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          1. ProTG4: A Web Server to Approximate the Sequence of a Generic Protein From an in Silico Library of Translatable G-Quadruplex (TG4)-Mapped Peptides. oa

          【外文期刊】 Siddhartha,Kundu ; 《Bioinformatics and biology insights》 2021年15卷 11779322211045878页MEDLINE

          【关键词】 Bioinformatics;mathematical and computational biology;peptidome and peptide analysis;

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          2. Employing computational tools to design a multi-epitope vaccine targeting human immunodeficiency virus-1 (HIV-1). oa

          【外文期刊】 Hamza,Sher ; Hafsa,Sharif ; 等 《BMC genomics》 2023年24卷1期 276页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Acquired immunodeficiency syndrome;Bioinformatics;Computational biology;

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          3. Computational identification of biomarker genes for lung cancer considering treatment and non-treatment studies. oa

          【外文期刊】 Mona,Maharjan ; Raihanul Bari,Tanvir ; 等 《BMC bioinformatics》 2020年21卷Suppl 9期 218页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Bioinformatics;Computational identification of biomarker;Lung cancer biomarkers;

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          4. CCBuilder 2.0: Powerful and accessible coiled-coil modeling. oa

          【外文期刊】 Christopher W,Wood ; Derek N,Woolfson ; 《Protein science : a publication of the Protein Society》 2018年27卷1期 103-111页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 coiled coil;collagen;computational design;

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          5. Current and Emerging Tools of Computational Biology To Improve the Detoxification of Mycotoxins. oa

          【外文期刊】 Natalie,Sandlin ; Darius,Russell Kish ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2022年88卷3期 e0210221页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 biodegradation;bioinformatics;bioremediation;

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          6. Intricacies in arrangement of SNP haplotypes suggest "Great Admixture" that created modern humans. oa

          【外文期刊】 Rajib,Dutta ; Joseph,Mainsah ; 等 《BMC genomics》 2017年18卷1期 433页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Bioinformatics;Computational biology;Genes;

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          7. MOGSA: Integrative Single Sample Gene-set Analysis of Multiple Omics Data. oa

          【外文期刊】 Chen,Meng ; Azfar,Basunia ; 等 《Molecular & cellular proteomics : MCP》 2019年18卷8 suppl 1期 S153-S168页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Bioinformatics software;Computational Biology;Mass Spectrometry;

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          8. Bioinformatics in Russia: history and present-day landscape. oa

          【外文期刊】 Muhammad A,Nawaz ; Igor E,Pamirsky ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷6期 SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Russia;bioinformatics;computational biology;

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          9. Sepsis in the era of data-driven medicine: personalizing risks, diagnoses, treatments and prognoses. oa

          【外文期刊】 Andrew C,Liu ; Krishna,Patel ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2020年21卷4期 1182-1195页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 computational medicine;genome informatics;precision medicine;

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          10. DIAMUND: direct comparison of genomes to detect mutations. oa

          【外文期刊】 Steven L,Salzberg ; Mihaela,Pertea ; 等 《Human mutation》 2014年35卷3期 283-8页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 bioinformatics;computational biology;exome sequencing;

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          11. Dual proteome-scale networks reveal cell-specific remodeling of the human interactome. oa

          【外文期刊】 Edward L,Huttlin ; Raphael J,Bruckner ; 等 《Cell》 2021年184卷11期 3022-3040.e28页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 AP-MS;BioPlex;bioinformatics;

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          12. Differential Co-Expression Analyses Allow the Identification of Critical Signalling Pathways Altered during Tumour Transformation and Progression. oa

          【外文期刊】 Aurora,Savino ; Paolo,Provero ; 等 《International journal of molecular sciences》 2020年21卷24期 SCIMEDLINE

          【关键词】 bioinformatics;biological networks;cancer;

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          13. Next-Generation Hydrogel Design: Computational Advances in Synthesis, Characterization, and Biomedical Applications. oa

          【外文期刊】 Muhammad Mazhar,Fareed ; Sergey,Shityakov ; 《Polymers》 2025年17卷10期 SCIMEDLINECA

          【关键词】 bioinformatics;computational modeling;engineered biological scaffolds;

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          14. XGBoost framework with feature selection for the prediction of RNA N5-methylcytosine sites. oa

          【外文期刊】 Zeeshan,Abbas ; Mobeen Ur,Rehman ; 等 《Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy》 2023年31卷8期 2543-2551页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 5-methylcytosine (m5C);Bioinformatics;Classification;

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          15. Thriving in multidisciplinary research: advice for new bioinformatics students. oa

          【外文期刊】 Raymond K,Auerbach ; 《The Yale journal of biology and medicine》 2012年85卷3期 323-9页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 bioinformatics;bioinformatics education;computational biology;

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          16. Combining Feature-Based Molecular Networking and Contextual Mass Spectral Libraries to Decipher Nutrimetabolomics Profiles. oa

          【外文期刊】 Lapo,Renai ; Marynka,Ulaszewska ; 等 《Metabolites》 2022年12卷10期 SCIMEDLINECABP

          【关键词】 bioinformatics;chemometrics;computational metabolomics;

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          17. A novel information retrieval model for high-throughput molecular medicine modalities. oa

          【外文期刊】 Firas H,Wehbe ; Steven H,Brown ; 等 《Cancer informatics》 2009年8卷 1-17页MEDLINE

          【关键词】 clinical bioinformatics;information retrieval;molecular medicine;

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          18. Composition, physicochemical property and base periodicity for discriminating lncRNA and mRNA. oa

          【外文期刊】 Prasad,Rajesh ; Annangarachari,Krishnamachari ; 《Bioinformation》 2023年19卷12期 1145-1152页MEDLINE

          【关键词】 Bioinformatics;computational biology;lncRNA;

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          19. Comparative exploration of multidimensional flow cytometry software: a model approach evaluating T cell polyfunctional behavior. oa

          【外文期刊】 Timothy T,Spear ; Michael I,Nishimura ; 等 《Journal of leukocyte biology》 2017年102卷2期 551-561页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 ACCENSE;Pestle;SPICE;

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          20. Revealing the Determinants of Widespread Alternative Splicing Perturbation in Cancer. oa

          【外文期刊】 Yongsheng,Li ; Nidhi,Sahni ; 等 《Cell reports》 2017年21卷3期 798-812页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 DrAS-Net;Network biology;alternative splicing;

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          21. Shedding Light on the Drug-Target Prediction of the Anti-Inflammatory Peptide TnP with Bioinformatics Tools. oa

          【外文期刊】 Carla,Lima ; Silas Fernandes,Eto ; 等 《Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)》 2022年15卷8期 SCIMEDLINE

          【关键词】 TnP;bioinformatics and computational tools;cyclic peptides;

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          22. Developing computational biology at meridian 23° E, and a little eastwards. oa

          【外文期刊】 Christos A,Ouzounis ; 《Journal of biological research (Thessalonike, Greece)》 2018年25卷 18页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Biochemical engineering;Bioinformatics;Biotechnology;

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          23. Classifying Variants of Undetermined Significance in BRCA2 with protein likelihood ratios. oa

          【外文期刊】 Rachel,Karchin ; Mukesh,Agarwal ; 等 《Cancer informatics》 2008年6卷 203-16页MEDLINECA

          【关键词】 bioinformatics and computational biology;breast cancer;cancer susceptibility genes;

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          24. Human OMICs and Computational Biology Research in Africa: Current Challenges and Prospects. oa

          【外文期刊】 Yosr,Hamdi ; Lyndon,Zass ; 等 《Omics : a journal of integrative biology》 2021年25卷4期 213-233页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Africa;African OMICs innovation ecosystem;bioinformatics;

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          25. A Continuous Statistical Phasing Framework for the Analysis of Forensic Mitochondrial DNA Mixtures. oa

          【外文期刊】 Utpal,Smart ; Jennifer Churchill,Cihlar ; 等 《Genes》 2021年12卷2期 SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Bayesian inference;DEploid;Ion Torrent;

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          26. Twenty Year History of Cancer Informatics (CiX) - A Long and Established Legacy of Quality Research and Scientific Advances in the Field of Oncology. oa

          【外文期刊】 Jimmy T,Efird ; 《Cancer informatics》 2025年24卷 11769351251329712页MEDLINECA

          【关键词】 bioinformatics;cancer informatics;computational biology;

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          27. mLoc-mRNA: predicting multiple sub-cellular localization of mRNAs using random forest algorithm coupled with feature selection via elastic net. oa

          【外文期刊】 Prabina Kumar,Meher ; Anil,Rai ; 等 《BMC bioinformatics》 2021年22卷1期 342页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Bioinformatics;Computational biology;Feature selection;

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          28. TADsplimer reveals splits and mergers of topologically associating domains for epigenetic regulation of transcription. oa

          【外文期刊】 Guangyu,Wang ; Qingshu,Meng ; 等 《Genome biology》 2020年21卷1期 84页SCIMEDLINE

          【关键词】 Bioinformatics;Chromatin conformation;Computational biology;

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          29. QUADrATiC: scalable gene expression connectivity mapping for repurposing FDA-approved therapeutics. oa

          【外文期刊】 Paul G,O'Reilly ; Qing,Wen ; 等 《BMC bioinformatics》 2016年17卷1期 198页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Big data;Bioinformatics;Computational biology;

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          30. Prognostic Significance of CCDC8 in Bladder Cancer: Insights from Bioinformatics and Immunohistochemical Analysis. oa

          【外文期刊】 Xiaojie,Zhao ; Xin,Yu ; 等 《Journal of Cancer》 2025年16卷2期 382-397页SCIMEDLINE

          【关键词】 bladder cancer;computational biology and bioinformatics;pro-apoptotic coiled-coil domain containing 8 (CCDC8);

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          31. Multibatch TMT Reveals False Positives, Batch Effects and Missing Values. oa

          【外文期刊】 Alejandro,Brenes ; Jens,Hukelmann ; 等 《Molecular & cellular proteomics : MCP》 2019年18卷10期 1967-1980页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Tandem mass spectrometry;bioinformatics;computational biology;

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          32. FLiPPR: A Processor for Limited Proteolysis (LiP) Mass Spectrometry Data Sets Built on FragPipe. oa

          【外文期刊】 Edgar,Manriquez-Sandoval ; Joy,Brewer ; 等 《Journal of proteome research》 2024年23卷7期 2332-2342页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 bioinformatics;computational tools;data analysis workflow;

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          33. Bioinformatics mentorship in a resource limited setting. oa

          【外文期刊】 Daudi,Jjingo ; Gerald,Mboowa ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷1期 SCIMEDLINEBP

          【关键词】 bioinformatics;computational biology;education;

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          34. Empowering High-Throughput High-Content Analysis of Microphysiological Models: Open-Source Software for Automated Image Analysis of Microvessel Formation and Cell Invasion. oa

          【外文期刊】 Noah,Wiggin ; Carson,Cook ; 等 《Cellular and molecular bioengineering》 2024年17卷5期 369-383页SCIMEDLINE

          【关键词】 Bioinformatics;Computational biology;Hydrogel;

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          35. Longitudinal analysis of SARS-CoV-2 spike and RNA-dependent RNA polymerase protein sequences reveals the emergence and geographic distribution of diverse mutations. oa

          【外文期刊】 William M,Showers ; Sonia M,Leach ; 等 《Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases》 2022年97卷 105153页SCIMEDLINEBP

          【关键词】 Bioinformatics;Computational genomics;Pathogen surveillance;

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          36. Evidence for Widespread Class II Microcins in Enterobacterales Genomes. oa

          【外文期刊】 T Jeffrey,Cole ; Jennifer K,Parker ; 等 《Applied and environmental microbiology》 2022年88卷23期 e0148622页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Enterobacteriaceae;Gram-negative bacteria;bacteriocins;

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          37. Key steps and methods in the experimental design and data analysis of highly multi-parametric flow and mass cytometry. oa

          【外文期刊】 Paulina,Rybakowska ; Marta E,Alarcón-Riquelme ; 等 《Computational and structural biotechnology journal》 2020年18卷 874-886页SCIMEDLINE

          【关键词】 Bioinformatics;Computational tools;Flow cytometry;

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          38. On the Need to Develop Guidelines for Characterizing and Reporting Intrinsic Disorder in Proteins. oa

          【外文期刊】 Michael,Vincent ; Vladimir N,Uversky ; 等 《Proteomics》 2019年19卷6期 e1800415页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 bioinformatics;computational biology;intrinsically disordered proteins;

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          39. Drug Design by Pharmacophore and Virtual Screening Approach. oa

          【外文期刊】 Deborah,Giordano ; Carmen,Biancaniello ; 等 《Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)》 2022年15卷5期 SCIMEDLINE

          【关键词】 bioinformatics;computational biology;drug discovery;

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          40. A redrawn map for the human motor cortex. oa

          【外文期刊】 David A,Leopold ; 《Nature》 2023年617卷7960期 253-254页SCIMEDLINECABP

          【关键词】 Brain;Computational biology and bioinformatics;Neuroscience;

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