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            1. Unveiling how vitrification affects the porcine blastocyst:clues from a transcriptomic study

            【中文期刊】 C.Almi?ana F.Dubuisson  等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2022年13卷3期 735-755页

            【摘要】 Background:Currently, there is a high demand for efficient pig embryo cryopreservation procedures in the porcine industr...

            【关键词】 Blastocyst； Embryo； Gene expression；

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            2. A reversed framework for the identification of microRNA-target pairs in plants.

            【外文期刊】 Chaogang,Shao ; Ming,Chen ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2013年14卷3期 293-301页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 ARGONAUTE 1-enriched small RNA high-throughput sequencing; degradome sequencing; microRNA–target pair;

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            3. Single-Cell RNA Sequencing Reveals Monocyte-Derived Interstitial Macrophages with a Pro-Fibrotic Phenotype in Bleomycin-Induced Pulmonary Fibrosis. oa

            【外文期刊】 Shunli,Wang ; Jie,Li ; 等 《International journal of molecular sciences》 2024年25卷21期 SCIMEDLINE

            【关键词】 bleomycin; cell–cell communication; idiopathic pulmonary fibrosis;

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            4. Qualitative and quantitative analysis of MED12 c.887G>A causing both missense and splicing variants in X-linked Ohdo syndrome.

            【外文期刊】 Sumihito,Togi ; Hiroki,Ura ; 等 《American journal of medical genetics. Part A》 2024年194卷9期 e63628页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 MED12‐related disease; X chromosome inactivation; X‐linked Ohdo syndrome;

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            5. Genetic and genomic analyses of Drosophila melanogaster models of chromatin modification disorders. oa

            【外文期刊】 Rebecca A,MacPherson ; Vijay,Shankar ; 等 《Genetics》 2023年224卷4期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Coffin–Siris syndrome; Cornelia de Lange syndrome; Nicolaides–Baraitser syndrome;

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            6. Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability.

            【外文期刊】 Xia,Li ; Shenbo,Chen ; 等 《Discover oncology》 2025年16卷1期 302页

            【关键词】 Cell–cell communication; Glioma; Immune microenvironment;

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            7. In silico target network analysis of de novo-discovered, tick saliva-specific microRNAs reveals important combinatorial effects in their interference with vertebrate host physiology. oa

            【外文期刊】 Michael,Hackenberg ; David,Langenberger ; 等 《RNA (New York, N.Y.)》 2017年23卷8期 1259-1269页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 deep-sequencing; disease biology; gene target prediction;

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            8. iPSC for modeling neurodegenerative disorders.

            【外文期刊】 Valeria,Valadez-Barba ; A,Cota-Coronado ; 等 《Regenerative therapy》 2020年15卷 332-339页

            【关键词】 AD, Alzheimer's disease; AFP, Alpha-Fetoprotein; Alzheimer;

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            9. Transcriptomic analysis of a 3D blood-brain barrier model exposed to disturbed fluid flow. oa

            【外文期刊】 Nesrine,Bouhrira ; Brandon J,DeOre ; 等 《Fluids and barriers of the CNS》 2022年19卷1期 94页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Blood–brain barrier; Fluid dynamics; RNA sequencing;

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            10. Core-shell nanoparticles suppress metastasis and modify the tumour-supportive activity of cancer-associated fibroblasts. oa

            【外文期刊】 Dávid,Kovács ; Nóra,Igaz ; 等 《Journal of nanobiotechnology》 2020年18卷1期 18页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cancer-associated fibroblasts; Core–shell nanoparticles; Metastasis;

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            11. Masks of Albinism: Clinical Spectrum of Hermansky-Pudlak Syndrome. oa

            【外文期刊】 Anastasia M,Bobreshova ; Sofya A,Ionova ; 等 《International journal of molecular sciences》 2024年25卷20期 SCIMEDLINE

            【关键词】 Hermansky–Pudlak syndrome; RNA analysis; albinism;

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            12. Targeting the m6A RNA modification pathway blocks SARS-CoV-2 and HCoV-OC43 replication. oa

            【外文期刊】 Hannah M,Burgess ; Daniel P,Depledge ; 等 《Genes & development》 2021年35卷13-14期 1005-1019页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 HCoV-OC43; N6-methyladenosine; RNA modification;

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            13. Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation.

            【外文期刊】 Jieun,Kim ; Eun-Young,Eo ; 等 《Cells》 2024年13卷23期

            【关键词】 airway epithelium; air–liquid interface; ciliated cells;

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            14. From Mouth to Brain: Distinct Supragingival Plaque Microbiota Composition in Cerebral Palsy Children With Caries.

            【外文期刊】 Mingxiao,Liu ; Yuhan,Shi ; 等 《Frontiers in cellular and infection microbiology》 2022年12卷 814473页

            【关键词】 16S rRNA sequencing; caries; cerebral palsy;

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            15. RNA-seq reveals co-dysregulated circular RNAs in the adenomyosis eutopic endometrium and endometrial-myometrial interface. oa

            【外文期刊】 Zhengchen,Guo ; Hua,Duan ; 等 《BMC women's health》 2022年22卷1期 293页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Adenomyosis; Endometrial–myometrial interface; Endometrium;

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            16. Defining RNA motif-aminoglycoside interactions via two-dimensional combinatorial screening and structure-activity relationships through sequencing. oa

            【外文期刊】 Sai Pradeep,Velagapudi ; Matthew D,Disney ; 《Bioorganic & medicinal chemistry》 2013年21卷20期 6132-8页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 1× Hybridization Buffer 1; 1× Hybridization Buffer 2; 2DCS;

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            17. Expression profiling of WD40 family genes including DDB1- and CUL4- associated factor (DCAF) genes in mice and human suggests important regulatory roles in testicular development and spermatogenesis. oa

            【外文期刊】 Bhavesh V,Mistry ; Maha,Alanazi ; 等 《BMC genomics》 2020年21卷1期 602页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 DDB1–CUL4-associated factors; Gene expression; RNA sequencing;

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            18. Host ecotype and rearing environment are the main drivers of threespine stickleback gut microbiota diversity in a naturalistic experiment.

            【外文期刊】 Andreas,Härer ; Christine J,Frazier ; 等 《Royal Society open science》 2024年11卷6期 240649页

            【关键词】 16S rRNA sequencing; Gasterosteus aculeatus; gut microbiome;

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            19. Single-cell RNA sequencing reveals a landscape and targeted treatment of ferroptosis in retinal ischemia/reperfusion injury. oa

            【外文期刊】 Yangyang,Li ; Yuwen,Wen ; 等 《Journal of neuroinflammation》 2022年19卷1期 261页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Fer-1; Ferroptosis; Retinal ischemia–reperfusion injury;

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            20. Cloudy with a Chance of Insights: Context Dependent Gene Regulation and Implications for Evolutionary Studies. oa

            【外文期刊】 Elisa,Buchberger ; Micael,Reis ; 等 《Genes》 2019年10卷7期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing (ATACseq); ChIPseq; RNAseq;

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            21. Differential transcriptomic analysis of crayfish (Procambarus clarkii) from a rice coculture system challenged by Vibrio parahaemolyticus.

            【外文期刊】 Jian,Zhou ; Han,Zhao ; 等 《Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics》 2020年36卷 100741页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Immune response; Rice–crayfish coculture system; Vibrio parahaemolyticus;

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            22. LIX1-like protein promotes liver cancer progression via miR-21-3p-mediated inhibition of fructose-1,6-bisphosphatase.

            【外文期刊】 Jie,Zou ; Xiaoyun,Zhu ; 等 《Acta pharmaceutica Sinica. B》 2021年11卷6期 1578-1591页

            【关键词】 CCl4, carbon tetrachloride; DEN, diethylnitrosamine; ECAR, extracellular acidification rate;

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            23. Application of RNA-seq and Bioimaging Methods to Study Microbe-Microbe Interactions and Their Effects on Biofilm Formation and Gene Expression.

            【外文期刊】 Cristina Isabel,Amador ; Claus,Sternberg ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2018年1734卷 131-158页

            【关键词】 Bacterial pathogens; Bacterial physiology; Biofilms;

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            24. A Single-Cell Survey of Cellular Heterogeneity in Human Great Saphenous Veins.

            【外文期刊】 Yiping,Sun ; Xueqing,Hu ; 等 《Cells》 2022年11卷17期

            【关键词】 cell–cell interaction; great saphenous vein; single-cell RNA sequencing;

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            25. E47 Governs the MYC-CDKN1B/p27KIP1-RB Network to Growth Arrest PDA Cells Independent of CDKN2A/p16INK4A and Wild-Type p53.

            【外文期刊】 Kathleen M,Scully ; Reyhaneh,Lahmy ; 等 《Cellular and molecular gastroenterology and hepatology》 2018年6卷2期 181-198页

            【关键词】 CDK, cyclin-dependent kinase; CDKN1B/p27KIP1, CDKN1B/p27Kinase Inhibitory Protein 1; CDKN2A/p16INK4A, CDKN2A/p16Inhibitor of CDK 4A;

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            26. Evaluation of the therapeutic effect and dose-effect of Bifidobacterium breve on the primary Clostridioides difficile infected mice.

            【外文期刊】 Jingpeng,Yang ; Hong,Yang ; 《Applied microbiology and biotechnology》 2021年105卷24期 9243-9260页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 16S rRNA amplicon sequencing; Bifidobacterium breve; Dose–effect;

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            27. Unraveling the intercellular communication disruption and key pathways in Alzheimer's disease: an integrative study of single-nucleus transcriptomes and genetic association. oa

            【外文期刊】 Andi,Liu ; Brisa S,Fernandes ; 等 《Alzheimer's research & therapy》 2024年16卷1期 3页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Alzheimer’s disease; Cell–cell communication; Multi-omics;

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            28. Tm4sf1-marked Endothelial Subpopulation Is Dysregulated in Pulmonary Arterial Hypertension. oa

            【外文期刊】 Jason,Hong ; Brenda,Wong ; 等 《American journal of respiratory cell and molecular biology》 2023年68卷4期 381-394页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Sugen–hypoxia; endothelial progenitor cells; monocrotaline;

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            29. Comprehensive RNA-Seq Analysis of Potential Therapeutic Targets of Gan-Dou-Fu-Mu Decoction for Treatment of Wilson Disease Using a Toxic Milk Mouse Model.

            【外文期刊】 Taohua,Wei ; Wenjie,Hao ; 等 《Frontiers in pharmacology》 2021年12卷 622268页

            【关键词】 Gan–Dou–Fu–Mu decoction (GDFMD); RNA-sequencing; Wilson disease (WD);

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            30. Computationally Characterizing Protein-Bound Long Noncoding RNAs and Their Secondary Structure Using Protein Interaction Profile Sequencing (PIP-Seq) in Plants.

            【外文期刊】 Mengge,Shan ; Zachary D,Anderson ; 等 《Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)》 2019年1933卷 363-380页

            【关键词】 Long noncoding RNA (lncRNA); Messenger RNAs; RNA secondary structure;

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            31. Trigeminal Autonomic Cephalalgias Manifested As The Only Initial Symptom Of Ehlers-Danlos Syndrome Type IV.

            【外文期刊】 Mei-Jiao,Chen ; Hong-Fu,Li ; 等 《Journal of pain research》 2019年12卷 3215-3220页

            【关键词】 Ehlers–Danlos syndrome; Sanger sequencing; internal carotid artery dissection;

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            32. Transcriptome-wide identification and characterization of the Procambarus clarkii microRNAs potentially related to immunity against Spiroplasma eriocheiris infection.

            【外文期刊】 Jiangtao,Ou ; Yue,Li ; 等 《Fish & shellfish immunology》 2013年35卷2期 607-17页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Host–pathogen interaction; MicroRNA transcriptome; Next generation sequencing;

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            33. Partner, Neighbor, Housekeeper and Dimension: 3D versus 2D Glomerular Co-Cultures Reveal Drawbacks of Currently Used Cell Culture Models. oa

            【外文期刊】 Anna,Rederer ; Victoria,Rose ; 等 《International journal of molecular sciences》 2023年24卷12期 SCIMEDLINE

            【关键词】 3D co-culture; bulk-RNA sequencing; cell culture model;

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            34. Ferroptosis Transcriptional Regulation and Prognostic Impact in Medulloblastoma Subtypes Revealed by RNA-Seq.

            【外文期刊】 Christophe,Desterke ; Yuanji,Fu ; 等 《Antioxidants (Basel, Switzerland)》 2025年14卷1期

            【关键词】 RNA-sequencing; epigenetic; ferroptosis;

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            35. Construction of a "Bacteria-Metabolites" Co-Expression Network to Clarify the Anti-Ulcerative Colitis Effect of Flavonoids of Sophora flavescens Aiton by Regulating the "Host-Microbe" Interaction.

            【外文期刊】 Jing,Shao ; Zhaocheng,Li ; 等 《Frontiers in pharmacology》 2021年12卷 710052页

            【关键词】 16S rRNA sequencing; gut bacteria; metabolomics;

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            36. Novel GTF2I-PDGFRB and IKZF1-TYW1 fusions in pediatric leukemia with normal karyotype. oa

            【外文期刊】 Ioannis,Panagopoulos ; Marta,Brunetti ; 等 《Experimental hematology & oncology》 2019年8卷 12页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Array comparative genomic hybridization; Fluorescence in situ hybridization; Fusion genes;

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            37. Peripheral Blood Gene Expression Profiling Reveals Molecular Pathways Associated with Cervical Artery Dissection. oa

            【外文期刊】 Polina S,Shlapakova ; Larisa A,Dobrynina ; 等 《International journal of molecular sciences》 2024年25卷10期 SCIMEDLINE

            【关键词】 bulk RNA sequencing; cervical artery dissection; epithelial–mesenchymal plasticity;

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            38. Rhizosphere Microbiomes of European + Seagrasses Are Selected by the Plant, But Are Not Species Specific.

            【外文期刊】 Catarina,Cúcio ; Aschwin H,Engelen ; 等 《Frontiers in microbiology》 2016年7卷 440页

            【关键词】 16S rRNA; amplicon sequencing; marine bacteria;

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            39. Identifying HIF1A and HGF as two hub genes in aortic dissection and function analysis by integrating RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data.

            【外文期刊】 Hai-Bing,Li ; Chang,Liu ; 等 《Frontiers in cardiovascular medicine》 2024年11卷 1475991页

            【关键词】 RNA-sequencing; aortic dissection; hepatocyte growth factor;

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            40. Molecular Responses to Cadmium Exposure in Two Contrasting Durum Wheat Genotypes. oa

            【外文期刊】 Erika,Sabella ; Andrea,Luvisi ; 等 《International journal of molecular sciences》 2021年22卷14期 SCIMEDLINE

            【关键词】 Triticum durum; basic helix–loop–helix (bHLH); heavy metals;

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