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            1. Clinical Perspective on Use of Long-Read Sequencing in Prenatal Diagnosis of Thalassemia

            【外文期刊】 Toledo, Diana M. ; Lafferty, Katherine A. ; 《Clinical Chemistry: Journal of the American Association for Clinical Chemists》 2023年69卷3期 211-212页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Thalassemia; long-read sequencing; prenatal diagnostics;

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            2. Draft Genome Resource for the Ex-types of Phytophthora ramorum, P. kernoviae, and P. melonis, Species of Regulatory Concern, Using Ultra-Long Read MinION Nanopore Sequencing

            【外文期刊】 Srivastava, Subodh K. ; Abad, Z. Gloria ; 等 《Molecular Plant-Microbe Interactions》 2020年33卷6期 794-797页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genome; ex-type; high throughput sequencing;

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            3. Nanoblot: an R-package for visualization of RNA isoforms from long-read RNA-sequencing data

            【外文期刊】 Demario S ; Xu K ; 等 《RNA》 2023年29卷8期 1099-1107页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 alternative polyadenylation; alternative splicing; data visualization;

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            4. ELISA-based detection of Open Reading Frame protein 1 in patients at risk of developing lung cancer

            【外文期刊】 《Clinica chimica acta: International journal of clinical chemistry and applied molecular biology》 2020年507卷 1-6页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Open Reading Frame 1 protein; Long-interspersed nuclear element 1; Biomarker;

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            5. Nanopore long-read sequencing of circRNAs

            【外文期刊】 Rahimi, Karim ; Nielsen, Anne Faerch ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2021年196卷 23-29页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CircRNA; Back splice junction; Nanopore sequencing;

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            6. Accelerating the Next Generation Long Read Mapping with the FPGA-Based System

            【外文期刊】 Chen, P. ; Wang, C. ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2014年11卷5期 840-852页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Acceleration; Bioinformatics; Genomics;

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            7. Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus Bacterial Artificial Chromosome Contains a Duplication of a Long Unique-Region Fragment within the Terminal Repeat Region

            【外文期刊】 Yakushko, Yuri ; Hackmann, Christian ; 等 《Journal of Virology》 2011年85卷9期 4612-4617页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 genes; long unique-region fragment; open reading frame 19: ORF-19;

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            8. Comprehensive Analysis of Congenital Adrenal Hyperplasia Using Long-Read Sequencing

            【外文期刊】 Liu, Yingdi ; Chen, Miaomiao ; 等 2022年68卷7期 927-939页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 congenital adrenal hyperplasia; long-read sequencing; comprehensive analysis of congenital adrenal hyperplasia;

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            9. Best Practices in Microbial Experimental Evolution: Using Reporters and Long-Read Sequencing to Identify Copy Number Variation in Experimental Evolution

            【外文期刊】 Spealman, Pieter ; De, Titir ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2023年91卷3期 356-368页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Copy-number variant; Long term experimental evolution; Fluorescent CNV reporter;

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            10. LncRNA-Encoded Short Peptides Identification Using Feature Subset Recombination and Ensemble Learning

            【外文期刊】 Siyuan Zhao ; Jun Meng ; 等 2022年14卷1期 101-112页

            【关键词】 Long non-coding RNA; Short peptides; Short open reading frames;

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            11. Co-occurrences enhance our understanding of aquatic fungal metacommunity assembly and reveal potential host–parasite interactions

            【外文期刊】 Vass Máté ; Eriksson Karolina ; 等 《FEMS Microbiology Ecology》 2022年98卷11期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 coastal marine habitats; ecological network; long-read metabarcoding;

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            12. CReSIL: accurate identification of extrachromosomal circular DNA from long-read sequences

            【外文期刊】 Wanchai Visanu ; Jenjaroenpun Piroon ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2022年23卷6期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CRESIL; eccDNA; long-read sequence;

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            13. Linear: a framework to enable existing software to resolve structural variants in long reads with flexible and efficient alignment-free statistical models

            【外文期刊】 Pan Chenxu ; Rahn René ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷2期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 alignment-free approach; graph generative model; structural variants resolution;

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            14. Verification of CRISPR editing and finding transgenic inserts by Xdrop indirect sequence capture followed by short- and long-read sequencing

            【外文期刊】 Blondal, Thorarinn ; Gamba, Cristina ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2021年191卷 68-77页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Target enrichment; Indirect sequence capture; CRISPR editing validation;

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            15. EVIDENCE THAT THE MURINE AIDS DEFECTIVE VIRUS DOES NOT ENCODE A SUPERANTIGEN

            【外文期刊】 Doyon L. ; Sekaly RP. ; 等 《Journal of Virology》 1996年70卷1期 1-9页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Retrovirus-induced immunodeficiency; Mammary-tumor virus; Cd4+ t-cells;

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            16. Genome projects in invasion biology

            【外文期刊】 McCartney, MA ; Mallez, S ; 等 2019年20卷6期 1201-1222页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Invasion genomics; Invasive species; Population genomics;

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            17. HLA Class I Analysis Provides Insight Into the Genetic and Epigenetic Background of Immune Evasion in Colorectal Cancer With High Microsatellite Instability

            【外文期刊】 Kawazu, Masahito ; Ueno, Toshihide ; 等 《Gastroenterology》 2022年162卷3期 799-812页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer; Class I Major Histocompatibility Complex; Antitumor Immunity;

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            18. High-resolution characterization of the gut microbiota of neonatal dairy calves using full-length 16S rRNA gene amplicon sequencing

            【外文期刊】 Hawkins, Jalyn G. ; Carpenter, Shelby ; 等 2024年102卷 70-71页

            【关键词】 dairy calves; gut microbiota; long-read sequencing;

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            19. Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for long-read sequencing of single molecules

            【外文期刊】 Mayjonade, Baptiste ; Gouzy, Jerome ; 等 《BioTechniques》 2016年61卷4期 203-205页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 DNA extraction; long-read sequencing; PacBio;

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            20. Genome size evolution: towards new model systems for old questions

            【外文期刊】 Blommaert, Julie ; 《Proceedings of the Royal Society. Biological sciences》 2020年287卷1933期

            【关键词】 genomics; next-generation sequencing; long-read sequencing;

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            21. Reference genome of Townsend's big-eared bat, Corynorhinus townsendii

            【外文期刊】 Capel, Samantha L. R. ; Hamilton, Natalie M. ; 等 《The Journal of Heredity》 2024年115卷2期 203-211页

            【关键词】 California Conservation Genomics Project; CCGP; Chiroptera;

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            22. Exploration of whole genome amplification generated chimeric sequences in long-read sequencing data

            【外文期刊】 Lu Na ; Qiao Yi ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chimeric sequence; long-reads sequencing; multiple displacement amplification;

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            23. Incorporating the plasmidome into antibiotic resistance surveillance in animal agriculture

            【外文期刊】 Ricker, N. ; Spoja, B. S. ; 等 《Plasmid: An International Journal Devoted to Extrachromosomal Gene Systems》 2021年113卷

            【关键词】 Metagenomics; Long-read sequencing; Resistance plasmid;

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            24. Detecting PKD1 variants in polycystic kidney disease patients by single-molecule long-read sequencing

            【外文期刊】 Borras, Daniel M. ; Vossen, Rolf H. A. M. ; 等 《Human mutation》 2017年38卷7期 870-879页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ADPKD; complex genomic regions; DNA diagnostics;

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            25. DMD exon 2 duplication due to a complex genomic rearrangement is associated with a somatic mosaicism

            【外文期刊】 Kubota A. ; Ishiura H. ; 等 2022年32卷3期 263-269页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Complex rearrangements; Droplet digital PCR; Dystrophinopathy;

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            26. The Chromosome-Scale Genome Resource for Two Endophytic Fusarium species, F. culmorum and F. pseudograminearum

            【外文期刊】 Shan, Xiaoliang ; Zhu, Ying ; 等 《Molecular Plant-Microbe Interactions》 2021年34卷6期 703-706页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 fungal endophytes; long-read assembly; mitogenome;

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            27. JC Polyomavirus Whole Genome Sequencing at the Single-Molecule Level Reveals Emerging Neurotropic Populations in Progressive Multifocal Leukoencephalopathy

            【外文期刊】 L'honneur, Anne-Sophie ; Da Fonseca, Juliana Pipoli ; 等 《The Journal of Infectious Diseases》 2022年226卷7期 1151-1161页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 JC polyomavirus; neurotropic; progressive multifocal leukoencephalopathy;

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            28. Ribosomal profiling adds new coding sequences to the proteome

            【外文期刊】 Mumtaz, Muhammad Ali S. ; Couso, Juan Pablo ; 《Biochemical Society Transactions》 2015年43卷6期 1271-1276页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 long non-coding ribonucleic acid (ncRNA); NGS sequencing of footprints from polysome fractions (Poly-Ribo-Seq); proteome;

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            29. Long-read genome assembly and genetic architecture of fruit shape in the bottle gourd

            【外文期刊】 Pei Xu ; Ying Wang ; 等 2021年107卷3期 956-968页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 bottle gourd; fruit shape; functional mapping;

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            30. FEASIBILITY, FACTOR STRUCTURE AND CONSTRUCT VALIDITY OF THE EASY-READ ADULT SOCIAL CARE OUTCOMES TOOLKIT (ASCOT-ER)

            【外文期刊】 Rand, S. ; Towers, A. -M. ; 等 《Journal of intellectual disability research: JIDR》 2019年63卷7期 846-846页 MEDLINE

            【关键词】 ASCOT; Easy Read; SCRQoL;

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            31. Heterochromatin-Enriched Assemblies Reveal the Sequence and Organization of the Drosophila melanogaster Y Chromosome

            【外文期刊】 Chang, Ching-Ho ; Larracuente, Amanda M. ; 《Genetics: A Periodical Record of Investigations Bearing on Heredity and Variation》 2019年211卷1期 333-348页

            【关键词】 Drosophila melanogaster genome; Y chromosome; long-read assembly;

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            32. A chromosome-level genome assembly for the dugong (Dugong dugon)

            【外文期刊】 Baker, Dorothy Neve ; Abueg, Linelle ; 等 《The Journal of Heredity》 2024年115卷2期 212-220页

            【关键词】 conservation; long-read assembly; marine mammals;

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            33. Complete genome sequences of pooled genomic DNA from 10 marine bacteria using PacBio long-read sequencing

            【外文期刊】 Song, Weizhi ; Thomas, Torsten ; 等 《Marine genomics》 2019年48卷 35-43页

            【关键词】 Marine bacteria; Genome assembly; PacBio long-read sequencing;

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            34. Evidence of structural rearrangements in ESBL-positive pESI(like) megaplasmids of S.Infantis

            【外文期刊】 Alba, Patricia ; Carfora, Virginia ; 等 《FEMS Microbiology Letters》 2023年370卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Salmonella Infantis; megaplasmid; long read sequencing;

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            35. Improving the genome assembly of rabbits with long-read sequencing

            【外文期刊】 Bai, Yiqin ; Bai Y. ; 等 《Genomics》 2021年113卷5期 3216-3223页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Gap closing; Long-read sequencing; Rabbit genomes;

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            36. Identification and expression profiling of genes involved in circaelan clock regulation in red dragon fruit (Hylocereus polphizus) by full-length transcriptome sequencing

            【外文期刊】 Ma, Huaqing ; Wu, Jiao ; 等 《Plant signaling & behavior》 2021年16卷6期

            【关键词】 Red dragon fruit (hylocereus polyrhizus); circadian clock; smrt long-read sequencing;

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            37. Resistance profile of HIV-1 quasispecies in patients under treatment failure using single molecule, real-time sequencing

            【外文期刊】 Monaco, Daniela C. ; Zapata, Lucas ; 等 2020年34卷15期 2201-2210页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 HIV drug resistance; long-read next-generation sequencing; phasing;

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            38. Genome analysis of Zoysia japonica ‘Yaji’ cultivar using PacBio long-read sequencing

            【外文期刊】 Yang Dae-Hwa ; Jeong Ok-Cheol ; 等 《Plant biotechnology reports》 2023年17卷2期 275-283页

            【关键词】 NGS; PacBio-based long-read; Zoysia japonica;

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            39. CIRCexplorer pipelines for circRNA annotation and quantification from non-polyadenylated RNA-seq datasets

            【外文期刊】 Ma, Xu-Kai ; Xue, Wei ; 等 2021年196卷 3-10页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Circular RNA; CircRNA; CIRCexplorer;

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            40. Aberrant splicing of PSEN2, but not PSEN1, in individuals with sporadic Alzheimer's disease

            【外文期刊】 Course, Meredith M. ; Gudsnuk, Kathryn ; 等 《Brain: A journal of neurology》 2023年146卷Pt.2期 507-518页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Alzheimer's disease; long-read Iso-Seq; alternative splicing;

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