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【中文期刊】 周益强 金贵善 等 《中华神经外科杂志》 2014年30卷3期 288-291页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨脑胶质瘤中血小板源性生长因子B(PDGF-B)表达水平及其基因启动子区甲基化程度与肿瘤增殖的关系.方法 运用免疫组化检测54例脑胶质瘤中PDGF-B、磷酸化Smad2(p-Smad2)和Ki-67的表达水平;运用焦磷酸测序检测上述...
【中文期刊】 王宇涛 辛国荣 等 《生态学报》 2013年33卷3期 834-843页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)是自然界分布最广泛的一类植物共生真菌,能够与大部分高等植物的根系形成共生关系.由于它们在农林、环境等领域的巨大应用潜力,国内外关于AMF物种多样性的研究一直受到...
【关键词】 丛枝菌根真菌(AMF)； 物种多样性； 寄主植物；
【中文期刊】 王璇 王建东 等 《医学研究生学报》 2013年26卷1期 19-22页 ISTICPKU
【摘要】 目的 K-ras基因在结直肠癌发生、发展中均有重要作用.K-ras野生型的患者对西妥昔单抗(Cetuximab,C225)敏感,而突变型者不敏感.文中探讨结直肠癌中K-ras基因突变情况及其临床病理学意义.方法 从结直肠癌石蜡标本中提取基因...
【中文期刊】 孙涛 邓明俊 等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷10期 1021-1025,1035页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 本研究旨在通过对贾第鞭毛虫和隐孢子虫(简称“两虫”)进行序列信息分析的基础上,利用焦磷酸测序技术建立一种快速、简单地确证两虫的方法.方法 通过序列信息比对,对贾第鞭毛虫的磷酸丙糖异构酶(triose phosphate isomera...
【中文期刊】 胡子有 韩慧 等 《南方医科大学学报》 2013年33卷7期 1053-1056页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定.方法 根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断...
【中文期刊】 石奕武 秦兵 等 《实用医学杂志》 2012年28卷9期 1444-1446页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:寻找鉴定Ⅰ型电压依赖型钠通道基因(SCN1A)突变嵌合体的有效方法,降低癫痫伴热性惊厥附加症的再发风险.方法:抽取携带已知突变c.5768A＞ G/p.Q1923R的患儿及无突变的患儿母亲的外周血全基因组DNA,将患儿的DNA与母亲的...
【关键词】 惊厥,发热性； 癫痫； Ⅰ型电压依赖型钠通道基因；
【中文期刊】 孙树梅 周浩 等 《南方医科大学学报》 2012年32卷5期 610-613页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 评价巢式PCR联合焦磷酸测序法在乙型肝炎病毒(HBV)耐药基因检测中的敏感与特异性.方法 选取rtM204I(ATT)突变型和rtM204(ATG)未突变型质粒,按照不同比例混合后,采用巢式PCR联合焦磷酸测序法对突变位点进行检测,并...
【中文期刊】 姬粉芝 王磊 等 《中华肝脏病杂志》 2012年20卷4期 280-284页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究rtA181位点突变慢性乙型肝炎(CHB)患者的用药史、临床特点及个体化治疗效果. 方法 核苷(酸)类似物(NUCs)治疗中病毒学突破并检出rtA181突变的54例CHHB及相关肝硬化患者,检测其血清HBV DNA、HBsAg定量...
【中文期刊】 剧慧栋 李月颖 等 《微生物学杂志》 2012年32卷6期 58-64页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 应用PCR-焦磷酸测序技术(pyrosequencing)一种新型快速检测奶牛乳房炎(bovine mastitis)4种主要致病菌无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)、停乳链球菌(S.dysgalactiae)、...
【中文期刊】 杜传清 毛平 等 《实用医学杂志》 2012年28卷20期 3397-3400页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:定量研究急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中BCL2L10基因启动子区异常甲基化状态,探讨其与AML的临床关系.方法:应用焦磷酸测序法,对62例原发AML患者的骨髓进行BCL2L10基因启动区甲基化...
【中文期刊】 滕士阶 周彦 等 《重庆医科大学学报》 2012年37卷12期 1102-1105页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立一种高通量、快速检测拉夫米定耐药突变的新方法,指导临床抗病毒治疗药物的选择.方法:选取150例慢性乙型肝炎患者血清标本为研究对象,乙型肝炎病毒(HepatitisB virus,HBV)DNA定量结果均阳性(拷贝数≥103拷贝/m...
【中文期刊】 陈垲钿 宗凌 等 《听力学及言语疾病杂志》 2012年20卷4期 366-370页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究焦磷酸测序(Pyrosequencing)单样本及多样本混合测序方法在遗传性聋基因筛查中的可行性及适用性.方法 利用焦磷酸测序遗传分析检测系统,选择遗传性聋常见突变位点SLC26A4 IVS7-2A>G及少见的突变位点GJB3 5...
【中文期刊】 杨芳 王磊 《山东大学学报（医学版）》 2011年49卷4期 129-132页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 研究慢性乙型肝炎(CHB)患者替比夫定(LdT)相关耐药的HBV聚合酶基因突变模式及临床特点.方法 对LdT治疗中病毒学突破的HBeAg阳性CHB,经焦磷酸测序法证实为LdT耐药突变的15例患者进行回顾性分析.结果 共检出4个耐药突变...
【中文期刊】 杨芳 王磊 《山东大学学报（医学版）》 2011年49卷4期 129-132页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 研究慢性乙型肝炎(CHB)患者替比夫定(LdT)相关耐药的HBV聚合酶基因突变模式及临床特点.方法 对LdT治疗中病毒学突破的HBeAg阳性CHB,经焦磷酸测序法证实为LdT耐药突变的15例患者进行回顾性分析.结果 共检出4个耐药突变...
【中文期刊】 孙海平 王磊 等 《山东大学学报（医学版）》 2010年48卷5期 85-88,92页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 分析HBV P基因区核苷(酸)类似物相关10个位点的变异情况.方法 采用焦磷酸测序法对NA治疗并发生病毒学突破或不充分病毒学应答的慢性乙型肝炎患者HBV P基因区10个位点(rtI169T、rtV173L、rtL180M、rtA181...
【中文期刊】 孙海平 王磊 等 《山东大学学报（医学版）》 2010年48卷5期 85-88,92页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 分析HBV P基因区核苷(酸)类似物相关10个位点的变异情况.方法 采用焦磷酸测序法对NA治疗并发生病毒学突破或不充分病毒学应答的慢性乙型肝炎患者HBV P基因区10个位点(rtI169T、rtV173L、rtL180M、rtA181...
【中文期刊】 刘夕群 朱术会 等 《遗传》 2010年32卷5期 517-523页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为了避免四酶焦测序体系中由于三磷酸腺苷双磷酸酶(apyrase)造成的测序结果偏差,文章建立了一种定量性能好的无三磷酸腺苷双磷酸酶的三酶焦测序体系.方法是将生物素修饰的DNA模板、荧光素酶和ATP硫酸化酶固定在磁性微球表面进行焦测序反应,当...
【中文期刊】 曾昭书 王黎 等 《郑州大学学报（医学版）》 2010年45卷3期 378-381页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:在全基因组中查找能够在世界各大人群中通用的高个体识别力单核苷酸多态性(SNPs)位点,以期为SNPs应用于法医学个体识别奠定基础.方法:从国际人类基因组单体型图计划(HapMap)数据库下载270名个体各约4 000 000个全基因组...
【中文期刊】 杨会勇 那广水 等 《中国药科大学学报》 2009年40卷5期 460-464页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:建立一种基于线性指数聚合酶链式反应(linear-after-the-exponential PCR,LATE-PCR)焦磷酸测序技术快速检测致病性海洋弧菌的方法.方法:首先根据海洋弧菌的16S rRNA基因和外膜蛋白K(OmpK)基...
【中文期刊】 盛艾娟 刘利新 等 《南方医科大学学报》 2008年28卷4期 567-571页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究中国北方汉族人群甘露糖结合凝集素(MBL)启动子多态性及血浆MBL浓度对HIV易感性的影响.方法 采用病例对照研究,病例组为115例北京佑安医院确诊为HIV感染的患者,对照组为115例非HIV感染的健康人,用焦磷酸测序法检测样本M...
【中文期刊】 郑瑞娟 王洁 等 《中华预防医学杂志》 2008年42卷2期 77-80页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 应用焦磷酸测序技术检测结核分枝杆菌rpoB基因突变,并探讨其在结核分枝杆菌利福平耐药性检测中的应用价值.方法 利用焦磷酸测序技术,测定150株结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因81个碱基的利福平抗药性决定区(RRDR),分析rpoB基...
【中文期刊】 许冠东 《微生物学通报》 2008年35卷1期 149-151页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 焦磷酸法最早是应用在检测DNA甲基化和SNP位点分析的一项技术,在2005年底,此技术被用来进行基因组序列的测定,已经成为下一代高通量测序中最成熟的一种技术.本篇文章着重介绍了采用焦磷酸测序法的罗氏公司最新一代高通量基因组测序系统GS FL...
【中文期刊】 林勇 关明 等 《中华检验医学杂志》 2008年31卷3期 297-300页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立基于焦磷酸测序技术的胰腺癌K-ras基因点突变的检测方法,并与Sanger测序法作一比较.方法 用焦磷酸测序法(Pyrosequencing)和Sanger测序法(Sanger sequencing)分别在10名正常胰腺组织、49...
【中文期刊】 郑瑞娟 秦莲花 等 《中华检验医学杂志》 2007年30卷7期 737-741页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用焦磷酸测序技术,建立一种高通量结核分枝杆菌利福平耐药性快速基因检测方法.方法 应用生物素标记的引物扩增rpoB基因片段,经链亲和素标记的磁珠分离制备单链模板,设计2个测序引物在焦磷酸测序仪上检测rpoB基因耐药突变区的81 bp序...
【中文期刊】 王莹 谢建平 等 《中国感染与化疗杂志》 2006年6卷5期 313-316页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨结核分枝杆菌对链霉素的耐药分子机制,建立基于焦磷酸测序(pyrosequencing)技术的快速检测结核分枝杆菌链霉素耐药性的方法.方法 用扩增后直接测序的方法检测了150株结核分枝杆菌链霉素耐药株的rpsL基因,并用pyrose...
【中文期刊】 袁建林 薛丽 等 《中华泌尿外科杂志》 2005年26卷11期 739-742页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的采用焦磷酸微测序技术,建立一种高通量、高分辨率的HLA-DRB基因型分析新方法,为临床应用提供依据.方法对HLA-DRB外显子2 DNA序列进行同源性分析,设计PCR引物,提取健康人外周血淋巴细胞基因组DNA,PCR扩增外显子2基因片段...
【中文期刊】 程绍辉 梁明华 等 《病毒学报》 2005年21卷3期 168-172页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 结合严重急性呼吸综合征(SARS)病毒株序列信息分析和高通量测序技术,建立一种快速、简单地确定SARS病毒株并筛查SARS病毒突变位点和突变频率的方法.从感染人SARS病毒的Vero-6细胞中提取病毒RNA,反转录为cDNA后,PCR扩增目...
【关键词】 焦磷酸测序技术； 严重急性呼吸综合征(SARS)； 核酸多态性；
【中文期刊】 蒋思文 熊远著 等 《遗传》 2001年23卷2期 119-122页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 选择43头大白猪，79头长白猪，66头皮特兰猪和60头清平猪作试验材料，采用焦磷酸测序技术分析猪线粒体细胞色素b(CytB)基因单倍型。研究结果显示CytB基因可分为4种单倍型E1，E2，A1和A2。清平猪仅存在于A1单倍型(100%)，大...
【中文期刊】 朱婷 曾丹宁 等 《微生物与感染》 2019年14卷2期 89-98页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 为探索母婴皮肤细菌群落特征,本研究对8对母婴7个不同皮肤部位的细菌群落进行焦磷酸测序分析.结果显示,皮肤细菌主要属于放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌...
【中文期刊】 陈慧娟 曾飞跃 等 《口腔医学》 2019年39卷6期 505-509页 ISTICCA
【摘要】 目的 探究涎腺导管结石患者是否存在导管内或口腔菌群失调,探讨细菌与涎石病发生的相关性.方法 收集20例涎腺导管结石(1例腮腺结石,19例下颌下腺结石)患者的导管结石样本、导管内唾液及口腔内唾液样本作为实验组,收集20例健康志愿者导管内唾液及...
【中文期刊】 张婕妤 封利颖 等 《检验医学与临床》 2019年16卷20期 2948-2951页 ISTICCA
【摘要】 目的 对实验室自建焦磷酸测序法检测乙醛脱氢酶2(ALDH2)*2和亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)677基因多态性的方法进行性能评价.方法 对不同浓度(10.0、2.0、0.4、0.0 ng/μL)的杂合型DNA标本进行检测,评价方法的检...
【中文期刊】 赵玲艳 黄嘉欣 等 《食品科学》 2020年41卷20期 105-111页
【摘要】 以盐渍线椒和盐渍米椒为研究对象,采用454焦磷酸测序技术,探究盐渍辣椒细菌的群落组成及相对丰度,为盐渍辣椒优势优良菌种的筛选及发酵辣椒菌种资源库的建立提供理论支持.结果 表明,盐渍线椒已知分类的细菌可归属到8个门、15个纲、26个目、31个...
【中文期刊】 解美霞 王燕 等 《生物技术进展》 2020年10卷6期 668-673页
【摘要】 基因编辑技术发展迅速,但对应的检测方法较少.为寻找创建基因编辑作物适用的检测方法,以PL3基因编辑水稻编辑位点为靶标,有效设计了焦磷酸测序的扩增引物及测序引物,并进行有效性检测,分别利用Sequence to Analyze等程序以及SNP...
【中文期刊】 徐石勇 赵新 等 《生物技术进展》 2020年10卷6期 637-645页
【摘要】 金银花是大宗药材,市场掺伪时有发生,但目前的检测方法不能满足快速准确的检测需求,因此亟需建立快精准的检测方法.为了确立高精准度和大通量的金银花掺伪鉴别检测方法,结合SNP标记及焦磷酸测序分型分析技术,对金银花及其常见伪品差异性SNP位点进行...
【中文期刊】 徐琴 黄盛文 等 《国际检验医学杂志》 2018年39卷7期 769-772页 ISTICCA
【摘要】 目的 建立基于焦磷酸测序技术的维生素 K环氧化物还原酶复合物亚单位1(V KORC1)和细胞色素P4502C9(CYP2C9)基因分型的方法,用于检测华法林药物代谢酶相关基因多态性.方法 收集50份健康人外周血样本,提取全血基因组 DNA....
【中文期刊】 樊佳 赵二川 等 《重庆医学》 2018年47卷8期 1044-1048页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 探讨ASC与Caspase-1在原发性胆汁性肝硬化(PBC)发病过程中的影响.方法 采用实时荧光定量PCR、Western blot、焦磷酸测序及ELISA等方法分别检测30例 PBC患者及健康对照者外周血单个核细胞(PBMC)中Ca...
【中文期刊】 杨楠楠 李贵芳 等 《贵州医科大学学报》 2018年43卷3期 274-278页 ISTIC
【摘要】 目的:采用焦磷酸测序定量检测人体γ珠蛋白基因(HBG)启动子区甲基化.方法:收集30例经基因检测确诊为轻型β-地中海贫血(简称地贫)患者的全血DNA样本,查找γ珠蛋白基因的启动子区CpG位点,设计PCR扩增引物及焦磷酸测序引物;DNA样本经...
【中文期刊】 周钢 钟焱 《检验医学》 2018年33卷12期 1127-1131页 ISTICCA
【摘要】 目的 建立鼠类肉瘤病毒癌基因同源物B1(BRAF)基因V600E(T>A)突变位点的焦磷酸测序(PYRO)方法.方法 提取100例结直肠癌患者的gDNA,采用Qigene pyro24测序仪进行BRAF基因的PYRO,并通过重复性试验和Sa...
【关键词】 焦磷酸测序； 鼠类肉瘤病毒癌基因同源物B1； 结直肠癌；
【中文期刊】 张松梅 田菲 等 《口腔医学》 2018年38卷5期 389-393页 ISTICCA
【摘要】 目的 研究无牙颌患者的口腔菌群组成.方法 收集11例无牙颌患者口底/舌腹、舌背、唇颊前庭、硬腭/牙槽嵴顶、唾液中的菌斑样本,构建细菌16S rRNA基因文库,采用焦磷酸测序法对16S rRNA基因的V2-V3可变区进行序列分析,完成无牙颌患...
【中文期刊】 渠滕 田文君 等 《中国现代医学杂志》 2017年27卷21期 66-70页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨焦磷酸测序法检测丙肝分型在临床应用中的准确性和敏感性,评价其方法的优缺点.方法 收集100例丙肝患者的血浆标本,分装相同的2份,通过焦磷酸测序法和Sanger测序法分别进行丙型肝炎病毒基因分型的检测,对两种测序方法的结果进行比较....
【中文期刊】 张丽娜 郑妍 等 《临床检验杂志》 2017年35卷7期 481-485页 ISTICCA
【摘要】 目的 建立一种海洋致病性弧菌的快速诊断方法,为海洋性弧菌感染的临床检测构建新的技术平台.方法 分别针对创伤弧菌vvhA,副溶血弧菌和溶藻弧菌的toxR基因设计扩增引物和测序引物,并PCR扩增特异性DNA片段,制备单链模板,进行焦磷酸测序,得...
【中文期刊】 刘霞 朱怡文 等 《医学分子生物学杂志》 2017年14卷5期 249-254页 ISTICCA
【摘要】 目的 研究唐氏综合征中线粒体DNA突变情况.方法 采用高通量测序和焦磷酸测序检测7个唐氏综合征(Down's syndrome,DS)家系中的患儿和母亲的线粒体基因组序列,分析线粒体基因组序列的变化情况.结果 ①DS患儿中检测到36个与其母...
【中文期刊】 杨楠楠 徐琴 等 《中国医药导报》 2017年14卷29期 11-14页 ISTICCA
【摘要】 目的 建立一种基于焦磷酸测序技术的用于CYP2C19基因多态性快速检测的方法.方法 选择2016年12月～2017年3月于贵州省人民医院行健康体检者50名,提取其基因组DNA,针对CYP2C19*2 (681G＞A)、CYP2C19*3(6...
【中文期刊】 张海燕 黎青叶 等 《癌变·畸变·突变》 2017年29卷2期 81-86页 ISTICCA
【摘要】 目的:构建适用于环境化学污染物暴露相关基因甲基化的焦磷酸测序方法,应用于检测多环芳烃暴露的焦炉工人外周血细胞DNA的基因甲基化修饰.方法:采用亚硫酸氢盐修饰后测序检测多环芳烃职业暴露工人外周血中RAS相关结构域家族基因1A(RASSF1A)...
【中文期刊】 莫之婧 郑顺心 等 《山东医药》 2017年57卷9期 1-4页 ISTICCA
【摘要】 目的 选择适宜的CpG位点用于焦磷酸测序法检测肝癌衰老标记蛋白30 (SMP30)启动子甲基化.方法 提取人肝癌细胞系SMCC-7721和BEL-7404的基因组DNA,设计针对SMP30基因序列1和序列2的扩增和测序引物,焦磷酸测序法检测...
【中文期刊】 赵斐 姜焰凌 等 《昆明医科大学学报》 2017年38卷10期 27-31页 ISTICCA
【摘要】 目的 研究不同的PCR产物投入量(2.5 μL,5μL和10 μL),对焦磷酸测序通过率的影响.方法 从20例酒依赖患 者和20例健康对照全血样本中提取DNA.按各样本的DNA用量200 ng进行亚硫酸盐转化,经PCR扩增后,按PCR产物不...
【中文期刊】 李凡玲 田虎 等 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 2017年24卷6期 301-304页 ISTICCSCD
【摘要】 目的 联合基因芯片和焦磷酸测序筛查新生儿遗传性聋基因突变,为早期诊断和预防遗传性聋提供理论依据.方法 采集2000例新生儿抗凝脐带血,提取基因组DNA,采用微阵列芯片检测4个聋病基因共9个突变位点,对基因芯片检测的阳性结果 进行焦磷酸测序验...
【中文期刊】 赵焕英 方霄 等 《实验技术与管理》 2019年36卷10期 73-76页
【摘要】 采用免疫组化法、直接测序法、焦磷酸测序法分别对弥漫性脑胶质瘤患者异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)第132位精氨酸的突变进行检测.结果表明:3种方法对高频突变的检出一致性为90.62％,免疫组化只能检测出R132H突变类型,而两种测序方法都能检测...
【中文期刊】 刘咪 朱静 等 《野生动物学报》 2019年40卷4期 873-881页
【摘要】 通过采集健康成年雪豹的新鲜粪便样品,借助高通量焦磷酸测序技术对雪豹肠道微生物多样性进行研究,并进行个体间差异的比较,为雪豹的救护饲养和营养生态学研究提供资料.研究结果表明,雪豹粪便微生物共包括9个细菌门,18个纲,31个目,64个科,82个...
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