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            【中文期刊】 任婧  卜竹林  等 《中草药》 2025年56卷2期 566-584页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 运用生物信息学、网络药理学及实验验证的方法探究熟地黄Rehmanniae Radix Praeparata治疗2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制.方法 熟地黄的水提物ig给予T2DM小鼠...

            【关键词】 生物信息学网络药理学2型糖尿病

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            【中文期刊】 王天禧  杨炳松  等 《生物技术通报》 2025年41卷4期 176-187页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]从苹果全基因组中鉴定MdPLATZs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究MdPLATZs转录因子的生物学功能奠定基础.[方法]通过生物信息学方法从苹果全基因组鉴定出17个PLATZ基因家族成员,并依据其序列特征将其划分为4个...

            【关键词】 苹果MdPLATZ9转录因子

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            【中文期刊】 覃悦  杨妍  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 146-160页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]赤霉素氧化酶GAox包括GA20氧化酶(GA20ox)、GA2氧化酶(GA2ox)和GA3氧化酶(GA3ox),是植物体内赤霉素GA生物合成的关键调控酶,与植物的生长发育及对胁迫的响应息息相关.从二倍体和四倍体马铃薯全基因组中鉴定S...

            【关键词】 马铃薯倍性赤霉素氧化酶

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            【中文期刊】 宋姝熠  蒋开秀  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 190-201页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]基于全基因组鉴定'红阳'猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础.[方法]利用生物信息学方法分析'红阳'猕猴桃T...

            【关键词】 ’红阳’猕猴桃TCP转录因子全基因组鉴定

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            【中文期刊】 刘涛  王志淇  等 《生物技术通报》 2025年41卷4期 145-155页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]GRAM(Glucosyltransferases,Rab-like GTPase activators and Myotubularins)是普遍存在于动、植物蛋白中的结构域,在植物生长发育及响应逆境胁迫等过程中发挥着重要功能.在...

            【关键词】 马铃薯GRAM基因家族生物信息学

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            【中文期刊】 易晓姝  郑安儒  等 《生物工程学报》 2025年41卷7期 2897-2912页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 PLATZ是一类植物特异性的锌指类转录因子(plant AT-rich sequence and zinc-binding),在植物的生长发育和抗逆中发挥重要作用.为了更好地解析茶树[Camellia sinensis(L.)Kuntze]...

            【关键词】 PLATZ基因家族茶树生物信息学分析

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            【中文期刊】 龙茜  刘培  等 《中草药》 2025年56卷10期 3585-3598页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于异病同治理论通过生物信息学的方法从卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)角度探究干眼症(dry eye disease,DED)的关键基因及作用机制,并进一步寻找治疗干眼症的天然活性成分,以期拓展干...

            【关键词】 异病同治卵巢早衰干眼症

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            【中文期刊】 卢辰宇  王思慧  等 《临床皮肤科杂志》 2025年54卷5期 261-268页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:使用生物信息学方法筛选瘢痕疙瘩Janus激酶-信号转导及转录激活因子(JAK-STAT)通路相关的差异表达基因(DEG)及其预测出的靶向中药单体,以期为瘢痕疙瘩的防治提供新思路.方法:收集135例瘢痕疙瘩患者的转录组数据,并从基因型-...

            【关键词】 瘢痕疙瘩JAK-STAT通路生物信息学

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            【中文期刊】 宝乌日力嘎  包明兰  等 《华西药学杂志》 2025年40卷1期 35-40页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 结合网络药理学和分子对接技术研究地格达-8味散治疗α-萘异硫氰酸酯(ANIT)诱导大鼠胆汁淤积型肝炎模型的机制.方法 建立ANIT致大鼠胆汁淤积型肝炎模型,观察地格达-8味散对大鼠胆汁淤积型肝炎的影响;利用Cytoscape软件建立"...

            【关键词】 地格达-8味散胆汁淤积型肝炎网络药理学

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            【中文期刊】 杨莉  曲茜彤  等 《植物学报》 2025年60卷3期 377-392页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 AHL(AT-hook)蛋白家族在植物生长发育、器官构建、逆境胁迫及植物激素信号应答中发挥关键作用.为揭示菠菜(Spinacia oleracea)AHL基因家族的生物学功能,在基因组范围内对SoAHL家族成员进行鉴定和分析,并探究外源水杨...

            【关键词】 菠菜AT-hook基因家族生物信息学

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            【中文期刊】 赵越梦  刘瓅莹  等 《中华中医药杂志》 2025年40卷3期 1112-1117页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:深入研究多囊卵巢综合征(PCOS)患者中双硫死亡的潜在机制.方法:通过分析两个数据集(GSE34526和GSE137684),识别了与双硫死亡相关的差异表达基因,并进行了主成分分析和免疫浸润分析.运用加权基因共表达网络分析构建了基因网...

            【关键词】 多囊卵巢综合征双硫死亡颗粒细胞

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            【中文期刊】 高文波  柯佳宁  等 《中国艾滋病性病》 2025年31卷2期 149-155页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 本文旨在通过生物信息学与网络药理学相关分析,探析祛湿解毒颗粒治疗艾滋病免疫重建不全的作用靶点以及作用机制.方法 使用GEO数据集数据库中的GSE77939、GSE106792数据集以及Gene Cards数据库收集艾滋病免疫重建不全相...

            【关键词】 祛湿解毒艾滋病免疫重建不全生物信息学

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            【中文期刊】 龚钰涵  陈兰  等 《生物技术通报》 2025年41卷7期 214-225页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]端粒结合蛋白(telomere repeat binding,TRB)是一类端粒双链DNA结合蛋白,对植物生长发育起着重要作用.通过鉴定茶树[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze]TRB基因家族,克隆关键基因C...

            【关键词】 茶树TRB家族生物信息学

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            【中文期刊】 匡健华  程志鹏  等 《生物技术通报》 2025年41卷2期 221-233页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]探究荷花(Nelumbo nucifera)NnGH3家族成员的特征及其在非生物胁迫响应中的作用,为荷花抗逆新品种的选育提供新的关键候选基因资源.[方法]采用生物信息学方法从荷花全基因组中鉴定酰基酰胺合成酶(GH3)家族成员,对GH...

            【关键词】 荷花GH3基因家族生物信息学

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            【中文期刊】 陈耀武  陈志翔  等 《中国临床药理学杂志》 2025年41卷8期 1170-1174页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学分析慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)中铁死亡基因及相关发病机制,并筛选通过铁死亡相关途径治疗CTEPH的潜在中药活性成分.方法 通过R语言分析数据集GSE130391中差异表达基因,从FerrDB数据库获取铁死亡相...

            【关键词】 慢性血栓栓塞性肺动脉高压铁死亡生物信息学

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            【中文期刊】 贾子健  王宝强  等 《生物技术通报》 2025年41卷2期 163-174页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]CHX(cation/H+exchanger)基因家族是植物特有的一价阳离子转运蛋白,在植物的生长发育、盐碱胁迫响应中发挥重要作用.从藜麦全基因组范围内鉴定CHX基因家族成员,分析相关基因表达特点,为后续CHX基因功能深入研究提供支...

            【关键词】 藜麦CHX生信分析

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            【中文期刊】 张逸群  陈家栋  等 《中草药》 2025年56卷1期 259-268页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 对铁皮石斛Dendrobium officinale中糖基转移酶基因DoUGT83A1进行克隆,并对其进行生物信息学及表达模式分析.方法 从铁皮石斛"雁荡山1号"叶组织中获得DoUGT83A1基因,利用软件进行生物信息学分析,利用ME...

            【关键词】 铁皮石斛DoUGT83A1基因生物信息学分析

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            【中文期刊】 刘越圳  聂小山  等 《中草药》 2025年56卷9期 3253-3262页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆茅苍术Atractylodes lancea细胞分裂素羟化酶基因(AlCYP735A,GenBank:PP839072.1),对其进行生物信息学分析、组织特异性表达分析以及构建原核表达载体对该蛋白进行重组表达.方法 从茅苍术cDN...

            【关键词】 茅苍术AlCYP735A基因克隆

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            【中文期刊】 张晔  刘岩  等 《药物评价研究》 2025年48卷3期 576-583页ISTICPKUCA

            【摘要】 目的 探究近10年药物相互作用(DDI)领域预测模型的研究现状和热点.方法 检索2013年1月1日—2024年8月13日Web of Science核心合集数据库中发表的有关DDI预测模型研究文献,运用CiteSpace 6.3 R1软件绘...

            【关键词】 药物相互作用预测模型文献计量学

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            【中文期刊】 韩江涛  张帅博  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 171-180页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]β-淀粉酶(β-amylase,BAM)能水解淀粉,在植物生长和响应非生物胁迫中起重要作用.从全基因组水平对甜瓜BAM基因家族成员进行鉴定,为甜瓜BAM基因功能研究及抗性育种提供基因资源.[方法]分析BAM家族蛋白理化性质、系统进化...

            【关键词】 甜瓜β-淀粉酶基因家族

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            【中文期刊】 原梦  谭新杰  等 《中草药》 2025年56卷11期 4036-4042页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆山茱萸Cornus officinalis G10H1基因(CoG10H1),并进行相关的生物信息学分析、表达分析和亚细胞定位研究.方法 基于山茱萸转录组数据筛选并克隆CoG10H1基因,并对其CoGl0Hl及其编码蛋白的理化性质...

            【关键词】 山茱萸CoG10H1生物信息学

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            【中文期刊】 张益瑄  马宇  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 123-136页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]基于最新版马铃薯基因组信息,鉴定DIR基因家族所有成员,并利用生物信息学技术和转录组数据,对DIR基因家族成员系统进化、基因结构、顺式元件及表达模式进行预测及分析,为深入研究DIR基因在马铃薯生长发育及胁迫响应中的功能提供参考.[方...

            【关键词】 马铃薯DIR蛋白基因家族

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            【中文期刊】 王柯燕  唐丽媚  等 《药学学报》 2025年60卷4期 1156-1165页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 JAZ蛋白作为茉莉酸途径的抑制因子,对植物生长发育、植物次级代谢产物合成的调控具有重要作用.为研究雷公藤(Tripterygium wilfordii)JAZ基因家族的功能,本研究系统鉴定了雷公藤JAZ基因家族成员,分析其理化性质、基因染色...

            【关键词】 雷公藤JAZ生物信息学分析

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            【中文期刊】 许淑芸  魏京京  等 《微生物学通报》 2025年52卷3期 1295-1308页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]牛呼吸道综合征严重影响着牛群健康,对养殖业有着较为严重的影响,溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica)作为主要的牛呼吸道致病菌,常在牛免疫力低下时引起牛呼吸道疾病(bovine respiratory dise...

            【关键词】 溶血性曼氏杆菌ChaN生物信息学

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            【中文期刊】 班秋艳  赵鑫月  等 《生物技术通报》 2025年41卷4期 256-265页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]PIFs(phytochrome interacting factors)是光敏色素介导光温信号中的核心成员.研究茶树(Camellia sinensis(L.)O.Kuntze)PIF3的功能,为利用光信号途径避免或缓解逆境对茶树...

            【关键词】 CsPIF3a基因克隆生物信息学分析

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            【中文期刊】 蔡芷辰  赵君谊  等 《中草药》 2025年56卷4期 1338-1345页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以金银花Lonicerae Japonicae Flos中糖基转移酶为研究对象,进行糖基转移酶LjUGT73C1 基因的生物信息学分析、基因合成与亚克隆、表达分析和纯化.方法 利用前期盐胁迫金银花组学研究构建的金银花转录组数据库注释信...

            【关键词】 金银花LjUGT73C1基因生物信息分析

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            【中文期刊】 李志强  罗正乾  等 《生物技术通报》 2025年41卷5期 141-152页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用.[方法]利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MY...

            【关键词】 大豆R2R3-MYB基因家族生物信息学分析

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            【中文期刊】 黄颖  遇文婧  等 《生物技术通报》 2025年41卷2期 248-256页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]分析山新杨谷胱甘肽转移酶(GST)基因的表达模式,为深入研究木本植物GST基因的功能提供基础.[方法]克隆山新杨GST基因并进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR技术分析GST基因在植物激素及非生物胁迫下的表达模式.[结果]克隆了3...

            【关键词】 谷胱甘肽转移酶生物信息学分析基因表达模式

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            【中文期刊】 肖鸿扬  冯婧娴  等 《中草药》 2025年56卷9期 3245-3252页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆粗茎秦艽 Gentiana crassicaulis的裂环马钱苷合酶(secologanin synthase,SLS)基因GcSLS,分析其理化性质、系统进化关系、组织表达特性,为进一步研究植物萜类化合物生物合成通路中的关键酶及...

            【关键词】 粗茎秦艽裂环马钱苷合酶表达模式

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            【中文期刊】 程爽  孙昊  等 《植物生理学报》 2025年61卷5期 663-672页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 杨树分布广、适应性强,具有较高的生态、经济和工业价值.S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)催化ATP和L-甲硫氨酸反应生成S-腺苷蛋氨酸,参与植物中多胺和乙烯的形成.然而,植物中SAMS基因家族的功能研究较少,SAMS在木本植物中对干旱胁迫的...

            【关键词】 S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因杨树干旱胁迫

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            【中文期刊】 杨豫正  姚晓玲  等 《中医杂志》 2025年66卷7期 724-733页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 运用生物信息学方法及试验验证探讨雷公藤治疗类风湿关节炎(RA)的可能作用机制.方法 通过基因表达综合数据库(GEO)、中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP),采用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集、蛋...

            【关键词】 类风湿关节炎雷公藤生物信息学

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            【中文期刊】 李思影  董一凤  等 《中国矫形外科杂志》 2025年33卷14期 1303-1309页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]本研究利用RNA转录组测序结合生物信息学分析,旨在鉴定与骨肉瘤发生发展密切相关的核心基因,并探讨其功能注释及涉及的信号通路.[方法]收集骨肉瘤患者的组织和血液样本:包括肿瘤组织中心区与边缘区各1例及对应的肿瘤全血样本1例,同时采集患...

            【关键词】 骨肉瘤转录组测序生物信息学

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            【中文期刊】 季双双  龙思丹  等 《中草药》 2025年56卷3期 933-946页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探究结直肠腺癌经典序列转化中的差异基因及其与免疫细胞浸润和患者生存时间的相关性,并预测具有靶向作用的中药.方法 从GEO数据库寻找符合要求的配对样本数据,使用R语言筛选序列转化过程中始终存在差异表达的关键基因,并通过基因本体(gene...

            【关键词】 结直肠癌肠腺瘤生物信息学

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            【中文期刊】 孙雨  欧阳旭  等 《植物生理学报》 2025年61卷6期 869-885页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是2-甲基赤藓糖醇-4-磷酸途径(2-C-methyl-D-erythritol-4-phos-phate path...

            【关键词】 甘草DXS基因甘草酸

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            【中文期刊】 刘绍博  姚龙宇  等 《中草药》 2025年56卷8期 2662-2677页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 采用方证代谢组学联合靶向蛋白分析策略,进行痹痛宁胶囊(Bitongning Capsules,BC)质量标志物(quality markers,Q-Marker)的深入挖掘,为BC质量标准的提升奠定基础.方法 以BC的临床主治病症为核...

            【关键词】 痹痛宁胶囊质量标志物方证代谢组学

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            【中文期刊】 瞿美玲  周思敏  等 《生物技术通报》 2025年41卷6期 256-268页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]研究灰毡毛忍冬bHLH转录因子家族成员的结构和功能,分析其表达特征,为后续深入研究灰毡毛忍冬bHLH基因家族在花发育过程中的功能奠定基础.[方法]基于灰毡毛忍冬两品种花转录组数据,筛选bHLH基因家族成员,利用在线工具进行生物信息学...

            【关键词】 灰毡毛忍冬bHLH基因家族生物信息学

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            【中文期刊】 王琛  刘国梅  等 《生物技术通报》 2025年41卷3期 161-170页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]鉴定白菜型油菜(Brassia rapa L.)类胡萝卜素裂解双加氧酶(carotenoid cleavage dioxygenases,CCDs)基因家族成员,深入了解BrCCD家族基因功能及组织表达特性.[方法]利用生物信息学方...

            【关键词】 白菜型油菜生物信息学分析CCDs基因家族

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            【中文期刊】 邓萍  原梦  等 《中草药》 2025年56卷15期 5571-5577页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 克隆连翘 Forsythia suspensa 的 FsADH1 基因,初步探究蛋白定位以及在低温胁迫下该基因的表达模式.方法 参考连翘转录组数据,克隆得到FsADH1 基因,并通过生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质进行分析,利用烟...

            【关键词】 连翘FsADH1生物信息学

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            【中文期刊】 卢勇杰  夏海乾  等 《生物技术通报》 2025年41卷4期 266-277页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [目的]AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive factor)转录因子家族中的ESR2基因对植物叶芽发育调控具有重要的作用.克隆烟草NtESR2基因并分析其功能,为烟草叶芽的发育调控提供靶标基因.[方法]采...

            【关键词】 烟草NtESR2CRISPR/Cas9

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            【中文期刊】 杨志城  叶亮  等 《中草药》 2025年56卷10期 3599-3613页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探索胃"炎-癌"转化中的潜在作用靶点及其发病机制,并采用生物信息学技术预测潜在干预"炎-癌"进展的中药并验证.方法 从GEO数据库下载胃癌及慢性胃炎基因芯片,分为训练组及验证组,采用sva包及ComBat函数移除批次效应并整合.采用R...

            【关键词】 慢性胃炎胃癌机器学习

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