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【学位论文】 作者:范慧慧导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 生物体细胞是一个有机联系的整体,其中调控作为生物联系得以维系的必然因素,正日渐成为复杂疾病相关机理研究领域的一个热点和难点。转录调控是在基因互作层面去揭示主导基因表达水平改变的直接遗传因素,而表观调控则是通过遗传物质DNA之外的表观修饰水平...
- 概要:
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【学位论文】 作者:李永生导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 恶性肿瘤的发生发展是遗传与表观遗传共同驱动的结果。表观遗传学是指无序列改变的对染色体的修饰作用,从而引起基因表达的改变,其范畴包括DNA甲基化、组蛋白修饰、基因组印记以及非编码RNA的转录调控等,在恶性肿瘤等重大疾病发生发展中起着决定性的作...
- 概要:
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【学位论文】 作者:李想导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 精神分裂症(Schizophrenia,SZ)与双相情感障碍(Bipolar Disorder,BP)是重要的精神类遗传性疾病,越来越多的研究证实DNA甲基化在这些疾病的发生发展中发挥着重要的调控作用。因此,在全基因组水平研究精神类疾病的D...
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【学位论文】 作者:智慧导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 长非编码RNAs(lncRNAs)为长度大于200个核苷酸的RNA转录本。lncRNAs通常缺乏蛋白编码能力,但是在生命活性网络的调控中发挥重要作用。其在生物体内参与行使多种功能,如基因表达调控、表观遗传调控、转录调控、蛋白质活性和剪切的改...
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【学位论文】 作者:李琬导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 研究表明,信号转导或生物学通路的缺陷或错误可以引起癌症的发生。这些细胞信号通路彼此之间通过多种方式相互作用,形成了信号网络。网络motif是一种具有功能特性的显著常出现的网络构件,在信号网络中能够反映出信号转导的模式。揭示网络motif在信...
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【学位论文】 作者:平艳艳导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2014年
【摘要】 胶质母细胞瘤(Glioblastoma multiforme,GBM)是一种在成年人中常见的原发脑瘤,平均的生存期为12-15月。GBM相关的多组学研究揭示了GBM具有分子异常(DNA突变、拷贝数改变和miRNA功能异常)的广泛复杂性和高度...
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【学位论文】 作者:石洪波导师:郭政 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2013年
【摘要】 microRNA是一类重要的非编码小分子RNA,长约22个核苷酸,它通过降解靶基因mRNA或者抑制靶基因mRNA的翻译来发挥作用,通常在转录后水平调控基因的表达。microRNA参与各种各样的生物调节,如细胞的发育、增殖、分化、凋亡以及脂肪...
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【学位论文】 作者:李静导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2013年
【摘要】 MicroRNA(miRNA)是一种广泛的存在于真核生物钟的一种内源性的非编码的RNA分子,它主要是在转录后的调控水平上行使其调控作用,它调控了人类大约三分之一的基因,是一种十分重要的调控因子。目前,研究miRNA与疾病,尤其是癌症的发生、...
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【学位论文】 作者:刘伟导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(生物信息学)(博士) 2013年
【摘要】 精确预测疾病状态是临床癌症研究的一个重要课题。近年的研究通过识别基于微阵列表达谱的基因生物学标记来对癌症治疗结果进行预测,效果优于传统的临床诊断因子。然而,单基因生物学标记在不同群体的病人之间的再现性很差,使得基于单基因生物学标记的分类器的...
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【学位论文】 作者:王艳秋导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2013年
【摘要】 MicroRNA(miRNA)和基因间区的长非编码RNA(lincRNA)是基因组上的两类重要非编码RNA,它们与生物学机理和疾病发生发展密切相关。由于miRNA和lincRNA研究还不十分透彻,还有许多新miRNA和lincRNA有待于识...
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【学位论文】 作者:陈新导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 药物治疗是一种常用的肿瘤治疗方法。对同一类型的肿瘤患者,相同抗癌药物的治疗效果存在差异,有些患者对药物敏感,而有些患者对药物存在耐药性。因此寻找生物标记来预测癌症病人对药物的反应具有重要意义。药物敏感性基因就是这样的一种生物标记,它的表达可...
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【学位论文】 作者:李伟导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 编码基因的转录后调控机制的研究是系统生物学的一个挑战。其中一个热点是越来越多的研究证实具有转录后调控作用的miRNA可以调控很多基因的翻译过程。同时很多miRNA功能的研究的结果显示,miRNA的功能主要是通过调节其靶基因参与的功能而实现的...
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【学位论文】 作者:李春权导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 复杂疾病发生、发展与代谢通路特定区域(子通路)的功能异常密切相关。精绍的识别复杂疾病相关的风险代谢子通路对揭示疾病的发生发展机制意义重大。然而,现存的大部分通路识别的生物信息学方法仅仅具有全通路识别能力,无法精细的识别疾病的代谢子通路。本文...
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【学位论文】 作者:汪强虎导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 MicroRNA是一类大约19~25个核苷酸的内源性单链非编码小分子RNA,通过特异性识别并结合靶mRNA3’非翻译区(3’-untranslated region,3’UTR),降解靶mRNA分子或抑制其翻译,是一类重要的调控因子。Mic...
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【学位论文】 作者:王莹莹导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】
MicroRNA是一类小的,长度在19-24nt的非编码RNA,在转录后调控层面上行使重要的调节功能。近年来,microRNA与各种类型疾病的发生、发展、预后等方面关系的研究逐步成为生物信息学领域新的热点和难点问题。
“micro...
【关键词】 microRNA组学 ; 非编码微小RNA ;
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【学位论文】 作者:孙杰导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 在功能基因组时代,利用高通量的基因组技术和蛋白质组技术可以识别出大量感兴趣的基因集合。这些感兴趣的基因集合往往与相同或相似的表型相关,通常是一些差异表达基因集合、共同表达的基因模块、蛋白质复合物或者是信号通路。因此,对这些基因集合数据进行生...
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【学位论文】 作者:吕飒丽导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 疾病的诊断和治疗是关系人类健康的两个重大问题。疾病及其相关基因的研究一直以来都是生物信息学领域的热点问题。挖掘疾病相关基因,尤其考虑基因共同参与某个生物学过程而挖掘出的通路,对于疾病诊断及治疗都有重要的临床意义。疾病、基因及通路、治疗疾病的...
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【学位论文】 作者:连保峰导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2012年
【摘要】 miRNA是一种长约22nt的单链的内源性非编码RNA,它在真核生物中广泛存在。miRNA作为后转录调控的重要元件,它通过降解靶基因mRNA或者抑制其翻译成蛋白质影响其表达。人类基因组中大约三分之一的基因可能受到miRNA调节并且其表达具有...
【关键词】 复杂疾病 ; miRNA/TF调控网络 ;
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【学位论文】 作者:张帆导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 随着高通量生物实验技术的进步,可以获得大量的生物组学(Omics)数据(如基因组、蛋白质组、代谢组等)。为我们构建各种各样的大规模生物分子网络(如蛋白质相互作用网络、基因调控网络、代谢网络等)以及系统地分析生物分子网络的拓扑结构、组织形式、...
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【学位论文】 作者:杜磊导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 近年来,在基因组学、蛋白质组学的发展基础上,从系统的角度来进行研究逐步成为现代生物学的主流研究方法,系统生物学作为一门新兴的生物学交叉学科正方兴未艾。作为生物系统的抽象表示,生物分子网络在揭示生物学过程和功能机制方面越来越受到研究者的重视。...
- 概要:
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【学位论文】 作者:徐娟导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 microRNA(miRNA)是一类重要的非编码RNA分子,长约22个核苷酸,通过在转录后水平上降解靶基因mRNA或抑制靶基因的mRNA翻译来发挥作用。它们在许多生物和代谢过程中起着非常重要的作用,比如细胞增殖,信号传导,发育和凋亡。因此,...
【关键词】 miRNA-miRNA基因 ; 功能协同网络 ;
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【学位论文】 作者:廖明帜导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 随着人类基因组计划的完成和对编码基因的功能分析不断深入,对非编码区的研究已经成为后基因组时代的巨大挑战和研究热点。大多数真核生物是由蛋白质编码序列和非编码序列两部分组成,其中只有极小一部分编码蛋白质基因,人类基因组中只有不到3%的编码区,而...
- 概要:
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【学位论文】 作者:陈晓文导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 microRNA(miRNA)是一类长度大约为22nt的单链非编码RNA,在很多生物学过程中起着重要的作用,像细胞分化、增殖、凋亡等等。miRNA在转录后水平调控着多个蛋白质的表达,从而在癌症发生和发展过程中起到了调控和枢纽作用。很多研究发...
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【学位论文】 作者:顾云燕导师:郭政 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 通过高通量测序技术扫查癌基因组体细胞突变,已经发现了数以千计的癌相关突变基因,为系统揭示癌症的发生与发展机制提供了大量数据。有证据表明,参与不同通路的多个突变基因之间的相互协作提供了癌细胞的生长优势。然而,在目前的癌症研究中,突变基因间的这...
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【学位论文】 作者:许超汉导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 随着各种高通量生物技术的迅速发展,生物学领域产生了大量数据,例如基因表达谱,蛋白质互作数据等,这些数据为深入研究各种复杂疾病的致病机制提供了可能。为了合理利用这些生物学数据,整合方法被广泛应用于生物医学研究,并且在识别复杂疾病相关的基因或功...
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【学位论文】 作者:王珍珍导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 microRNA的调控是一个非常复杂的过程,该调控过程涉及到了大量的分子事件在时间和空间的协同作用。是否这种复杂的调控过程会限制哺乳动物microRNA的靶基因在染色体上的分布仍然是未知的。这里,我们进行了一个全基因组范围的分析并且提供了m...
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【学位论文】 作者:宫滨生导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 随着高通量分子生物学检测技术的迅速发展以及人们对生物医学知识的不断积累,可以获得许多疾病研究的SNP遗传谱、microarray表达谱、蛋白质互作网络、代谢和信号转导通路、转录因子和microRNA调控关系、疾病相关基因等海量生物医学信息资...
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【学位论文】 作者:王化琨导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 聚类是一种广泛使用的基因表达数据分析技术。目前,大部分聚类方法基于距离分类基因,而很少有聚类方法根据基因表达水平的分布的相似性来分类基因。而且,随着生物学注释资源的积累,越来越多的基因已经被注释到不同的生物学功能类别中。因此,根据基因表达数...
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【学位论文】 作者:姜永帅导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 人类群体生存在不断变化的环境中,许多人口和进化事件,如迁移、人口扩张、殖民、遗传漂变、选择、重组和突变等,形成了人类基因组中的遗传变异。为了充分理解这些遗传变异,一些大型的国际计划,如HapMap计划、千人基因组计划等,相继开展。本研究中我...
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【学位论文】 作者:朱荣胜导师:李霞 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(博士) 2011年
【摘要】 MicroRNA是一种内源性、非编码、小分子(成体一般仅有21-23nt左右)RNA,在转录后起重要的调控作用。它广泛地分布于动物、植物和病毒中,通过抑制或降解的方式对其靶基因的表达进行调解,从而起到影响生物过程的作用。本研究从microR...
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【学位论文】 作者:龚雪导师:郭政 哈尔滨医科大学 生物学 生物物理学(生物信息学)(博士) 2010年
【摘要】 借助传统的小规模实验和目前的高通量扫查数据,采用数据挖掘技术识别与癌的发生与发展相关的基因与功能,对研究癌症机理及寻找可应用于临床诊断、治疗的生物标志有重要的意义。本课题通过分析已知癌基因数据库中收录的和大规模高通量检测预测的癌基因,从功能...
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