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            1. 一种改进的基于PCR的建立饱和突变库的方法

            【中文期刊】 佘文文 倪静  等 《湖北大学学报（自然科学版）》 2019年41卷1期 1-4,9页

            【摘要】 定点饱和诱变技术一直以来被广泛应用于蛋白的定向进化和代谢途径的研究,然而建立偏爱性低的高质量饱和突变库一直面临着严峻挑战.提出一种改进的建立智能突变体文库的方法,选取柠檬烯环氧水解酶(LEH)为突变对象,摒弃传统的NNK/NNN密码子简并引...

            【关键词】 定点突变； 饱和突变； PCR；

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            2. 基于网络药理学和分子对接技术研究千金子引发腹泻的作用机制

            【中文期刊】 鲁家彤 吴亚娇  等 《毒理学杂志》 2023年37卷3期 181-188页 ISTICCA

            【关键词】 千金子； 腹泻； 网络药理学；

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            3. G蛋白偶联受体及其类型的预测

            【中文期刊】 吴建盛 马昕  等 《生物物理学报》 2010年26卷2期 138-148页 MEDLINEISTICCA

            【关键词】 G蛋白偶联受体； 支持向量机； 绝对密码子使用频率；

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            4. 马铃薯α-淀粉酶基因的克隆及生物信息学分析

            【中文期刊】 王玉丽 王永刚  等 《基因组学与应用生物学》 2010年29卷6期 1019-1025页 ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 本研究利用RT-PCR从马铃薯(Solanum tuberosum)茎段总RNA中扩增、克隆了一cDNA分子.该cDNA分子含有一长为1 224 bp的开放读框,可编码一含407个氨基酸残基的多肽、理论分子量为46.40 kD、可能为亲水性...

            【关键词】 马铃薯； α-淀粉酶基因； 克隆；

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            5. A Reliable Method for Quantifying Plasma Cell-Free DNA Using an Internal Standard Strategy: Evaluation in a Cohort of Non-Pregnant and Pregnant Women

            【外文期刊】 Cepeda, Julieta ; Racca, M. Emilia ; 等 《Reproductive sciences.》 2024年31卷4期 987-996页

            【关键词】 cfDNA isolation; cfDNA quantification; Plasma cell-free DNA;

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            6. Characterization of a three bacteria mixed culture in a chemostat: Evaluation and application of a quantitative terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis for absolute and species specific cell enumeration

            【外文期刊】 Schmidt JK ; Konig B ; 等 《Biotechnology and Bioengineering》 2007年96卷4期 738-756页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 population dynamics; microbial community; quantification;

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            7. Comparison and imputation-aided integration of five commercial platforms for targeted DNA methylome analysis

            【外文期刊】 Tanic, Miljana ; Moghul, Ismail ; 等 《Nature biotechnology》 2022年40卷10期 1478-+页

            【关键词】 PCR BIAS; METHYLATION; SAMPLES;

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            8. ITS all right mama: investigating the formation of chimeric sequences in the ITS2 region by DNA metabarcoding analyses of fungal mock communities of different complexities

            【外文期刊】 Aas, Anders Bjornsgaard ; Davey, Marie Louise ; 等 《Molecular ecology resources》 2017年17卷4期 730-741页

            【关键词】 chimeric sequences; DNA metabarcoding; microbial ecology;

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            9. External and semi-internal controls for PCR amplification of homologous sequences in mixed templates

            【外文期刊】 Kalle, Elena ; Gulevich, Alexander ; 等 《Journal of Microbiological Methods》 2013年95卷2期 285-294页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Microbial diversity; Polymerase; PCR bias;

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            10. Comparison of BKV quantification using a single automated nucleic acid extraction platform and 3 real-time PCR assays

            【外文期刊】 Greer, A. E. ; Forman, M. S. ; 等 《Diagnostic microbiology and infectious disease》 2015年82卷4期 297-302页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 BKV quantification; BKV real-time PCR; Assay-dependent variability in BKV quantification;

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            11. Quantitative improvement of 16S rDNA DGGE analysis for soil bacterial community using real-time PCR.

            【外文期刊】 Ahn JaeHyung ; Kim YooJeong ; 等 《Journal of Microbiological Methods》 2009年78卷2期 216-222页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rDNA DGGE; Real-time PCR; Bacterial community structure;

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            12. Suddenly everyone is a microbiota specialist

            【外文期刊】 Boers, S. A. ; Jansen, R. ; 等 《Clinical microbiology and infection: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases》 2016年22卷7期 581-582页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Bias; Metagenomics; Microbiome;

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            13. Rapid lab-on-a-chip profiling of human gut bacteria

            【外文期刊】 Bjerketorp J ; Cbiang ANT ; 等 《Journal of Microbiological Methods》 2008年72卷1期 82-90页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 gut cocktail; human gut microbiota; lab-on-a-chip (LOC);

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            14. Effect of primer mismatch, annealing temperature and PCR cycle number on 16S rRNA gene-targetting bacterial community analysis

            【外文期刊】 Sipos R ; Szekely AJ ; 等 《FEMS Microbiology Ecology》 2007年60卷2期 341-350页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 PCR bias; universal diversity; annealing temperature;

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            15. Terminal restriction fragment length polymorphism analysis of ribosomal RNA genes to assess changes in fungal community structure in soils

            【外文期刊】 Edel-Hermann W. ; Dreumont C. ; 等 《FEMS Microbiology Ecology》 2004年47卷3期 397-404页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Microbial community; Fungus; Soil;

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            16. An international comparability study on quantification of total methyl cytosine content

            【外文期刊】 Yang I ; Kim SK ; 等 《Analytical Biochemistry: An International Journal of Analytical and Preparative Methods》 2009年384卷2期 288-295页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DNA methylation; Methyl cytosine; Quantification;

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            17. Modeling bacterial species abundance from small community surveys

            【外文期刊】 Narang R ; Dunbar J ; 《Microbial Ecology: An International Journal》 2004年47卷4期 396-406页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 RIBOSOMAL-RNA GENES; MICROBIAL DIVERSITY; PCR AMPLIFICATION;

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            18. Innovative methods for soil DNA purification tested in soils with widely differing characteristics

            【外文期刊】 Sagova-Mareckova M ; Cermak L ; 等 《Applied and Environmental Microbiology》 2008年74卷9期 2902-2907页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MICROBIAL DNA; BACTERIAL COMMUNITIES; PCR INHIBITORS;

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            19. Intracolony variation of bacterial gut microbiota among castes and ages in the fungus-growing termite Macrotermes gilvus

            【外文期刊】 Hongoh Y ; Ekpornprasit L ; 等 《Molecular ecology》 2006年15卷2期 505-516页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; gut bacteria; Macrotermes;

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            20. Amplification-free Illumina sequencing-library preparation facilitates improved mapping and assembly of (G plus C)-biased genomes

            【外文期刊】 Kozarewa, I ; Ning, ZM ; 等 《Nature methods》 2009年6卷4期 291-295页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 YEAST ARTIFICIAL CHROMOSOMES; PARASITE PLASMODIUM-FALCIPARUM; SINGLE NUCLEOTIDE;

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            21. Single-molecule polymerase chain reaction reduces bias: Application to DNA methylation analysis by bisulfite sequencing

            【外文期刊】 Chhibber A ; Schroeder BG ; 《Analytical Biochemistry: An International Journal of Analytical and Preparative Methods》 2008年377卷1期 46-54页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DNA methylation; 5-methylcytosine; bisulfite;

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            22. Expression of a synthetic gene encoding a Tribolium castaneum carboxylesterase in Pichia pastoris

            【外文期刊】 Delroisse JM ; Dannau M ; 等 《Protein Expression and Purification》 2005年42卷2期 286-294页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 carboxylesterase; Tribolium castaneum; codon bias;

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            23. PCR bias associated with conserved primer binding sites, used to determine genotype diversity within Citrus tristeza virus populations

            【外文期刊】 《Journal of Virological Methods》 2016年237卷 107-113页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 PCR bias; Viral populations; Citrus tristeza virus;

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            24. Male-killer dynamics in the tropical butterfly, Acraea encedana (Lepidoptera: Nymphalidae)

            【外文期刊】 Hassan, Sami Saeed M. ; Idris, Eihab ; 等 2013年20卷6期 717-722页 SCISCIE

            【关键词】 female bias; PCR; population dynamics;

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            25. Universal and blocking primer mismatches limit the use of high-throughput DNA sequencing for the quantitative metabarcoding of arthropods

            【外文期刊】 Pinol, J. ; Mir, G. ; 等 《Molecular ecology resources》 2015年15卷4期 819-830页

            【关键词】 annealing temperature; insects; Ion Torrent;

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            26. A novel workflow to improve genotyping of multigene families in wildlife species: An experimental set-up with a known model system

            【外文期刊】 Gillingham, Mark A. F. ; Montero, B. Karina ; 等 《Molecular ecology resources》 2021年21卷3期 982-998页

            【关键词】 ACACIA; allele dropout; amplicon genotyping;

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            27. Application of a high-density oligonucleotide microarray approach to study bacterial population dynamics during uranium reduction and reoxidation

            【外文期刊】 Brodie EL ; DeSantis TZ ; 等 《Applied and Environmental Microbiology》 2006年72卷9期 6288-6298页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S RIBOSOMAL-RNA; DISSIMILATORY METAL REDUCTION; CONTAMINATED AQUIFER;

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            28. PrimerMiner: an r package for development and in silico validation of DNA metabarcoding primers

            【外文期刊】 《Methods in Ecology and Evolution》 2017年8卷5期 622-626页

            【关键词】 data mining; DNA barcoding; ecosystem assessment;

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            29. Molecular phylogenetic diversity of the microbial community associated with a high-temperature petroleum reservoir at an offshore oilfield

            【外文期刊】 Li H ; Yang SZ ; 等 《FEMS Microbiology Ecology》 2007年60卷1期 74-84页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 petroleum reservoir; 16S rRNA gene diversity; microbial community;

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            30. Differences in rDNA libraries of faecal bacteria derived from 10-and 25-cycle PCRs

            【外文期刊】 Bonnet R ; Suau A ; 等 《International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology》 2002年52卷Pt.3期 757-763页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Biodiversity; Human gut flora; Pcr;

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            31. The choice of universal primers and the characteristics of the species mixture determine when DNADNA metabarcoding can be quantitative

            【外文期刊】 Pi?ol Josep ; Senar Miquel A. ; 等 《Molecular ecology》 2019年28卷2期 407-419页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 COI; diet analysis; environmental DNA;

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            32. Amplicon-sequencing of raw milk microbiota: impact of DNA extraction and library-PCR

            【外文期刊】 Siebert, Annemarie ; Hofmann, Katharina ; 等 《Applied Microbiology and Biotechnology》 2021年105卷11期 4761-4773页

            【关键词】 PCR bias; Eukaryotic DNA depletion; Enzymatic lysis;

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            33. A statistical analysis of random mutagenesis methods used for directed protein evolution

            【外文期刊】 Wong TS ; Roccatano D ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2006年355卷4期 858-871页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 protein engineering; directed evolution; random mutagenesis;

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            34. Characterization of single nucleotide polymorphisms from expressed sequence tags of Chinese mitten crab Eriocheir sinensis

            【外文期刊】 Li, Hong Jun ; He, Chong Bo ; 等 《Aquatic Biology》 2010年11卷2期 193-199页

            【关键词】 Eriocheir sinensis; Single nucleotide polymorphism; SNP;

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            35. Universal and blocking primer mismatches limit the use of high-throughput DNA sequencing for the quantitative metabarcoding of arthropods.

            【外文期刊】 J,Piñol ; G,Mir ; 等 《Molecular ecology resources》 2015年15卷4期 819-30页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Ion Torrent; PCR bias; PCR cycles;

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            36. Sequencing on the SOLiD 5500xl System - in-depth characterization of the GC bias. oa

            【外文期刊】 Simone,Roeh ; Peter,Weber ; 等 《Nucleus (Austin, Tex.)》 2017年8卷4期 370-380页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 CpG island; GC bias; H3K9ac;

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            37. Amplicon-sequencing of raw milk microbiota: impact of DNA extraction and library-PCR. oa

            【外文期刊】 Annemarie,Siebert ; Katharina,Hofmann ; 等 《Applied microbiology and biotechnology》 2021年105卷11期 4761-4773页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Bead-beating; Enzymatic lysis; Eukaryotic DNA depletion;

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            38. Comparison of BKV quantification using a single automated nucleic acid extraction platform and 3 real-time PCR assays.

            【外文期刊】 A E,Greer ; M S,Forman ; 等 《Diagnostic microbiology and infectious disease》 2015年82卷4期 297-302页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Assay-dependent variability in BKV quantification; BKV quantification; BKV quantification assay genotype bias;

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            39. Bias in Whole Genome Amplification: Causes and Considerations.

            【外文期刊】 Jeffrey,Sabina ; John H,Leamon ; 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2015年1347卷 15-41页

            【关键词】 Amplification artifacts; Bias; DOP-PCR;

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            40. Is amplification bias consequential in transposon sequencing (TnSeq) assays? A case study with a Staphylococcus aureus TnSeq library subjected to PCR-based and amplification-free enrichment methods.

            【外文期刊】 Duah,Alkam ; Thidathip,Wongsurawat ; 等 《Microbial genomics》 2021年7卷10期

            【关键词】 Cas9; Nanopore; PCR-bias;

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