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            1. 李氏大足蝗线粒体全基因组序列分析

            【中文期刊】 高佳 程春花  等 《动物学研究》 2009年30卷6期 603-612页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

            【摘要】 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测全序列.结果表明,李氏大足蝗的线粒体基因组全长15597 bp,A+T含量为74.8%,37个基因位置与飞蝗的一致,基因间隔序列共计17处105 bp,间隔长度从1～21 bp不等;有10对基因间存在58...

            【关键词】 线粒体基因组； rRNA二级结构； 李氏大足蝗；

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            2. Structural diversity of eukaryotic 18S rRNA and its impact on alignment and phylogenetic reconstruction

            【中文期刊】 《蛋白质与细胞》 2011年02卷2期 161-170页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 Ribosomal RNAs are important because they catalyze the synthesis of peptides and proteins. Comparative studies of the se...

            【关键词】 secondary structure diversity； tertiary structure diversity； 18S rRNA；

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            3. Aerofilum fasciculatum gen. nov., sp. nov. (Oculatellaceae) and Euryhalinema pallustris sp. nov. (Prochlorotrichaceae) isolated from an Indian mangrove forest

            【外文期刊】 Chakraborty, Sandeep ; Maruthanayagam, Veerabadhran ; 等 2021年522卷 165-186页

            【关键词】 Aerofilum; Euryhalinema; cyanobacteria;

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            4. Phylogeny and Establishment of a New Ciliate Family, Wilbertomorphidae fam. nov (Ciliophora, Karyorelictea), a Highly Specialized Taxon Represented by Wilbertomorpha colpoda gen. nov., spec. nov.

            【外文期刊】 Xu, Yuan ; Li, Jiamei ; 等 《The Journal of Eukaryotic Microbiology》 2013年60卷5期 480-489页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 AU test; Loxodida; marine ciliates;

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            5. Molecular Phylogeny and Diversity of the Salt-Tolerant Alkaliphilic Actinobacteria Inhabiting Coastal Gujarat, India

            【外文期刊】 Gohel, S. D. ; Singh, S. P. ; 《Geomicrobiology journal》 2018年35卷6/10期 775-789页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Salt tolerant alkaliphilic actinobacteria; PCR-DGGE; Secondary structure analysis;

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            6. Phylogeny and characterisation of Nannochloropsis oceanica var. sinensis var. nov. (Eustigmatophyceae), a new oleaginous alga from China

            【外文期刊】 Shaona Cao ; Xiaowen Zhang ; 等 《Phycologia》 2013年52卷6期 573-577页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 18S rRNA; Eicosapentaenoic acid; Fatty acid analysis;

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            7. Phylogenetic insights into the diversity of homocytous cyanobacteria from Amazonian rivers

            【外文期刊】 Diego Bonaldo Genuário ; Marcelo Gomes Mar?al Vieira Vaz ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2017年116卷 120-135页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Alkalinema; Brazil; Cephalothrix;

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            8. Nucleotide Sequence and Secondary Structure of 5S rRNA from Sphingobium chungbukense DJ77

            【外文期刊】 Hae-Ryong Kwon ; Young-Chang Kim ; 《The journal of microbiology》 2007年45卷1期 79-82页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5S ribosomal RNA; Sphingobium chungbukense; secondary structure;

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            9. Yogsothoth knorrus gen. n., sp n. and Y. carteri sp n. (Yogsothothidae fam. n., Haptista, Centroplasthelida), with Notes on Evolution and Systematics of Centrohelids

            【外文期刊】 Shishkin, Yegor ; Drachko, Daria ; 等 《Protist》 2018年169卷5期 682-696页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Heliozoa; centrohelids; cell coverings;

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            10. Is there a molecular key to the level of "biological species" in eukaryotes? A DNA guide

            【外文期刊】 Coleman AW ; 《Molecular phylogenetics and evolution》 2009年50卷1期 197-203页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Biological species; Interbreeding limits; ITS-2;

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            11. The systematic position of Paraspathidium Noland, 1937 (Ciliophora, Litostomatea?) inferred from primary SSU rRNA gene sequences and predicted secondary rRNA structure

            【外文期刊】 Zhang, Q. ; Yi, Z. ; 等 《European Journal of Protistology》 2010年46卷4期 280-288页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Paraspathidium; Phylogeny; Plagiopylea;

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            12. Marinilactibacillus piezotolerans sp. nov., a novel marine lactic acidbacterium isolated from deep subseafloor sediment of the NankaiTrough

            【外文期刊】 Toffin L ; Zink K ; 等 《International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology》 2005年55卷1期 345-351页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 New species; Lactate; Phylogeny;

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            13. Phylogenetic analysis of the family Thermaceae with an emphasis on signature position and secondary structure of 16S rRNA

            【外文期刊】 Chen CY. ; Zhao SL. ; 等 《FEMS Microbiology Letters》 2003年221卷2期 293-298页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Thermacea; 16s rrna; Signature position;

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            14. The search finds an end: the morphologically chimeric hysterocinetids belong to the subclass Hymenostomatia (Ciliophora: Oligohymenophorea)

            【外文期刊】 Obert, Tomas ; Zhang, Tengyue ; 等 《Zoological Journal of the Linnean Society》 2023年199卷1期 97-123页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 morphology; multigene phylogeny; new species;

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            15. Characterization of a new pathogenic Acanthamoeba species, A. byersi n. sp., isolated from a human with fatal amoebic encephalitis.

            【外文期刊】 Qvarnstrom, Y. ; Nerad, T. A. ; 等 《The Journal of Eukaryotic Microbiology》 2013年60卷6期 626-633页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Group 1 Acanthamoeba; human isolate; nuclear small subunit ribosomal RNA gene;

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            16. The universally conserved nucleotides of the small subunit ribosomal RNAs

            【外文期刊】 Noller, Harry F. ; Donohue, John Paul ; 等 2022年28卷5期 623-644页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; RNA conservation; protein synthesis;

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            17. Application of the secondary structure model of rRNA for phylogeny: D2–D3 expansion segments of the LSU gene of plant-parasitic nematodes from the family Hoplolaimidae Filipjev, 1934

            【外文期刊】 Sergei A. Subbotin ; Dieter Sturhan ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2007年43卷3期 881-890页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Character coding; Bayesian inference; D2–D3 expansion segments;

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            18. Untangling filamentous marine cyanobacterial diversity from the coast of South Florida with the description of Vermifilaceae fam. nov. and three new genera: Leptochromothrix gen. nov., Ophiophycus gen. nov., and Vermifilum gen. nov.

            【外文期刊】 Berthold, David E. ; Lefler, Forrest W. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2021年160卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA phylogeny; Culture collection; Oscillatoriales;

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            19. The N-terminal extension of Escherichia coli ribosomal protein L20 is important for ribosome assembly, but dispensable for translational feedback control

            【外文期刊】 Guillier M ; Allemand F ; 等 《RNA》 2005年11卷5期 728-738页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 autogenous control; protein structure; ribosomal protein;

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            20. A UNIQUE PSEUDANABAENALEAN (CYANOBACTERIA) GENUS NODOS ILINEA GEN.NOV. BASED ON MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR DATA

            【外文期刊】 Ralph B. Perkerson III ; Jeffrey R. Johansen ; 等 《Journal of phycology》 2011年47卷6期 1397-1412页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; 16S-23S ITS; cyanobacteria;

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            21. Large subunit mitochondrial rRNA secondary structures and site-specific rate variation in two lizard lineages

            【外文期刊】 Brown RP ; 《Journal of Molecular Evolution》 2005年60卷1期 45-56页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; Bayesian inference; covarion;

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            22. Identification, genetic variation, and structural analysis of 18S rRNA of Theileria orientalis and Theileria velifera-like isolates from Myanmar

            【外文期刊】 Bawm, Saw ; Sagara, Rumi ; 等 《Parasitology International》 2021年82卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 18S rRNA; Genetic variation; Myanmar;

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            23. Undaria mitochondrial large subunit ribosomal DNA (Phaeophyceae,Alariaceae): Structural properties and use for phylogenetic analysis

            【外文期刊】 Saitoh Kenji ; Muraoka Daisuke ; 《Phycological Research》 2006年54卷2期 149-153页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Algae; DNA; Mitochondrial DNA;

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            24. Cryptic host-driven speciation of mobilid ciliates epibiotic on freshwater planarians

            【外文期刊】 Rataj, Matej ; Vd'acny, Peter ; 《Molecular phylogenetics and evolution》 2021年161卷 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA gene; Cytochrome c oxidase; ITS2 molecule;

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            25. Amazoninema gen. nov., (Synechococcales, Pseudanabaenaceae) a novel cyanobacteria genus from Brazilian Amazonian rivers

            【外文期刊】 Diego Bonaldo Genuario ; Wallace Rafael de Souza ; 等 《Journal of the American Association for Laboratory Animal Science》 2021年60卷2期 2249-2257页

            【关键词】 Brazil; Halomicronema; ITS secondary structures;

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            26. Signaling probe design for amplification-free detection of bacterial genes using DNA microarray

            【外文期刊】 Uno, Haruka ; Takeuchi, Hiyori ; 等 2022年133卷2期 133-139页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Signaling probe; DNA microarray; 5S rRNA;

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            27. Phylogeny of calcareous dinoflagellates as inferred from ITS and ribosomal sequence data

            【外文期刊】 Gottschling M ; Keupp H ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2005年36卷3期 444-455页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 5.8S rRNA; Calciodinellaceac; internal transcribed spacer;

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            28. Identification of evolutionary conserved structural elements in the mt SSU rRNA of Zygaenoidea (Lepidoptera): A comparative sequence analysis

            【外文期刊】 Niehuis O ; Naumann CM ; 等 《Organisms, diversity, & evolution》 2006年6卷1期 17-32页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Lepidoptera; 12S rRNA; multiple alignment;

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            29. Detection of the new cosmopolitan genus Thermoleptolyngbya (Cyanobacteria, Leptolyngbyaceae) using the 16S rRNA gene and 16S-23S ITS region

            【外文期刊】 Sciuto, Katia ; Moro, Isabella ; 《Molecular phylogenetics and evolution》 2016年105卷 15-35页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; 16S-23S ITS; Cryptic taxa;

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            30. Morphological and Molecular Characterization of the Representative of Brasilonema (Scytonemataceae, Cyanoprokaryota) from the Tropical Greenhouse in Kiev (Ukraine)

            【外文期刊】 P. A. Romanenko ; O. N. Vinogradova ; 等 《International Journal on algae》 2020年22卷2期 103-122页

            【关键词】 subaerophytic cyanobacteria; Brasilonema octagenarum; morphological variability;

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            31. Identification of novel gender-associated mitochondrial haplotypes in Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758)

            【外文期刊】 《Zoological Journal of the Linnean Society》 2017年179卷4期 738-750页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rDNA; 16S rRNA secondary structure; cox2-cox1;

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            32. Molecular phylogenetics in 2D: ITS2 rRNA evolution and sequence-structure barcode from Veneridae to Bivalvia

            【外文期刊】 Salvi, D. ; Mariottini, P. ; 《Molecular phylogenetics and evolution》 2012年65卷2期 792-798页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Bivalvia; ITS2 rRNA; Molecular taxonomy;

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            33. Widespread prevalence but contrasting patterns of intragenomic rRNA polymorphisms in nematodes: Implications for phylogeny, species delimitation and life history inference

            【外文期刊】 《Molecular ecology resources》 2020年20卷1期 318-332页

            【关键词】 concerted evolution; Halicephalobus; metabarcoding;

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            34. Coccomyxa cimbrica sp. nov., a green microalga found in association with carnivorous plants of the genus Drosera L.

            【外文期刊】 Katia Sciuto ; Barbara Baldan ; 等 2019年54卷4期 531-547页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 18S rRNA; Coccomyxa cimbrica; ITS2;

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            35. Translation mechanisms involving long-distance base pairing interactions between the 5 ' and 3 ' non-translated regions and internal ribosomal entry are conserved for both genomic RNAs of Blackcurrant reversion nepovirus

            【外文期刊】 Karetnikov A ; Lehto K ; 《Virology》 2008年371卷2期 292-308页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 nepovirus; translation; translational enhancer;

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            36. Two distinct 18S rRNA secondary structures in Dipodascus (Hemiascomycetes)

            【外文期刊】 Ueda-Nishimura K. ; Mikata K. ; 《Microbiology》 2000年146卷Pt.5期 1045-1051页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 18s rrna gene; 18s rrna secondary structures; Dipodascus;

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            37. Towards an assessment of character interdependence in avian RNA phylogenetics: A general secondary structure model for the avian mitochondrial 16S rRNA

            【外文期刊】 do Amaral, F.R. ; Sheldon, F.H. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2010年56卷1期 498-506页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 16S rRNA; Avian phylogenetics; Character interdependence;

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            38. The Impact of rRNA Secondary Structure Consideration in Alignment and Tree Reconstruction: Simulated Data and a Case Study on the Phylogeny of Hexapods

            【外文期刊】 《Molecular biology and evolution》 2010年27卷11期 2507-2521页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 rRNA: ribosomal RNA; genetic evolution; RNA secondary structure;

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            39. New bioinformatic tools for analysis of nucleotide modifications in eukaryotic rRNA

            【外文期刊】 Piekna-Przybylska D ; Decatur WA ; 等 《RNA》 2007年13卷3期 305-312页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 rRNA; modification; ribosome;

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            40. When barcoding fails: Genome chimerization (admixing) and reticulation obscure phylogenetic and taxonomic relationships

            【外文期刊】 Matthias Sipiczki ; 2022年22卷5期 1762-1785页

            【关键词】 barcodes; Metschnikowia; mosaic genome;

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