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【中文期刊】 范丽妃 鲁玉辉 等 《中药药理与临床》 2024年40卷7期 20-26页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于基因芯片数据挖掘和网络药理学研究芪归抵挡汤治疗糖尿病肾病(DKD)分子机制.方法:利用相关数据平台,挖掘芪归抵挡汤治疗DKD的活性成分和作用靶点,并进行GO功能和KEGG通路富集分析.最终,通过体内实验验证芪归抵挡汤调控糖尿病肾病...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 景凯 徐志伟 等 《山东大学学报（医学版）》 2024年62卷1期 21-30页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用生物信息学分析方法,结合 GEO 数据库,探讨获取结直肠肿瘤关键基因的差异表达情况.方法 使用GEO数据库分析结直肠肿瘤患者的肿瘤组织和正常组织基因表达数据,使用GEO2R筛选差异表达基因(differential express...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨玉雯 姚元谦 等 《中医药导报》 2023年29卷2期 127-132页ISTIC
【摘要】 目的:研究茵陈活性成分6,7-二甲氧基香豆素(Scoparone)治疗肝癌的分子机制.方法:使用GEO数据库下载肝癌的芯片数据,从TCMSP数据库检索Scoparone的作用靶点,使用R软件获取肝癌差异基因;通过Jvenn和Cytoscap...
【关键词】 肝癌；6,7-二甲氧基香豆素；茵陈；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王睿孜 薛福敏 等 《现代医药卫生》 2023年39卷11期 1801-1808页
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选出儿童克罗恩病(PCD)的差异基因(DEGs),探讨PCD的致病机制,为PCD的诊疗提供潜在靶点.方法 从基因表达数据库(GEO)中获得健康对照和PCD患儿结肠组织的芯片数据库GSE126124,通过基因分析表达...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 沈浮 邝高艳 等 《中国组织工程研究》 2021年25卷14期 2183-2191页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:类风湿关节炎的发病机制目前尚不完全明确,免疫失衡是类风湿关节炎发病的重要环节,而免疫浸润在类风湿关节炎中的相关调控机制的研究较少.目的:利用GEO基因芯片数据库,对类风湿关节炎基因探针芯片数据进行通路富集和免疫浸润分析,并对类风湿关节...
【关键词】 类风湿关节炎；免疫浸润；GEO基因芯片数据库；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王蕊 杨正飞 《海南医学院学报》 2021年27卷23期 1808-1813页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:分别比较缺血后24 h和72 h大脑中动脉闭塞模型(MCAO)小鼠与假手术(Sham)小鼠左心室的差异基因,分析缺血性卒中后不同时间点的差异基因及其调控的功能通路,以期分析缺血性卒中后诱发心功能障碍的机制并为其治疗提供依据.方法:在美...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘镍 苏文渊 等 《中国老年学杂志》 2020年40卷22期 4835-4838页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过分析GSE25076基因芯片数据,探索神经源性高血压小鼠下丘脑的差异基因,尝试寻找该病的潜在治疗靶点.方法 在NCBI提供的GEO2R平台内检索GSE25076,将全部数据下载保存为Excel格式,并进行差异基因分析.采用DAVI...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李雪 冯彦超 等 《中西医结合心脑血管病杂志》 2021年19卷20期 3460-3464页ISTIC
【摘要】 目的 筛选冠心病病人基因芯片数据并进行生物信息学分析,以期筛选冠心病的特征基因.方法 利用GEO数据库筛选冠心病基因集,经过GEO数据库的GEO2R在线分析工具找出符合条件的基因,绘制Venn图寻找共同表达差异基因,再进行GEO富集可视化分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈晓琳 许德华 等 《肿瘤预防与治疗》 2021年34卷4期 295-305页ISTIC
【摘要】 目的:利用转录组数据识别与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)相关的功能模块与核心基因,为CRC的早期诊断和治疗提供线索.方法:从GEO数据库下载4套与CRC相关的表达谱数据:GSE44076(98病例+50对照)、GSE...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周匡果 黄亮 等 《华中科技大学学报（医学版）》 2012年41卷4期 404-408页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 从分子水平揭示合并异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因突变的正常核型急性髓系白血病(CN-AML)患者的发病机制,为临床诊疗提供新工具.方法 在GEO 中检索IDH1突变的AML芯片数据,使用BRB-Array Tools、GSEA、MI...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 童也 武振方 等 《江苏大学学报（医学版）》 2019年29卷5期 379-385页ISTICCA
【摘要】 目的:寻找并分析类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的关键基因,从而更好地理解RA的潜在发病机制.方法:采用表达谱的综合分析方法鉴定RA滑膜液巨噬细胞中差异表达基因(differential expression ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨正飞 杨小燕 等 《吉林中医药》 2019年39卷12期 1638-1641页ISTIC
【摘要】 目的 比较模型组(MCAO组)大鼠与假手术组(Sham组)大鼠脑组织的差异基因,分析差异基因影响的功能通路,为脑梗死的治疗提供可行的研究方向和具体的作用靶点.方法 在GEO数据库下载MCAO组大鼠与Sham组大鼠脑组织中的表达谱芯片,并通过...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 石磊 李万鹏 等 《中国医药导报》 2019年16卷24期 19-23页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学技术挖掘糖尿病心肌病(DC)相关差异表达基因及其功能.方法 应用生物信息学方法分析基因表达谱数据集GSE4547.结果 挖掘原始芯片数据,筛选到79个差异表达基因.基于基因本体论功能注释和相关通路分析,以及通过构建差异共...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 冯维熙 曹新 《生命科学研究》 2016年20卷3期 235-242页ISTICCA
【摘要】 长链非编码RNAs (long noncoding RNAs,lncRNAs)在细胞中有重要调控作用.已有研究报道,脑缺血再灌注损伤可诱导大量lncRNAs表达水平的改变,然而其具体作用机理未知.现从GEO数据库中下载基因芯片数据,分析损伤...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 林睿 张鸿翔 等 《饮食保健》 2018年5卷23期 297-299页
【摘要】 目的:探索前列腺癌发生的关键基因,为前列腺癌的治疗寻找新的靶点.材料方法:根据标准流程提取GEO数据库中GSE55495芯片数据:13例前列腺癌8例正常前列腺癌进行收集处理、整合,分析.采用计算机R语言编程分析并绘制芯片热图(pheatma...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 熊筱晶 《生命的化学》 2009年29卷1期 115-119页ISTIC
【摘要】 基因芯片现已深入到生物学研究的多个方面,如表达谱分析、基因分型分析、比较基因组学分析、甲基化分析、ChiP-on-chip分析、微RNA分析等.基因芯片研究产生了海量的数据,由NCBI开发维护的GEO是最为知名的存贮和查询芯片数据的综合型数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 石洁 常文静 等 《中国防痨杂志》 2025年47卷6期 769-778页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法鉴定结核病表达差异基因及相关信号通路,以发现可用于结核病诊断的生物标志物.方法:从高通量基因表达数据库(GEO)中搜索结核病患者样本及健康人群的基因表达芯片数据集,下载GSE139825基因芯片微阵列数据集作为分析数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 周未来 李俊 等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷2期 287-294页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法寻找与哮喘发病相关的关键基因并讨论其分子机制.方法:对GSE143303芯片数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与哮喘发病显著相关的模块,并对模块基因进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、功能及通路富...
【关键词】 支气管哮喘；支气管镜管腔内活检；加权基因共表达网络分析；
- 概要：
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- 结论：
【会议论文】杨飞霞 世界中医药学会联合会中药化学专业委员会第九届学术年会 2021年
【摘要】 目的:采用网络药理学结合分子对接的方法探讨益气解毒方治疗鼻咽癌(NPC)的活性成分及作用机制. 方法:利用TCMSP数据库收集益气解毒方中药物活性成分及有效靶点,依托GEO数据库获取NPC相关靶点;药物与疾病靶点取交集获得交集靶点.对...
- 概要：
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【学位论文】 作者：孙桂英 导师：张建营 郑州大学 公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（硕士） 2020年
【摘要】 食管癌（esophageal cancer，EC）是最常见的消化道癌症之一，在我国，食管鳞状细胞癌（食管鳞癌，esophageal squamous cell carcinoma，ESCC）患者占食管癌患者的90%以上，因起病隐匿，早期症状...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吴科俊 李建棣 等 《广西医学》 2025年47卷8期 1173-1185页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨血小板衍生生长因子A(PDGFA)在瘢痕疙瘩组织中的表达特征及其促纤维化作用机制.方法 在GEO数据库中检索瘢痕疙瘩相关单细胞RNA测序数据集,分析PDGFA在瘢痕疙瘩组织中的表达水平及相关细胞特征.在GEO数据库、SRA数据库和...
【关键词】 瘢痕疙瘩；血小板衍生生长因子A；成纤维细胞；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：张阁 导师：贺培凤 于琦 山西医科大学 公共卫生与预防医学 公共卫生（硕士） 2018年
【摘要】 人类基因组计划的完成以及生物信息学等学科的快速发展，使得基因组学逐渐从基因测序揭示生命遗传信息的本质研究转移到从分子水平上对基因功能进行研究。生物信息学也随之由最初的基因组序列解读转移到基因表达谱数据所蕴含的生物学意义的挖掘上。生物信息学及...
- 概要：
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【中文期刊】 屈小亚 张宇 等 《医学信息》 2025年38卷3期 1-6页
【摘要】 目的 探究肺纤维化中miRNA可能的作用机制.方法 从GEO数据库中筛选肺纤维化相关miRNA芯片数据,筛选出两个数据集中共同的差异miRNA,并在相关数据库中预测靶基因与LncRNA.通过GO和KEGG分析上述靶基因的生物学作用,利用ST...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李昕瑜 罗君 等 《中国处方药》 2025年23卷17期 1-6页
【摘要】 目的 基于网络药理学联合GEO芯片分析的方法,研究苗药红花龙胆治疗胃癌的靶点和分子机制.方法 使用SwissTargetPrediction数据库收集各成分作用靶点.通过GEO芯片提取胃癌的差异表达基因,运用R语言绘制热图和火山图.借助Cy...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 朱金燕 云艳娇 等 《中国民族民间医药》 2025年34卷2期 100-106页
【摘要】 目的:基于生物信息学方法构建心房纤颤(AF)铜死亡相关lncRNA-mRNA调控网络,鉴定与铜死亡相关的mRNA,并预测相关中药.方法:从GEO数据库下载数据集GSE41177基因芯片的转录数据,通过差异分析及共表达分析获得与AF铜死亡相关...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕卓辰 罗士元 等 《临床麻醉学杂志》 2024年40卷11期 1184-1191页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学筛选与脓毒症相关性死亡相关的潜在差异表达基因和微小RNAs(miRNAs).方法 从GEO数据库下载人类血液样本基因表达谱芯片数据集GSE48080和GSE54514,选择两个时点(诊断脓毒症...
- 概要：
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【中文期刊】 陶婧 谭晓宁 等 《中国中西医结合肾病杂志》 2024年25卷3期 230-233,后插5-后插6页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制.方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点.借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点.通过R语言...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 柯昌虎 严慧 等 《湖北医药学院学报》 2024年43卷2期 169-178页ISTICCA
【摘要】 目的:利用 GEO 芯片和网络药理学探讨康力欣胶囊治疗乳腺癌的分子机制.方法:通过 TCMSP、HERB、Batman-TCM数据库检索药物的化学成分,借助Swiss Target Prediction数据库获取药物成分对应的相关靶点;在G...
- 概要：
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【中文期刊】 张玉佩 唐伟 《中国中医药图书情报杂志》 2024年48卷2期 57-62页
【摘要】 目的 基于GEO基因芯片、网络药理学及分子对接技术探讨参苓脾喜汤防治慢性胃炎(CG)、胃黏膜上皮内瘤变(GIN)、胃早期癌(EGC)的作用机制.方法 从GEO数据库下载含CG、GIN、EGC基因芯片GSE130823,使用R4.1.1筛选共...
- 概要：
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【中文期刊】 黄睿 安随虎 等 《西北民族大学学报（自然科学版）》 2024年45卷2期 37-45页
【摘要】 目的:应用GEO和TCGA数据库中的结肠癌基因表达数据,通过生物信息学手段挖掘影响结肠癌诊断和预后的关键基因,以期找到结肠癌早期诊断及预后相关的生物标志物,为结肠癌的临床诊断及结肠癌药物研发提供分子基础.方法:检索GEO基因表达数据库,下载...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 唐毅 林敬源 等 《吉林医学》 2024年45卷10期 2324-2328页CA
【摘要】 目的:挖掘干燥综合征发生颈动脉硬化的关键信号分子,为进一步阐明干燥综合征发生颈动脉硬化提供生物信息学基础.方法:利用GEO数据库,数据来源于两个芯片,分别是颈动脉硬化经内膜剥脱后的标本芯片GSE12128 和原发性干燥综合征的多组学芯片GS...
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- 结论：
【中文期刊】 于官正 李鸿 等 《中成药》 2023年45卷9期 3097-3103页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于网络药理学和动物实验探讨黄芪葛根汤治疗糖尿病肾病的作用.方法 分别采用GEO数据库与TCMSP、TCMID、TCMIP数据库筛选DN差异基因和复方有效成分与靶点,构建调控网络,筛选核心基因,进行KEGG和GO富集分析.将大鼠随机分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁心柱 李玲琴 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2023年25卷11期 3592-3604页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 利用生物信息学方法探讨原发性干燥综合征(Primary Sj?gren's syndrome,pSS)的关键基因,分析其可能的免疫浸润机制,并挖掘潜在的靶向中药,为pSS的临床治疗提供新方向.方法 从GEO数据库下载pSS基因表达谱芯...
- 概要：
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【中文期刊】 龙清吟 傅馨莹 等 《湖南中医药大学学报》 2023年43卷4期 668-676页ISTICCA
【摘要】 目的 基于基因芯片数据库(GEO)、网络药理学,结合ox-LDL诱导的大鼠主动脉血管内皮细胞氧化损伤模型进行实验验证,探究补阳还五汤(Buyang Huanwu Decoction,BYHWD)干预动脉粥样硬化(atherosclerosi...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 季军峰 赵桂峰 《中国循证心血管医学杂志》 2023年15卷12期 1300-1304,1309页ISTIC
【摘要】 目的 使用GEO数据库和网络药理学方法探讨芪参益气滴丸(QSYQ)干预心肌梗死(MI)的疗效基础和作用机制.方法 GEO数据库筛选MI差异基因;TCMSP数据库以及文献检索筛选QSYQ的相关活性成分,SwissTargePrediction...
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- 方法：
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【中文期刊】 李健雄 韩雨辰 等 《解放军医学院学报》 2023年44卷9期 986-992页ISTICCA
【摘要】 背景 细胞周期蛋白依赖性激酶 4(cyclin dependent kinase 4,CDK4)属于丝氨酸/苏氨酸激酶家族,是许多癌症的潜在治疗靶点,但其在骨肉瘤中的表达水平及功能尚不清楚,有待深入研究.目的 本研究旨在探索CDK4基因在骨...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 袁心柱 李玲琴 等 《中国中西医结合肾病杂志》 2023年24卷11期 996-999页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法分析GEO芯片数据,寻找糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的关键基因以及信号通路,挖掘可能作用于靶向基因的中药活性成分.方法:从GEO数据库下载DN基因表达谱芯片数据集GSE142153,使...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 韩伟佳 孙颖 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2023年32卷1期 77-84页ISTICCA
【摘要】 目的 探索肝性脑病(hepatic encephalopathy,HE)的神经功能损伤的靶点基因以及基因的调控网络,为未来研究HE脑组织损伤的机制提供新思路.方法 检索GEO数据库,应用生物信息技术分析方法,筛选差异表达基因(differe...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 范桢亮 杨梦凡 等 《中国中西医结合肾病杂志》 2023年24卷4期 296-299,后插2页ISTIC
【摘要】 目的:利用基因芯片分析寻找单侧输尿管梗阻(UUO)模型肾小管间质纤维化(TIF)的机制,并探究自噬在TIF中的变化.方法:选取GEO数据库中编号为GSE42303的基因芯片,提取其中假手术组与UUO组的肾组织基因表达谱进行分析.实验研究选取...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 赵丹丹 郭子怡 等 《中华老年口腔医学杂志》 2023年21卷6期 332-336页ISTIC
【摘要】 目的 铜死亡是一种新的细胞程序性死亡方式,本研究旨在分析铜死亡相关基因在牙周炎组织中的表达,探讨铜死亡与牙周炎的关系.方法 通过下载GEO数据库中牙周炎基因芯片数据集GSE10334,分析12个铜死亡相关基因在牙周炎组织和正常组织中的表达差...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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