等 《基因组学与应用生物学》 2022年41卷2期 383-394页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了研究添加不同氨基酸溶液培养蛇足石杉(Huperzia serrata)离体叶状体对累积石杉碱甲(huperzine A,Hup A)的差异响应,利用转录组测序比较分析影响Hup A累积显著不同的天冬氨酸(D)、赖氨酸(K)处理的叶状体差...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘菲 刘婷 等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷9期 2925-2935页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 云斑车蝗(Gastrimargus marmoratus)隶属于直翅目(Orthoptera)斑翅蝗科(Oedipodidae)飞蝗亚科(Locustinae),是一种地域分布较广的蝗虫.本研究运用第二代测序技术对云斑车蝗进行转录组测序,并...
- 概要：
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【中文期刊】 陈艳霞 张振祥 等 《基因组学与应用生物学》 2021年40卷9期 2976-2987页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 甘肃马鹿(Cervus elaphus kansuensis)是中国特有马鹿亚种之一,目前其种群退化比较严重.本研究应用现代分子生物学技术对其SSR和SNP标记特征进行分析,旨在为甘肃马鹿的遗传保护、种群改良、分子辅助育种等奠定基础.本研究...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 陈家鑫 蒋诗情 等 《中草药》 2025年56卷2期 546-557页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于转录组测序技术探讨隐丹参酮(cryptotanshinone,CPT)联合顺铂(cisplatin,DDP)干预对A2780/DDP细胞的影响及其潜在作用机制.方法 体外培养人卵巢癌A2780和A2780/DDP细胞,将细胞分为对...
【关键词】 隐丹参酮； 顺铂； A2780/DDP细胞；
- 概要：
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【中文期刊】 王亚萍 包文泉 等 《植物学报》 2025年60卷1期 101-113页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组学将时空分辨率从多细胞水平转移到单细胞水平,该技术的快速发展能够更好地揭示新的稀有细胞类型、挖掘细胞间异质性并绘制细胞发育轨迹图.目前,单细胞转录组学已广泛应用于植物生长发育、应激反应和环境适应等不同研究方向,有助于更精确、全面...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘安东 宁婉清 等 《微生物学报》 2025年65卷3期 1219-1240页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]对具有拮抗植物病原真菌作用的链霉菌ZH-356 进行定殖能力和生防作用评价,并结合组学分析初步揭示其植病生防机制.[方法]采用绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)荧光标记法,检测链霉菌ZH-35...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张向歌 陈晨 等 《植物学报》 2025年60卷1期 33-48页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 块茎是油莎豆(Cyperus esculentus)独特且极其重要的器官,富含油脂且具有与种子类似的繁殖能力,研究油莎豆块茎特异性表达基因对于解析其块茎特异性生长发育(尤其是油脂积累)的调控机理具有重要意义.通过对油莎豆主要器官(根、叶、分...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李亚军 何金曼 等 《生物技术》 2025年35卷1期 25-29,94页 ISTICCA
【摘要】 [目的]分析硅缺乏对小新月菱形藻基因在转录水平上的调控.[方法]收集缺硅24 h和正常培养条件下的藻细胞,利用illumina NovaSeq 6000平台对其RNA进行测序.以正常培养藻细胞为对照,鉴定硅缺乏条件下差异表达基因,并对其进行...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李强明 白玉 等 《中华实用诊断与治疗杂志》 2025年39卷1期 1-8页 ISTIC
【摘要】 目的 采用生物信息学方法筛选GATAD2A调控食管鳞状细胞癌(ESCC)的关键基因和通路,探讨GATAD2A在ESCC中作用的分子机制.方法 取对数生长期ESCC细胞株KYSE-150,分为敲低组(转染GATAD2A-siRNA)和对照组(...
【关键词】 食管鳞状细胞癌； KYSE-150细胞； GATAD2A；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张琼 陆銮眉 等 《生态学杂志》 2024年43卷5期 1291-1299页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 探讨土壤pH对琯溪蜜柚枝条、叶片和果实粒化的影响,为琯溪蜜柚科学种植和可持续发展提供理论支持.选取不同土壤pH但立地条件和果树长势较为均匀的4组琯溪蜜柚果园(土壤pH分别为5.15、4.76、4.73和4.49),对琯溪蜜柚叶片和枝稍进行I...
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【中文期刊】 岳丽昕 王清华 等 《生物技术通报》 2024年40卷9期 212-224页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]挖掘大葱雄性不育相关的特异性模块并筛选核心基因,为后续深入解析大葱雄性不育分子机制提供理论依据.[方法]以大葱可育株MF和不育株MS不同发育时期的花蕾为研究对象,基于转录组测序和加权基因共表达网络分析(weighted gene c...
【关键词】 大葱； 雄性不育； 加权基因共表达网络分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张皓翔 王艳杰 等 《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》 2024年38卷6期 556-560页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:传统研究变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)主要通过动物模型和分子生物学方法研究,转录组测序技术的诞生推进了 AR基因层面的探索.近年来重点聚焦于常见RNA在AR中作用的研究,提示AR的生物信息学分析已取得突破性进展...
- 概要：
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【中文期刊】 赵乐 徐磊磊 等 《中国矫形外科杂志》 2024年32卷17期 1600-1604页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]通过转录组测序和生物信息学分析寻找骨肉瘤发生的关键基因和相关通路.[方法]收集骨肉瘤组织和癌旁对照组织,通过转录组芯片建立表达谱并筛选差异性表达基因(differentially expressed genes,DEGs).利用在线...
- 概要：
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【中文期刊】 李玉清 王洪连 等 《中药药理与临床》 2024年40卷2期 40-47页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于高通量转录组测序以及加权基因共表达网络(Weighted gene co-expression network,WGCNA)分析挖掘黄芪三七合剂治疗肾缺血再灌注(IRI)急性肾损伤的关键靶基因.方法:将27只C57BL/6小鼠随机...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 雷诗卉 李薇 等 《中国实验方剂学杂志》 2024年30卷18期 98-106页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:结合基因集富集分析(GSEA)和趋势分析(STEM)方法研究左归降糖解郁方治疗糖尿病并发抑郁症的关键途径并进行验证.方法:将SD大鼠随机分为正常组、模型组、左归降糖解郁方高、中、低剂量组、西药组.采用高脂饲养、链脲佐菌素(STZ)注射...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘子宇 徐欣玉 等 《中草药》 2024年55卷11期 3735-3748页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究银杏二萜内酯葡胺注射液(Diterpene Ginkgolides Meglumine Injection,DGMI)在C57BL/6J小鼠大脑中动脉闭塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO...
【关键词】 银杏二萜内酯葡胺注射液； 缺血性脑卒中； 黑质；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高萌萌 赵天宇 等 《生物技术通报》 2024年40卷7期 137-149页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]"三系"法是选育杂交大豆的主要途径,但恢复系中仅有少数大豆恢复基因被克隆,为挖掘更多新恢复基因,从而促进多基因聚合的强恢复系选育,提高杂种F1 的育性稳定性.[方法]以大豆细胞质雄性不育系JLCMS5A和其恢复系JLR2 为材料,采...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 陈思 王向前 等 《中国血吸虫病防治杂志》 2024年36卷5期 481-493页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用单细胞转录组测序技术(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)探究泡型棘球蚴病(alveolar echino-coccosis,AE)患者肝脏组织免疫微环境T细胞亚型及功能.方法 以青海省人民医...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 江楠 苏雅馨 等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2024年42卷3期 286-294页 MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 从单细胞水平探究细粒棘球蚴感染小鼠不同时期肝组织微环境细胞中T细胞亚型组成及其转录谱特征.方法 从课题组前期细粒棘球蚴感染后1个月(1只)、3个月(1只)和6个月(2只)的BALB/c小鼠和健康小鼠(1只,对照组)肝组织的单细胞转录组...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 栾明春 王越 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷7期 813-816页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用转录组测序技术直接检测疑似感染患者标本中的未知病原体,为感染的诊断、治疗和预警提供依据.方法 对大连地区疑似感染的一名患者的标本进行RNA提取,直接用于RNA文库构建和测序,对测序获得数据进行生物信息学分析,与微生物数据库进行比对...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董佳裕 刘鑫 等 《药物评价研究》 2024年47卷7期 1486-1501页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 建立小鼠支气管哮喘模型和人非小细胞肺癌细胞(A549)炎症模型,研究金振口服液(Jinzhen Oral Liquid,JZOL)对支气管哮喘的药效作用和分子机制.方法 将66只雌性BALB/c小鼠随机分为对照组和模型组,模型组小鼠采...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐晓晛 蒋晗偲 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷5期 853-863页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响.通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型...
【关键词】 水牛(Bubalus bubalis)； 卵泡大小； 卵母细胞；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱晓姝 滕飞 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷2期 195-206页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序技术提供单个细胞分辨率的基因表达谱,有助于更准确地揭示细胞异质性.聚类是识别生物组织中细胞类型的主要方法,选择合适的聚类算法可以提升单细胞转录组测序数据分析的性能.本文阐述了 k-means、层次聚类(hierarchica...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王雪飞 张燕 等 《中华中医药杂志》 2024年39卷7期 3403-3409页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:研究不同归经的芳香药对流行性感冒(以下简称流感)小鼠的气道黏膜和基因表达谱的差异.方法:40只BALB/c小鼠随机分为空白组、模型组、藿香组及苍术组,每组10只.除空白组外,滴鼻接种FM1病毒制造流感模型,治疗组小鼠分别雾化吸入藿香或...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘梦雅 梁永林 等 《中国中药杂志》 2024年49卷18期 4977-4985页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基于转录组学技术探讨香砂六君子汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的分子机制并进行实验验证.通过1-甲基-3-硝基-1-亚硝基胍(MNNG)复合多因素法建立CAG大鼠模型,香砂六君子汤干预90 d.测定各组大鼠体质量和3 h进食量,采用HE染色观...
【关键词】 香砂六君子汤； 慢性萎缩性胃炎； cGMP/PKG通路；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 张楠 闫华筝 等 《细胞与分子免疫学杂志》 2024年40卷12期 1133-1137页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 脊髓损伤(SCI)是一个涉及多种细胞相互作用的复杂病理生理过程,传统的测序方法只能检测受损局部细胞群体的平均基因表达水平,难以体现其异质性,因此需要新技术揭示细胞间的异质性和复杂的细胞间相互作用.单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术通...
【关键词】 单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)； 脊髓损伤免疫微环境； 中性粒细胞；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林玲 莫国东 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷4期 663-674页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生长激素(growth hormone,GH)不仅能调节动物的代谢、生长、发育和生殖,也能调节动物的免疫系统.本研究旨在通过转录组测序及生物信息学技术分析GH影响J亚群禽白血病病毒(subgroup J avian leukosis vir...
【关键词】 差异表达基因(DEGs)； 生长激素(GH)； J亚群禽白血病病毒(ALV-J)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陆华冠 彭望霞 等 《中国中药杂志》 2024年49卷10期 2597-2606页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 旨在通过单细胞、转录组学测序和体内外实验,探讨巨噬细胞极化在扶正化瘀片(FZHY)治疗肝纤维化中的作用.从GEO数据库中获取肝纤维化相关芯片、转录组数据集及单细胞测序数据集,筛选差异基因;运用GeneCards、DisGeNET、NC-BI...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈杰 张秋欢 等 《中国病原生物学杂志》 2024年19卷9期 1025-1030页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于转录组学分析生脉饮抗登革1型病毒(DENV-1)的作用及其机制.方法 采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)法和细胞凋亡检测试剂盒检测生脉饮对C6/36、293、LO2、HBMEC和AC16细胞的增...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴翠萍 朱一丹 等 《山东大学耳鼻喉眼学报》 2024年38卷4期 1-6,14页 ISTICCA
【摘要】 目的 探究胆红素对神经干细胞(neural stem cells,NSCs)活性和增殖的影响.方法 分离培养小鼠NSCs,加入不同浓度的胆红素,培养 2d后行活/死细胞染色;培养 7d后行神经球形成、Ki-67 检测和转录组测序分析以探究胆...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨丽 杨静 等 《中国优生与遗传杂志》 2024年32卷4期 674-680页 ISTIC
【摘要】 目的 通过对不明原因复发性流产(URSA)孕妇绒毛组织的lncRNA比对参考基因组进行注释,探究URSA中潜在的lncRNA生物学靶点.方法 收集4例URSA(实验组)和4例选择性终止妊娠(ETP)孕妇(对照组)的绒毛组织样本,使用Stri...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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