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【会议论文】桑鹏 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会 2014年
【摘要】 Background: Acquired immune deficiency syndrome (AIDS) has caused catastrophic consequences to human society.During the ...
【关键词】 gp120； dynamics and function； conformational equilibrium and transition；
【外文期刊】 Baumketner A ; Shea JE ; 《Journal of Molecular Biology》 2007年366卷1期 275-285页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alzheimer amyloid beta peptide; replica exhange molecular dynamics simulations; peptide conformations;
【外文期刊】 Shen, H. ; Shen, X. ; 等 《Molecular simulation》 2013年39卷10/13期 842-847页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Nisha Amarnath,Jonniya ; Md Fulbabu,Sk ; 等 2022年40卷3/4期 1400-1415页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 With-no-lysine (WNK) kinase; conformational dynamics; molecular dynamics;
【外文期刊】 Iorio, Antonio ; Roche, Jennifer ; 等 《Journal of Structural Biology》 2021年213卷3期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Allosteric regulation; Lactate dehydrogenase; Conformational landscape;
【外文期刊】 Albrecht AA ; Skaliotis A ; 等 《Computational biology and chemistry》 2008年32卷4期 248-255页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein folding; HP-model; landscape analysis;
【外文期刊】 Marin-Argany, Marta ; Rivera-Hernandez, Geovanny ; 等 《The Biochemical Journal》 2011年437卷1期 25-34页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 amyloid fibril; amyloid-beta oligomer; anti-amyloid-beta;
【外文期刊】 Mitul Srivastava ; Lovika Mittal ; 等 2022年31卷9期 e4398-e4398页
【关键词】 allosteric regulation; classical and steered MD simulation; conformational change;
【外文期刊】 Chakraborty, Sandipan ; Akhter, Shamim ; 等 《Chemical biology and drug design》 2015年86卷4期 938-944页
【关键词】 folding energy landscape; globular conformation; molecular dynamics simulation;
【外文期刊】 Tang YF ; Goger MJ ; 等 《Biochemistry》 2006年45卷22期 6940-6946页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; SUBUNIT-BINDING DOMAIN; N-TERMINAL DOMAIN;
【外文期刊】 Pise, Nikita ; Prabhu, Arati ; 等 《Current Protein and Peptide Science》 2022年23卷9期 619-641页
【关键词】 Therapeutic peptides; aggregation; conformation;
【外文期刊】 K. V. Shaitan ; 《Biophysics》 2017年62卷6期 892-899页 MEDLINE
【关键词】 structural biology; molecular dynamics; supercomputer technologies;
【外文期刊】 Elphege P. Nora ; Job Dekker ; 等 《BioEssays :》 2013年35卷9期 818-828页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 chromatin domains; chromatin folding; chromosome conformation capture (3C);
【外文期刊】 Dai,D. ; Huang,Q. ; 等 《Biochimica et biophysica acta: BBA: International journal of biochemistry, biophysics and molecular biololgy. Proteins and Proteomics》 2014年1844卷10期 1729-1740页 SCISCIE
【关键词】 Conformational dynamics; Conformational selection; Energy landscape;
【外文期刊】 Herrmann, Jennifer C. ; Beagrie, Robert A. ; 等 2022年38卷4期 395-408页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 TRANSCRIPTION FACTORS; CHROMOSOME CONFORMATION; CHROMATIN ARCHITECTURE;
【外文期刊】 Joachim Frank ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2013年99卷11期 832-836页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 free-energy landscape; conformational states; ribosome;
【外文期刊】 Brandstetter, Katharina ; Zulske, Tilo ; 等 2022年121卷6期 977-990页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Aubol, B.E. ; Jamros, M.A. ; 等 《Biochemistry》 2013年52卷43期 7595-7605页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Splicing kinase srpk1 conforms; landscape; SR protein substrate;
【外文期刊】 Langmead,C.J. ; 《Advances in Experimental Medicine and Biology》 2014年805卷 87-105页 SCIEMEDLINE
【关键词】 Conformational ensembles; Energy landscapes; Generative models;
【外文期刊】 Pinelo, Jose E. E. ; Manandhar, Pragya ; 等 《Journal of thrombosis and haemostasis: JTH》 2023年21卷6期 1529-1543页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 cryptic interactions; conformational landscape; fibrinogenemia;
【外文期刊】 Chiang, Tsung-Han ; Hsu, David ; 等 《Bioinformatics》 2010年26卷12期 i269-i277页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 energy landscape; protein conformation; computation efficiency;
【外文期刊】 Wang, Jingjing ; Meng, Xianwen ; 等 《Briefings in functional genomics》 2016年15卷5期 385-395页
【关键词】 chromosomal conformation capture; long-range interactions; chromatin interactions;
【外文期刊】 Saini, Anupam ; Chadha, Renu ; 等 《Pharmaceutical development and technology》 2016年21卷1/8期 611-618页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Conformation; crystal structure; crystal energy landscape;
【外文期刊】 Han, Mengzhi ; Xu, Ji ; 等 《Biophysical Chemistry: An International Journal Devoted to the Physical Chemistry of Biological Phenomena》 2016年209卷 9-20页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Glycoprotein Ib alpha; Protein conformational transition; Metadynamics;
【外文期刊】 Meier S ; Ozbek S ; 《BioEssays: news and reviews in molecular, cellular and developmental biology》 2007年29卷11期 1095-1104页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 LONG-RANGE INTERACTIONS; ENERGY LANDSCAPE THEORY; ONE SEQUENCE;
【外文期刊】 Lai, Alex L. ; Clerico, Eugenia M. ; 等 《The Journal of biological chemistry》 2017年292卷21期 8773-8785页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 70-kilodalton heat shock protein (Hsp70); allosteric regulation; chaperone DnaK (DnaK);
【外文期刊】 Seera, Suryanarayana ; Nagarajaram, Hampapathalu A. ; 2022年29卷3期 254-267页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Conformational heterogeneity; Intrinsically disordered protein; intrinsically disordered region;
【外文期刊】 Victor Munoz ; Michele Cerminara ; 《The Biochemical Journal》 2016年473卷Pt.17期 2545-2559页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 conformational rheostats; molecular dynamics simulations; nuclear magnetic resonance;
【外文期刊】 Péter Závodszky ; István Hajdú ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2013年99卷4期 263-269页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 conformational selection; energy landscape; protein dynamics;
【外文期刊】 Arrastia, Mary, V ; Jachowicz, Joanna W. ; 等 2022年40卷1期 64-+页
【关键词】 CHROMOSOME CONFORMATION; SUPER-ENHANCERS; NANOG LOCUS;
【外文期刊】 Nagarajan, Balaji ; Sankaranarayanan, Nehru Viji ; 等 2020年30卷8期 516-527页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 carbohydrates; conformational analysis; energy landscape;
【外文期刊】 Sagawa T ; Azuma T ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2007年355卷3期 770-775页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Grunberg R ; Leckner J ; 等 《Structure》 2004年12卷12期 2125-2136页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SIDE-CHAIN CONFORMATIONS; MOLECULAR RECOGNITION; DYNAMICS SIMULATIONS;
【外文期刊】 Mathews, Rita ; Ramya, L. ; 《Journal of molecular graphics & modelling》 2020年96卷
【关键词】 Myelin oligodendrocyte glycoprotein; GLYCAM; Steered Molecular Dynamics;
【外文期刊】 Herenyi L. ; Szigeti K. ; 等 《European Biophysics Journal》 2004年33卷1期 68-75页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Anomalous diffusion; Energy landscape; Spectral diffusion;
【外文期刊】 Bianconi, A. ; Ciasca, G. ; 等 《Journal of Biological Physics》 2012年38卷1期 169-179页 SCISCIE
【关键词】 Intrinsic disordered proteins; Protein conformations; Temperature effects in protein fluctuations;
【外文期刊】 Pan T. ; Sosnick TR. ; 《Nature structural biology》 1997年4卷11期 931-938页 MEDLINE
【关键词】 Group-i ribozyme; Transfer ribonucleic-acid; Tetrahymena ribozyme;
【外文期刊】 Francia F ; Palazzo G ; 等 《Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics》 2004年1658卷1/2期 50-57页 SCISCIE
【关键词】 photosynthetic reaction center; trehalose; electron transfer;
【外文期刊】 Santini S ; Wei GH ; 等 《Structure》 2004年12卷7期 1245-1255页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 SOLID-STATE NMR; ACTIVATION-RELAXATION TECHNIQUE; MONTE-CARLO SIMULATIONS;
【外文期刊】 Tran, Trang T. ; Liu, Zhanglong ; 等 《Biochemical and Biophysical Research Communications》 2020年532卷2期 219-224页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 HIV-1 Protease; Non-B subtypes; Natural polymorphisms;
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