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            1. 千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析

            【中文期刊】 汤贤春 钱倩  等 《生命科学研究》 2016年20卷5期 395-400页 ISTICCA

            【摘要】 基于已构建的千里光全长cDNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(GenBank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质...

            【关键词】 千里光； 角质层蜡质； 脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)；

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            2. 基于CyClus3D聚类算法的PPI网络模体研究

            【中文期刊】 浦恩禄 张孟娇  等 《大理大学学报》 2015年14卷12期 39-42页

            【关键词】 蛋白质； 蛋白质相互作用； CyClus3D聚类算法；

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            3. On the evolution of protein folds: Are similar motifs in different protein folds the result of convergence, insertion, or relics of an ancient peptide world?

            【外文期刊】 Lupas AN ; Ponting CP ; 等 《Journal of Structural Biology》 2001年134卷2/3期 191-203页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Protein evolution; Protein structure similarity; Protein function;

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            4. HIVNEF-mediated major histocompatibility complex class I down-modulation is independent of Arf6 activity

            【外文期刊】 Larsen JE. ; Massol RH. ; 等 《Molecular biology of the cell》 2004年15卷1期 323-331页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Hiv-1 nef protein; Sh3 domain; Plasma-membrane;

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            5. Toward the quantitative prediction of T-cell epitopes: QSAR studies on peptides having affinity with the class I MHC molecular HLA-A*0201

            【外文期刊】 Lin ZH ; Wu YZ ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2004年11卷4期 683-694页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 epitope prediction; 3D-QSAR; HLA-A*0201;

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            6. Manganese-dependent polioviruses caused by mutations within the viral polymerase

            【外文期刊】 Crotty S. ; Gohara D. ; 等 《Journal of Virology》 2003年77卷9期 5378-5388页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Genome-linked protein; Strand rna viruses; 3d(pol);

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            7. Evolutionarily Conserved Role of Calcineurin in Phosphodegron-Dependent Degradation of Phosphodiesterase 4D

            【外文期刊】 Zhu, Hong ; Suk, Hee Yun ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2010年30卷18期 4379-4390页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 E3 ubiquitin ligase: 74812-49-0; EC 6.3.2.19; cullin 1;

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            8. The vitamin D receptor interacts preferentially with DRIP205-like LxxLL motifs

            【外文期刊】 Zella LA ; Chang CY ; 等 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2007年460卷2期 206-212页 SCISCIE

            【关键词】 vitamin D receptor; LxxLL motif; phage display;

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            9. Smoothing 3D Protein Structure Motifs Through Graph Mining and Amino Acid Similarities

            【外文期刊】 WAJDI DHIFLI ; RABIE SAIDI ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2014年21卷2期 162-172页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 3D motifs; amino acids; graph mining;

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            10. Molecular docking, 3D-QASR and molecular dynamics simulations of thiazoles Pin1 inhibitors

            【外文期刊】 Zhao, Jiangheng ; Liu, Min ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2022年40卷23期 12699-12713页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Pin1; pSer/Thr-Pro motifs; molecular docking;

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            11. Properties of Bacterial and Archaeal Branched-Chain Amino Acid Aminotransferases

            【外文期刊】 Bezsudnova, E. Yu. ; Boyko, K. M. ; 等 《Biochemistry》 2017年82卷13期 1572-1591页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 branched-chain amino acid aminotransferases (BCATs); pyridoxal 5'-phosphate catalysis; bacterial and archaeal enzymes;

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            12. Deep Learning of Sequence Patterns for CCCTC-Binding Factor-Mediated Chromatin Loop Formation

            【外文期刊】 Kuang, Shuzhen ; Wang, Liangjiang ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2021年28卷2期 133-145页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 3D genome; chromatin loops; CTCF;

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            13. Novel domain architectures and functional determinants in atypical annexins revealed by phylogenomic analysis

            【外文期刊】 Fernandez, Maria-Pilar ; Garcia, Montserrat ; 等 《Biological chemistry》 2017年398卷7期 751-763页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 3D modeling; conserved motifs; functional determinants;

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            14. In silico analysis of Mn transporters (NRAMP1) in various plant species

            【外文期刊】 Vatansever, Recep ; Filiz, Ertugrul ; 等 《Molecular biology reports》 2016年43卷3期 151-163页

            【关键词】 Transporter family; Motif signature; Interaction partner;

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            15. Identification of caspase 3 motifs and critical aspartate residues in human phospholipase D1b and phospholipase D2a.

            【外文期刊】 Wright MH ; Farquhar MJ ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2008年369卷2期 478-484页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Amino Acid Motifs; Amino Acid Sequence; Apoptosis;

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            16. VeRNAl: a tool for mining fuzzy network motifs in RNA

            【外文期刊】 Oliver, Carlos ; Mallet, Vincent ; 等 2022年38卷4期 970-976页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 SEARCH TOOL; 3D MOTIFS; CLASSIFICATION;

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            17. Automated classification of RNA 3D motifs and the RNA 3D Motif Atlas

            【外文期刊】 Petrov,A.I. ; Zirbel,C.L. ; 等 《RNA》 2013年19卷10期 1327-1340页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FR3D; Motif classification; RNA 3D motifs;

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            18. Complementary roles of the DRY motif and C-terminus tail of GPCRS for G protein coupling and beta-arrestin interaction

            【外文期刊】 Kim KM ; Caron MG ; 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2008年366卷1期 42-47页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 dopamine D-2 and D-3 receptor; DRY motif; beta-arrestin;

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            19. Functional implications of structural predictions for alternative splice proteins expressed in Her2/neu-induced breast cancers

            【外文期刊】 Menon, R. ; Roy, A. ; 等 《Journal of proteome research》 2011年10卷12期 5503-5511页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 3D structure; alternative splice isoforms; functional motifs;

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            20. Structural analysis of the envelope gp120 V3 loop for some HIV-1 variants circulating in the countries of Eastern Europe

            【外文期刊】 Andrianov,A.M. ; Kornoushenko,Y.V. ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2013年31卷7/8期 665-683页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 3D structure; Computer modeling; Conserved structural motifs;

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            21. Prediction of Proteins Putatively Involved in the Thiol: Disulfide Redox Metabolism of a Bacterium (Listeria): The CXXC Motif as Query Sequence

            【外文期刊】 Shubha Gopal ; Vanishree Srinivas ; 等 《In silico biology: An international on computational biology》 2009年9卷5/6期 407-414页 MEDLINE

            【关键词】 CXXC motif; 3D structure; L. monocytogenes EGD-e;

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            22. Individual C1 domains of PKD3 in phorbol ester-induced plasma membrane translocation of PKD3 in intact cells

            【外文期刊】 Anderson G ; Chen J ; 等 《Cellular Signalling》 2005年17卷11期 1397-1411页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 C1 domain; PKD3; PKC;

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            23. TAZ regulates cell proliferation and sensitivity to vitamin D3 in intrahepatic cholangiocarcinoma

            【外文期刊】 Xiao, Heng ; Tong, Rongliang ; 等 《Cancer letters》 2016年381卷2期 370-379页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Transcriptional coactivator with PDZ binding motif (TAZ); P53; Cytochrome P450 family 24 subfamily A polypeptide 1 (CYP24A1);

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            24. The RNA 3D Motif Atlas: Computational methods for extraction, organization and evaluation of RNA motifs

            【外文期刊】 Parlea, Lorena G. ; Sweeney, Blake A. ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2016年103卷 99-119页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Structured RNA molecules; Hairpin loop; Internal loop;

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            25. Ring Catalog: A resource for designing self-assembling RNA nanostructures

            【外文期刊】 Parlea, Lorena ; Bindewald, Eckart ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2016年103卷 128-137页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RNA motifs; 3D structural elements; Sequence design;

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            26. Spatiotemporal Expression of 3-B-3(?) and 7-D-4 Chondroitin Sulfation, Tissue Remodeling, and Attempted Repair in an Ovine Model of Intervertebral Disc Degeneration

            【外文期刊】 Brooke Farrugia ; Susan M. Smith ; 等 《Cartilage》 2020年11卷2期 234-250页

            【关键词】 chondroitin sulfate motifs; tissue remodeling; tissue regeneration;

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            27. RR3DD: an RNA global structure-based RNA three-dimensional structural classification database

            【外文期刊】 Hong, Xu ; Zheng, Jinfang ; 等 2021年18卷S2期 738-746页

            【关键词】 RNA classification; RNA structure; database;

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            28. Chromosome condensation induced by geminivirus infection of mature plant cells

            【外文期刊】 Bass HW. ; Hanley-Bowdoin L. ; 等 《Journal of Cell Science》 2000年113卷7期 1149-1160页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Geminivirus; Dna replication; Chromosome condensation;

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            29. A structural, phylogenetic, and functional study of 15.5-kD/Snu13 protein binding on U3 small nucleolar RNA

            【外文期刊】 Marmier-Gourrier N. ; Clery A. ; 等 《RNA》 2003年9卷7期 821-838页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 U3 snorna; 15; 5-kd/snu13 protein;

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            30. DNA Nanotechnology and Its Applications in Biomedical Research

            【外文期刊】 Sun, Lifan ; Yu, Lu ; 等 《Journal of biomedical nanotechnology》 2014年10卷9期 2350-2370页

            【关键词】 DNA Motifs; 2D DNA Arrays; 3D DNA Nanostructures;

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            31. 3D-QSAR study for DNA cleavage proteins with a potential anti-tumor ATCUN-like motif

            【外文期刊】 Gonzalez-Diaz H ; Sanchez-Gonzalez A ; 等 《Journal of Inorganic Biochemistry: An Interdisciplinary Journal》 2006年100卷7期 1290-1297页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ATCUN motif; DNA cleavage; anti-tumor activity;

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            32. Roles of protein kinase c and actin-binding protein 280 in the regulation of intracellular trafficking of dopamine D-3 receptor

            【外文期刊】 Cho EY ; Cho DI ; 等 《Molecular Endocrinology》 2007年21卷9期 2242-2254页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DENSITY-LIPOPROTEIN RECEPTOR; FILAMIN-A; COUPLED RECEPTORS;

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            33. SRC2-3 binds to vitamin D receptor with high sensitivity and strong affinity

            【外文期刊】 Egawa, Daichi ; Itoh, Toshimasa ; 等 《Bioorganic and medicinal chemistry》 2017年25卷2期 568-574页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Vitamin D; Nuclear receptor; Coactivator;

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            34. Spatial organization of the transcriptional regulatory network of Saccharomyces?cerevisiae Saccharomyces?cerevisiae

            【外文期刊】 Sun Dong‐Qing ; Tian Liu ; 等 《FEBS letters.》 2019年593卷8期 876-884页

            【关键词】 3D genome; chromatin interaction; network hierarchy;

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            35. AraPPISite: a database of fine-grained protein-protein interaction site annotations for Arabidopsis thaliana.

            【外文期刊】 Hong,Li ; Shiping,Yang ; 等 《Plant molecular biology》 2016年92卷1-2期 105-16页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 3D complex structure; Arabidopsis thaliana; Database;

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            36. Bioinformatic Identification of Functionally and Structurally Relevant Residues and Motifs in Protein S-Acyltransferases.

            【外文期刊】 Rodrigo,Quiroga ; Javier,Valdez Taubas ; 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2019年2009卷 191-199页

            【关键词】 3D structure; DHHC motif; Hidden Markov Model;

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            37. Vitamin D deficiency and severe asthma.

            【外文期刊】 Audrey H,Poon ; Bassam,Mahboub ; 等 《Pharmacology & therapeutics》 2013年140卷2期 148-55页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 1,25(OH)(2)D(3); 1,25-dihydroxyvitamin D(3); 25(OH)D(3);

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            38. The polybasic region in Gαi proteins: Relevant or not? Insights from Gαi3 research.

            【外文期刊】 Beata,Rysiewicz ; Ewa,Błasiak ; 等 《Cellular signalling》 2024年118卷 111138页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Dopamine D(2) receptor; GPCR; Gαi(3) subunit;

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            39. miR‑302d‑3p regulates the viability, migration and apoptosis of breast cancer cells through regulating the TMBIM6‑mediated ERK signaling pathway.

            【外文期刊】 Yanru,Liao ; Zhenxiong,Qiu ; 等 《Molecular medicine reports》 2021年24卷6期

            【关键词】 apoptosis; breast cancer; extracellular signal?regulated kinase signaling pathway;

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            40. SRC2-3 binds to vitamin D receptor with high sensitivity and strong affinity.

            【外文期刊】 Daichi,Egawa ; Toshimasa,Itoh ; 等 《Bioorganic & medicinal chemistry》 2017年25卷2期 568-574页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Charge clamp; Coactivator; Consensus motif;

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