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            1. Testing complete plastomes and nuclear ribosomal DNA sequences for species identification in a taxonomically difficult bamboo genus Fargesia

            【中文期刊】 Shi-Yu Lv Xia-Ying Ye  等 《植物多样性（英文版）》 2023年45卷2期 147-155页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Fargesia,the largest genus within the temperate bamboo tribe Arundinarieae,has more than 90 species mainly distributed i...

            【关键词】 Fargesia； Genome-skimming； DNA barcoding；

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            2. Phylogenomic and comparative analyses of Rheum(Polygonaceae,Polygonoideae)

            【中文期刊】 Hua-Jie Zhang Xu Zhang  等 《植物分类学报》 2022年60卷6期 1229-1240页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【关键词】 incomplete lineage sorting and hybridization； molecular marker； phylogenomic；

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            3. Plastid RNA editing reduction accompanied with genetic variations in Cymbidium,a genus with diverse lifestyle modes

            【中文期刊】 Mengqing Zhe Le Zhang  等 《植物多样性（英文版）》 2022年44卷3期 316-321页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Recent sequencing efforts have broadly uncovered the evolutionary trajectory of plastid genomes(plastomes)of flowering p...

            【关键词】 RNA editing； Plastomes； ndh genes；

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            4. Plastome sequencing of Myripnois dioica and comparison within Asteraceae

            【中文期刊】 《植物多样性（英文）》 2019年41卷5期 315-322页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 Myripnois is a monotypic shrub genus in the daisy family constricted to northern China. Although wild populations of Myr...

            【关键词】 Myripnois； Asteraceae； Plastomes；

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            5. Chloroplast phylogenomics of the New World grape species (Vitis, Vitaceae)

            【中文期刊】 《植物分类学报》 2018年56卷4期 297-308页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【关键词】 grape genus； phylogenomics； plastomes；

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            6. Unprecedented Parallel Photosynthetic Losses in a Heterotrophic Orchid Genus

            【外文期刊】 Barrett, Craig F. ; Sinn, Brandon T. ; 等 《Molecular biology and evolution》 2019年36卷9期 1884-1901页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 heterotroph; phylogenomics; plastome;

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            7. INTERSPECIFIC ALBINO AND VARIEGATED HYBRIDS IN THE GENUS ZANTEDESCHIA

            【外文期刊】 Yao JL. ; Rowland RE. ; 等 《Plant Science: An International Journal of Experimental Plant Biology》 1995年109卷2期 199-206页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Embryo rescue; Interspecific hybrids; Plastome genome incompatibility;

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            8. Chloroplast genome sequence of Pandanus odorifer (Forssk.) Kuntze: genome features, mutational hotspots and phylogenetic analyses

            【外文期刊】 Darshetkar, Ashwini M. ; Patil, Swaranjali S. ; 等 《Biologia: Casopis Slovenskej Akademie Vied》 2022年77卷12期 3397-3412页

            【关键词】 Gene composition; Nucleotide diversity; Pandanus;

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            9. Dark-colored Oncocyclus irises in Israel analyzed by AFLP, whole chloroplast genome sequencing and species distribution modeling

            【外文期刊】 Volis, Sergei ; Zhang, Yonghong ; 等 2022年68卷1/4期 43-53页

            【关键词】 Oncocyclus; phylogeny; plant conservation;

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            10. A novel chloroplast gene reported for flagellate plants

            【外文期刊】 Song Michael ; Kuo Li‐Yaung ; 等 《American journal of botany》 2018年105卷1期 117-121页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Adiantum shastense; open reading frame ( ORF ); plastome;

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            11. Can plastid genome sequencing be used for species identification in Lauraceae?

            【外文期刊】 Liu, Zhi-Fang ; Ma, Hui ; 等 《Botanical Journal of the Linnean Society》 2021年197卷1期 1-14页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 cytonuclear discordance; DNA barcoding; nrDNA;

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            12. A point mutation in the photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 gene confers variegation inHelianthus annuusL

            【外文期刊】 Azarin, Kirill ; Usatov, Alexander ; 等 《Plant Molecular Biology》 2020年103卷4/5期 373-389页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Helianthus annuus; Variegation; Plastom mutations;

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            13. Characterization of the complete chloroplast genome sequence of <Emphasis Type="Italic">Cardamine macrophylla</Emphasis> (Brassicaceae)

            【外文期刊】 Ting Ren ; Yanci Yang ; 等 《Conservation Genetics Resources》 2018年10卷4期 627-630页

            【关键词】 Cardamine macrophylla; Plastome; Illumina sequencing;

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            14. A multi-step comparison of short-read full plastome sequence assembly methods in grasses

            【外文期刊】 Wysocki, WP ; Clark, LG ; 等 《Taxon》 2014年63卷4期 899-910页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 ACRE; DE NOVO ASSEMBLY; NEXT-GENERATION SEQUENCING;

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            15. Phylogenomics, molecular evolution, and estimated ages of lineages from the deep phylogeny of Poaceae

            【外文期刊】 Jones, Samuel S. ; Burke, Sean V. ; 等 《Plant Systematics and Evolution》 2014年300卷6期 1421-1436页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Pharoideae; Poaceae; Puelioideae;

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            16. Plastome sequencing of a 167-year-old herbarium specimen and classical morphology resolve the systematics of two potentially extinct grass species

            【外文期刊】 Hardion, Laurent ; Verlaque, Regine ; 等 《Botanical Journal of the Linnean Society》 2021年195卷2期 115-123页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Arundinoideae; herbaria; Leptagrostis;

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            17. An intact plastid genome is essential for the survival of colorless Euglena longa but not Euglena gracilis

            【外文期刊】 Hadariova, Lucia ; Vesteg, Matej ; 等 《Current Genetics: Eukaryotes with Emphasis on Yeasts, Fungi, Mitochondria, Plastids》 2017年63卷2期 331-341页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Antibiotics; Astasia; Bleaching;

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            18. Plastome based phylogenetics and younger crown node age in Pelargonium

            【外文期刊】 van de Kerke, Sara J. ; Shrestha, Bikash ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年137卷 33-43页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Pelargonium; Geraniaceae; Phylogeny;

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            19. Navigating the tip of the genomic iceberg: next-generation sequencing for plant systematics. (Special Issue: Methods and applications of next-generation sequencing in botany.)

            【外文期刊】 Straub, S. C. K. ; Parks, M. ; 等 《American journal of botany》 2012年99卷2期 349-364页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Asclepias; chloroplast content; genome skimming;

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            20. Disentangling a 40-year-old taxonomic puzzle: the phylogenetic position of Mimulicalyx (Lamiales)

            【外文期刊】 Zhao, Fei ; Liu, Bing ; 等 《Botanical Journal of the Linnean Society》 2023年201卷2期 135-153页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Lamiales; molecular systematics; Phrymaceae;

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            21. Plastid phylogenomic insights into the evolution of Caryophyllales

            【外文期刊】 Yao, Gang ; Jin, Jian-Jun ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年134卷 74-86页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Caryophyllales; Gene loss; Molecular dating;

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            22. Construction of DNA Tools for Hyperexpression in Marchantia Chloroplasts

            【外文期刊】 Frangedakis, Eftychios ; Guzman-Chavez, Fernando ; 等 《ACS Synthetic Biology》 2021年10卷7期 1651-1666页

            【关键词】 Marchantia; plant; chloroplast;

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            23. Phylogenetic relationships in two African Cedreloideae tree genera (Meliaceae) reveal multiple rain/dry forest transitions

            【外文期刊】 Monthe, Franck K. ; Migliore, Jeremy ; 等 《Perspectives in plant ecology, evolution and systematics》 2019年37卷 1-10页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Biome shift; Cedreloideae; Diversification;

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            24. Piecing together the puzzle of parasitic plant plastome evolution

            【外文期刊】 Krause, K. ; 《Planta: An International Journal of Plant Biology》 2011年234卷4期 647-656页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Gene losses; Intron losses; Parasitic plants;

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            25. Highly accelerated rates of genomic rearrangements and nucleotide substitutions in plastid genomes of Passiflora subgenus Decaloba

            【外文期刊】 Shrestha, Bikash ; Weng, Mao-Lun ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2019年138卷 53-64页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Passifloraceae; Plastome; IR expansion/contraction;

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            26. Plastome evolution and phylogenetic relationships among Malvaceae subfamilies

            【外文期刊】 Wang, Jian-Hua ; Moore, Michael J. ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2021年765卷

            【关键词】 Malvaceae; Plastome; Genome structure;

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            27. A comparative study across the parasitic plants of Cuscuta subgenus Grammica (Convolvulaceae) reveals a possible loss of the plastid genome in its section Subulatae

            【外文期刊】 Banerjee, Arjan ; Stefanovic, Sasa ; 《Planta: An International Journal of Plant Biology》 2023年257卷4期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cuscuta; Dodder; Grammica;

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            28. The complete plastome sequence of Rubus takesimensis endemic to Ulleung Island, Korea: Insights into molecular evolution of anagenetically derived species in Rubus (Rosaceae)

            【外文期刊】 Yang, Ji Young ; Pak, Jae-Hong ; 等 《Gene: An International Journal Focusing on Gene Cloning and Gene Structure and Function》 2018年668卷 221-228页

            【关键词】 Rubus takesimensis; Ulleung Island; Plastome;

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            29. Phylogenetic signal detection from an ancient rapid radiation: Effects of noise reduction, long-branch attraction, and model selection in crown clade Apocynaceae

            【外文期刊】 Straub, Shannon C. K. ; Moore, Michael J. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2014年80卷 169-185页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Apocynaceae; Long-branch attraction; Next-generation sequencing;

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            30. Rapid sequence evolution is associated with genetic incompatibilities in the plastid Clp complex

            【外文期刊】 Abdel-Ghany, Salah E. ; LaManna, Lisa M. ; 等 2022年108卷3期 277-287页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 clpP; Cytonuclear coevolution; Epistasis;

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            31. Characterization of the complete chloroplast genome of <Emphasis Type="Italic">Dalbergia odorifera</Emphasis> (Leguminosae), a rare and critically endangered legume endemic to China

            【外文期刊】 Hafiz Muhammad Wariss ; Ting-Shuang Yi ; 等 《Conservation Genetics Resources》 2018年10卷3期 527-530页

            【关键词】 Dalbergia odorifera; Endangered species; Plastome;

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            32. Sequencing of the plastome in the leafless green mycoheterotroph Cymbidium macrorhizon helps us to understand an early stage of fully mycoheterotrophic plastome structure

            【外文期刊】 Kim, Hyoung T. ; Shin, Chang-Ho ; 等 《Plant Systematics and Evolution》 2018年304卷2期 245-258页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Cymbidium macrorhizon; Mycoheterotroph; ndh genes;

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            33. Plastid genomes reveal support for deep phylogenetic relationships and extensive rate variation among palms and other commelinid monocots

            【外文期刊】 Barrett, Craig F. ; Baker, William J. ; 等 《The New Phytologist》 2016年209卷2期 855-870页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Arecaceae; chloroplast; Palmae;

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            34. The first complete plastome sequence of the basal asterid family Styracaceae (Ericales) reveals a large inversion

            【外文期刊】 《Plant Systematics and Evolution》 2017年303卷1期 61-70页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Alniphyllum eberhardtii; Ericales; Inversion;

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            35. Exploration of Plastid Phylogenomic Conflict Yields New Insights into the Deep Relationships of Leguminosae

            【外文期刊】 《Systematic Biology》 2020年69卷4期 613-622页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Leguminosae; maximum likelihood; phylogenetic conflict;

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            36. Combining high-throughput sequencing and targeted loci data to infer the phylogeny of the "Adenocalymma-Neojobertia" clade (Bignonieae, Bignoniaceae)

            【外文期刊】 Fonseca, Luiz Henrique M. ; Lohmann, Lucia G. ; 《Molecular phylogenetics and evolution》 2018年123卷 1-15页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Neotropics; Ancestral character states; Genome skimming;

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            37. Chloroplast transcription, untangling the Gordian Knot

            【外文期刊】 Kindgren, Peter ; Strand, Asa ; 《The New Phytologist》 2015年206卷3期 889-891页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 chloroplast; development; plastid encoded RNA polymerase (PEP);

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            38. Chloroplast genome assembly of Handroanthus impetiginosus: comparative analysis and molecular evolution in Bignoniaceae

            【外文期刊】 Sobreiro, Mariane B. ; Vieira, Lucas D. ; 等 2020年252卷5期 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Branch-site selection; Codon usage; Comparative genomics;

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            39. A few-gene plastid phylogenetic framework for mycoheterotrophic monocots

            【外文期刊】 《American journal of botany》 2016年103卷4期 692-708页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 achlorophyllous plants; Asparagales; Dioscoreales;

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            40. Comparison of effectiveness of 5 '-regulatory sequences in transplastomic tobacco chloroplasts

            【外文期刊】 《Transgenic research》 2017年26卷1期 65-75页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Plastome transformation; Plastome promoters; Plastome 5 '-UTR;

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