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【学位论文】 作者：杨雁祥 导师：钟建江 夏小霞 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 蜘蛛牵引丝由大壶状腺分泌形成，拥有卓越的力学性能；是一种在工业及生物医药方面极具应用前景的生物材料。天然蜘蛛牵引丝主要由两种高分子量蛋白构成，蜘蛛牵引丝蛋白1和2（major ampullate spidroin1 and2），文献信息表明...
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【学位论文】 作者：高洁 导师：金卫林 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰，在调节细胞增殖、分化、个体发育等方面起重要作用。在细胞内DNA存在着甲基化和去甲基化的动态过程，这一过程影响着大脑的功能，而异常的甲基化水平则会引起许多神经系统疾病。TET(Ten-eleven tr...
- 概要：
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【学位论文】 作者：任玺 导师：赵一雷 上海交通大学 生物学 生物学(生物信息学)（硕士） 2016年
【摘要】 蛋白质在基质表面上的吸附动力学研究是生物学、医学、食品加工等许多领域共同关切的重要科学问题。时间分辨光谱技术通常被用来实时监测蛋白质的结合动力学过程，但是基于单变量分析的传统数据处理方法难以区分复杂动力学数据中的重叠组份，因此有必要引入多变...
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【学位论文】 作者：熊康丽 导师：汪志军 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 DNA磷硫酰化修饰最早发现于变铅青链霉菌1326中。与修饰相关基因包括dndA-E，其中dndB-E组成一个转录本。dnd基因簇受到DndB这一调控因子的转录调控。研究发现，经偶氮二甲胺这一典型的硫醇基氧化剂处理后，dnd的转录上调至初始状...
【关键词】 变铅青链霉菌1326 ； DNA磷硫酰化修饰 ；
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【学位论文】 作者：肖海涵 导师：何平 上海交通大学 生物学 病原生物学（硕士） 2016年
【摘要】 钩端螺旋体（简称钩体）是一种带有钩状末端的细长螺旋形细菌，分为致病型钩端螺旋体和腐生型钩端螺旋体，其中致病型钩体感染人或其他易感动物后可导致钩端螺旋体病，至今仍为在全球范围内传播的疾病之一。机体的固有免疫在抵抗钩体感染过程中发挥着重要的作用...
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- 结论：
【学位论文】 作者：渠香云 导师：夏伟梁 王弢 上海交通大学 生物学 疾病生物学（硕士） 2016年
【摘要】
目的:构建一种采用聚乙二醇（polyethylene glycol，PEG）富集血清中外泌体并进行分离的方法，并进行血清外泌体中乳腺癌相关microRNA标记的检测分析。
方法：分别采用PEG8000、商品化 EXOQuick试剂...
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【学位论文】 作者：颜慧颖 导师：张梦晖 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 世界范围内肥胖症及其相关代谢疾病的流行以及迅速蔓延已经成为一个严重的问题，不仅对个人健康，也对家庭和社会造成了影响。越来越多的研究表明肥胖会引起胰岛素抵抗，粥样动脉硬化等一系列的代谢性疾病，对人体健康和寿命存在不小的威胁。肠道菌群在肥胖及其...
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【学位论文】 作者：张晶晶 导师：崔大祥 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 细胞因子诱导的杀伤细胞（cytokine induced killer，CIK）是一种新型的免疫活性细胞，具有体外扩增速度快、杀瘤活性高、杀瘤谱广、靶向肿瘤等特点。而纳米金三角棱镜因其特有的结构、显著的光学各向异性、可控的纵横比和高度敏感的...
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【学位论文】 作者：林巾琳 导师：李保界 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 p53蛋白是调控细胞周期的关键因子，有维持基因组稳定性的重要功能，是一个重要的抑癌基因。肿瘤中最经常发生突变的基因之一就是p53基因的突变。BMP-Smad信号通路不仅能调节细胞的增殖、分化、迁移和凋亡，而且在控制胚胎的发育和维持生物的组织...
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【学位论文】 作者：李竹青 导师：王灿华 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 转基因生物标准物质对转基因作物及其产品的定量检测尤为重要。我国转基因生物标准物质的研制工作还处于初级阶段，因此研制新型的标准物质对解决目前我国转基因标准物质匮乏有着重要意义。本文构建了六个转基因水稻品系的质粒DNA标准分子，对其中四个质粒D...
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【学位论文】 作者：许钊葳 导师：王靖方 陶生策 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 蛋白质芯片是一项强大的蛋白质组学研究技术，过去十几年中，该技术已被广泛地用于基础研究和临床研究。到目前为止已累计了大量的原始芯片实验数据，仍缺乏一个专门为蛋白质芯片量身打造的数据库，绝大部分蛋白质芯片数据仍零散存储在众多的研究组，不能有效地...
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【学位论文】 作者：于映雪 导师：孔晓妮 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 肝纤维化是一种常见的由慢性炎症引起的细胞外基质(ECM)过量堆积的病理疾病，是世界性的健康问题，其中氧化应激在纤维发生过程中起重要作用。DJ-1(protein deglycase DJ-1)是一种与机体氧化应激紧密相关的蛋白，且我们研究小...
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【学位论文】 作者：聂东胜 导师：乔忠东 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 吸烟是世界上最大的公共卫生问题之一。目前，每年死于吸烟引起的相关疾病的人数已经超过600万；其中有超过500万人是主动吸烟，而因为二手烟致死的非吸烟者人数则超过60万。我国目前烟民数量已经超过3亿，其中15岁以上人群吸烟率为28.1％，男性...
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【学位论文】 作者：曹娜 导师：吴际 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 蛋白质棕榈酰化修饰是蛋白质翻译后脂质化修饰调控的重要形式之一，已有越来越多的研究揭示出蛋白质棕榈酰化修饰及棕榈酰基转移酶在癌症及神经退行性疾病中扮演了重要的角色，然而对于棕榈酰化修饰如何参与到癌症及神经退行性疾病中的机制并不清楚。癌症的形成...
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【学位论文】 作者：王晓玲 导师：王侃侃 上海交通大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2016年
【摘要】 急性早幼粒细胞白血病（acute promyelocytic leukemia，APL）是一种大量阻滞在早幼粒阶段、白血病细胞无限制增生的急性髓系白血病。由t(15;17)染色体易位产生的PML/RARα融合蛋白是APL发生的重要因素，它通...
【关键词】 PML/RARα融合蛋白 ； 急性早幼粒细胞白血病 ；
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【学位论文】 作者：彭莉 导师：刘喜朋 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 遗传信息分子DNA是生命体遗传与变异的分子基础。DNA的稳定性主要取决于DNA复制与DNA损伤修复系统的高效性与完备性。DNA聚合酶是进行DNA复制与损伤修复的核心酶，在细胞内负责子链DNA复制型合成与损伤链的修复型合成。DNA聚合酶都具有...
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【学位论文】 作者：张宁波 导师：邵志峰 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】
增强子通常特异性的启动或增强多能性相关基因的表达，进而调控细胞分化的进程。增强子的异常表达以及增强子序列的改变，可能会引起癌相关基因或者多能性相关基因的表达，导致细胞的癌变或凋亡，从增强子角度出发研究疾病致病机理将会有重要价值和意义。
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【学位论文】 作者：谷云琦 导师：乔中东 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 研究背景与目的：吸烟是全球最大的公共卫生卫生问题之一。研究证实吸烟对男性生殖健康有着不利影响。实验室的前期工作证明，使用香烟烟雾处理雄性小鼠可以促进精子DNA的断裂、生精细胞的凋亡等，进而影响其精液质量并降低子代小鼠的出生率和存活率。目前研...
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【学位论文】 作者：马英英 导师：齐颖新 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 血管重建（remodeling）以血管平滑肌细胞（vascular smooth muscle cells，VSMCs）增殖、凋亡、迁移为主要特征。研究发现，动脉粥样硬化（atherosclerosis，AS）好发于血流动力学较为复杂的部位...
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【学位论文】 作者：谢丽飒 导师：肖湘 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 海洋占据地球上70％以上的面积，尤其是深海大洋，不仅蕴含着各种生物和地球化学活动，而且在全球碳循环和储存过程中发挥着重要作用。地球上91%以上的碳储存在海洋中，这些碳在海洋表层被固定并向大洋深处输送的过程中，绝大部分都在中层水域被分解。这是...
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【学位论文】 作者：鲁飞杰 导师：张延 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 糖基化修饰是一种重要的蛋白翻译后修饰，糖基化的改变与众多疾病的发生、发展相关，目前临床上应用的肿瘤标志物大多为糖链或糖蛋白。由于糖肽仅占蛋白酶解肽段很小一部分且糖链结构异常复杂，因此，对复杂生物体系蛋白质的糖基化的分析面临着巨大挑战。目前研...
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【学位论文】 作者：王彦卓 导师：秦金红 上海交通大学 生物学 病原生物学（硕士） 2016年
【摘要】 基于16S rRNA基因序列的系统发育关系，钩端螺旋体可分为至少21个基因种。此21个种可划分为3类：致病型、中间型和腐生型。致病型钩体会引起人兽共患的钩端螺旋体病，此病呈全球分布。相对于其它致病菌，人们对钩体的生理、毒力因子以及致病机制的...
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【学位论文】 作者：雷明莉 导师：李婧 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 随着高通量测序的快速发展及测序成本的降低，RNA-Seq成为转录组分析的主要技术。差异表达分析是转录组后续研究的前提和基础，已有的统计模型主要是在单基因水平上进行的。但是很多复杂疾病或者表型是由生物网络模块内基因微弱变化累加所致。在基因芯片...
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【学位论文】 作者：胡晓雯 导师：朱洪新 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 UVRAG是一个自噬相关基因，其编码蛋白通过与Beclin1结合增强Vps34/PI3KC3的活性，在促进自噬小体成熟中发挥重要作用。Rubicon与UVRAG相互作用，导致Vps34/PI3KC3的活性下调，抑制自噬小体成熟。我们的前期工...
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【学位论文】 作者：许泉 导师：吴强 上海交通大学 生物学 生物信息与分子生物学（硕士） 2016年
【摘要】 CTCF和与之结合的cohesin蛋白复合物在绝缘子功能和哺乳动物基因组染色质高级结构的组织中发挥着极其重要的作用。最近的研究发现CTCF结合位点（CBSs）的方向与染色质的相互作用相关。我们结合CRISPR/Cas9基因组DNA编辑技术、...
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【学位论文】 作者：程瑞雪 导师：白晓慧 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 海洋是地球上最大的生态系统，蕴含着丰富的生物基因资源，深海是海洋的主要组成部分，普遍具有黑暗、高压、低温、寡营养等环境特征。由于绝大多数环境微生物无法在实验室中被培养，基因异源表达是获取深海生物基因资源的理想途径之一。目前常用的异源基因表达...
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【学位论文】 作者：孔华磊 导师：李华 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 从基因表达水平的角度对癌症样本进行分类，与传统的组织病理学分类癌症样本相比，其较高的临床预测能力已经获得越来越广泛的关注。根据癌症样本的基因表达谱发现某些基因的集合（称为基因集）可以显著区分不同癌症样本的基因表达谱并与癌症病人的临床结果有关...
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【学位论文】 作者：方静 导师：王风平 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 本研究以冷泉富集样本为例，来研究甲烷厌氧氧化富集样本中的微生物的组成、代谢途径以及相互作用关系。首先，分别统计宏基因组和宏转录组两组数据中的16S rRNA基因的构成，我们发现该样本中存在着大量并活跃着的ANME-2和 SRB；还发现了大量...
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【学位论文】 作者：丁夏丽 导师：郭晓奎 上海交通大学 生物学 病原生物学（硕士） 2016年
【摘要】
目的：
本文第一部分中，主要对钩端螺旋体56602株进行了全基因组测序及比较基因组分析，以期发现博氏钩体56602株毒力减弱的原因，及其对环境的适应性，补充钩体基因组数据库。
方法：
我们通过454焦磷酸测序结...
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【学位论文】 作者：王凯旋 导师：齐颖新 上海交通大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2016年
【摘要】 血管平滑肌细胞（vascular smooth muscle cells，VSMCs）异常增殖与心血管疾病发生和发展过程密切相关。在高血压等心血管疾病中，由于血流脉动而产生的周期性张应变（cyclic strain）异常增高是诱导 VSMC...
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- 结论：
【学位论文】 作者：冯舟 导师：庞小燕 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2016年
【摘要】 沃氏嗜胆菌（Bilophila wadsworthia）是一种硫化氢产生菌，因具有较强的嗜胆盐特性而得名。它是人体肠道内的常见菌之一，并被报道与阑尾炎及其它局部炎症相关。有研究显示，在MF（milk-derived fat）饮食条件下，小鼠...
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【学位论文】 作者：张婷婷 导师：夏伟梁 上海交通大学 生物学 神经生物学（硕士） 2015年
【摘要】 干细胞对于缺血再灌注引起的脑损伤的治疗具有较好的应用前景。许多研究报道都证明包括神经干细胞（NSC）、间充质干细胞（MSC）、内皮祖细胞（EPC）在内的干细胞对实验性的脑缺血具有明显的治疗效果。尽管大量研究表明干细胞或可通过分泌多种神经营养...
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- 结论：
【学位论文】 作者：刘冬成 导师：李明发 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 雌性果蝇幼虫性腺的正常发育保证了果蝇进入成虫阶段能持续不断地产生配子，保持生殖活力。幼虫期性腺包含生殖细胞和体细胞两大谱系，其中果蝇原始生殖细胞(primordial germ cells,PGCs)是成体生殖干细胞的前体。该群细胞在果蝇幼...
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- 方法：
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【学位论文】 作者：李艳 导师：左勇 上海交通大学 生物学 细胞生物学（硕士） 2015年
【摘要】 上皮间充质转化（EMT）是上皮细胞转化为具有间质细胞表型的生物学过程。其表型特征包括形态学表现为间质细胞特征，细胞粘附分子如E-钙黏蛋白（E-cadherin）表达减少和波形蛋白（Vimentin）异常表达等。EMT在胚胎发育、组织修复和肿...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：陈思 导师：秦樾 上海交通大学 生物学 细胞生物学（硕士） 2015年
【摘要】 FKBP12(FK506-binding protein12）是细胞响应免疫抑制剂雷帕霉素（rapamycin）和FK506的重要胞内蛋白。通过与FKBP12结合，雷帕霉素可以抑制mTORC1（mammalian TOR complex1）...
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【学位论文】 作者：陈慧慧 导师：郭熙志 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 脊椎方面的疾病在人群中比较多发，而且类型多样。比如，在婴幼儿群体中的先天性脊柱侧凸，在老年人群中比较多发的椎间盘突出和脊椎骨刺增生。脊椎发育缺陷的代表性症状之一是脊椎肋骨发育不全。脊椎肋骨发育不全可表现出多种特征，包括椎体的不均匀或者椎体间...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：许晓惠 导师：李胜天 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 癫痫是常见的神经系统疾病之一，它发作的直接原因是脑内神经元的高度同步化异常放电，因此脑电分析是诊断癫痫的重要手段之一。近年来，有研究表明脑电中的高频振荡（high-frequency oscillations，HFOs），即ripple（8...
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【学位论文】 作者：江诚 导师：陈海峰 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 核糖开关是一类顺式作用的调控元件，大部分存在于微生物mRNA的5’端，真菌和植物中也有发现。细胞中的一些代谢物和离子能够结合到特定的核糖开关上，诱导构象发生变化进而调控下游基因的表达。这种调控在转录水平和翻译水平上都有可能发生。preQ1是...
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【学位论文】 作者：赵梅 导师：赵宇峰 上海交通大学 生物学 生物学（硕士） 2015年
【摘要】 肠埃希氏菌Escherichia coli在正常情况下是人肠道中的共生细菌，但当机体免疫力降低时，或者当其移位至其它组织、器官时，E.coli能够引起疾病，属于机会性致病菌。现在普遍认为肠道菌群的结构与功能同代谢性疾病的发生发展有着重要的关...
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- 方法：
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【学位论文】 作者：梅星星 导师：吴际 上海交通大学 生物学 生物化学与分子生物学（硕士） 2015年
【摘要】
精子发生过程是一个高度复杂和精密的过程，起源于精原干细胞（spermatogonial stem cell，SSCs）自我更新和分化，并受到广泛的调节。MicroRNA在调节精子发生的准确性和复杂性上起着至关重要的作用。
通过荧光...
- 概要：
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