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            【学位论文】 作者:徐圆圆导师:郭敏   张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息(硕士) 2024年

            【摘要】 帕金森病(Parkinson''sDisease,PD)的发病机制尚未有明确结论,众多证据表明PD存在代谢重编程。目前关于代谢研究的主流工具是代谢组学,但是代谢组学有其不足之处,例如研究对象有限、研究方法通用性差、不能排除混杂因素干扰等。基...

            【关键词】 帕金森病病理状态

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            【学位论文】 作者:李凯文导师:张红雨   山东大学   临床医学 内科学(老年医学)(硕士) 2024年

            【摘要】 第一部分老年住院患者营养状态与慢性便秘的相关性研究
              研究背景:
              慢性便秘(Chronicconstipation,CC)是一种常见的功能性胃肠道疾病,表现为排便次数减少、粪便干结和(或)排便困难。流行病学研究显示,我国成...

            【关键词】 老年住院患者营养状态

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            【学位论文】 作者:张可欣导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2024年

            【摘要】 现代人类医学遗传学的核心问题在于建立基因型-疾病关联,以解析疾病潜在分子机制,进一步改善疾病临床治疗效果。随着对人体微生物群作用机制的深入探索,微生物在人类疾病发生发展中扮演的重要作用逐渐得到揭示。大量研究表明微生物和各种疾病间存在因果关系...

            【关键词】 基因-微生物-疾病三元关联预测模型

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            【学位论文】 作者:张晓敏导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2024年

            【摘要】 纳米抗体缺失轻链和部分重链抗体可变区,但具备和常规抗体一样的抗原结合能力,兼具有小分子药物和抗体药物的优势,传统的纳米抗体研发基于随机突变和重组,带来了相当大的实验负担。因此,相关人员也一直在探索新的技术以求为纳米抗体的研发带来突破。人工神...

            【关键词】 纳米抗体药物设计

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            【学位论文】 作者:李鑫导师:张红雨   山东大学   临床医学 内科学(老年医学)(硕士) 2023年

            【摘要】 目的:
              在人口老龄化逐渐加重的背景下,老年人营养不良问题日益显著,住院老年患者中,营养不良发生率可高达30%-60%。营养不良会导致老年人生理功能下降,慢性疾病的患病率升高,住院率与死亡率上升,进而导致社会养老负担加重。因此对老年...

            【关键词】 医护人员肠内营养知识

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            【学位论文】 作者:李贵阳导师:张红雨   山东大学   临床医学 全科医学(硕士) 2023年

            【摘要】 研究目的尿蛋白肌酐比值作为早期肾功能损伤的敏感标志物,最早被推荐广泛用于糖尿病肾病的筛查、诊断及评估,现被认为是全身血管内皮细胞损伤、功能障碍及炎症反应的标志物,更是心血管疾病的独立危险因素和不良心血管事件的独立预测因子。研究显示,尿蛋白肌...

            【关键词】 营养筛查老年住院患者

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            【学位论文】 作者:彭琪芮导师:张红雨   华中农业大学   药学 生物与医药(硕士) 2022年

            【摘要】 单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术能够在单个细胞水平上测量分子的转录表达量,为从细胞层面上研究复杂疾病与生命活动提供数据基础。然而,scRNA-seq数据由于测序技术的限制而存在高噪音、高稀疏化等数据偏差,这些偏差给设计开发数据分析...

            【关键词】 单细胞转录组子空间聚类

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            【学位论文】 作者:邓思敏导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2021年

            【摘要】 衰老是人类生活中自然而渐进的生物过程,受遗传与环境等多种因素的影响。寻求有效的生物标记物以及探索对抗衰老的措施,一直以来都是科学研究的热门领域之一。衰老的重要特征之一便是表观遗传调控发生紊乱。相对于DNA序列的遗传调控,表观遗传调控的过程大...

            【关键词】 年龄预测DNA甲基化

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            【学位论文】 作者:廖旋导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2021年

            【摘要】 结直肠癌(Colorectalcancer)是人类因癌症死亡的主要疾病之一,在全球范围内是第三常见的癌症,实现有效预防、正确诊断和治疗是当前结直肠癌研究中的重要目标。精准医疗已经成为癌症的热门治疗方向,而生物标志物在个体中的差异使肿瘤精准医...

            【关键词】 结直肠癌生物标志物

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            【学位论文】 作者:佟馨宇导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2021年

            【摘要】 乳腺癌(BRCA)是一种典型的全球性疾病。其中,雌激素受体阳性(ER+)亚型占比大概为70%。据临床数据显示,虽然ER+乳腺癌患者的预后较好,但其5年生存率只有22.8%左右,发现新的肿瘤标志物和治疗药物依旧迫在眉睫。雌激素是影响乳腺癌的发...

            【关键词】 乳腺癌药物重定位

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            【学位论文】 作者:王淑雨导师:张红雨   张赛扬   郑州大学   药学 药理学(硕士) 2021年

            【摘要】 背景和目的
              目前,肿瘤仍旧严重威胁着全球人类的健康,由恶性肿瘤导致的发病死亡率一直呈上升趋势。胃癌是全球范围内最常见的癌症,每年估计有超过100万的新增病例。癌症的成功治疗当前仍然是一个严峻的挑战,因此迫切需要开发更高效、更安全的...

            【关键词】 微管蛋白香豆素类化合物

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            【学位论文】 作者:齐元琨导师:张红雨   山东大学   临床医学 全科医学(硕士) 2021年

            【摘要】 研究背景
              肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)是多种原因引起,以肺动脉压力进行性升高、肺血管阻力逐渐增加为特征,最终导致右心乃至全心衰竭及死亡的心血管疾病。PH的诊断标准为:在海平面、静息状态下经右心导...

            【关键词】 肺动脉高压右心导管

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            【学位论文】 作者:王晖导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2021年

            【摘要】 近年来,伴随着大规模人群的全基因组关联分析(Genome-WideAssociationStudy,GWAS),许多与阿尔茨海默症(Alzheimer’sDisease,AD)相关的微效位点被发现。鉴于GWAS分析仅包含了常见变异,其发现的...

            【关键词】 阿尔茨海默症淀粉样蛋白

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            【学位论文】 作者:吕博敏导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2020年

            【摘要】 近年来,随着肠道微生物领域研究的深入开展,大量的研究表明肠道微生物与宿主体内的物质代谢和生理机能的维持存在着复杂而紧密的联系。与宿主的其他表型一样,肠道微生物作为动物的“第二基因组”同时受到来自环境因素和宿主遗传因素的共同影响。随着全基因组...

            【关键词】 肠道菌群关联疾病

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            【学位论文】 作者:薛刚导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2020年

            【摘要】 帕金森病(Parkinson’s disease, PD)是一种复杂的神经退行性疾病,虽然病理特征明显,但是病因仍不明确,目前也没有一种方法可以彻底治愈PD。组学技术的快速发展为理解PD发病的分子机制以及发现更加理性的治疗方法提供了机会和挑...

            【关键词】 帕金森病纵向数据

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            【学位论文】 作者:崔泽嘉导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2019年

            【摘要】 实现癌症的预后预测及分子分型对于癌症的治疗至关重要。预后代表着对治疗成功的估计及恢复的可能性,与癌症的分型紧密相关。作为一种复杂的多基因疾病,同样的癌症在不同个体上的表现不同,相同的临床表现也可能需要不同的治疗方案,这种癌症的异质性使得仅依...

            【关键词】 恶性肿瘤预后分析

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            【学位论文】 作者:田恬导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2019年

            【摘要】 生命如何起源是自然科学中最重要且最具挑战的问题之一。众所周知,磷是生命不可或缺的元素。基于磷对现代生命的重要性,人们普遍认为磷在生命起源中起到重要作用。然而,最近Goldford等人构建了一个无磷参与的,具有前生源性质的代谢网络,并以此为依...

            【关键词】 新陈代谢磷酸盐

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            【学位论文】 作者:高敏导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2019年

            【摘要】 乳腺癌是一种典型的全球性癌症,也是全球女性死亡的最常见原因之一。在组学时代,研究者们采用各种高通量测序技术积累了海量的生物医学数据,在此基础上揭示了越来越多的疾病相关变异/基因。如何有效利用这些数据寻找保护人类健康的新药是一项巨大的挑战。<...

            【关键词】 乳腺癌药理学

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            【学位论文】 作者:姜凌瀚导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2019年

            【摘要】 Causal基因的推断在理论和实践中都有重要意义,包括阐明生理过程尤其是人类疾病的机理,以及作物改良和疾病的治疗等,因此相应统计学方法的开发至关重要。现有的causal基因推断方法根据利用的数据类型和统计方法,大致可分三类:基于基因组的方法...

            【关键词】 causal基因推断方法

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            【学位论文】 作者:全源导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2018年

            【摘要】 在过去十年中,组学分析的快速发展使得研究者能够在全基因组水平上进行生物学相关研究。通过全基因组关联分析(genome-wide association study,简称GWAS)研究,已经鉴定出数以千计与表型相关的基因位点。然而,由于传统G...

            【关键词】 遗传疾病致病机制

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            【学位论文】 作者:褚欣奕导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2018年

            【摘要】 银屑病是一种在全球范围内发病率较高且难以治愈的慢性皮肤疾病。其发病机制十分复杂,涉及多个基因和调控通路间的相互作用,而目前还没有能够系统地整合这些因素的疾病模型。内源性网络理论(endogenous network theory)提出了一种...

            【关键词】 阿司咪唑抗银屑病活性

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            【学位论文】 作者:王刚导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物工程(硕士) 2018年

            【摘要】 神经退行性疾病(neurodegenerative disease,NDD)及中枢神经系统损伤(central nervous system injury,CNSI)常导致患者产生严重的神经功能障碍,对人类健康威胁巨大。两者主要病理表现均为...

            【关键词】 神经退行性疾病神经再生

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            【学位论文】 作者:陶婧芬导师:杨庆勇   张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2017年

            【摘要】 基因组变异是生物多样性形成、发展和消失,以及物种进化的物质基础,主要由单核苷酸多态性和基因组结构变异两个方面构成。相比单个核苷酸位点突变,结构变异对于表型变化(如各种慢性疾病)和进化具有更显著的影响,因此基因组结构变异在人类遗传学研究中受到...

            【关键词】 拟南芥基因组变异

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            【学位论文】 作者:谷宁导师:张红雨   山东大学   临床医学 老年医学(硕士) 2017年

            【摘要】 研究背景:
              人口老龄化进程的加速使得人口的平均预期寿命逐渐的延长,但老年人的健康问题却越来越突出。国内外大量的研究结果证明,老年人是发生营养不良和(或)营养风险的高危人群,营养不良会导致不良的临床结局;合理的营养支持治疗可以使患者...

            【关键词】 肺炎老年患者

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            【学位论文】 作者:王小滔导师:张红雨   彭城   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2017年

            【摘要】 染色质三维结构在基因表达调控、细胞发育以及疾病发生过程中起着重要作用。在过去,人们主要依赖显微技术来研究染色质的空间组织模式。近年来,染色质构象捕获技术,特别是能够在全基因组范围捕获染色质交互的Hi-C技术,极大地提高了研究染色质结构的精度...

            【关键词】 染色质拓扑相关结构域

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            【学位论文】 作者:孙雅圣娴导师:张青叶   张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2017年

            【摘要】 阿尔兹海默症(Alzheimer’sDisease,AD)是一种大脑神经退行性疾病。随着中国老龄化的人口数量急剧增长,AD患者的数量每年也在大幅度增长,给社会和家庭都带来了沉重的负担。AD具体的发病机制到目前为止仍不完全清楚,但现在确定的是...

            【关键词】 阿尔兹海默症药物设计

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            【学位论文】 作者:曲鑫导师:张红雨   山东大学   临床医学 老年医学(硕士) 2016年

            【摘要】 目的:随着医学不断发展、医学理念推陈出新,生物-心理-社会的医学模式得到医学界认可及关注,对患者个体化、综合化治疗已成为医学界的共识。临床实践发现,患者营养状况与治疗方案的选择及疾病预后密切相关,国内外专家学者对住院患者的营养状况日益重视。...

            【关键词】 中老年住院患者

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            【学位论文】 作者:熊乐导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2016年

            【摘要】 真核生物广泛使用组合调控方式调节基因表达。在该过程中,转录因子蛋白-蛋白相互作用与其DNA结合特异性存在耦合关系。然而,其背后的分子机制所知甚少。
              在本论文中,我们对碱性亮氨酸拉链(Basic leucinezipper, bZI...

            【关键词】 碱性亮氨酸拉链转录因子组合调控

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            【学位论文】 作者:罗志辉导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物工程(硕士) 2016年

            【摘要】 药物研发是一项投入高产出低的工作,如何提高药物研发效率是医药行业面临的一个主要问题。研究新药从老药出发可以极大地降低药物研发的难度。随着科学技术的进步,二代测序技术的发展,人类基因组的注释信息越来越丰富。分子生物学和遗传学的突破使研究者们可...

            【关键词】 系统遗传学多靶标药物

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            【学位论文】 作者:杨晓霞导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2015年

            【摘要】 蛋白质-核酸相互作用在基因表达和调控等诸多生命过程中发挥着极其重要的作用,利用计算方法准确识别蛋白质中与核酸发生物理接触的区域有助于阐明这类相互作用机制。目前大多数算法仅独立地采用特征驱动方法或模板方法预测核酸绑定残基,但是其预测精度仍有待...

            【关键词】 蛋白质核酸绑定残基

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            【学位论文】 作者:陈白雪导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2015年

            【摘要】 基于小分子配体的保守性,我们实验室提出了原始蛋白结构起源的小分子诱导模型,认为最早产生的蛋白质是由ATP诱导选择产生的。采用cDNA展示技术,对该假说进行了初步验证,获得的丰度最高的蛋白质具有ATP结合能力及ATP水解活性。本课题在该研究基...

            【关键词】 蛋白质原核表达载体

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            【学位论文】 作者:崔望导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2015年

            【摘要】 随着测序技术的蓬勃发展,国际科研机构,如1000 Genomes和HapMap,陆续启动了关于单倍型的研究项目,包括单倍型的组装、等位基因的特异性表达以及自然遗传变异的亲本传递效应等。这些研究揭示了单倍型的个体差异,群体的偏好以及对于疾病的...

            【关键词】 单倍型Hi-C数据

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            【学位论文】 作者:裴志华导师:张红雨   杨庆勇   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2015年

            【摘要】 植物开花性状受多基因共同调控,其深入分析对清楚认识开花机制,了解生物功能,提高经济作物产量以及改良轮作制度都具有重要意义。自上个世纪起,研究者以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为研究对象,通过基因突变、基因敲除、G...

            【关键词】 拟南芥开花时间

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            【学位论文】 作者:康寿凯导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2015年

            【摘要】 转录调控是各项生命活动的基础,探究其内在的分子机制是当今生命科学研究的核心问题,具有重要的意义。全面测定转录调控过程中涉及的多种蛋白质-核酸以及蛋白-蛋白之间的相互作用,是揭示复杂调控机制的关键。现行的各种针对于蛋白质-核酸互作与蛋白-蛋白...

            【关键词】 转录调控原位邻近连接

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            【学位论文】 作者:裴志华导师:张红雨   杨庆勇   华中农业大学   生物学 生物信息学(硕士) 2015年

            【摘要】 植物开花性状受多基因共同调控,其深入分析对清楚认识开花机制,了解生物功能,提高经济作物产量以及改良轮作制度都具有重要意义.自上个世纪起,研究者以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为研究对象,通过基因突变、基因敲除、G...

            【关键词】 拟南芥开花时间

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            【学位论文】 作者:郑觉非导师:张红雨   杨庆勇   华中农业大学   生物学 生物化学与分子生物学(硕士) 2015年

            【摘要】 近年来高通量测序技术发展迅速,相比以往,DNA测序成本更低,效率更高,规模也越来越庞大。但如何利用基本骨架(scaffolds)在染色体上水平组装出高质量基因组一直是基因组测序工作面临的难题。利用高通量染色体构象捕获技术(Hi-C),研究者...

            【关键词】 植物基因组染色体交互

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            【学位论文】 作者:李綎瑄导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物化学与分子生物学(硕士) 2014年

            【摘要】 细菌作为地球上最古老的物种之一,具有比真核生物更简单的细胞结构和独特的遗传物质组织调节方式。作为遗传学上经典的模式生物,大肠杆菌的染色体以1000倍以上的比例压缩凝聚在细胞中,与细胞中的蛋白质,RNA等共同构成拟核结构。近年来的研究表明细菌...

            【关键词】 TCC技术染色体

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            【学位论文】 作者:李建昕导师:张红雨   彭城   华中农业大学   其他 工程(硕士) 2014年

            【摘要】 计算机数据信息的爆炸性增长,正在改变着数据的存储、分析和可视化的方式,促进信息行业的发展,并且渗透到生活的各方面,成为我们日常生活中必不可少的一部分。近年来,随着基因组二代测序技术的迅速发展以及各种“组”学技术层出不穷,以核酸数据库为代表,...

            【关键词】 3D基因组数据可视化浏览器

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            【学位论文】 作者:朱强导师:张红雨   华中农业大学   生物学 生物信息学(博士) 2014年

            【摘要】 随着基因组、转录组、蛋白质组等各种“组学”研究计划的蓬勃开展,生命科学进入了“组学”时代。代谢组学(metabolomics)作为一门对体内各种代谢途径、代谢产物进行高通量和系统分析的学科,是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后系统生物学的另...

            【关键词】 细菌代谢物化学信息学

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            【学位论文】 作者:贾西帅导师:张红雨   华中农业大学   生物学 微生物学(硕士) 2014年

            【摘要】 蛋白质起源是生命起源研究的核心课题之一。以前通过分析小分子配体在蛋白质空间中的分布模式,我们提出了原始蛋白结构起源的小分子诱导模型,即c.37折叠类型是小分子配体ATP诱导、选择产生的。本论文拟采用cDNA展示技术对该模型进行检验,并在此基...

            【关键词】 原始蛋白cDNA展示技术

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