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【中文期刊】 李威材 秦刚 等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷4期 344-355页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载 2 个符合本研究...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高志鹏 贾迪 等 《哈尔滨医科大学学报》 2024年58卷2期 120-128页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中预后相关免疫基因并解析其在乳腺癌中的预后价值.方法 获取癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库1 086 例乳腺癌样本和...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏轶楣 滕腾 等 《中国医药导报》 2024年21卷24期 109-116,145页ISTICCA
【摘要】 目的 应用生物信息学对变应性鼻炎患者与健康对照者的鼻黏膜细胞间差异表达基因进行分析,探索变应性鼻炎的发病机制及关键基因.方法 从GEO数据库中下载5名健康对照者鼻上皮细胞样品和7例变应性鼻炎患者鼻上皮细胞样品的芯片数据(GSE43523)....
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 布娅·米然别克 贺欢 等 《临床消化病杂志》 2024年36卷4期 239-244页ISTICCA
【摘要】 [目的]通过生物信息学方法挖掘溃疡性结肠炎(ulcerative colititis,UC)致病关键基因.[方法]从公共基因芯片数据平台下载GSE53306和GSE38713基因芯片数据集,对UC活动期患者、UC静止期患者和健康志愿者进行分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 罗焱瑞 赵倩 《天津医科大学学报》 2024年30卷3期 205-211,254页ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学方法整合肝癌转录组和甲基化组数据,利用Lasso回归分析筛选肝癌特异性标志物,并构建肿瘤预测模型.方法:在GEO(gene expression omnibus)中下载GSE70091、GSE77314数据集,共53例肝...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曾春艳 李俊 等 《南昌大学学报（医学版）》 2024年64卷5期 81-87页ISTIC
【摘要】 目的 了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据.方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 舒佳玉 王欢 等 《现代肿瘤医学》 2024年32卷19期 3636-3642页ISTICCA
【摘要】 目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)中铁死亡相关新型生物标志物,并分析免疫细胞浸润情况.方法:从GEO数据库中下载OSCC数据集.利用R软件筛选差异表达基因(DEGs)并进行功能和通路富集分析,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究基...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 崔永康 苟小军 等 《医学研究杂志》 2024年53卷12期 78-87页ISTIC
【摘要】 目的 探讨非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关键基因,构建NAFLD疾病进程的风险预测模型并进行验证.方法 基于GEO数据库中已有的NAFLD表达谱芯片数据集,采用差异表达基...
【关键词】 非酒精性脂肪性肝病；差异表达基因分析；KEGG通路富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 申杨 段子博 等 《天津医科大学学报》 2024年30卷5期 391-398页ISTIC
【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选外阴鳞状细胞癌(VSCC)的关键基因及分析免疫浸润特征.方法:从GEO数据库中下载VSCC相关基因表达数据,应用差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析筛选出共同的DEGs,对DEGs进行富集分析.采...
【关键词】 外阴鳞状细胞癌；加权基因共表达网络分析；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王俊丽 郭纪敏 等 《中国卫生标准管理》 2024年15卷15期 144-148页
【摘要】 目的 研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白 2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制.方法 通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组...
【关键词】 毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A；差异表达基因；GO富集分析；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 邓颖 刘迪 等 《湖北工业大学学报》 2024年39卷4期 41-49页
【摘要】 针对胰腺癌临床症状隐匿、诊断及治疗困难等特点,利用生物信息学技术,旨在鉴定可能参与PC发生或发展的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),为该疾病的早期诊断和预防提供理论支持.从GEO数据库下...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苟彩霞 卢亚琼 等 《甘肃医药》 2024年43卷9期 792-797页
【摘要】 目的:使用生物信息学的方法,鉴别出与宫颈癌远处转移相关的潜在生物学标记物,并对其机制进行研究.方法:使用R语言分析,利用TCGA数据库,挖掘出宫颈癌远处转移患者与非远处转移患者之间的差异表达基因集,进一步筛选出两组基因集的共差异表达基因,对...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 佘细虹 曾智 等 《内科》 2024年19卷3期 302-307页
【摘要】 目的 应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)联合差异表达基因(DEG)分析法鉴定重度抑郁症(MDD)的关键基因.方法 从基因表达数据库中获取MDD患者和健康志愿者死后脑组织mRNA微阵列数据.应用WGCNA和DEG分析法筛选与MDD最显著...
【关键词】 重度抑郁症；加权基因共表达网络分析；生物标志物；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈晓玲 杨娟 等 《现代医药卫生》 2024年40卷7期 1109-1117页
【摘要】 目的 识别结直肠癌中的差异表达基因(DEGs),探索结直肠癌的关键通路和基因.方法 选取来自基因表达综合数据集的基因表达谱GSE211496、GSE6988和GSE29900数据集,使用GEO2R分析工具进行分析并下载相关数据,通过在线数据...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 宋红红 《吉林医学》 2024年45卷7期 1618-1622页CA
【摘要】 目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制.方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906 和GSE74341 三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘晓雅 常孟孟 等 《中国现代医生》 2024年62卷14期 6-10,18页
【摘要】 目的 利用基因共表达权重网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索与尿道下裂发病相关的潜在基因.方法 利用WGCNA算法将数据集GSE35034 处理并构建基因共表达权重...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董俊娟 都日娜 等 《内蒙古医学杂志》 2024年56卷1期 11-17页
【摘要】 目的 通过对紫外线照射后人皮肤表皮细胞基因芯片的生物信息学分析,获得光损伤性皮肤病的关键基因,探索其发病机制.方法 从GEO数据库中获取2个紫外线照射后人皮肤表皮细胞株HaCat的基因芯片数据集,第一个基因芯片数据集采用R软件筛选出显著性差...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈菊萍 王雨璇 等 《皮肤病与性病》 2024年46卷5期 319-323页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出雄激素性脱发(AGA)的差异基因(DEGs)和可能与雄激素性脱发发病相关的通路,为AGA的发病机制和治疗方案提供新思路.方法 从GEO数据库下载雄激素性脱发相关基因芯片表达谱;筛选出DEGs并进行富集分析;基于...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘梦莹 蔡浩 等 《赣南医学院学报》 2024年44卷5期 441-449页
【摘要】 目的:高通量筛选结合生物信息学分析方法寻找乳腺癌关键基因,为探讨乳腺癌潜在分子标志物、提高对乳腺癌发生发展机制的认识提供指导.方法:⑴从GEO数据库筛选所需基因芯片数据集,利用GEO2R在线分析各数据集的差异表达基因,绘制韦恩图得到共同显著...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杨新瑞 刘艳华 等 《包头医学院学报》 2024年40卷1期 30-35页CA
【摘要】 目的:通过生物信息学的方法挖掘帕金森病(Parkinson's disease,PD)的关键基因,为PD提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征.方法:从高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库下载合并GS...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 赵茜 冯晓诗 等 《锦州医科大学学报》 2024年45卷4期 1-10页CA
【摘要】 目的 鉴定和验证胶质瘤发生发展及预后的相关基因.方法 利用孟德尔随机化方法筛选与胶质瘤发生风险相关的蛋白.基于TCGA数据库获取胶质瘤组织与癌旁组织的差异表达基因,整合风险蛋白和差异表达基因,并使用LASSO回归分析进一步筛选关键基因;使用...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陆博文 秦森彪 等 《重庆邮电大学学报（自然科学版）》 2024年36卷4期 707-715页
【摘要】 乳腺癌脑转移(breast cancer brain metastasis,BCBM)的发病机制尚未明确.为了探究BCBM的发病机制,对BCBM差异表达基因的生物学功能进行研究并筛选关键调控基因.从基因表达综合数据库(gene expres...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 何雅慧 陈芝涛 等 《中国医药科学》 2024年14卷9期 26-30页
【摘要】 目的 基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路.方法 本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STR...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 苏曦阳 尹安康 等 《中国现代医生》 2024年62卷26期 9-14页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法分析阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)和血管性痴呆(vascular dementia,VD)与正常对照组的差异表达基因(differentially expressed genes,DEG...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 郑家裕 严玲欣 等 《蛇志》 2024年36卷2期 177-186页
【摘要】 目的 基于GEPIA数据库探讨正常组织与肺腺癌组织的差异表达基因以及差异表达基因与肺腺癌分期的关系,Ka-plan-Meier Plotter数据库分析该基因对肺腺癌患者生存预后的影响和TIMER数据库分析差异表达基因与肿瘤免疫细胞浸润的关...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 侯志娟 文普帅 《中国医科大学学报》 2023年52卷2期 126-131页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 通过生物信息学方法探讨结直肠癌转移的分子机制,为结直肠癌转移提供潜在的治疗靶点.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载GSE41568数据集,用Limma软件包筛选转移性和原发性结直肠癌的差异表达基因;通过加权基因共表达网络分析(...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 董博清 李杨 等 《器官移植》 2023年14卷1期 83-92页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活.方法 在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集.GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱虹颖 王建波 《介入放射学杂志》 2023年32卷9期 875-880页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 从分子水平探索支架内再狭窄(ISR)的关键基因,以及ISR的发病机制.方法 通过基因表达综合(GEO)公共数据库获取GSE46560数据集,利用R语言的limma包分析获得ISR组与对照之间的差异表达基因(DEG),并对外周血的微阵列...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陶丽竹 陈健 等 《四川动物》 2023年42卷2期 161-171页ISTICPKU
【摘要】 为探讨低氧胁迫对唇(?)Hemibarbus labeo和杂交(?)基因表达水平的影响,基于Illumina HiSeq高通量测序平台,对低氧条件下唇(?)和杂交(?)肝脏组织进行转录组测序并开展生物信息学分析.结果显示,唇(?)和杂交(?...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 毛戬 温萍萍 等 《安徽医科大学学报》 2023年58卷12期 2081-2088页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探究环状RNA(circRNA)在癫痫发病中的可能作用机制.方法 利用circRNA基因芯片检测癫痫患者与健康对照者外周静脉血中circRNA表达谱筛选出差异表达的 circRNA.利用 circPrimer、circMir、Targ...
【关键词】 环状RNA_0017178；癫痫；差异性表达；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙语新 龚晓娟 等 《法医学杂志》 2023年39卷5期 433-440页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法筛选出经尸体检验确诊的婴儿猝死综合征(sudden infant death syn-drome,SIDS)和婴儿感染性猝死(infectious sudden death in infancy,ISDI)死者脑、心...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 袁悦 王雪妍 等 《微生物学杂志》 2023年43卷1期 20-31页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为挖掘微杆菌(Microbacterium sp.)XT11在黄原胶降解过程中起关键作用的功能基因,预测黄原胶降解通路,利用转录组测序技术对该菌株在不同碳源培养条件下的转录本进行测序,对差异基因进行功能富集分析.结果表明,菌株XT11以葡萄...
【关键词】 Microbacterium sp.XT11；黄原胶降解；转录组；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 黄子葵 李斐 等 《中国医学科学院学报》 2023年45卷4期 597-607页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于系统生物信息学分析鼻咽癌样本基因芯片数据,筛选鼻咽癌的潜在预测基因,并对其进行实验验证.方法 通过基因表达综合数据库筛选鼻咽癌数据集,通过limma包进行差异分析,加权基因共表达网络包进行加权基因共表达网络分析,绘制韦恩图寻找共同...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 夏天 金志勇 等 《中国临床神经外科杂志》 2023年28卷8期 504-507,512页ISTIC
【摘要】 目的 探讨脑胶质瘤预后模型的构建方法及预测效果.方法 从CGGA数据库获得脑胶质细胞瘤的样本数据,进行差异表达基因(DEGs)分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA),获得关键基因,采用Lasso-Cox方法分析有效关键基因并计算风险评分...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 孙家官 瞿蓉蓉 等 《新乡医学院学报》 2023年40卷11期 1032-1038页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选结核感染的免疫调控基因,为结核病诊断和治疗提供新靶标.方法 选择 2019 年 7 月至 9月青海省第四人民医院收治的5 例肺结核患者为研究对象,分别于初诊(进展期)和抗结核治疗6 个月后(好转期)用PAXgene全血RNA管采集...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高雅宁 李健 等 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2023年17卷1期 27-33页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 夏悦昕 刘志远 等 《临床输血与检验》 2023年25卷1期 82-87页ISTICCA
【摘要】 目的 筛选先天性纯红细胞再生障碍性贫血(diamond-blackfan anemia,DBA)氧化应激相关差异基因,以及关键信号通路,为深入研究DBA的分子机制提供新的切入点.方法 采用GEO数据库的mRNA表达芯片数据GSE14335,...
【关键词】 先天性纯红细胞再生障碍性贫血；生物信息学分析；差异表达基因；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 梅玉洁 安恒庆 等 《新疆医科大学学报》 2023年46卷2期 259-263页ISTICCA
【摘要】 目的 基于公共数据库构建前列腺癌的预后风险预测模型.方法 下载TCGA数据库中前列腺癌相关数据及GEO数据库的GSE104131数据集,对GSE104131测序数据进行加权基因共表达网络分析,得到关联前列腺癌(PCa)组织最高的关键模块,并...
【关键词】 前列腺癌；加权基因共表达网络分析；差异表达；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 钱晗 曹梦菲 等 《实用临床医药杂志》 2023年27卷3期 21-28,34页ISTICCA
【摘要】 目的 基于外周血单个核细胞(PBMCs)寻找心肌梗死潜在的生物学标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载心肌梗死患者PBMCs的测序数据集GSE59867,基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异表达基因(DEGs)探讨心肌...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 付佳音 莫非 等 《贵州医科大学学报》 2023年48卷3期 285-292页ISTIC
【摘要】 目的 探讨胃癌(GC)组织中碳酸酐酶(CAⅨ)的临床意义及其分子机制.方法 采用基因表达谱动态数据分析(GEPIA2)数据库预测GC组织中CAⅨ基因的差异性表达,利用癌症数据分析(UALCAN)数据库分析CAⅨ表达与GC患者临床病理特征的关...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陈佳艳 唐易 等 《激光生物学报》 2023年32卷1期 26-35页ISTICCA
【摘要】 同龄的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)呈现明显的两性生长差异,即雄性个体的体长、体重皆大于雌性个体.而mTOR信号通路在细胞生长、发育以及蛋白合成过程中起重要作用.为了了解黄颡鱼两性差异的营养生长机制与mTOR信号通...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李晴晴 李小霞 等 《宁夏医科大学学报》 2023年45卷10期 987-993页ISTIC
【摘要】 目的 分析缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)基因表达芯片数据,筛选IS差异表达基因,利用生物信息分析其相关基因功能和信号通路,为IS发病机制提供分子理论基础.方法 从GEO数据库下载IS芯片表达数据,采用DESeq2、ed...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 尤红俊 任淑婷 等 《临床与病理杂志》 2023年43卷5期 888-899页ISTICCA
【摘要】 目的:对2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)测序数据进行生物信息学分析,分析长链非编...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 鄢雯 李囡 等 《基础医学与临床》 2023年43卷11期 1685-1692页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)数据库分析筛选出结肠癌(CC)组织差异表达基因,同时通过体外实验进行验证,挖掘潜在的结肠癌差异关键基因.方法 从 GEO 数据库获取人 CC 数据集 GSE10950 和 GSE74602,利用GEO2R和韦...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 陆洲成 钟树武 等 《中南医学科学杂志》 2023年51卷6期 839-844页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学筛选脓毒症中性粒细胞活化的关键基因.方法 从GEO数据库中下载4 个成人脓毒症芯片数据集(GSE69528、GSE28750、GSE57065、GSE95233),进行差异表达基因(DEG)筛选.基因本体论(GO)分析D...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 高美 尉春艳 等 《广西医学》 2023年45卷24期 3006-3011页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的差异表达基因(DEGs)及其临床意义.方法 从GEO数据库下载与HGSOC相关的基因芯片数据集GSE54388,使用R语言筛选DEGs,并采用DAVID数据库进行富集分析.选取35 例HGSOC患...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王志翊 周培森 等 《浙江临床医学》 2023年25卷7期 952-955页ISTIC
【摘要】 目的 通过基因表达综合(GEO)数据库微阵列分析,筛选出重要的肺纤维化相关泛素化基因,探讨其在肺纤维化大鼠肺组织中表达情况及作用.方法 采用GEO数据库中GSE47460和GSE70866两个数据集,利用R语言limma包获取肺纤维化组和正...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 熊华朝 严明权 等 《实用临床医药杂志》 2023年27卷19期 1-6,11页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨线粒体自噬相关基因(MRGs)在胃腺癌(STAD)中的差异表达并挖掘核心基因.方法 从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得STAD患者的临床样本信息,基于基因集富集分析(GSEA)网站和基因卡片(Ge...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 艾伦娜 刘昱圻 等 《中华老年多器官疾病杂志》 2023年22卷6期 450-455页ISTIC
【摘要】 目的 应用基因表达(GEO)数据库对冠心病患者相关基因进行研究分析,探索新的冠心病潜在调控机制.方法 检索GEO数据库,选择冠心病患者和对照者的相关基因表达谱数据.导入处理后的冠心病患者的GSE71226 数据集,利用GEO2R分析鉴定冠心...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李梁珊 赵虎 等 《检验医学》 2023年38卷9期 825-832页ISTICCA
【摘要】 目的 采用生物信息学分析方法挖掘结直肠癌(CRC)关键基因,作为潜在的预后生物标志物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库获取与CRC相关的GSE33113数据集.采用R软件中的limma程序包获取CRC组织与癌旁组织的差异表达基因,采用D...
【关键词】 差异表达基因；加权基因共表达网络分析；EXO1；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
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