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【中文期刊】 袁琳慧 张立军 等 《国际眼科杂志》 2023年23卷8期 1343-1351页 ISTICCA
【摘要】 目的:通过生物信息学的方法探究糖尿病视网膜病变(DR)中免疫相关的关键基因以及免疫细胞的浸润情况.方法:2022-09/10从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用"limma"R包获得差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG通...
【中文期刊】 朱海燕 张春江 等 《成都中医药大学学报》 2023年46卷5期 28-33,42页 ISTIC
【摘要】 目的:探索脑瘫印记基因表达差异,进行差异基因验证,明晰印记基因与脑瘫的因果关系,为脑瘫的早期生物学诊断提供候选靶标.方法:提取正常-脑瘫双生对mRNA,行全基因组表达谱芯片检测,筛选其中的差异印记基因,随机采集同龄脑瘫患儿、发育落后儿、正常...
【中文期刊】 郑超越 张升校 等 《实用临床医药杂志》 2023年27卷15期 86-92页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨皮肌炎(DM)可能的发病机制、潜在治疗靶点及药物.方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载符合筛选标准的健康人群和DM患者的芯片信息.利用R语言相关软件包筛选差异表达基因(DEGs);分析DEGs的基因本体(GO)功能富集和京都基...
【中文期刊】 朱文娟 周菲 等 《山西医科大学学报》 2023年54卷12期 1600-1610页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学方法筛选和分析肠易激综合征的差异表达基因,为该疾病的发生发展提供可能的靶点,并在小胶质细胞中进行验证.方法 从GEO数据库下载GSE36701和GSE166869的基因表达芯片数据,分为肠易激综合征(ir-ritable...
【中文期刊】 张凤 覃颖 等 《广西医科大学学报》 2023年40卷5期 843-849页 ISTICCA
【摘要】 目的:探究铁死亡关键基因在不明原因复发性流产(URSA)发生发展中的作用,初步确定潜在生物标志物.方法:从基因表达综合(GEO)数据库下载数据集GSE26787,利用GEO2R筛选差异表达基因(DEGs);从FerrDbV2数据库下载铁死亡...
【中文期刊】 万喻婷 王治 等 《医学研究杂志》 2023年52卷9期 134-139页 ISTIC
【摘要】 目的 利用生物信息学技术筛选子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及潜在的治疗药物,为诊断和治疗 EC提供理论依据.方法 筛选了...
【中文期刊】 董媛 李佳璐 等 《武警医学》 2023年34卷9期 771-780页 ISTICCA
【摘要】 目的 探究跨膜和螺旋结构域1(TMCO1)在泛癌中的表达水平及与其预后、免疫浸润的关系.方法 使用GE-PIA数据库、TIMER2.0 数据库分析泛癌 TMCO1 基因表达量,使用 GEPIA、UCSC数据库分析 TMCO1 与预后指标相关...
【关键词】 跨膜和螺旋结构域1基因; 泛癌; 表达差异;
【中文期刊】 蒋向辉 徐玉平 《华中师范大学学报(自然科学版)》 2023年57卷4期 561-575页
【摘要】 该研究利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨茯苓抗食管癌的潜在作用靶点,为食管癌的临床诊治开创新思路.首先在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库中筛选出茯苓的有效活性成分及对应靶点,运用Cytoscape软件中鉴定候选药...
【关键词】 加权基因共表达网络分析; 差异表达; 食管癌;
【中文期刊】 蒋盛强 胡靖 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷11期 4724-4734页
【摘要】 通过对甲型H1N1流感病毒感染A549细胞前后表达的环状RNA进行鉴定,筛选病毒感染引起的差异表达环状RNA,为进一步研究环状RNA在流感病毒感染过程中的调控作用奠定基础.本研究从病毒感染和PBS处理的A549细胞中提取RNA,构建测序文库...
【中文期刊】 王丽 赵子龙 等 《食品与发酵工业》 2023年49卷16期 41-48页
【摘要】 酶是天然存在的高效催化剂,长期的进化过程产生了诸多的同源酶,同源酶的序列相似高却有不同的功能,而导致功能差异的原因也倍受关注.类胡萝卜素合成过程中,番茄红素 β-环化酶(lycopene β-cyclase,LCYB)和新黄质合酶(neox...
【中文期刊】 Su-Ping Niu Ya-Jun Zhang 等 《中国神经再生研究(英文版)》 2021年16卷5期 865-870页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Complex pathological changes occur during the development of spinal cord injury (SCI), and determining the underlying mo...
【关键词】 bioinformatics; differential expression; factor;
【中文期刊】 石登红 王继玥 等 《热带亚热带植物学报》 2020年28卷4期 317-328页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱.结果表明,共获得了197362个转录本,总长度和平均长度分别为114072125和577 bp.使用BlastX和Bl...
【中文期刊】 《中国神经再生研究(英文版)》 2013年31期 2932-2941页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Hypobaric hypoxia can cause severe brain damage and mitochondrial dysfunction, and is involved in hypoxic brain injury. ...
【中文期刊】 《中华医学杂志(英文版)》 2013年1期 108-113页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Background Brain hypoplasia and mental retardation in Down syndrome (DS) can be attributed to a severe and selective dis...
【关键词】 Down syndrome; microRNA; differential expression;
【中文期刊】 王佳宇 于功昌 等 《中华劳动卫生职业病杂志》 2019年37卷1期 7-12页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 筛选早期矽肺大鼠肺组织中微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱的变化,为差异miRNA的功能分析提供信息.方法 将SPF级Wistar雄性大鼠随机分为阴性对照组和二氧化硅(SiO2)染尘组,每组30只.染尘组采用一次性非暴露...
【中文期刊】 欧阳任辉 李想 等 《中华地方病学杂志》 2019年38卷10期 787-792页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 研究14-3-3基因在猪带绦虫不同发育阶段的表达差异情况,为探讨猪带绦虫14-3-3(Ts14-3-3)基因的生长发育调控机制奠定基础.方法 自四川省甘孜藏族自治州雅江县绦虫病流行区的猪带绦虫病患者体内采集成虫虫体,经镜下形态学观察和...
【中文期刊】 王佳宇 耿晓 等 《中华劳动卫生职业病杂志》 2019年37卷2期 110-115页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过检测染矽尘大鼠肺组织和A549细胞中微RNA-29b-3p (miRNA-29b-3p)和微RNA-34c-3p(miRNA-34c-3p)的表达水平,探讨miRNA-29b-3p和miRNA-34c-3p在肺纤维化进程中的作用....
【中文期刊】 韩昌旭 侯彬彬 等 《中华皮肤科杂志》 2019年52卷3期 176-181页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 比较并分析申克孢子丝菌菌丝相及早期酵母相转录组学的差异,明确酵母相形成过程中转录组表达谱的变化.方法 对25℃沙氏培养基培养96 h获得的菌丝相申克孢子丝菌及37℃脑心浸液培养基培养36 h获得的早期酵母相申克孢子丝菌的转录组进行测序...
【中文期刊】 赵玲 谭树芬 等 《中华内分泌代谢杂志》 2019年35卷1期 58-66页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 建立2型糖尿病合并脑缺血树鼩模型,探讨在代谢异常及脑缺血条件下,缺血后适应(postconditioning,PC)对树鼩脑皮层基因表达的调控机制.方法 将70只健康成年树鼩分为对照组、2型糖尿病(T2DM)组、脑缺血(IS)组、T2...
【中文期刊】 《中国神经再生研究(英文版)》 2012年07卷5期 369-375页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The present study utilized samples from bilateral motor branches of the femoral nerve, as well as saphenous nerves, vent...
【关键词】 differential protein expression; mass spectrometry; motor nerve;
【中文期刊】 《中国神经再生研究(英文版)》 2010年5卷5期 383-389页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 BACKGROUND: The Glasgow Coma Scale, computer tomography, and nuclear magnetic resonance imaging have been frequently use...
【关键词】 differential protein expression; astrocyte; fluid percussion injury;
【中文期刊】 《中国癌症研究(英文版)》 2008年20卷3期 164-170页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Objective:To establish and optimize the two-dimensional gel electrophoresis(2-DE)maps of squamous carcinoma of the cervi...
【关键词】 Two-dimensional gel electrophoresis; Cervical cancer; Proteome;
【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志(英文版)》 2007年13卷3期 341-348页 SCIMEDLINEISTIC
【摘要】 AIM: To identify tumor associated genes of rectal cancer and to probe the application possibility of gene expression pro...
【关键词】 Rectal cancer; Tumor associated genes; cDNA microarray;
【中文期刊】 Volodymyr Dvornyk 刘耀中 等 《遗传学报》 2007年34卷11期 974-983页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 绝经是女性一生中很重要的生理现象之一,它能增加一系列复杂免疫、神经退化、新陈代谢和心血管方面的疾病.血液单核细胞能分化成各种各样的细胞,这些细胞在组织形态发生和免疫应答方面起着很重要的作用.本研究中采用了包含大约14,500 个基因探针的A...
【中文期刊】 王新军 曹海河 等 《遗传学报》 2007年34卷2期 160-170页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 杂种优势在提高粮食作物特别是玉米的产量方面具有重要的作用.然而,杂种优势的原理却仍然是一个世界性的难题.用12个玉米自交系及其按不完全双列杂交组配的33个杂交种为材料,分4个不同发育时期取杂交种及其亲本的雌穗组织,利用差异显示技术,分析杂种...
【中文期刊】 邢朝柱 赵云雷 等 《遗传学报》 2006年33卷10期 948-956页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 采用DDRT-PCR技术,以棉花盛花期顶尖叶片cDNA为材料,对上海生物工程公司合成的专用于基因差异显示分析的3个锚定引物和全套26个随机引物进行筛选,最后选择了15个扩增差异带丰富的随机引物.采用3个锚定引物和这15个随机引物组成的45对...
【中文期刊】 《植物学报(英文版)》 2006年48卷8期 965-970页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Antarctic ice microalga can survive and thrive in cold channels or pores in the Antarctic ice layer. In order to underst...
【关键词】 Antarctic ice microalga; Chlamydomonas sp.; two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis;
【中文期刊】 《中国癌症研究(英文版)》 2006年18卷3期 203-208页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Objective: To establish and optimize the two-demensional electrophoresis maps of uterine leiomyoma and to study the diff...
【关键词】 Two-dimensional electrophoresis; Uterine leiomyoma; Proteome;
【中文期刊】 聂东宋 朱文兵 等 《遗传学报》 2005年32卷4期 337-345页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 运用"数据库消减杂交"(digital differential display )方法来筛选人类睾丸特异表达新基因,获得了有差异显示的代表新基因的克隆重叠群.挑选其中一个克隆重叠群HS.326528进行多组织RT-PCR,初步获得该重叠群...
【中文期刊】 《植物学报》 2005年47卷7期 839-848页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 To enrich differentially expressed sequence tags (ESTs) for aluminum (Al) tolerance, cDNA subtraction libraries were gen...
【关键词】 aluminum tolerance; differential gene expression; near-isogenic lines;
【中文期刊】 《浙江大学学报B(英文版)》 2005年6卷4期 280-287页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 To construct a hepatic stellate cells (HSCs) subtracted cDNA library to find differentially expressed genes in normal mi...
【关键词】 Schistosomiasis japonica; Suppression subtractive hybridization; Differential expression;
【中文期刊】 《中国癌症研究(英文版)》 2005年17卷1期 6-10页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Objective: To analyze the differentially expressed cDNA sequences related to chlorophyllin (CHL) mediated inhibition of ...
【关键词】 Chlorophyllin; Anti-benzo[a]pyrene diolepoxide; Antitransformation;
【中文期刊】 《植物学报》 2005年47卷5期 622-631页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 To explore the mode of the spatio-temporal expression of six newly discovered ginsenoside biosynthesis candidate gene tr...
【关键词】 Aspergillus niger polysaccharide; elicitor; GBR6 mRNA expression;
【中文期刊】 《中华医学杂志(英文版)》 2005年118卷10期 799-805页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Background This investigation was undertaken to obtain differentially expressed genes related to human glioma using cDNA...
【关键词】 cDNA microarray; differential expression; glioma;
【中文期刊】 李丹 卢光琇 《中华医学杂志(英文版)》 2004年117卷12期 1791-1796页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Background Evidence for the importance of genetic factors in male infertility is accumulating. This study was designed t...
【中文期刊】 田曾元 戴景瑞 《遗传学报》 2003年30卷2期 154-162页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 为探讨玉米杂种优势的分子机理,以10个玉米自交系及其组配的38个杂交种为材料,利用cDNA-AFLP技术,分析杂种与亲本在玉米雌穗小穗分化期功能叶片的基因差异表达类型与主要农艺性状的杂种表现及杂种优势的关系.研究表明:(1)杂种的基因相对于...
【中文期刊】 江元清 赵武玲 《植物学报》 2002年44卷12期 1456-1461页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 豌豆(Pisum sativum Linn.)肌动蛋白基因至少可以分为3类异型体: PEAcⅠ、PEAcⅡ和PEAcⅢ,它们的编码区序列相似性很高,而非编码区序列存在显著的差异.RT-PCR和以3′端非翻译区作探针的Southern杂交结果...
【中文期刊】 倪中福 孙其信 等 《植物学报》 2002年44卷4期 457-462页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 为探讨小麦(Triticum aestivum L.)杂种优势形成的分子机理,选用普通小麦品种(系)3338、6554和2410TD及其强优势杂种A(3338×6654)和无优势杂种B(2410TD×6554),采用mRNA差异显示技术,对...
【中文期刊】 金勇丰 朱立成 等 《植物学报》 2002年44卷10期 1182-1187页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 利用5′/3′RACE PCR技术,从桃(Prunus persica (L.) Batsch)果实中克隆了植物乙烯生物合成的关键酶--ACC合酶的全长cDNA pacs,对pacs基因进行全序列测定表明,该基因全长1 848个碱基,编码区...
【中文期刊】 汪进 黄明辉 等 《中国癌症研究(英文版)》 2002年14卷1期 5-10页 SCIMEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 Objective: A single mechanistic pathway cannot explain the genesis of drug resistance in cancer. Drug resistance in canc...
【关键词】 cDNA microarray; Differential gene expression; Multidrug resistance;
【中文期刊】 《细胞研究(英文版)》 2002年12卷2期 133-142页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 A systemic study was initiated to identify stage-specific expression genes in fish embryogenesis by using suppression su...
【关键词】 SSH; embryonic development; differential expression genes;
【中文期刊】 王婧 孙妍 等 《中国病理生理杂志》 2018年34卷1期 75-80页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选出结肠癌差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),并分析其在结肠癌组织和相应癌旁组织中的差异表达情况.方法:从lncRNAtor数据库下载结肠癌组织中差异表达的lncRNA数据(Colon adenocarci-noma:Per...
【中文期刊】 《世界胃肠病学杂志(英文版)》 2000年6卷3期 85页 SCIMEDLINEISTIC
【摘要】 AIM To describe a liver cancer = specific gene expression profile and to identify genes that showed alteredexpression be...
【关键词】 liver neoplasms/diagnosis; gene expression; differential hybridization;
【中文期刊】 邓亦麒 何兴金 等 《西北植物学报》 2018年38卷6期 1039-1047页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 叶子花(Bougainvillea spectabilis Willd .)的苞片色彩鲜艳,呈花瓣状,在景观园艺和环境美化有着广泛应用.为了进一步了解花瓣状苞片的演化机制,该研究采用RNA-seq技术分别对苞片和叶片进行测序,比较苞片和叶片...
【中文期刊】 王津晗 路倩颖 等 《中华放射医学与防护杂志》 2018年38卷2期 81-86页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨致死剂量的电离辐射对小鼠空肠组织转录组动态变化.方法 小鼠经14 Gy137Cs γ射线腹部照射后,分别于6h,3.5和5d提取各组小鼠空肠总RNA进行转录组测序.表达变化倍数在2倍以上即视为显著差异,对表达差异的基因进行IPA、...
【中文期刊】 蒋海港 王树刚 等 《植物研究》 2018年38卷3期 415-421页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 慈竹(Bambusa emeiensis)纤维素含量丰富,是较好的造纸原料,但竹茎中木质素影响着制浆生产及纸浆质量.目前,对慈竹木质素生物合成机制所知甚少,这限制了遗传调控竹木质素的研究.本文以拟南芥、水稻等植物的已知木质素基因作为查询序列...
【中文期刊】 宋敏 巩彦龙 等 《西安交通大学学报(医学版)》 2018年39卷2期 210-215页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析椎动脉型颈椎病(CSA)模型大鼠垂体组织差异基因表达谱变化,探讨垂体对CSA 的调控机制.方法 将10只SPF级雄性Wistar大鼠随机分为模型组和正常组,采用复合造模法建立CSA模型,模型成功后取垂体组织,提取总RNA,用全基因...
【关键词】 基因芯片; 垂体; 椎动脉型颈椎病(CSA);
【中文期刊】 黄幼生 解娜 等 《临床与实验病理学杂志》 2017年33卷6期 591-595页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的 探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在胃癌组织中的表达特征.方法 采用Exiqon miRNA芯片检测3对胃癌组织及其配对正常胃黏膜组织中miRNA差异表达情况,随机选取10个上调或下调差异表达的miRNA应用qPCR技术验...
【中文期刊】 刘忆南 邵蕾 等 《中华实验眼科杂志》 2017年35卷9期 778-785页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 背景 目前研究证实微小RNA(miRNA)参与大多数人类肿瘤疾病的发生和发展,其作用类似于抑癌基因或癌基因.葡萄膜黑色素瘤(UM)是成人常见的眼部恶性肿瘤,其发生和转移机制仍未完全阐明.探讨UM组织中miRNA的差异表达情况有望为UM的靶向...
【关键词】 葡萄膜黑色素瘤/病理; 微小RNA; 信号转导通路;