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【中文期刊】 徐金瑞 吕翠萍 等 《吉林大学学报(医学版)》 2019年45卷1期 12-16,后插1页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过卡介苗 (BCG) 感染牛肺泡巨噬细胞 (BAM) 的转录组测序及生物信息学分析, 揭示差异表达的基因和长链非编码RNA (lncRNA) , 为巨噬细胞抗结核分枝杆菌感染的免疫调控机制研究提供理论依据.方法:采用肺脏灌洗离心法收...
【中文期刊】 王大玮 周凡 等 《植物研究》 2019年39卷1期 148-155页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 以怒江红山茶叶片为材料,采用Illumina Hiseq 2000平台测序,共获得140 996条无冗余的序列,进行SSR位点搜索后,得到32 696个SSR位点,出现频率为23.2%.所搜索的SSR以二核苷酸重复类型最多,三核苷酸和单核苷...
【中文期刊】 青薇 代彦君 等 《中国组织工程研究》 2019年23卷2期 239-244页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:近年来国内外研究将辛伐他汀缓释微球组装在支架材料上,发现其可完成骨缺损的修复,取得不错的效果.目的:探讨辛伐他汀缓释微球对组织工程成骨性能的影响.方法:采用薄膜分散法制作纳米脂质体辛伐他汀缓释微球,检测其粒径和多分散系数及包封率.采用...
【中文期刊】 于浩滢 高冉冉 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2019年21卷5期 859-866页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的:以丹参基因组及全长转录组数据库为基础,对丹参酮生物合成关键酶基因进行预测,进一步推进丹参酮生物合成途径的解析.方法:结合丹参中CYP450s的系统发育鉴定丹参CYP71clan成员,采用生物信息技术分析其差异表达、基因结构和保守基序等...
【中文期刊】 邹辛联 周安佩 等 《西北植物学报》 2019年39卷2期 240-249页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究以滇杨正、倒扦插苗为对象,于速生期(8月)收集插穗主枝萌发处下侧树皮组织和主枝的叶片组织进行转录组比较分析.结果显示:(1)正、倒扦插滇杨苗于2种组织中的转录调控变化存在差异;测序得到358 587条Unigenes,并于叶片组织和树...
【中文期刊】 张少平 郑开斌 等 《西北植物学报》 2019年39卷9期 1551-1558页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为获取紫背天葵(Gynura bicolor D C.)花青素合成代谢相关调控基因信息,该试验以紫背天葵叶片为材料,以其花朵为对照,进行转录组测序,并进行CHS、CHI、F3H等8类合成酶基因以及MYB、bHLH及WD40等3类转录因子检索...
【中文期刊】 苗成利 孙春艳 等 《中国老年学杂志》 2019年39卷12期 2995-2999页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 通过转录组测序分析颗粒物(PM)2.5是否会在肠道中积累并引起基因表达的异常.方法 采用BALB/c品系小鼠,将处理过的PM2.5硅胶颗粒采用直接饲喂方式进行培养,分别取喂食10 d和30 d的小鼠大肠黏膜进行转录组测序并进行基因表达...
【关键词】 颗粒物(PM)2.5; 肠道炎症; 转录组测序;
【中文期刊】 张威 叶颖江 等 《北京大学学报(医学版)》 2019年51卷3期 542-547页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探索直肠癌新辅助放化疗的敏感性分子特征.方法:前瞻性收集局部进展期中、低位直肠癌30例患者的临床病理资料,包括一般情况、放化疗前影像学资料、放化疗前活组织病理检查资料、肿瘤分化程度等9项指标,分析其与直肠癌放化疗后肿瘤消退分级(tum...
【中文期刊】 周志军 韩媛吕 等 《环境昆虫学报》 2019年41卷4期 799-807页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 优雅蝈螽Gampsocleis gratiosa是一种在我国具有悠久人工饲养历史的鸣虫.简单重复序列(Simple sequence repeats,SSR)非常适用于种群遗传研究.本文运用MISA软件分别在优雅蝈螽转录组和基因组浅层测序结...
【中文期刊】 郑知临 曹红利 等 《西北植物学报》 2019年39卷9期 1534-1542页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究以‘铁观音’茶树品种的种子为试验材料,采用转录组测序技术分析种子发育的3个时期(幼果期、膨大期、成熟期)的表达差异,探究茶树种子油脂代谢的分子机制.结果 表明:(1)经转录组测序、组装后共获得30 940 581个clean read...
【中文期刊】 李琳 肖瑶宇 等 《西北植物学报》 2019年39卷8期 1379-1388页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为深入挖掘中国水仙转录组中萜类合成相关基因,了解中国水仙萜类代谢途径和分子调控机制,该研究以'云香'水仙为材料,在其盛花期花瓣与副冠转录组测序的基础上,筛选已注释的萜类合成途径基因并利用NCBI blastn进行再注释,通过对部分候选基因的...
【中文期刊】 鲁武锋 李丽芳 等 《环境昆虫学报》 2019年41卷4期 789-798页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 泽兰实蝇Procecidochares utilis Stone是恶性杂草紫茎泽兰Eupatorium adenophorum Spreng重要的专食性天敌.为进一步开发泽兰实蝇的基因资源,深入了解其遗传信息,本研究采用Illumina H...
【中文期刊】 张欣 王沐淇 等 《临床肝胆病杂志》 2019年35卷10期 2272-2277页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 构建Mindin低表达的Huh7细胞并对其进行转录组学研究,以探索Mindin的生物学作用.方法 设计并合成Mindin干扰序列,通过慢病毒载体GV248将其导入Huh7细胞,实时定量PCR检测对Mindin转录水平的抑制效果,获得M...
【中文期刊】 秦婷玉 刘静 等 《中国肿瘤临床》 2019年46卷16期 861-864页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 选择性剪接(alternative splicing,AS)为真核细胞中pre-mRNA通过选择不同的剪接位点产生转录组和蛋白质组多样性过程,并受多个顺式作用元件和反式作用因子的调控.慢性髓系白血病(chronic myeloid leuk...
【中文期刊】 杨莹 陈宇晟 等 《遗传》 2018年40卷11期 964-976页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化.近年来,在DNA和蛋白质修饰基础上,可逆RNA甲基化修饰研究引领了第3次表观遗传学修饰研究的浪潮.RNA存在100余种化学修饰,甲基化是最主要的修...
【中文期刊】 张丽丽 张富春 《植物研究》 2018年38卷1期 91-99页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 盐穗木(Halostachys caspica)是荒漠盐碱地广泛分布的盐生植物,具有极强的耐盐性.为揭示盐胁迫下盐穗木基因组层面的基因表达变化特性,通过对300和500 mmol·L-1 NaCl胁迫3h的盐穗木同化枝进行了转录组测序.有效...
【中文期刊】 余鹏 邱一果 等 《南方医科大学学报》 2018年38卷8期 901-909页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究地塞米松(DEX)对内毒素诱导性葡萄膜炎(EIU)的治疗效果及转录组测序探讨其潜在的机制.方法 将125ng脂多糖(LPS)注射入雌性BALB/c小鼠玻璃体内建立EIU模型,每隔4h用0.1% DEX滴眼,共6次.注射LPS后24...
【关键词】 转录组测序; 内毒素诱导性葡萄膜炎; RIG-I类受体信号通路;
【中文期刊】 赵建华 尹跃 等 《西北植物学报》 2018年38卷5期 816-822页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究以‘宁杞1号’枸杞果实为材料,基于转录组测序TR28373|c0_g1序列,利用RT-PCR技术,克隆出枸杞果糖激酶基因LbFRK7的全长序列为1 060 bp,其中,ORF开放阅读框为1 044 bp,编码有348个氨基酸,蛋白质分...
【中文期刊】 何浩强 陈光 等 《世界科学技术-中医药现代化》 2018年20卷1期 1-6页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 中医证候是中医理论的精粹部分,其生物学基础研究是证明中医科学性和中医药现代化的关键环节.转录组学从分子水平研究证候相关基因转录及转录调控规律以探索证候生物学基础,目前在证候研究中得到一定应用.本文对中医证候转录组学研究进行综述,包括转录组学...
【中文期刊】 王晓云 陈渝渝 等 《中国抗生素杂志》 2018年43卷6期 759-764页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 为了初步了解广藿香酮抗金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的分子机制.方法 本研究用琼脂稀释法测定广藿香酮的药物敏感性,通过对金黄色葡萄球菌ATCC25923在1倍最低抑菌浓度(minimum inhibito...
【中文期刊】 丁蒙蒙 时小东 等 《广西植物》 2018年38卷1期 90-100页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 楠木(Phoebe zhennan)为樟科常绿乔木,是国家二级重点保护树种.楠木生长缓慢,木材形成所需周期较长,其原因有待进一步深入分析.近年来转录因子已成为植物分子生物学研究的热点,高通量测序技术的应用和发展促进了转录因子的挖掘和深入分析...
【中文期刊】 纪艳丽 彭广华 《眼科新进展》 2018年38卷1期 84-88页 ISTICPKUCA
【摘要】 单细胞转录组测序技术(single-cell RNA-sequencing,sc RNA-seq)是从单个细胞水平分析细胞转录组的表达谱,用于鉴定细胞特异性标记物,发现罕见细胞类型、细胞亚型,揭示细胞之间的差异表达,成为研究复杂生物体系细胞...
【中文期刊】 姚运法 张少平 等 《西北植物学报》 2018年38卷11期 2000-2009页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 采用Illumina Hi-seq 2500转录组高通量测序,构建黄秋葵花和果荚转录组文库,并利用测序评估、差异基因功能注释等生物信息学方法进行分析.研究结果表明:(1)分别获得黄秋葵花和果荚有效数据7.12 Gb和8.14Gb,碱基百分比...
【中文期刊】 李彦 焦秀洁 等 《西北植物学报》 2018年38卷7期 1244-1253页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用Illumina HiSeqTM 2000对山地虎耳草和棒腺虎耳草进行转录组测序,分析和比较其SSR和SNP特征.结果表明:山地虎耳草63 763条Unigene序列中含有4 622个SSR,发生频率为7.25%,有110种重复基元,平...
【中文期刊】 李彦 更吉卓玛 等 《植物研究》 2018年38卷6期 939-947页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用MISA (MicroSatellite)软件对山地虎耳草转录组拼接序列进行微卫星位点信息分析,为后期SSR标记的开发和物种遗传多样性检测提供候选序列.结果发现,在拼接得到的63 763条Unigene序列中含有4 622个SSR,发生...
【中文期刊】 唐文龙 赵鹏飞 等 《西北植物学报》 2018年38卷3期 439-444页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究在转录组数据分析基础上,通过RT-PCR方法从牡丹(Paeonia suf fruticosa.L)品种‘洛阳红’中克隆AGL6基因,并分析了其在不同组织和花型中的表达模式.结果显示:(1)AGL6开放阅读框长度732 bp,编码24...
【中文期刊】 陈燕 吕科良 等 《西北植物学报》 2018年38卷11期 1986-1999页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解龙眼ERF家族的基本性质以及在体胚发生早期的表达规律,该研究对龙眼基因组鉴定出108个ERF家族成员进行基本理化性质分析与进化树构建,并结合龙眼转录组及miRNA、lncRNA数据库对DlERF家族成员与lncRNA、miRNA之间的...
【中文期刊】 李文建 冯景 等 《西北植物学报》 2018年38卷4期 615-623页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为探究建兰花色形成的分子调控机理,该研究以同株建兰黄绿色、红色花瓣为实验材料,采用高通量High-seq测序技术进行转录组文库构建,从基因水平探索花色物质的合成代谢通路及关键调控基因的转录活性.结果表明:(1)转录组测序共获得131 110...
【中文期刊】 于婉晨 王世军 等 《北京中医药大学学报》 2018年41卷9期 759-770页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨虚寒证的发生及黄芪水煎液对虚寒证产生治疗作用的分子机制.方法 选用传统中药复方(生石膏、龙胆草、黄柏、知母)按照2:1.2:1:1.5的比例,灌胃给药16 g/(kg·d),持续14 d,建立虚寒证大鼠模型.模型建立后,采用SPS...
【中文期刊】 谭香玉 晏容 等 《中成药》 2018年40卷3期 691-695页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过RNA-seq分析斑蝥素酸镁对肝癌细胞转录组的影响,为阐明斑蝥素酸镁对肝癌细胞增殖的抑制效应提供分子信息,以期为临床上利用斑蝥素酸镁治疗肝癌提供相关理论基础.方法 体外培养的肝癌细胞株SMMC-7721,用不同浓度(0、0.895...
【关键词】 斑蝥素酸镁; 肝癌细胞SMMC-7721; 转录组;
【中文期刊】 戎利勤 李晓冬 等 《西北植物学报》 2018年38卷8期 1437-1442页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 该研究采用高通量测序技术Illumina HiSeq 2000,对小花草玉梅花器官进行转录组测序,挖掘参与其花发育相关的基因.测序结果得到54513822个序列读取片段(reads),包含7826726115 bp的碱基序列信息.将测序数据...
【中文期刊】 邓亦麒 何兴金 等 《西北植物学报》 2018年38卷6期 1039-1047页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 叶子花(Bougainvillea spectabilis Willd .)的苞片色彩鲜艳,呈花瓣状,在景观园艺和环境美化有着广泛应用.为了进一步了解花瓣状苞片的演化机制,该研究采用RNA-seq技术分别对苞片和叶片进行测序,比较苞片和叶片...
【中文期刊】 蒋海港 王树刚 等 《植物研究》 2018年38卷3期 415-421页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 慈竹(Bambusa emeiensis)纤维素含量丰富,是较好的造纸原料,但竹茎中木质素影响着制浆生产及纸浆质量.目前,对慈竹木质素生物合成机制所知甚少,这限制了遗传调控竹木质素的研究.本文以拟南芥、水稻等植物的已知木质素基因作为查询序列...
【中文期刊】 王华 张石虎 等 《热带亚热带植物学报》 2018年26卷5期 515-522页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解杜鹃花(Rhododendron pulchurum)转录因子在干旱胁迫下的表达模式,利用高通量测序技术,对不同水分条件下"白凤4号"叶的转录因子表达谱进行分析.结果表明,在不同水分处理间有34~161个差异表达的转录因子,杜鹃花响应...
【中文期刊】 王荣 成梦琳 等 《植物研究》 2018年38卷4期 559-567页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 以栀子叶片为材料,通过转录组测序与液相色谱技术来研究黑暗条件下褪黑素对栀子叶片类黄酮含量及相关基因表达水平的影响,结果显示褪黑素不仅延缓了栀子叶片的黄化,而且主要通过抑制类黄酮等生物合成途径上的相关基因表达,进而减少类黄酮积累来延缓叶片黄化...
【中文期刊】 王培育 王丛巧 等 《西北植物学报》 2018年38卷9期 1587-1597页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了解文心兰miRNA的序列特性及其在不同组织部位中以及软腐病侵染过程中的表达规律,该研究对文心兰转录组及miRNA数据库中的25条miRNA前体(pre-miRNA)序列和15条成熟体序列进行序列特性分析,并对25条pre-miRNAs在...
【关键词】 文心兰; pre-miRNAs; 序列特性;
【中文期刊】 李彦杰 刘仁华 等 《生态学报》 2018年38卷23期 8434-8441页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究狗牙根对水淹环境的适生性机制,取长势一致的狗牙根分为未水淹对照组(A1)和30 cm沉水处理组(A2),A2水淹15d后两组同时采样,提取样本总RNA作转录组测序.A1和A2测序数据经de novo组装分别获得128031和83363...
【中文期刊】 张少平 赖正锋 等 《热带亚热带植物学报》 2018年26卷2期 125-132页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为获取紫背天葵(Cynura bicolor)花青素合成相关转录调控因子MBW家族基因,采用二代高通量测序技术进行全转录功能基因组测序后组装,再通过Pfam、SwissProt和Nr数据库搜索,共获得138个MBW相关Unigene,分别有...
【中文期刊】 任岚 肖茹丹 等 《遗传》 2018年40卷11期 998-1006页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLFs)是锌指蛋白超家族的一个亚家族,参与细胞内的多种生理、病理过程,该家族成员在红细胞分化发育过程中发挥非常重要的作用,但是家族成员间对红系分化的协同调控作用还鲜有报道.本...
【中文期刊】 陈亘浓 黄河清 等 《环境昆虫学报》 2018年40卷6期 1219-1224页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 黑腹胃蝇是中国新疆荒漠地区马科动物马胃蝇蛆病最主要的病原体.本研究基于已获得的黑腹胃蝇的转录组数据,利用MISA软件(1.0版)对黑腹胃蝇转录组中1 kb以上的Unigene进行SSR位点分析.在黑腹胃蝇转录组25 847条Unigenes...
【中文期刊】 王嵘晔 李春磊 等 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 2018年39卷6期 461-469页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:鉴定海洋中药魁蚶(JNY-2)中发挥抗肿瘤作用的蛋白成分.方法:运用JNY-2转录组测序reads,de novo组装unigenes,构建JNY-2转录组数据库;通过液质联用技术联合转录组数据,对分离得到的JNY-2活性蛋白组分JN...
【中文期刊】 谢睦南 马骏 等 《环境昆虫学报》 2018年40卷2期 425-432页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 检疫辐照处理通过电离辐射来灭杀进出口货物中的检疫性害虫.明确辐照处理的分子机制,找到既能有效灭杀处理对象,而又能量消耗经济,且不会对货物质量造成损伤的合适辐射剂量是研究辐照处理的关键基础性问题.本研究对检疫性害虫——新菠萝灰粉蚧分别采用10...
【中文期刊】 洪森荣 吴辉 等 《植物研究》 2018年38卷1期 100-109页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 以黄独微型块茎为材料,进行了4℃低温离体保存,并对其进行了转录组分析.结果表明:原始数据进行质量预处理后,对照组(Con25)和处理组(Con4)的reads有效比分别为98.67%和98.69%;对拼接序列去重复后最终得到了219 792...
【中文期刊】 李婷 李璐 等 《生物学杂志》 2018年35卷2期 1-6页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 基底型乳腺癌许多特性与肿瘤干细胞十分相似,为筛选出基底型乳腺癌的关键靶点,从乳腺癌干细胞入手,采用乳腺癌干细胞标志物CD44+CD24-/low流式分选HCC1937和SUM149PT乳腺癌细胞系的干细胞及非干细胞,利用高通量转录组测序筛选...
【关键词】 基底型乳腺癌; 肿瘤干细胞; CD44+CD24-/low;
【中文期刊】 周家伟 刘雨佳 等 《世界中医药》 2018年13卷2期 259-263页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:单加氧酶(Monooxygenase,MO)是一类通过在底物上加一个氧原子的加氧酶,在动植物体内参与多种代谢途径.本实验致力于从雷公藤转录组数据中克隆得到单加氧酶基因cDNA全长,并对克隆得到的MO基因进行初步的功能分析.方法:通过对...
【中文期刊】 甘云 林瑞庆 等 《中国人兽共患病学报》 2018年34卷1期 54-59页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 代谢组学是继后基因组学、转录组学和蛋白质组学之后迅速发展起来的一门新兴学科,由于其独特的优点,现已成为一种重要的研究手段,目前主要应用于药物研发、疾病监测与诊断等领域.随着代谢组学技术的逐渐成熟以及新的分析方法的逐步建立,代谢组学的应用越来...
【中文期刊】 李轶 刘会占 等 《中华耳科学杂志》 2018年16卷1期 110-117页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 本文介绍使用微吸管技术分类收集高纯度的内耳毛细胞的方法.方法 将成年小鼠内耳基底膜与Corti's器一起分离,使用胶原酶消化后获得游离单个细胞,采用微吸管对内耳毛细胞、支持细胞进行分类收集、提取总RNA,并进行单类细胞成分的转录组分析...
【中文期刊】 张纯 唐承晨 等 《生物学杂志》 2017年34卷2期 86-90页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 逆境胁迫是制约植物正常生长发育的重要因素,探索植物应答逆境胁迫的分子机制也是人们长期探索的重要课题.随着模式植物基因组测序工作的完成,植物学的研究也进入了功能基因组时代.作为功能基因组学的一个重要方面和全新的研究领域,转录组学有助于人们从转...
【中文期刊】 刘亚军 张峰 等 《遗传》 2017年39卷8期 717-725页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 基因转录调控及其机制分析是后基因组时代生物学研究的重点之一.随着高通量测序技术的发展,人们可以从不同层面研究基因的转录调控行为,从转录组、转录因子结合,到染色质局部结构和整体空间构象,可系统分析转录调控的分子机制.干细胞分化过程的转录调控分...