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【中文期刊】 Lance M.O'Connor Blake A.O'Connor 等 《药物分析学报（英文版）》 2023年13卷8期 836-850页SCIMEDLINECSCDCA
【摘要】 Bioinformatic analysis of large and complex omics datasets has become increasingly useful in modern day biology by provi...
【关键词】 Multi-omics integration；Systems bioinformatics；Data mining；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Qian Zhang Mingran Yang 等 《癌症生物学与医学（英文版）》 2024年21卷4期 312-330页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Gastric cancer(GC),the fifth most common cancer globally,remains the leading cause of cancer deaths worldwide.Inflammati...
【关键词】 Gastric cancer；inflammation-induced tumorigenesis；multi-omics；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Kelin Wang Muhammad Ali Abid 等 《分子植物（英文版）》 2023年1期 279-293页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Genomic prediction is an effective way to accelerate the rate of agronomic trait improvement in plants.Traditional metho...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Xiaomeng Xue Feng Li 等 《定量生物学（英文版）》 2024年12卷2期 173-181页
【摘要】 The identification of tumor driver genes facilitates accurate cancer diagnosis and treatment,playing a key role in preci...
【关键词】 cancer driver genes；feature extraction；multi-omics data；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Yuanpeng Xiong Xuan He 等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷3期 275-286页
【摘要】 Background:Chromatin-associated RNA(caRNA)acts as a ubiquitous epigenetic layer in eukaryotes,and has been reported to b...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Shao-Wu Zhang Jing-Yu Xu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 928-938页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Identification of cancer driver genes plays an important role in precision oncology research,which is helpful to underst...
【关键词】 Driver gene；Directed graph convolutional network；Multilayer perceptron；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王彤 杨琪 等 《中国卫生统计》 2025年42卷4期 502-509页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 提出基于一致性聚类集成的多组学数据整合方法(multi-omics data integration with consensus clus-tering ensemble,MICCE),探讨MICCE方法在低级别胶质瘤(lower-...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何海斌 马佳宏 等 《生命科学研究》 2025年29卷3期 216-223页ISTICCA
【摘要】 肺腺癌作为常见的肺癌亚型之一,预后较差,对其进行精准分型有助于指导治疗.本文介绍了肺腺癌分型的主流方法,即其根据数据来源可以分为基于表型特征和分子特征的分类方法,根据数据类型的数量可以分为基于单一组学和整合多种组学的分类方法,并总结了不同方...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 章子怡 王棨临 等 《遗传》 2024年46卷10期 820-832页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 乳腺癌的高度异质性导致其治疗及预后评估较为复杂.治疗方案的选择受到肿瘤亚型、病变分级、基因型等多种因素的影响,因此需要制定个体化治疗策略.患者的预后效果因病情不同而产生显著差异.作为人工智能的一个重要分支,机器学习能高效处理海量数据,并实现...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 师国京 李灵梅 等 《中国卫生统计》 2024年41卷3期 376-381页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(im-prov...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 徐琪 禹雷 等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李思慧 刘书庆 等 《中国中医药信息杂志》 2024年31卷2期 64-69页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 基于ACU&MOX-DATA平台,初步明确不同腧穴、不同靶器官及不同刺灸法对腧穴功效的影响,并可视化展示相关结果是否存在腧穴功效"特性""共性"的特点.方法 以原创组学数据和公共组学数据整合后获得的多源异构数据作为数据源,经标准化处理...
- 概要：
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【中文期刊】 张甜甜 赵庶旭 等 《计算机应用与软件》 2024年41卷6期 79-84页
【摘要】 肝癌是威胁人类健康的常见恶性肿瘤之一.通过对基因数据使用深度学习方法进行整合来系统地获取对肝癌的认知,使用多组学的疾病分析方法来探究各组学之间的相互关系,有助于更准确的临床决策.然而,由于多组学数据具有高维稀疏性,存在大量的冗余特征和较少的...
- 概要：
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【中文期刊】 李兵 赵钰文 等 《数字中医药（英文版）》 2024年7卷4期 309-319页
【摘要】 方剂组学作为一种新兴的研究范式,从整体和系统的角度探索了基于多组学的方剂药理机制的研究.本文回顾了方剂组学的最新进展,重点介绍了相关数据库和分析平台、方法创新及转化应用.通过整合方剂和多组学数据,研究者从单靶点分析、信号通路、多靶点网络和靶...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 龚海燕 张晓彤 等 《工程科学学报》 2024年46卷2期 279-289页
【摘要】 随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科交叉联合分析的基石....
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 秦双双 韦坤华 等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1383-1395页ISTICCSCDCA
【摘要】 药用植物 4.0 是信息技术、生物技术与药用植物高度融合的技术创新体系.基于药用植物跨组学生物学、药效学数据采集与挖掘,药用植物 4.0 搭建了药用植物跨组学大数据平台,通过跨组学大数据的集成与分析,解读药用植物形态、生态、组学与药效,以及...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 宫慧敏 邱望仁 《生物医学工程学进展》 2023年44卷4期 338-346页CA
【摘要】 该文基于测序技术和人类基因组计划的不断发展,对医学工作者和生物信息工作者在肺腺癌领域取得的成果进行归纳分析,阐述了肺腺癌标志物的研究进展等.该文首先介绍了传统通过血清检测的肺腺癌标志物的研究进展,梳理了传统标志物从单一检测到联合检测的发展过...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 Weihua Yue Hailiang Huang 等 《医学评论（英文）》 2022年4期 385-416页
【摘要】 Schizophrenia(SCH)is a complex and severe mental disorder with high prevalence,disability,mor-tality and carries a heavy...
【关键词】 accurate diagnosis；multi-omics data；objective biomarkers；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 吕俊杰 王科俊 等 《生物学杂志》 2018年35卷3期 80-83页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 可变剪接现象广泛存在于哺乳动物中.最新的研究数据表明,人类基因约95％的外显子都能够产生可变剪接,随着高通量测序技术和生物信息学技术的不断发展,人们对可变剪接的研究逐步从单个基因深入到组学层面,高通量组学数据的不断涌现,各组学数据之间的相互...
- 概要：
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【中文期刊】 王念 俞成诚 等 《中国中药杂志》 2025年50卷1期 278-284页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着大数据和人工智能技术的发展,组学技术在中医药研究中的广泛应用生成了大型实验数据集,跨尺度寻找海量数据之间的关联成为可能,由此也逐步进入数据密集型研究范式.重视技术及算力工具的多组学数据融合分析模式作为新兴方法之一,或许是该领域的突破点....
- 概要：
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【中文期刊】 朱岩 张志丹 等 《生物工程学报》 2025年41卷3期 1152-1178页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 生物制造是新质生产力的重要代表,是通过工程细胞或无细胞体系实现物质高效转化的创新生产方式.其生产过程具有时空异质性、复杂性及动态性,给过程系统认知、优化调控带来了显著挑战.本文总结了生物过程多组学数据获取及分析的关键技术,归纳了基于多组学数...
- 概要：
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【中文期刊】 Shaopan Ye Jiaqi Li 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2021年12卷2期 508-519页
【摘要】 Background:Presently, multi-omics data (e.g., genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics) are available to ...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨穗碧 杨杰 等 《中华重症医学电子杂志》 2025年11卷2期 134-138页
【摘要】 重症医学是一个多学科和跨专业的专业，致力于全面管理患有或有风险发展为急性、危及生命的器官功能障碍的患者。长期以来，该学科面临着多种急危重综合征异质性的重大挑战，这一难题导致随机对照试验在相关疾病研究中屡屡受挫，对群体的治疗效果进行探索难以识...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Zhitao Tian Jingqi Jia 等 《遗传学报》 2024年51卷7期 714-722页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Metabolic network construction plays a pivotal role in unraveling the regulatory mechanism of biological ac-tivities,alt...
【关键词】 Metabolic network；Chemical modification；Genetic study；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李兵 于亚南 等 《中国中药杂志》 2024年49卷13期 3414-3420页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 模块药理学通过对多维度、多靶点生物网络的系统解构阐释疾病复杂机制和药物多靶点相互作用关系,在疾病发生发展机制、病证生物学基础、中药多靶点药理机制解析、方剂组方配伍规律研究、中药复方新药发现等领域取得了应用进展.多组学数据和生物网络的复杂性特...
- 概要：
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【中文期刊】 Binyu Yang Siying Liu 等 《定量生物学（英文版）》 2024年12卷2期 182-196页
【摘要】 Molecular subtyping of gastric cancer(GC)aims to comprehend its genetic landscape.However,the efficacy of current subtyp...
【关键词】 DNA alterations；gastric cancer；hierarchical classification；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 Ali Yetgin 《Quantitative Biology》 2025年13卷3期 e70002页
【摘要】 Our understanding of intricate biological systems has been completely transformed by the development of multi-omics appr...
【关键词】 artificial intelligence；data processing；deep learning；
- 概要：
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【中文期刊】 刘阳 白卉 等 《生物化学与生物物理进展》 2016年43卷10期 923-935页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 作为功能基因组学中重要的组成部分,基因表达谱在生物学、医学和药物研发等多个领域发挥着重要作用.特别是随着精准医疗概念的提出,整合多组学数据用于个性化医疗是未来的发展趋势.本文从基因表达谱的基本概念出发,重点介绍面向药物发现的基因表达谱分析方...
- 概要：
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【中文期刊】 Zhuxia Li Guangdun Peng 《生物物理学报(英文)》 2022年8卷3期 119-135页
【摘要】 Cells and tissues are exquisitely organized in a complex but ordered manner to form organs and bodies so that individual...
【关键词】 Spatial transcriptomics；Spatial data analysis；Spatial multi-omics；
- 概要：
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【中文期刊】 Mang Liang Bingxing An 等 《畜牧与生物技术杂志（英文版）》 2023年14卷1期 88-97页
【摘要】 Background: Genomic selection (GS) has revolutionized animal and plant breeding after the first implementation via early...
【关键词】 BLUP；Cosine kernel；Genomic prediction；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 Siyu Li Xinhao Zhuang 等 《蛋白质与细胞》 2025年16卷5期 374-380页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Dear Editor,The breakthrough in single-cell omics sequencing tech-nologies has provided an unprecedented level of detail...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Bingjie Wu Huijuan Xiong 等 《遗传学报》 2025年52卷6期 839-847页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Phenotypic prediction is a promising strategy for accelerating plant breeding.Data from multiple sources(called multi-vi...
【关键词】 Multi-view data；Best linear unbiased prediction；Similarity function；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Jiazhen Zheng Yue Li 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2023年6卷6期 1149-1162页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Streptomycetes possess numerous gene clusters and the potential to produce a large amount of natural products.Histone de...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 Xabier Martinez-de-Morentin Sumeer A.Khan 等 《定量生物学（英文版）》 2023年11卷3期 246-259页
【摘要】 Background:Single-cell multi-omics technologies allow a profound system-level biology understanding of cells and tissues...
【关键词】 single-cell；multi-omic；Autoencoder；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Chen, Jiazhou ; Han, Guoqiang ; 等 《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》 2020年67卷4期 987-998页
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Pucher, Bettina M. ; Zeleznik, Oana A. ; 等 《Nature reviews neuroscience》 2019年20卷2期 671-681页SCISCIE
【关键词】 data integration;sparse canonical correlation analysis;non-negative matrix factorization;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Douglas McCloskey ; Sibei Xu ; 等 《Metabolic engineering》 2018年48卷 82-93页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Adaptive laboratory evolution;tpiAgene knockout;Mutation analysis;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 Chuanjie Zhang ; Luping Shen ; 等 《Journal of cellular physiology.》 2020年235卷4期 3849-3863页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 bladder urothelial carcinoma;immune infiltrates;multi-omics data;
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【外文期刊】 RonglaiShen ; Keith SChan ; 等 《Biostatistics》 2018年19卷1期 71-86页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Multi-type omics data;Integrative clustering;iCluster;
- 概要：
- 方法：
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