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            1. Characterizing the Molecular Motions and Free Energy Landscapes of HIV-1 gp120

            【会议论文】桑鹏 第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会 2014年

            【摘要】 Background: Acquired immune deficiency syndrome (AIDS) has caused catastrophic consequences to human society.During the ...

            【关键词】 gp120； dynamics and function； conformational equilibrium and transition；

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            2. Folding units govern the cytochrome c alkaline transition

            【外文期刊】 Hoang L. ; Maity H. ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2003年331卷1期 37-43页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Protein folding; Cytochrome c; Alkaline transition;

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            3. Mutation of asparagine 52 to glycine promotes the alkaline form of iso-1-cytochrome c and causes loss of cooperativity in acid unfolding

            【外文期刊】 Baddam S ; Bowler BE ; 《Biochemistry》 2006年45卷14期 4611-4619页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 NATIVE-LIKE INTERMEDIATE; CYTOCHROME-C; DENATURED STATE;

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            4. Kinetics of the salt-induced B- to Z-DNA transition

            【外文期刊】 Gonzalez VM. ; Perez JM. ; 等 《European Biophysics Journal》 1998年27卷4期 417-423页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Z-dna; Kinetics; Circular dichroism;

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            5. Control of Kinetics by Cooperative Interactions

            【外文期刊】 Hellmann, N. . ; 《IUBMB life》 2011年63卷5期 329-336页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 copper protein; oxygen binding protein; conformational transition;

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            6. How the protein concentration affects unfolding curves of oligomers

            【外文期刊】 Ragone R. ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2000年53卷3期 221-225页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Conformational stability; Denaturant binding model; Denaturation midpoint;

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            7. Experiments and simulation on ZIKV NS2B-NS3 protease reveal its complex folding

            【外文期刊】 Kumar, Ankur ; Kumar, Prateek ; 等 《Virology》 2021年556卷 110-123页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Zika virus; NS2B-NS3 protease; Equilibrium unfolding;

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            8. Conformational stability and dynamics of cytochrome c affect its alkaline isomerization

            【外文期刊】 Tomaskova N ; Varhac R ; 等 《Journal of biological inorganic chemistry: JBIC: a publication of the Society of Biological Inorganic Chemistry》 2007年12卷2期 257-266页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 alkaline isomerization; conformational change; cytochrome c;

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            9. Studies on the interaction between Ag+ and human serum albumin

            【外文期刊】 Shen XC. ; Liang H. ; 等 《Journal of Inorganic Biochemistry: An Interdisciplinary Journal》 2003年95卷2/3期 124-130页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Ag(i)-serum albumin; Equilibrium constant; Conformation transition;

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            10. Counting the ions surrounding nucleic acids

            【外文期刊】 2017年45卷4期 1596-1605页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; POISSON-BOLTZMANN EQUATION; MAGNESIUM-IONS;

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            11. Ultraviolet-circular dichroism spectroscopy and potentiometric study of the interaction between human serum albumin and sodium perfluorooctanoate

            【外文期刊】 Messina P ; Prieto G ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2005年79卷6期 300-309页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 fluorinated surfactant; sodium perfluorooctanoate; human serum albumin;

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            12. Unfolding mechanism of a hyperthermophilic protein O-6-methylguanine-DNA methyltransferase

            【外文期刊】 Nishikori S ; Shiraki K ; 等 《Biophysical Chemistry: An International Journal Devoted to the Physical Chemistry of Biological Phenomena》 2005年116卷2期 97-104页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 archaea; hyperthermostable protein; O-6-methylguanine-DNA methyltransferase;

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            13. Unfolding of α-helical 20-residue poly-glutamic acid analyzed by multiple runs of canonical molecular dynamics simulations.

            【外文期刊】 Naoki,Ogasawara ; Kota,Kasahara ; 等 《PeerJ》 2018年6卷 e4769页

            【关键词】 Conformational change; Disorder; Helix unfolding;

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            14. tRNA Shifts the G-quadruplex-Hairpin Conformational Equilibrium in RNA towards the Hairpin Conformer.

            【外文期刊】 Ambadas B,Rode ; Tamaki,Endoh ; 等 《Angewandte Chemie (International ed. in English)》 2016年55卷46期 14315-14319页 SCIMEDLINECA

            【关键词】 G-quadruplex; conformational transition; equilibrium shift;

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            15. Experiments and simulation on ZIKV NS2B-NS3 protease reveal its complex folding.

            【外文期刊】 Ankur,Kumar ; Prateek,Kumar ; 等 《Virology》 2021年556卷 110-123页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Conformational transition; Equilibrium unfolding; NS2B-NS3 protease;

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            16. Reciprocally-Coupled Gating: Strange Loops in Bioenergetics, Genetics, and Catalysis.

            【外文期刊】 Charles W,Carter ; Peter R,Wills ; 《Biomolecules》 2021年11卷2期

            【关键词】 aminoacyl-tRNA synthetases; catalytically active molten globules; conformational change;

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            17. Temperature and pressure effects on conformational equilibria of alanine dipeptide in aqueous solution

            【外文期刊】 Takekiyo T. ; Imai T. ; 等 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2004年73卷2期 283-290页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Raman spectroscopy; Reference interaction site model (rism) theory; Alanine dipeptide;

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            18. Transition of hemoglobin between two tertiary conformations: The transition constant differs significantly for the major and minor hemoglobins of the Japanese quail (Cortunix cortunix japonica)

            【外文期刊】 Okonjo KO ; Bello OS ; 等 《Biochimica et biophysica acta: BBA: International journal of biochemistry, biophysics and molecular biololgy. Proteins and Proteomics》 2008年1784卷3期 464-471页 SCISCIE

            【关键词】 Japanese quail hemoglobin; tertiary conformational transition; multiple reactive sulfhydryl group;

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            19. INTERACTIONS OF ARISTOLOLACTAM BETA-D-GLUCOSIDE WITH RIGHT-HANDED AND LEFT-HANDED FORMS OF SYNTHETIC DEOXYRIBONUCLEIC ACID - SPECTROSCOPIC AND THERMODYNAMIC STUDY

            【外文期刊】 Ray A ; Maiti M ; 《Biochemistry》 1996年35卷23期 7394-7402页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Dna triple helix; Z-transition; Molecular-structure;

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            20. Role of subunit interactions in P450 oligomers in the loss of homotropic cooperativity in the cytochrome P450 3A4 mutant L211F/D214E/F304W

            【外文期刊】 Fernando H ; Davydov DR ; 等 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2007年460卷1期 129-140页 SCISCIE

            【关键词】 cytochrome P450 3A4; allostery; cooperativity;

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            21. The catalytic power of enzymes: Conformational selection or transition state stabilization?

            【外文期刊】 Giraldo J ; Roche D ; 等 《FEBS Letters: For the Rapid Publication of Short Reports in Biochemistry, Biophysics and Molecular Biology》 2006年580卷9期 2170-2177页

            【关键词】 enzyme efficiency; transition state stabilization; substrate conformational selection;

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            22. Role of single-point mutations and deletions on transition temperatures in ideal proteinogenic heteropolymer chains in the gas phase

            【外文期刊】 Olivares-Quiroz, L. ; 《European Biophysics Journal》 2016年45卷5期 393-403页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Conformational phase transitions; Equilibrium statistical mechanics; Ideal heteropolymers;

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            23. Folding of Staphylococcal Nuclease Induced by Binding of Chemically Modified Substrate Analogues Sheds Light on Mechanisms of Coupled Folding/Binding Reactions

            【外文期刊】 Mori, Yujiro ; Mizukami, Takuya ; 等 《Biochemistry》 2023年62卷11期 1670-1678页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CONFORMATIONAL SELECTION; CHYMOTRYPSIN INHIBITOR-2; LIGAND CONCENTRATION;

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