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            1. Mitochondrial DNA suggests at least 11 origins of parasitism in angiosperms and reveals genomic chimerism in parasitic plants. oa

            【外文期刊】 Todd J,Barkman ; Joel R,McNeal ; 等 《BMC evolutionary biology》 2007年7卷 248页 MEDLINE

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            2. Conservation and divergence of microRNAs in Populus. oa

            【外文期刊】 Abdelali,Barakat ; Phillip K,Wall ; 等 《BMC genomics》 2007年8卷 481页 SCIMEDLINEBP

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            3. Conservation and canalization of gene expression during angiosperm diversification accompany the origin and evolution of the flower. oa

            【外文期刊】 André S,Chanderbali ; Mi-Jeong,Yoo ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2010年107卷52期 22570-5页 SCIMEDLINECABP

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            4. PlantTribes: a gene and gene family resource for comparative genomics in plants. oa

            【外文期刊】 P Kerr,Wall ; Jim,Leebens-Mack ; 等 《Nucleic acids research》 2008年36卷Database issue期 D970-6页 SCIMEDLINECABP

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            5. The draft genome of the transgenic tropical fruit tree papaya (Carica papaya Linnaeus). oa

            【外文期刊】 Ray,Ming ; Shaobin,Hou ; 等 《Nature》 2008年452卷7190期 991-6页 SCIMEDLINECABP

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            6. Comparison of next generation sequencing technologies for transcriptome characterization. oa

            【外文期刊】 P Kerr,Wall ; Jim,Leebens-Mack ; 等 《BMC genomics》 2009年10卷 347页 SCIMEDLINEBP

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            7. Complete plastid genome sequences of Drimys, Liriodendron, and Piper: implications for the phylogenetic relationships of magnoliids. oa

            【外文期刊】 Zhengqiu,Cai ; Cynthia,Penaflor ; 等 《BMC evolutionary biology》 2006年6卷 77页 MEDLINE

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            8. A genome triplication associated with early diversification of the core eudicots. oa

            【外文期刊】 Yuannian,Jiao ; Jim,Leebens-Mack ; 等 《Genome biology》 2012年13卷1期 R3页 SCIMEDLINE

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            9. Local Auxin Biosynthesis Mediated by a YUCCA Flavin Monooxygenase Regulates Haustorium Development in the Parasitic Plant Phtheirospermum japonicum. oa

            【外文期刊】 Juliane K,Ishida ; Takanori,Wakatake ; 等 《The Plant cell》 2016年28卷8期 1795-814页 SCIMEDLINECABP

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            10. A physical map for the Amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure. oa

            【外文期刊】 Andrea,Zuccolo ; John E,Bowers ; 等 《Genome biology》 2011年12卷5期 R48页 SCIMEDLINE

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            11. Comparative Metabolomics of Early Development of the Parasitic Plants Phelipanche aegyptiaca and Triphysaria versicolor. oa

            【外文期刊】 Kristen,Clermont ; Yaxin,Wang ; 等 《Metabolites》 2019年9卷6期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Phelipanche aegyptiaca; Triphysaria versicolor; central carbon and nitrogen metabolism;

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            12. Characterization of the basal angiosperm Aristolochia fimbriata: a potential experimental system for genetic studies. oa

            【外文期刊】 Barbara J,Bliss ; Stefan,Wanke ; 等 《BMC plant biology》 2013年13卷 13页 SCIMEDLINEBP

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            13. Genome-wide analysis of the cyclin family in Arabidopsis and comparative phylogenetic analysis of plant cyclin-like proteins. oa

            【外文期刊】 Guanfang,Wang ; Hongzhi,Kong ; 等 《Plant physiology》 2004年135卷2期 1084-99页 SCIMEDLINECABP

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            14. The butterfly plant arms-race escalated by gene and genome duplications. oa

            【外文期刊】 Patrick P,Edger ; Hanna M,Heidel-Fischer ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2015年112卷27期 8362-6页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 chemical defenses; coevolution; diversification;

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            15. Evolution of a horizontally acquired legume gene, albumin 1, in the parasitic plant Phelipanche aegyptiaca and related species. oa

            【外文期刊】 Yeting,Zhang ; Monica,Fernandez-Aparicio ; 等 《BMC evolutionary biology》 2013年13卷 48页 MEDLINE

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            16. A combination of conserved and diverged responses underlies Theobroma cacao's defense response to Phytophthora palmivora. oa

            【外文期刊】 Noah P,Winters ; Eric K,Wafula ; 等 《BMC biology》 2024年22卷1期 38页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Cacao; Evolution; Genomics;

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            17. Transcriptomic approach to uncover dynamic events in the development of mid-season sunburn in apple fruit. oa

            【外文期刊】 Jessica M,Waite ; Elizabeth A,Kelly ; 等 《G3 (Bethesda, Md.)》 2023年13卷8期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Malus ; 3′ RNA-Seq; QuantSeq;

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            18. Comparative transcriptomics among floral organs of the basal eudicot Eschscholzia californica as reference for floral evolutionary developmental studies. oa

            【外文期刊】 Laura M,Zahn ; Xuan,Ma ; 等 《Genome biology》 2010年11卷10期 R101页 SCIMEDLINE

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            19. Mechanistic model of evolutionary rate variation en route to a nonphotosynthetic lifestyle in plants. oa

            【外文期刊】 Susann,Wicke ; Kai F,Müller ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2016年113卷32期 9045-50页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 Orobanchaceae; evolutionary rates; parasitism;

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            20. Horizontal gene transfer is more frequent with increased heterotrophy and contributes to parasite adaptation. oa

            【外文期刊】 Zhenzhen,Yang ; Yeting,Zhang ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2016年113卷45期 E7010-E7019页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 HGT; genomic transfer; parasitism;

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            21. Phylotranscriptomic Analyses of Mycoheterotrophic Monocots Show a Continuum of Convergent Evolutionary Changes in Expressed Nuclear Genes From Three Independent Nonphotosynthetic Lineages. oa

            【外文期刊】 Prakash Raj,Timilsena ; Craig F,Barrett ; 等 《Genome biology and evolution》 2023年15卷1期 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 BUSCO; mycoheterotrophy; photosynthesis;

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            22. Genomic structural variants constrain and facilitate adaptation in natural populations of Theobroma cacao, the chocolate tree. oa

            【外文期刊】 Tuomas,Hämälä ; Eric K,Wafula ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2021年118卷35期 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 cacao; de novo assembly; genetic load;

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            23. Single-copy nuclear genes place haustorial Hydnoraceae within piperales and reveal a cretaceous origin of multiple parasitic angiosperm lineages. oa

            【外文期刊】 Julia,Naumann ; Karsten,Salomo ; 等 《PloS one》 2013年8卷11期 e79204页 SCIMEDLINECABP

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            24. Risk versus reward: host dependent parasite mortality rates and phenotypes in the facultative generalist Triphysaria versicolor. oa

            【外文期刊】 Loren A,Honaas ; Sam,Jones ; 等 《BMC plant biology》 2019年19卷1期 334页 SCIMEDLINEBP

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            25. Evaluating methods for isolating total RNA and predicting the success of sequencing phylogenetically diverse plant transcriptomes. oa

            【外文期刊】 Marc T J,Johnson ; Eric J,Carpenter ; 等 《PloS one》 2012年7卷11期 e50226页 SCIMEDLINECABP

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            26. Adaptive evolution of chloroplast genome structure inferred using a parametric bootstrap approach. oa

            【外文期刊】 Liying,Cui ; Jim,Leebens-Mack ; 等 《BMC evolutionary biology》 2006年6卷 13页 MEDLINE

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            27. Extra-large G proteins have extra-large effects on agronomic traits and stress tolerance in maize and rice. oa

            【外文期刊】 Christian F,Cantos ; Claude W,dePamphilis ; 等 《Trends in plant science》 2023年28卷9期 1033-1044页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 XLG phylogeny; abiotic stress; biotic stress;

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            28. The Selaginella genome identifies genetic changes associated with the evolution of vascular plants. oa

            【外文期刊】 Jo Ann,Banks ; Tomoaki,Nishiyama ; 等 《Science (New York, N.Y.)》 2011年332卷6032期 960-3页 SCIMEDLINECABP

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            29. The Chlamydomonas reinhardtii plastid chromosome: islands of genes in a sea of repeats. oa

            【外文期刊】 Jude E,Maul ; Jason W,Lilly ; 等 《The Plant cell》 2002年14卷11期 2659-79页 SCIMEDLINECABP

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            30. Gene capture prediction and overlap estimation in EST sequencing from one or multiple libraries. oa

            【外文期刊】 Ji-Ping Z,Wang ; Bruce G,Lindsay ; 等 《BMC bioinformatics》 2005年6卷 300页 SCIMEDLINEBP

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            31. Systematics and plastid genome evolution of the cryptically photosynthetic parasitic plant genus Cuscuta (Convolvulaceae). oa

            【外文期刊】 Joel R,McNeal ; Kathiravetpilla,Arumugunathan ; 等 《BMC biology》 2007年5卷 55页 SCIMEDLINEBP

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            32. The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification. oa

            【外文期刊】 Dawn,Field ; George,Garrity ; 等 《Nature biotechnology》 2008年26卷5期 541-7页 SCIMEDLINECABP

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            33. Detecting and Characterizing the Highly Divergent Plastid Genome of the Nonphotosynthetic Parasitic Plant Hydnora visseri (Hydnoraceae). oa

            【外文期刊】 Julia,Naumann ; Joshua P,Der ; 等 《Genome biology and evolution》 2016年8卷2期 345-63页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Hydnoraceae; holoparasite; nonphotosynthetic;

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            34. De novo characterization of the gametophyte transcriptome in bracken fern, Pteridium aquilinum. oa

            【外文期刊】 Joshua P,Der ; Michael S,Barker ; 等 《BMC genomics》 2011年12卷 99页 SCIMEDLINEBP

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            35. The evolution of the SEPALLATA subfamily of MADS-box genes: a preangiosperm origin with multiple duplications throughout angiosperm history. oa

            【外文期刊】 Laura M,Zahn ; Hongzhi,Kong ; 等 《Genetics》 2005年169卷4期 2209-23页 SCIMEDLINEBP

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            36. Widespread genome duplications throughout the history of flowering plants. oa

            【外文期刊】 Liying,Cui ; P Kerr,Wall ; 等 《Genome research》 2006年16卷6期 738-49页 SCIMEDLINECABP

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            37. Multiple major increases and decreases in mitochondrial substitution rates in the plant family Geraniaceae. oa

            【外文期刊】 Christopher L,Parkinson ; Jeffrey P,Mower ; 等 《BMC evolutionary biology》 2005年5卷 73页 MEDLINE

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            38. Genome-wide identification of MST, SUT and SWEET family sugar transporters in root parasitic angiosperms and analysis of their expression during host parasitism. oa

            【外文期刊】 Vikram A,Misra ; Eric K,Wafula ; 等 《BMC plant biology》 2019年19卷1期 196页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Expression; MST; Orobanchaceae;

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            39. "Stealth dissemination" of macrophage-tumor cell fusions cultured from blood of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma. oa

            【外文期刊】 Gary A,Clawson ; Gail L,Matters ; 等 《PloS one》 2017年12卷9期 e0184451页 SCIMEDLINECABP

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            40. The Amborella genome: an evolutionary reference for plant biology. oa

            【外文期刊】 Douglas E,Soltis ; Victor A,Albert ; 等 《Genome biology》 2008年9卷3期 402页 SCIMEDLINE

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            41. Analysis of 81 genes from 64 plastid genomes resolves relationships in angiosperms and identifies genome-scale evolutionary patterns. oa

            【外文期刊】 Robert K,Jansen ; Zhengqiu,Cai ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2007年104卷49期 19369-74页 SCIMEDLINECABP

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            42. FLOWERING LOCUS T duplication coordinates reproductive and vegetative growth in perennial poplar. oa

            【外文期刊】 Chuan-Yu,Hsu ; Joshua P,Adams ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2011年108卷26期 10756-61页 SCIMEDLINECABP

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            43. Genomics of sorghum local adaptation to a parasitic plant. oa

            【外文期刊】 Emily S,Bellis ; Elizabeth A,Kelly ; 等 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 2020年117卷8期 4243-4251页 SCIMEDLINECABP

            【关键词】 environmental niche modeling; genotype–environment association analysis; species distribution modeling;

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            44. Identification of shared single copy nuclear genes in Arabidopsis, Populus, Vitis and Oryza and their phylogenetic utility across various taxonomic levels. oa

            【外文期刊】 Jill M,Duarte ; P Kerr,Wall ; 等 《BMC evolutionary biology》 2010年10卷 61页 MEDLINE

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            45. GetOrganelle: a fast and versatile toolkit for accurate de novo assembly of organelle genomes. oa

            【外文期刊】 Jian-Jun,Jin ; Wen-Bin,Yu ; 等 《Genome biology》 2020年21卷1期 241页 SCIMEDLINE

            【关键词】 Assembler; Assembly graph; Mitogenome;

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            46. Functional genomics of a generalist parasitic plant: laser microdissection of host-parasite interface reveals host-specific patterns of parasite gene expression. oa

            【外文期刊】 Loren A,Honaas ; Eric K,Wafula ; 等 《BMC plant biology》 2013年13卷 9页 SCIMEDLINEBP

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            47. Phylogenetic analysis of pectin-related gene families in Physcomitrella patens and nine other plant species yields evolutionary insights into cell walls. oa

            【外文期刊】 Thomas W,McCarthy ; Joshua P,Der ; 等 《BMC plant biology》 2014年14卷 79页 SCIMEDLINEBP

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            48. The evolution of the plastid chromosome in land plants: gene content, gene order, gene function. oa

            【外文期刊】 Susann,Wicke ; Gerald M,Schneeweiss ; 等 《Plant molecular biology》 2011年76卷3-5期 273-97页 SCIMEDLINECABP

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            49. Floral gene resources from basal angiosperms for comparative genomics research. oa

            【外文期刊】 Victor A,Albert ; Douglas E,Soltis ; 等 《BMC plant biology》 2005年5卷 5页 SCIMEDLINEBP

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            50. The TvPirin gene is necessary for haustorium development in the parasitic plant Triphysaria versicolor. oa

            【外文期刊】 Pradeepa C G,Bandaranayake ; Alexey,Tomilov ; 等 《Plant physiology》 2012年158卷2期 1046-53页 SCIMEDLINECABP

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