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【中文期刊】 严循东 张先稳 《实用临床医药杂志》 2025年29卷3期 30-37页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于蛋白质组学和转录组学筛选肺腺癌预后生物标志物并构建预后模型.方法 从TCGA公共数据库下载肺腺癌的蛋白质组学、转录组学及患者临床特征数据.按照7∶3比例将数据集分成训练组和验证组.根据患者临床生存时间、生存状态和蛋白表达数据,在训...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者： 罗武 导师：付绍杰 南方医科大学 临床医学 外科学（硕士） 2019年
【摘要】
第一部分通过对TCGA数据库挖掘的肾癌组织DNA甲基化差异性分析
目的
据报道在早起肿瘤的发生阶段，存在着大量的异常DNA甲基化。本研究拟针对从TCGA数据库挖掘的肾癌特异性DNA甲基化数据差异性分析，建立cfDNA甲基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 蒋琴 周航宇 等 《肿瘤预防与治疗》 2024年37卷12期 1015-1023页 ISTIC
【摘要】 目的:本研究利用公共数据库结合细胞功能学实验,筛选结肠癌中呈差异表达的CYP450超家族2亚家族基因,系统分析CYP2家族基因在结肠癌中的表达情况及功能作用.方法:利用TCGA数据库,筛选结肠癌中呈差异表达的CYP2家族基因;运行R包进行预...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 侯娟 滕长财 等 《右江医学》 2024年52卷2期 133-138页
【摘要】 目的 研究肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中酰基辅酶A合成酶中链家族成员 3(ACSM3)在 357 例卵巢癌患者中的表达量及其与患者生存状况的关系.方法 对TCGA数据库中 357 例卵巢癌患者的ACSM3 表达量及其与生存情况的关系进行分...
【关键词】 酰基辅酶A合成酶中链家族成员3； 肿瘤基因图谱； 预后；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 马靖琳 王婷 等 《医学信息》 2024年37卷1期 1-9,15页
【摘要】 目的 分析叉头转录因子M1(FOXM1)在软组织肉瘤(STSs)中的表达及临床预后价值.方法 通过Oncomine数据库分析FOXM1在常见恶性肿瘤尤其是STSs中的表达水平,随后在TCGA数据库中进行验证;在CCLE数据库分析FOXM1在...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹静 路鹏霏 等 《癌症进展》 2023年21卷10期 1090-1094,1109页 ISTIC
【摘要】 目的 通过生物信息学方法分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶(QPRT)在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能.方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)检索恶性黑色素瘤患者的临床资料.应用基因表达谱互动分析(GEPIA)数据...
【关键词】 恶性黑色素瘤； 喹啉酸磷酸核糖基转移酶； 公共数据库；
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【中文期刊】 谷润川 杨雄涛 等 《中日友好医院学报》 2022年36卷5期 272-277,封2页 ISTICCA
【摘要】 目的:对外壳蛋白ε与非小细胞肺癌的关系、唾液酸化免疫球蛋白G的结合及其与肺癌的关系进行探索.方法:通过细胞照射、免疫沉淀联合质谱分析研究唾液酸化免疫球蛋白与外壳蛋白ε的结合;依托TCGA、GEO、GTEx、HPA、EGA及KM plotte...
【关键词】 唾液酸化免疫球蛋白G； 外壳蛋白ε； 非小细胞肺癌；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 童璐 欧阳慧婷 等 《湖南师范大学学报（医学版）》 2022年19卷5期 32-38页 ISTIC
【摘要】 目的:研究NPY1R在乳腺癌他莫昔芬耐药中的作用,为预测和逆转乳腺癌内分泌耐药提供新的分子标志物.方法:从GEO数据库中获取乳腺癌他莫昔芬耐药前后基因表达数据集,并通过GEO2R筛选出NPY1R为乳腺癌他莫昔芬耐药前后差异表达基因,利用TC...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李敖 王玉然 等 《医学信息》 2022年35卷22期 17-22页
【摘要】 目的 利用生物信息学技术对自噬相关基因(ATGs)进行分析,并建立预测肺腺癌患者预后的基因表达模型.方法 利用TCGA数据库筛选肿瘤组织和正常组织中差异表达的ATGs,进行GO和KEGG富集分析确定与ATGs相关的信号通路,再进行单变量和多...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈弟 陈迪康 等 《中南大学学报（医学版）》 2018年43卷4期 368-382页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过对多个公共数据库中胶质母细胞瘤转录组数据进行挖掘,筛选胶质母细胞瘤预后相关的基因,并构建预后分析模型.方法:利用生物信息学技术对GEO(GSE53733)中生存时间大于36个月和小于12个月的样本数据对比分析得到差异表达基因,即胶...
- 概要：
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【中文期刊】 谢龙祥 闫中义 等 《河南大学学报（医学版）》 2018年37卷3期 223-228页 CA
【摘要】 由美国政府发起的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划是一个公共资助的项目,其采用高通量基因组测序、基因芯片技术,运用多维数据整合分析方法,将人类几乎所有癌症(包括亚型在内的50多种肿瘤)的基因组变异...
【关键词】 癌症基因组图谱(TCGA)； 癌症基因组学； 测序；
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【中文期刊】 郑兆胤 杨柳 等 《中国卫生检验杂志》 2023年33卷1期 15-19页 ISTIC
【摘要】 目的 通过肿瘤基因图谱(TCGA)数据库研究膜外基质金属蛋白酶-14(MMP14)在肺癌中的表达情况以及与肺癌临床病理特征的关系,进而推测MMP14对肺癌患者预后的影响,探讨MMP14在肺癌早期诊断中的作用.方法 检索TCGA中的肺癌数据集...
【关键词】 膜外基质金属蛋白酶-14； 肺癌； 肿瘤基因图谱；
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【中文期刊】 张文桃 胡艳芬 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2022年38卷4期 505-514页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义.利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用T...
- 概要：
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【中文期刊】 李丹 余涛 等 《中国医院药学杂志》 2019年39卷16期 1629-1633页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:阐明PLOD2基因在肺腺癌中的表达及临床意义.方法:检索Oncomine和TCGA等生物信息数据库中有关PLOD2的信息,对所获取的数据资料挖掘并进行2次分析,对PLOD2在肺腺癌中的作用进行荟萃分析.结果:Oncomine数据库中共...
【关键词】 PLOD2基因； 肺腺癌； Oncomine数据库；
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【中文期刊】 李丹 余涛 等 《现代药物与临床》 2019年34卷9期 2807-2812页 ISTICCA
【摘要】 目的 阐明SLC2A1基因在肺腺癌中的表达及临床意义.方法 通过检索Oncomine和TCGA等生物信息数据库中有关SLC2A1的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对SLC2A1在肺腺癌中的作用进行荟萃分析.结果 Oncomin...
【关键词】 SLC2A1基因； 肺腺癌； Oncomine数据库；
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