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【中文期刊】 周家锐 纪震 等 《电子学报》 2013年41卷3期 513-518页
【摘要】 提出近似重复矢量(Approximate Repeat Vector,ARV)模型用于DNA序列冗余片段的描述.通过将数据生物信息学特征引入压缩预处理,并使用ARV矢量构造编码码本,提出了非对称DNA序列压缩算法BioLZMA-2.算法引入...
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【学位论文】 作者:胡苗苗 导师:蔡骅 南京理工大学 控制科学与工程 控制理论与控制工程(硕士) 2012年
【摘要】 自20世纪末以来,生物测序技术不断的发展,随之产生的各类生物数据,迅速形成了庞大的生物信息数据库。如何有效的分析,管理这些海量的数据,是生物学家和计算机专家们必须着力解决的棘手问题。数据压缩技术是解决这一问题的有效方法。DNA序列数据是一类...
- 概要:
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【中文期刊】 纪震 周家锐 等 《电子学报》 2011年39卷5期 991-995页
【摘要】 本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序...
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