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【中文期刊】 余萌 王似锦 等 《中国药事》 2022年36卷7期 758-771页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨适用于药品微生物控制中的洋葱伯克霍尔德菌群(Bcc)的鉴定策略.方法:结合药品微生物控制中对Bcc的鉴定和分型需求,对目前应用较为广泛的微生物鉴定技术的特点和鉴定或分型能力进行阐述和讨论,提供满足不同鉴定水平要求的鉴定策略.结果:...
【中文期刊】 苏佳 何锴 等 《北京大学学报(自然科学版)》 2022年58卷2期 326-336页
【摘要】 以生活在同一生境,但具有不同进化关系和不同食性的野生哺乳类动物(鼠科、猬科和鼩鼱科)为研究对象,通过16S rRNA基因扩增子测序,分析和比较其肠道菌群.共识别出5378个操作分类单位(OTUs),主要隶属 Firmicutes(40.55...
【关键词】 野生小型哺乳动物; 肠道菌群; 16S rRNA基因扩增子测序;
【中文期刊】 李娟 郝婷婷 等 《动物医学进展》 2022年43卷6期 86-90页
【摘要】 畜禽呼吸系统疾病发病率和病死率较高,临床诊断难度大,给养殖业带来巨大经济损失.微生物群组在呼吸道疾病发生和发展中起重要作用,环境因子、抗生素、肠道微生物等因素均可导致动物呼吸道微生物多样性发生改变.16 S rRNA基因测序技术有灵敏度高和...
【中文期刊】 朱文根 李星浩 等 《水生生物学报》 2019年43卷1期 109-116页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为揭示草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道菌群的影响,在通过人工浸泡方式感染GCRV后,采用针对16S rRNA基因的高通量测序技术对草鱼肠道菌群的...
【关键词】 草鱼呼肠孤病毒; 肠道菌群; 16S rRNA基因;
【中文期刊】 王晶 黄丽英 等 《重庆医学》 2021年50卷24期 4218-4222页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 通过16 S rRNA测序,分析不同喂养方式对食物过敏婴幼儿肠道微生态的影响.方法 应用Illumina高通量测序技术检测食物过敏婴幼儿(n=44)及健康婴幼儿(n=12)的粪便中微生物16S rRNA-V3区,分析不同喂养方式的食物...
【中文期刊】 刘驰 李家宝 等 《生态学报》 2015年35卷9期 2769-2788页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中.近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,...
【关键词】 16S rRNA基因; 微生物群落; 多样性;
【中文期刊】 叶乃芳 凌华志 等 《安徽医科大学学报》 2015年7期 1000-1003页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:应用16S rRNA序列分析技术鉴定临床少见或疑难细菌,提高细菌鉴定的准确性。方法收集临床少见或疑难细菌44株,提取DNA,采用通用引物进行PCR扩增及目的片段基因测序,并将测序结果在核酸数据库中比对分析以确定菌种。结果44株临床少见...
【关键词】 16S rRNA基因; 序列分析; 细菌;
【中文期刊】 宋伦圭 《介入放射学杂志》 2014年23卷10期 906-912页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的:评价16S核糖体RNA (rRNA)基因测序在肝脓疡中细菌鉴定中的应用价值。方法2012年1月-2013年12月间共20例肝脓疡行经皮置管引流的患者,分别行脓液培养,血培养和16S rRNA基因测序。利用454 GS Junior S...
【中文期刊】 杜爽 张文飞 等 《基因组学与应用生物学》 2013年6期 700-706页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 脊椎动物肠道内定植了大量的微生物群落,在正常肠道菌群中,拟杆菌菌群和厚壁杆菌菌群作为优势菌群存在,对宿主的生理健康起着重要的作用。为了更好地了解外来入侵物种红耳龟的肠道拟杆菌和厚壁杆菌菌群多样性组成,本研究提取3只成体红耳龟粪便的宏基因组D...
【中文期刊】 胡子有 韩慧 等 《南方医科大学学报》 2013年33卷7期 1053-1056页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定.方法 根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断...
【中文期刊】 石林波 张小燕 等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷7期 671-675页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨福建华溪蟹(Sinopotamonfukienense)的遗传多样性.方法 采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16S rRNA基因序列的组成.经比对获得639 bp长度的COI基因序列和52...
【关键词】 福建华溪蟹; COI基因序列; 16S rRNA基因序列;
【中文期刊】 石林波 汪雁 等 《中国人兽共患病学报》 2012年28卷3期 213-216,222页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨Sinopotamon.fukienense与S.xiusuiense 间的的遗传分化.方法 采用PCR结合DNA测序技术,测定两种华溪蟹S.fukienense 与 S.xiusuiense 线粒体16S rRNA基因序列的组成...
【关键词】 华溪蟹; 16S rRNA基因; 遗传分化;
【中文期刊】 赵志祥 罗坤 等 《生态学报》 2010年30卷14期 3849-3857页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 土壤细菌在温室土壤环境中具有十分重要的生态功能,与温室作物以及微生物内部存在互作关系.研究土壤细菌的群落结构组成,有助于了解土地利用变化与生态环境效应之间的关系.结合 16S rRNA基因克隆文库和宏基因组末端测序对温室黄瓜根围土壤细菌的多...
【关键词】 土壤细菌多样性; 末端测序; 16S rRNA基因克隆文库;
【中文期刊】 尚世强 董关萍 等 《中华儿科杂志》 2003年41卷9期 692-696页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的应用聚合酶链反应(PCR)、限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)及测序技术,建立检测不同属种细菌的 16S-23SrRNA基因区间的特异图谱.方法对临床上常见的细菌进行PCR扩增、RFLP、分子克隆及序列分析,同时对临床标本进行培...
【关键词】 RNA,核糖体,16S; RNA,核糖体,23 S; 基因,rRNA;
【中文期刊】 黎玉莲 周少璐 等 《工业微生物》 2019年49卷5期 40-49页 ISTICCA
【摘要】 微生物对水性涂料产品的稳定性起着重要作用,本实验以广东省某涂料厂的水性涂料为研究对象,利用16S rRNA基因高通量测序技术检测其微生物群落结构及多样性.结果 表明5个水性涂料样本在97%的相似水平下共获得有效序列总数224 801,涵盖了...
【中文期刊】 吴琼 王思珍 等 《中国畜牧兽医》 2019年46卷5期 1370-1378页
【摘要】 为系统探讨中国西门塔尔牛瘤胃内的微生物多样性及其功能,本试验利用16S rRNA基因高通量测序技术检测分析西门塔尔牛(20月龄,平均体重约为550 kg)瘤胃液样本菌群结构并进行PICRUSt功能预测.结果 显示,两组样本通过Illumin...
【中文期刊】 毕玉晶 杨瑞馥 《中华炎性肠病杂志(中英文)》 2019年3卷3期 189-193页
【摘要】 肠道微生物群是定居在宿主消化道内的肠道微生物的总称.研究表明,许多疾病都与肠道菌群的改变密切相关.在复杂生态系统中使用高通量测序技术,即16S rRNA测序及元基因组测序,极大地丰富了肠道微生物组数据库,也鉴定出了很多细菌新种,促进了肠道微...
【中文期刊】 张群英 王黎 等 《浙江临床医学》 2016年18卷3期 420-422页 ISTIC
【摘要】 目的 应用细菌基因测序技术了解阴道内微生物种群的分布情况.方法 采集10例产褥期妇女阴道分泌物(pH值、清洁度、脓球、滴虫、霉菌等)测定雌激素,提取微生物总基因组,扩增16S rRNA测序.另选择正常育龄妇女为对照,比较两组结果了解产褥期阴...
【中文期刊】 周晨 张绍武 等 《北京生物医学工程》 2014年33卷6期 591-597页 ISTIC
【摘要】 目的 随着高通量测序技术的发展,产生了大量的微生物16S rRNA基因序列数据.对该数据进行精确的微生物操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)划分,有助于了解环境中微生物的种群组成及分布.方法 本文在真...
【关键词】 聚类; 操作分类单元; 16S rRNA基因;
【中文期刊】 王敏 姜叶灵 等 《检验医学》 2009年24卷3期 165-168页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过采用聚合酶链反应(PCR)技术对慢性前列腺炎患者前列腺液中细菌16S rRNA基因检测,探讨PCR方法诊断慢性前列腺炎细菌学病因的价值.方法 收集102例慢性前列腺炎患者的前列腺液进行细菌培养,同时采用PCR法检测前列腺液中细菌1...
【中文期刊】 田慧敏 李洪涛 等 《动物分类学报》 2008年33卷2期 294-300页 ISTICCSCDBP
【摘要】 利用DNA 测序技术对台湾海峡部分鱼类绦虫的16S rRNA和18S rRNA基因片段序列进行了分析.使用PAUP4.01b10软件构建的进化树显示,目前关于绦虫二叶目、锥吻目、假叶目、盘头目和四叶目的划分是比较合理的,绦虫进化基本遵循了头...
【中文期刊】 王国戗 罗予 《临床检验杂志》 2007年25卷3期 170-171页 ISTICCA
【摘要】 目的 用聚合酶链反应(PCR)技术鉴定拟杆菌.方法 以该属细菌的标准16S Rrna基因序列为靶基因设计通用引物,对该属标准菌株及不同来源的临床株进行PCR扩增,然后对扩增产物进行基因测序验证引物的特异性和敏感性.结果 设计的引物能扩增13...
【关键词】 拟杆菌; 16S rRNA; 聚合酶链反应技术(PCR);
【中文期刊】 任艳 李秀钧 等 《中华医学遗传学杂志》 2003年20卷3期 181-185页 MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的探索与糖尿病发病相关的线粒体基因突变位点.方法采用PCR、DNA直接测序技术对28个临床疑似线粒体基因突变糖尿病家系(mitochondrial diabetes mellitus, MDM)进行线粒体基因突变高发区域(tRNALeu(...
【关键词】 线粒体基因; 糖尿病家系; tRNALeu(UUR)基因;
【中文期刊】 姚雪 裴广倩 等 《中国人民公安大学学报(自然科学版)》 2016年1期 11-14页
【摘要】 随着接触DNA技术的迅猛发展,在刑事案件侦查过程中,从犯罪现场作案人接触的客体上,能够提取并检测出DNA,但是成功率较低。原因是人手接触物品而遗留在客体上的DNA含量多为痕量,使得该技术的应用存在诸多方面的困难。高通量测序技术的兴起,揭示了...
【关键词】 皮肤宏基因组; 16S rRNA基因; 群落结构分析;
【中文期刊】 陈伟 程咏梅 等 《计算机科学》 2014年41卷2期 261-263,284页
【摘要】 随着环境基因组学及深度测序技术的发展,基于16S rRNA基因序列研究微生物种群结构取得了长足进展.然而,由于环境样本的复杂性,尤其缺少真实背景信息,定量研究环境微生物种群结构仍是当前的研究难点.测序算法仿真平台研究,不仅有助于定量、定性分...
【关键词】 16S rRNA基因; 模拟测序算法; PCR误差模型;
【中文期刊】 李瑞芳 赵玉峰 等 《广东农业科学》 2011年38卷3期 121-122,125页
【摘要】 从河南黄河稻区土壤中分离出一株具有较强稻瘟病菌拮抗活性的芽孢杆菌菌株BS501,经过形态观察、生理生化特性检测和电镜技术,确定其为芽孢杆菌属细菌,为进一步确定其分类学地位,扩增了 BS501基因组的16S rDNA.并将测序结果提交GenB...
【中文期刊】 张春杨 彭振兴 《生态环境》 2008年17卷1期 109-112页
【摘要】 该文研究降解多环芳烃类环境污染物的微生物资源、降解活性和分子系统特征.利用萘-无机盐选择性培养基分离萘降解菌,用培养技术和气相色谱法检测菌株对底物的利用和降解情况,用分子克隆技术获得菌株的16S rRNA基因并测序,用DNAMAN软件对菌株...
【中文期刊】 梁君荣 王军 等 《厦门大学学报(自然科学版)》 2006年45卷z1期 207-210页
【摘要】 应用PCR技术扩增了我国南方重要养殖石鲈科鱼类斜带髭鲷(Hapalogenys nitens)和花尾胡椒鲷(Plectorhinchus cinctus)线粒体DNA(mtDNA)的16S rRNA基因片段,纯化后分别进行EcoRⅠ、Mse...
【中文期刊】 魏霞 王星星 等 《中草药》 2024年55卷4期 1110-1123页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究一贯煎多糖(YGJP-W)的基本结构特征以及其改善四氯化碳(CC14)诱导小鼠肝纤维化的活性,分析YGJP-W抗肝纤维化活性与其调节肠道菌群结构变化关系.方法 采用水提醇沉和弱阴离子交换色谱制备一贯煎多糖组分YGJP-W,依次采用...
【中文期刊】 尹霄 毛旭华 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷11期 1276-1282,1294页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用16SrRNA基因测序分析褥疮患者皮肤菌群的特征,为褥疮的预防与治疗提供新的思路.方法 选取江苏大学附属宜兴医院的18例住院褥疮患者为褥疮组,同时选取20例无褥疮病史的健康志愿者为健康对照组.采集两组人群的皮肤样本,并使用16Sr...
【中文期刊】 刘婷婷 刘丕弘 等 《中国病原生物学杂志》 2024年19卷11期 1260-1265页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 本研究旨在探讨心力衰竭(HF)患者肠道微生物组的变化特征,并分析这些变化与患者临床预后的关联.方法 前瞻性队列研究,纳入了 155名确诊为心力衰竭的患者.通过16SrRNA基因测序技术分析肠道微生物组的多样性和组成,并应用统计学方法评...
【关键词】 心力衰竭; 肠道微生物组; 16SrRNA基因测序;
【中文期刊】 曹少锋 范青杰 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷4期 408-413页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究母鼠妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)对其肠道微生态的影响,从微生物角度对GDM的早期预防与早期治疗提供参考.方法 利用高脂饮食联合腹腔注射链脲佐菌素构建GDM模型,采用16S rR...
【中文期刊】 蒋天慧 贾伟彬 等 《微生物学通报》 2024年51卷8期 2870-2887页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]随着水产养殖集约化程度的不断提高,养殖水体环境中氮素污染及富营养化问题日益加剧,严重抑制自养型氨氧化菌的功能活性,因此深入解析产碱杆菌这类潜在的异养型氨氧化功能微生物在水产养殖系统中的分布特点及其氨氧化功能特性对于解决氮素污染问题具...
【中文期刊】 杜志凌 李文娇 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷11期 1295-1302页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过16SrRNA基因测序技术对食管鳞癌患者和健康人群的肠道微生物群进行分析,为该类患者的治疗提供参考.方法 按照纳入、排除标准收集2023年7月至2023年12月河南省肿瘤医院收治的42名食管鳞癌患者(EC组)和33名性别、年龄匹配...
【中文期刊】 曾圣鑫 陈志坤 等 《微生物学报》 2024年64卷9期 3224-3237页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]本研究通过测定健康猫和子宫蓄脓猫子宫菌群的变化,旨在揭示子宫蓄脓猫的子宫菌群的变化,并探究引起子宫蓄脓的主要病原菌.[方法]采用全长16S rRNA基因测序技术测定健康猫和子宫蓄脓猫子宫微生物组,分析子宫菌群组成及其差异.使用鉴别培...
【中文期刊】 于官正 李鸿 等 《中国微生态学杂志》 2024年36卷12期 1406-1416页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 基于UPLC-QE-MS和16SrRNA基因测序技术分析溃疡性结肠炎(UC)小鼠肠道菌群及内源性代谢物之间的联动系统,挖掘关键生物标志物,探讨UC治疗的潜在靶点.方法 将雄性C57小鼠(体重18~22g,8周龄)随机分为正常组与模型组...
【中文期刊】 何盼 张超 等 《微生物学通报》 2023年50卷3期 1010-1022页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]甲烷厌氧氧化(anaerobic oxidation of methane,AOM)包含反硝化型甲烷厌氧氧化和硫酸盐还原型甲烷厌氧氧化.目前,人们向水体中排放过量的含氮及含硫污染物,引起了严重的环境污染和生态破坏.[目的]利用甲烷厌...
【关键词】 双阳极室微生物燃料电池; 甲烷厌氧氧化; 脱氮除硫;
【中文期刊】 梁海慧 张扬 等 《微生物学通报》 2023年50卷11期 5045-5057页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]近些年,16S rRNA基因测序与宏基因组分析常用于肠道微生物病原体检测.[目的]为了使检测不受限于高成本与耗时长的问题,基于荧光探针的实时荧光定量 PCR(real-time fluorescence quantitative P...
【中文期刊】 刘雅倩 周英 等 《中国微生态学杂志》 2023年35卷8期 936-942,949页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究绝经综合征患者的肠道菌群特征,为该类患者的治疗提供参考.方法 选取77例绝经综合征患者为病例组(P组),24例绝经前后健康女性为健康对照组(H组),采用16SrRNA基因测序技术检测两组对象肠道菌群结构,计算临床参数与肠道菌群的S...
【关键词】 绝经综合征; 肠道菌群; 16SrRNA基因测序;
【中文期刊】 陈煜阳 金嘉伟 等 《中国微生态学杂志》 2023年35卷12期 1410-1417页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 观察缺血性卒中后不同中医证候类型患者肠道菌群的组成与结构,寻找不同证候类型与肠道菌群之间的关系,并初步探索各中医证候类型可能存在的特征菌属.方法 本研究共纳入首发急性缺血性卒中患者17名,并基于缺血性中风证候要素诊断量表与中风病中医诊...
【中文期刊】 张良志 唐显江 等 《兽类学报》 2022年42卷5期 519-530页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 群落生态构建过程是近年来微生物群落生态学的研究热点.室内饲养可引起肠道菌群的剧烈变化,这种改变是否会影响群落的构建过程,一直未见报道.本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,采用16S rRNA测序技术,探讨室内饲养和...
【关键词】 肠道微生物; 高原鼠兔; 16S rRNA基因;
【中文期刊】 崔媛媛 王淼 等 《微生物学通报》 2022年49卷12期 5194-5205页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]肺部菌群与宿主健康和呼吸道疾病密切相关,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia,CRKP)是临床常见的条件致病菌,感染后对肺部菌群的影响尚不清楚.[目的]探究耐碳...
【关键词】 肺部菌群; 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌; 16S rRNA基因;
【中文期刊】 赵枫 史亚 等 《微生物学通报》 2022年49卷7期 2527-2537页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [背景]16S rRNA基因扩增子测序技术是一种不依赖培养而获得样本中细菌种群结构、相对丰度等信息的方法.高通量测序技术实验步骤较多,每一步骤细微的差别都可能在最终的测序结果中放大,并造成测序结果与实际情况的偏差.[目的]基于MiSeq测序...
【关键词】 16S rRNA基因; 反应条件; 靶向测序;
【中文期刊】 李亚梅 余茜 等 《四川大学学报(医学版)》 2022年53卷5期 857-865页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 观察卒中后1个月内认知下降患者肠道菌群构成改变,并探讨差异菌类与认知功能等临床指标的相关性.方法 采用横断面研究设计,分别选取卒中伴认知障碍(PSCI组)、卒中不伴认知障碍(Non-PSCI组)和对照者(NC组)各12例.收集各组人群...
【中文期刊】 许亚昆 马越 等 《生物多样性》 2019年27卷5期 534-542页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 微生物在人类生活中无处不在,过去人们对微生物的认识仅停留在单菌培养和定性研究上,而测序技术的发展极大地促进了微生物组学的研究.越来越多的证据表明:人体共生微生物、特别是肠道微生物与人类健康息息相关.二代测序技术凭借其高通量、高准确率和低成本...
【关键词】 微生物; 三代测序; 16S/18S rRNA;
【中文期刊】 王倩 胡欢 等 《微生物学通报》 2019年46卷11期 3084-3090页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 种植体周围炎是发生在骨性结合种植体周围组织的炎症,是由微生物引发的感染性疾病,可引起种植体周围支持组织丧失而导致种植失败.阐明种植体周围炎生物膜的微生物学基础,可为制定相应防治策略提供理论依据.随着测序技术的发展,基于16S rRNA基因的...
【中文期刊】 李岷 吴信华 等 《中国微生态学杂志》 2019年31卷9期 993-999,1004页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨不同浓度抗生素对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响,并预测相关功能变化.方法 15只SPF级ICR小鼠随机分为正常组、低浓度抗生素组和高浓度抗生素组,连续灌胃5d后,采集小鼠新鲜粪便样本.利用Illumina MiSeq测序平台,对细...
【中文期刊】 胡鹏威 刘楚云 等 《现代预防医学》 2019年46卷11期 2028-2031,2101页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 将16S rRNA基因测序分析技术应用于食品安全风险监测中非目标(相似、少见或非典型)致病菌的鉴定,为食源性疾病防控提供更多病原学证据.方法 采集18份畜类、18份禽类和9份鱼类共45份生鲜样品,目标致病菌按照GB4789标准检测,非...