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【中文期刊】 田雅昕 崔丁童 等 《中国卫生统计》 2025年42卷6期 826-834,842页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨图注意力自动编码器框架(spatially resolved transcriptomics with an adaptive graph attention au-to-encoder,STAGATE)在乳腺癌空间转录组学数据中...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Li, You ; Zhang, Guiyang ; 等 《Current Bioinformatics》 2022年17卷6期 483-492页
【关键词】 Graph neural networks;graph convolutional network;graph attention network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Wang, Haiyue ; Ma, Xiaoke ; 2022年23卷3期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 single-cell RNA-seq;auto-encoder;deep subspace clustering;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Qing-Wen Wu ; Jun-Feng Xia ; 等 2021年22卷5期 bbaa391-1-bbaa391-12页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 lncRNA-disease association;graph embedding;graph convolutional network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Niknam G. ; Molaei S. ; 等 《Neural Networks: The Official Journal of the International Neural Network Society》 2023年165卷 596-610页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Attention mechanism;Dynamic graph representation learning;Dynamic node embedding;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Li, Jing ; Zhang, Chen ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2022年20卷5期 MEDLINE
【关键词】 Drug-target interaction;matrix completion;graph convolutional network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Du, Zhi-Hua ; Wu, Yang-Han ; 等 2022年23卷3期 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 transcriptional regulatory network;transcription factor;graph neural network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yao, Heng ; Guan, Jihong ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2020年18卷3期 MEDLINE
【关键词】 Protein-Protein Interaction Network (PIN);protein complex;graph embedding;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lin,Guo ; Xiujuan,Lei ; 等 《Interdisciplinary sciences, computational life sciences》 2023年15卷2期 171-188页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Drug–drug interactions;Graph auto-encoder;Heterogeneous network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Qi,Liang ; Wenxiang,Zhang ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷1期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 feature crossing statistical strategy;graph auto-encoder;learning to rank;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Hang,Xu ; Huazhu,Fu ; 等 《Genome medicine》 2024年16卷1期 12页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Meimei,Liu ; Zhengwu,Zhang ; 等 《NeuroImage》 2021年245卷 118750页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lei,Chen ; Jinghai,Hu ; 等 《Scientific reports》 2026年16卷1期
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jing,Li ; Chen,Zhang ; 等 《Journal of bioinformatics and computational biology》 2022年20卷5期 2250023页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Drug–target interaction;graph auto-encoder;graph convolutional network;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Shuaishuai,Zu ; Li,Li ; 等 《Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society》 2025年187卷 107367页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Contrastive learning;Distribution-dependent regularization;Graph auto-encoder;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Wei,Hong ; Jiao,Yin ; 等 《ISA transactions》 2023年141卷 84-92页SCIMEDLINECA
【关键词】 Graph neural networks;Insider threat;LSTM auto-encoder;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Mingxin,Li ; Yu,Fan ; 等 《Genes》 2022年13卷10期 SCIMEDLINECABP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yuan,Zhu ; Feng,Zhang ; 等 《Methods (San Diego, Calif.)》 2023年211卷 1-9页SCIMEDLINECABP
【关键词】 Cancer metastatic events;Interaction prediction;Variational graph auto-encoder;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yao,Fu ; Runtao,Yang ; 等 《Computers in biology and medicine》 2022年151卷Pt A期 106289页SCIMEDLINEBP
【关键词】 CircRNA-disease association;Graph neural network;Random forest;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bing,Zhang ; Haoyu,Wang ; 等 《BMC bioinformatics》 2024年25卷1期 332页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Deep topological feature extraction;Feature aggregation;Graph convolutional auto-encoder;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Haiyue,Wang ; Xiaoke,Ma ; 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷3期 SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Shijia,Zhou ; Weicheng,Sun ; 等 《Frontiers in genetics》 2021年12卷 781277页
【关键词】 ceRNA network;extreme gradient boosting;feature fusion;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Liangrui,Ren ; Jun,Wang ; 等 《Briefings in functional genomics》 2024年23卷2期 128-137页SCIMEDLINECABP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Tongxuan,Lv ; Yong,Zhang ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷5期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 graph attention auto-encoder;multi-omics integration;multi-omics joint analysis;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bo,Li ; Chen,Peng ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷6期 SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lei,Chen ; Jiahui,Gu ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2024年25卷5期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 graph attention auto-encoder;miRNA;miRNA–disease association;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Fang,Yang ; Kunjie,Fan ; 等 《BMC bioinformatics》 2020年21卷1期 323页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Network embedding;Protein-protein interaction;Representation learning;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Qing-Wen,Wu ; Jun-Feng,Xia ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2021年22卷5期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 graph auto-encoder;graph convolutional network;graph embedding;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ghazaleh,Niknam ; Soheila,Molaei ; 等 《Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society》 2023年165卷 596-610页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Attention mechanism;Dynamic graph representation learning;Dynamic node embedding;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Bowei,Chen ; Sen,Xu ; 等 《Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society》 2023年167卷 118-128页SCIMEDLINEBP
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Jingxuan,Zhao ; Jianqiang,Sun ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷1期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 LncRNA;graph auto-encoder;lncRNA-protein interactions;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yi,Lai ; Ye,Zhu ; 等 《Sensors (Basel, Switzerland)》 2025年25卷2期 SCIMEDLINE
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Asia,Gervits ; Roded,Sharan ; 《Frontiers in bioinformatics》 2022年2卷 1025783页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Heng,Yao ; Jihong,Guan ; 等 《Journal of bioinformatics and computational biology》 2020年18卷3期 2040010页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Protein–Protein Interaction Network (PIN);graph embedding;protein complex;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Lihong,Peng ; Mengnan,Ren ; 等 《Interdisciplinary sciences, computational life sciences》 2024年16卷2期 418-438页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Deep neural network;Dual-net neural network;Graph attention auto-encoder;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Yanhui,Zhang ; Kunjie,Dong ; 等 《Genes》 2025年16卷8期 SCIMEDLINECABP
【关键词】 bio-networks;graph auto-encoder;miRNA biomarker identification;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Ramin,Hasibi ; Tom,Michoel ; 《BMC bioinformatics》 2021年22卷1期 525页SCIMEDLINEBP
【关键词】 Feature auto-encoder;Feature prediction;Gene expression;
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