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【中文期刊】 Yinqing Yang Kang Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年6期 1106-1118页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Rubus corchorifolius(Shanmei or mountain berry,2n=14)is widely distributed in China,and its fruits possess high nutritio...

【关键词】 Rubus corchorifolius； Genome assembly； Resequencing；

【中文期刊】 Liming Zhao Lvfeng Yuan  等 《遗传学报》 2024年51卷8期 866-876页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 The phenotypic diversity resulting from artificial or natural selection of sheep has made a significant contri-bution to...

【关键词】 Hu sheep； Whole-genome resequencing； Selection signature；

【中文期刊】 Bo Song Weidong Ning  等 《分子植物（英文版）》 2023年16卷8期 1252-1268页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Advances in DNA sequencing technology have sparked a genomics revolution,driving breakthroughs in plant genetics and cro...

【关键词】 WGRS； WGS； resequencing；

【中文期刊】 De-Yin Zhang Xiao-Xue Zhang  等 《动物学研究》 2022年43卷5期 695-705页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 The abundance of domesticated sheep varieties and phenotypes is largely the result of long-term natural and artificial s...

【关键词】 Sheep； Whole-genome resequencing； Selection signature analysis；

【中文期刊】 何健 郑伟杰  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 1010-1027页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因.选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用Fst&Pi的联合分析,保留候选区域,对注...

【关键词】 选择信号分析方法； 杜洛克猪； 全基因组重测序；

【中文期刊】 王舒闻 王东  等 《四川动物》 2024年43卷1期 24-33页 ISTICPKU

【摘要】 藏羚Pantholops hodgsonii是藏羚属Pantholops现存的唯一物种,由于Y染色体基因较保守,基于近缘物种的Y染色体多态性遗传位点筛选受到了很大的限制.本研究对15份藏羚新鲜组织样品进行基因组重测序,生物信息分析筛选出Y染...

【关键词】 藏羚； 基因组重测序； Y染色体；

【中文期刊】 杜晓蓉 李琦  等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷3期 451-461页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 连翘(Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl)为多年生木本植物,花柱二型具有自交不亲和性.挖掘连翘异型花柱发育候选基因,利于揭示连翘异型花柱的进化与发育机理.对40株长花柱型与短花柱型连翘植株进行全基因组重测序,检测样...

【关键词】 连翘； 异型花柱； 全基因组重测序；

【中文期刊】 张鑫淼 赵春龙  等 《水生生物学报》 2024年48卷10期 1724-1735页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为了从全基因组InDel角度进行全国地理尺度细鳞鲑属遗传分化与适应性研究,文章对采自陕西、甘肃、新疆、河北和黑龙江的6个细鳞鲑群体(共90尾样本)进行建库测序及InDel检测分析.结果表明:6个细鳞鲑群体共检测到3056034个高质量InD...

【关键词】 InDel； 全基因组重测序； 种群结构；

【中文期刊】 戎艳花 贾雪纯  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 160-171页

【摘要】 [目的]阐明晋南牛的遗传结构特征,通过选择信号检测挖掘与晋南牛经济性状相关的候选基因,探究其在进化过程中的受选择情况.[方法]对晋南牛和红安格斯牛全基因组测序数据进行分析,鉴定2个群体的单核苷酸多态性(single nucleotide p...

【关键词】 全基因组重测序； 晋南牛； 红安格斯牛；

【中文期刊】 石兰 马梅兰  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷2期 624-638页

【摘要】 [目的]皮山红羊是分布于新疆和田地区的新发现多羔性地方绵羊品种.本研究基于全基因组重测序技术从基因组水平上了解皮山红羊的群体遗传结构及产羔性状受选择信号区域,并对候选基因进行验证.[方法]选择30只连续产2～3羔的经产皮山红羊母羊为高繁组(...

【关键词】 皮山红羊； 全基因组重测序； 选择信号；

【中文期刊】 任钰为 陈星  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷2期 502-514页

【摘要】 旨在通过研究文昌鸡进化过程的特征,深入理解影响产蛋性能的因素,为文昌鸡优良品种选育提供基础.本研究采集35只健康文昌鸡(35周龄,15公,20母)和30只健康江汉鸡(35周龄,10公,20母)的血液组织各3 mL提取DNA,采用全基因组重测...

【关键词】 文昌鸡； 全基因组重测序； 遗传选择；

【中文期刊】 张涛 李佳芪  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷8期 3427-3435页

【摘要】 旨在鉴定新疆褐牛基因组结构变异(structure variation,SVs)特征,并在此基础上探索新疆褐牛培育过程中受到影响的结构变异.本研究基于全基因组重测序数据,利用Manta、Delly、Lumpy三款软件对新疆褐牛及其父母本(瑞...

【关键词】 结构变异； 全基因组重测序； 群体结构分析；

【中文期刊】 万伟粲 张旭  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷11期 4890-4898页

【摘要】 [目的]酃县白鹅是湖南地区优秀的地方鹅种,为了解酃县白鹅的保种效果,对保种场各家系进行保种工作的评估.[方法]从酃县白鹅保种场的42个家系中各选取1只公鹅,翅静脉采血,提取DNA,进行全基因组重测序.基于保种场42只酃县白鹅公鹅的重测序数据...

【关键词】 酃县白鹅； 全基因组重测序； 遗传多样性；

【中文期刊】 Zhen Wang Bangmin Song  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2024年15卷5期 1866-1880页

【摘要】 Background Long-term natural and artificial selection has resulted in many genetic footprints within the genomes of pig ...

【关键词】 Environmental adaptation； Local Chinese breeds； Pig；

【中文期刊】 马烨 刘玉强  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷8期 3438-3446页

【摘要】 [目的]利用全基因组选择信号检测方法探索中国地方猪基因组中与体型相关的候选基因,分析中国地方猪在进化和驯化过程中的受选择情况.[方法]基于310头地方猪的全基因组重测序数据,利用跨群体扩展单倍型纯合(cross population ext...

【关键词】 中国地方猪； 选择信号； 全基因组重测序；

【中文期刊】 靳浩展 肖文婉  等 《广东畜牧兽医科技》 2024年49卷4期 1-8页

【摘要】 为了对E.necatrix ENYS株在生产中进行质控及对临床应用效果的监测,该研究对ENYS株和ENGD株进行全基因组重测序,结合生物信息学分析建立了一种TaqMan qPCR检测技术.结果显示,En-marker5测序结果与预期相符,最...

【关键词】 毒害艾美耳球虫； 减毒活疫苗； 全基因组重测序；

【中文期刊】 石庆珍 徐鸿洋  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4311-4324页

【摘要】 旨在用不同方法对微量细胞全基因组遗传变异进行检测和比较分析.本研究首先以3、5、7、10个猪耳缘成纤维细胞为试验材料,利用不同方法提取微量细胞基因组,进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),比较不同细胞数...

【关键词】 微量细胞； 胚胎； 全基因组扩增；

【中文期刊】 刘思宇 张曼  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷9期 3876-3886页

【摘要】 旨在通过遗传多样性和群体结构分析,评估南阳牛的保种效果.本研究基于30头健康南阳牛的全基因组重测序数据,通过变异检测获得单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)信息,综合分析群体遗传多样性、群体...

【关键词】 南阳牛； 全基因组重测序； 遗传多样性；

【中文期刊】 梁慧丽 解玉静  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷11期 4968-4979页

【摘要】 旨在了解大尾寒羊基因组遗传变异特征和群体结构,可以为更好地保护和利用大尾寒羊提供指导.本研究对170只(66只公羊,104只母羊)大尾寒羊进行了全基因组重测序,利用GATK、Manta、Plink等软件对大尾寒羊基因组遗传变异、群体结构和连...

【关键词】 大尾寒羊； 全基因组重测序； 基因组变异；

【中文期刊】 刘珍妮 李建军  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷11期 4992-5002页

【摘要】 为了深入了解赣州番鸭的群体结构和遗传差异,本研究采集20只福建番鸭(FJ)、20只贵州天柱番鸭(TZ)、20只赣西北番鸭(GXB)和40只赣州番鸭(GZ)的血样用于全基因组重测序,测序深度为10 ×.随后,从NCBI数据库下载15只北京鸭(...

【关键词】 全基因组重测序； 赣州番鸭； 群体结构；

【中文期刊】 马钧 樊安平  等 《遗传》 2023年45卷7期 602-616页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 在畜禽资源保护中,群体遗传多样性和遗传结构是决定保种效果的重要因素.本研究采用全基因组重测序技术检测 100 头秦川牛(30 头公牛、70 头母牛)的基因组变异,通过分析群体遗传多样性、连续纯合片段(runs of homozygosity...

【关键词】 秦川牛； 全基因组重测序； 遗传多样性；

【中文期刊】 Ruicai Long Fan Zhang  等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷1期 14-28页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Alfalfa(Medicago sativa L.)is the most important legume forage crop worldwide with high nutritional value and yield.For ...

【关键词】 Alfalfa； Autotetraploid； Genome assembly；

【中文期刊】 叶雯 孙东晓  等 《中国畜牧兽医》 2023年50卷10期 4125-4132页

【摘要】 全基因组重测序(whole genome resequencing,WGRS)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的全基因组水平的测序,具有检测变异类型丰富、高性价比、应用广泛等优点.随着测序成本的降低和畜禽基因组测序工作的完成,全基...

【关键词】 全基因组重测序； 畜禽； 遗传多样性；

【中文期刊】 林燕 黄敏  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷9期 3700-3709页

【摘要】 旨在鉴别与鸭重要经济性状潜在相关的拷贝数变异(copy number variations,CNVs),为解析CNVs对鸭经济性状的影响提供前期研究基础.本研究利用从美国国家生物技术信息中心(National Center for Biot...

【关键词】 鸭； 全基因组重测序数据； 基因组；

【中文期刊】 毛银 卢艳波  等 《食品与生物技术学报》 2023年42卷9期 20-27页

【摘要】 为了获得高抑菌性能的乳酸菌,以植物乳杆菌DY6为出发菌株,首先对其进行常压室温等离子体(atmospheric room temperature plasma,ARTP)和亚硝基胍(nitrosoguanidine,NTG)的复合诱变,获得...

【关键词】 植物乳杆菌； 诱变； 抑菌活性；

【中文期刊】 路畅 董磊  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷7期 2761-2771页

【摘要】 旨在鉴定晋汾白猪单核苷酸多态性位点(SNP)并分析其特征,筛选特异性SNPs.本研究对30头晋汾白猪(9头公猪和21头母猪)耳组织DNA进行全基因组重测序,利用GATK和VEP软件检测变异位点和进行注释分类.整合晋汾白猪与其亲本的基因组重测...

【关键词】 晋汾白猪； 全基因组重测序； 单核苷酸多态性；

【中文期刊】 Miaomiao Niu Yuqiong Zhao  等 《动物模型与实验医学（英文）》 2023年6卷4期 283-293页

【摘要】 Background:Hundreds of single-nucleotide polymorphism(SNP)sites have been found to be potential genetic markers of type ...

【关键词】 Bama miniature pig； candidate marker； SNP；

【中文期刊】 袁金红 李俊华  等 《遗传》 2017年39卷12期 1168-1177页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 在传统的正向遗传学分析过程中,基因定位需要构建复杂的后代群体,并借助大量分子标记进行遗传连锁分析和区间定位,使得这一过程成本高且耗时长.MutMap是近年来发展的基于高通量第二代测序技术的一种新的正向遗传学分析方法.该方法的优点是遗传定位的...

【关键词】 MutMap； 突变体； 数量性状位点；

【中文期刊】 梁素芸 周正奎  等 《遗传》 2017年39卷4期 276-291页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 人类通过数千年的驯化和近代以来有计划性的育种,形成了当今多样化的畜禽品种,从而提供丰富的动物源性蛋白满足人类需求.在过去的100年里,数量遗传学应用于动物育种领域引发了畜禽育种技术的革命,但畜禽机体遗传发育体系相当复杂,一些性状仍然难以通过...

【关键词】 畜禽； 参考基因组； 重测序；

【中文期刊】 Shao-Xuan Wu Qi-Fan Zeng  等 《动物学研究》 2024年45卷2期 329-340页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 The leopard coral grouper(Plectropomus leopardus)isa species of significant economic importance.Although artificial cult...

【关键词】 Plectropomus leopardus； Whole-genome resequencing； Growth；

【中文期刊】 姚祥坦 张心怡  等 《生物多样性》 2024年32卷9期 1-12页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 阐明栽培作物的起源驯化历史,深入解析作物驯化改良的过程对于理解人类文明的进程至关重要.欧菱(Trapa natans)隶属于千屈菜科,为一年生水生浮叶草本,其果实俗称菱角,是我国传统的水生蔬菜作物.然而,相较于主粮作物,我们对栽培欧菱种质资...

【关键词】 起源驯化； 菱角； 孤儿作物；

【中文期刊】 贺宗毅 王伯初  等 《菌物学报》 2024年43卷11期 102-116页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 灵芝是我国著名的中药材,了解灵芝种质资源遗传多样性和群体结构,对于灵芝种群的有效保护和开发利用至关重要.本文采用全基因组重测序技术对来自野生与不同栽培类型的 62 份灵芝种质的遗传多态性和群体特征进行了分析.共计获得SNP位点1 388 5...

【关键词】 灵芝； 全基因组重测序； 种质；

【中文期刊】 周太梅 杨华  等 《中华高血压杂志》 2024年32卷2期 153-163页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 原发性高血压； 全基因组重测序； DNA pooling；

【中文期刊】 蒋平 胡运高  等 《应用与环境生物学报》 2024年30卷2期 367-376页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 提高水稻单产是增加粮食产量的重要技术途径.解析杂交水稻亲本产量性状形成的分子基础,有助于优异等位基因聚合和亲本重要性状的改良,从而进一步培育强杂种优势水稻新品种.利用二代基因组测序技术,对新育成的13个杂交水稻亲本(5个不育系,8个恢复系)...

【关键词】 产量性状； 分子基础； 基因组重测序；

【中文期刊】 刘强 姜衍  等 《应用昆虫学报》 2024年61卷1期 29-36页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]基于全基因组重测序对陕西及其邻近地区不同地理区位下的中华蜜蜂Apis cerana cerana群体的遗传多样性进行研究,为陕西中华蜜蜂遗传资源的保护和利用提供参考.[方法]对采自陕西西部的49个中华蜜蜂群体样本进行全基因组重测序,...

【关键词】 中华蜜蜂； 全基因组重测序； 陕西；

【中文期刊】 Cheng-Fei Sun Xin-Hui Zhang  等 《动物学研究》 2023年44卷1期 78-89页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 Largemouth bass(Micropterus salmoides)isan economically important fish species in North America,Europe,and China.Various...

【关键词】 Largemouth bass； Whole-genome；

【中文期刊】 罗瑞 陈娅  等 《生物多样性》 2023年31卷10期 147-159页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 芸薹属(Brassica)包含多种重要经济作物.近年来,随着DNA测序技术的快速发展和测序成本的不断降低,全基因组重测序已成为芸薹属植物研究的重要手段.本文简要介绍了芸薹属植物全基因组测序近况以及在利用重测序技术研究该属植物的驯化起源、环境...

【关键词】 芸薹属； 全基因组重测序； 研究进展；

【中文期刊】 周璐 程晓庆  等 《中华地方病学杂志》 2023年42卷3期 190-195页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法:2017-2021年，在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市，采集腹泻患者粪便标本，进行耶尔森菌菌株分离；同时，收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌...

【关键词】 耶尔森菌属； 全基因组重测序； 毒力基因；

【中文期刊】 沈丽丽 曹斌斌  等 《基因组学与应用生物学》 2023年42卷6期 581-592页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 毛竹； 全基因组重测序； 单核苷酸多态性；

【中文期刊】 Nai-Yi Xu Wei Si  等 《动物学研究》 2021年42卷6期 710-720页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 The Chantecler chicken,a unique Canadian indigenous breed,is well adapted to extremely cold environments.However,its gen...

【关键词】 Chantecler chickens； Whole-genome resequencing； Cold adaptation；