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            1. pVACtools: A Computational Toolkit to Identify and Visualize Cancer Neoantigens

            【外文期刊】 Hundal, Jasreet ; Kiwala, Susanna ; 等 2020年8卷3期 409-420页

            【关键词】 TUMOR-SPECIFIC NEOANTIGENS; NEURAL-NETWORKS; PREDICTION;

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            2. Comprehensive genomic analysis reveals FLT3 activation and a therapeutic strategy for a patient with relapsed adult B-lymphoblastic leukemia

            【外文期刊】 Griffith, Malachi ; Griffith, Obi L. ; 等 《Experimental Hematology: Official Publication of the International Society for Experimental Hematology》 2016年44卷7期 603-613页 SCISCIEMEDLINE

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            3. RNA-Sequencing Reveals Oligodendrocyte and Neuronal Transcripts in Microglia Relevant to Central Nervous System Disease

            【外文期刊】 Solga, Anne C. ; Pong, Winnie W. ; 等 《Glia》 2015年63卷4期 531-548页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 laser-capture microdissection; fluorescence-activated cell sorting; macrophage;

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            4. Phase 1/dose expansion trial of brentuximab vedotin and lenalidomide in relapsed or refractory diffuse large B-cell lymphoma

            【外文期刊】 Ward, Jeffrey P. ; Berrien-Elliott, Melissa M. ; 等 2022年139卷13期 1999-2010页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 FOXO1 MUTATIONS; BCL2 MUTATIONS; MULTICENTER;

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            5. A deep learning approach to automate refinement of somatic variant calling from cancer sequencing data

            【外文期刊】 Ainscough, Benjamin J. ; Barnell, Erica K. ; 等 《Nature Genetics》 2018年50卷12期 1735-1743页 SCISCIEMEDLINE

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            6. Toward a Stool mRNA-Based Assay for Detection of Colorectal Cancer Lesions Reply

            【外文期刊】 Barnell, Erica K. ; Kang, Yiming ; 等 《Gastroenterology》 2020年158卷3期 793-794页 SCISCIEMEDLINE

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            7. Recurrent somatic mutations affecting B-cell receptor signaling pathway genes in follicular lymphoma

            【外文期刊】 Krysiak, Kilannin ; Gomez, Felicia ; 等 《Blood: The Journal of the American Society of Hematology》 2017年129卷4期 473-483页 SCISCIEMEDLINE

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            8. Association Between Mutation Clearance After Induction Therapy and Outcomes in Acute Myeloid Leukemia

            【外文期刊】 Klco, Jeffery M. ; Miller, Christopher A. ; 等 《JAMA: the Journal of the American Medical Association》 2015年314卷8期 811-822页 SCISCIEMEDLINE

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            9. Error-Corrected Circulating Tumor DNA Sequencing in Non Hodgkin Lymphoma

            【外文期刊】 Riley, Meghan ; Tiska, Grace ; 等 《Modern pathology》 2017年30卷Suppl.2期 373A-373A页 SCISCIEMEDLINE

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            10. A Phase I Trial of BKM120 (Buparlisib) in Combination with Fulvestrant in Postmenopausal Women with Estrogen Receptor-Positive Metastatic Breast Cancer

            【外文期刊】 Ma, Cynthia X. ; Luo, Jingqin ; 等 《Clinical cancer research: an official journal of the American Association for Cancer Research》 2016年22卷7期 1583-1591页 SCISCIEMEDLINE

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            11. Rapid progression of adult T-cell leukemia/lymphoma as tumor-infiltrating Tregs after PD-1 blockade

            【外文期刊】 Rauch, Daniel A. ; Conlon, Kevin C. ; 等 《Blood: The Journal of the American Society of Hematology》 2019年134卷17期 1406-1414页 SCISCIEMEDLINE

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            12. DoCM: a database of curated mutations in cancer

            【外文期刊】 Ainscough, Benjamin J. ; Griffith, Malachi ; 等 《Nature methods》 2016年13卷10期 806-807页 SCISCIEMEDLINE

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            13. Accounting for proximal variants improves neoantigen prediction

            【外文期刊】 Hundal, Jasreet ; Kiwala, Susanna ; 等 《Nature Genetics》 2019年51卷1期 175-179页 SCISCIEMEDLINE

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            14. NeoPalAna: Neoadjuvant Palbociclib, a Cyclin-Dependent Kinase 4/6 Inhibitor, and Anastrozole for Clinical Stage 2 or 3 Estrogen Receptor-Positive Breast Cancer

            【外文期刊】 Ma, Cynthia X. ; Gao, Feng ; 等 《Clinical cancer research: an official journal of the American Association for Cancer Research》 2017年23卷15期 4055-4065页 SCISCIEMEDLINE

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            15. Yap1 Mediates Trametinib Resistance in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas

            【外文期刊】 Mudianto, Tenny ; Campbell, Katie M. ; 等 《Molecular human reproduction.》 2021年27卷8期 2326-2339页 SCISCIEMEDLINE

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            16. Association Between Mutation Clearance After Induction Therapy and Outcomes in Acute Myeloid Leukemia (vol 314, pg 811, 2015)

            【外文期刊】 Klco, Jeffery M. ; Miller, Christopher A. ; 等 《JAMA: the Journal of the American Medical Association》 2015年314卷8期 A811-A811页 SCISCIEMEDLINE

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            17. Standard operating procedure for somatic variant refinement of sequencing data with paired tumor and normal samples

            【外文期刊】 Barnell, Erica K. ; Ronning, Peter ; 等 《Genetics in medicine》 2019年21卷4期 972-981页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 somatic variant refinement; manual review;

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            18. Neoadjuvant and Adjuvant Pembrolizumab in Resectable Locally Advanced, Human Papillomavirus-Unrelated Head and Neck Cancer: A Multicenter, Phase II Trial

            【外文期刊】 Uppaluri, Ravindra ; Campbell, Katie M. ; 等 《Clinical cancer research: an official journal of the American Association for Cancer Research》 2020年26卷19期 5140-5152页 SCISCIEMEDLINE

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            19. Neoadjuvant and Adjuvant Pembrolizumab in Resectable Locally Advanced, Human Papillomavirus-Unrelated Head and Neck Cancer: A Multicenter, Phase II Trial. oa

            【外文期刊】 Ravindra,Uppaluri ; Katie M,Campbell ; 等 《Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research》 2020年26卷19期 5140-5152页 SCIMEDLINEBP

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            20. Immunogenomic profiling and pathological response results from a clinical trial of docetaxel and carboplatin in triple-negative breast cancer. oa

            【外文期刊】 Foluso O,Ademuyiwa ; Ina,Chen ; 等 《Breast cancer research and treatment》 2021年189卷1期 187-202页 SCIMEDLINEBP

            【关键词】 Breast cancer; Clinical trials; Combination chemotherapy;

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            21. NeoPalAna: Neoadjuvant Palbociclib, a Cyclin-Dependent Kinase 4/6 Inhibitor, and Anastrozole for Clinical Stage 2 or 3 Estrogen Receptor-Positive Breast Cancer. oa

            【外文期刊】 Cynthia X,Ma ; Feng,Gao ; 等 《Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research》 2017年23卷15期 4055-4065页 SCIMEDLINEBP

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            22. A Phase I Trial of BKM120 (Buparlisib) in Combination with Fulvestrant in Postmenopausal Women with Estrogen Receptor-Positive Metastatic Breast Cancer. oa

            【外文期刊】 Cynthia X,Ma ; Jingqin,Luo ; 等 《Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research》 2016年22卷7期 1583-91页 SCIMEDLINEBP

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            23. A Phase II Trial of Neoadjuvant MK-2206, an AKT Inhibitor, with Anastrozole in Clinical Stage II or III PIK3CA-Mutant ER-Positive and HER2-Negative Breast Cancer. oa

            【外文期刊】 Cynthia X,Ma ; Vera,Suman ; 等 《Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research》 2017年23卷22期 6823-6832页 SCIMEDLINEBP

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            24. Noninvasive Detection of High-Risk Adenomas Using Stool-Derived Eukaryotic RNA Sequences as Biomarkers

            【外文期刊】 Barnell, Erica K. ; Kang, Yiming ; 等 《Gastroenterology》 2019年157卷3期 884-887页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Precision Oncology; Early Cancer Detection; High-Risk Adenoma;

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            25. GenVisR: Genomic Visualizations in R

            【外文期刊】 Skidmore, Zachary L. ; Wagner, Alex H. ; 等 《Bioinformatics》 2016年32卷19期 3012-3014页 SCISCIEMEDLINE

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            26. Single-agent ibrutinib in relapsed or refractory follicular lymphoma: a phase 2 consortium trial

            【外文期刊】 Bartlett, Nancy L. ; Costello, Brian A. ; 等 《Blood: The Journal of the American Society of Hematology》 2018年131卷2期 182-190页 SCISCIEMEDLINE

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            27. A Phase II Trial of Neoadjuvant MK-2206, an AKT Inhibitor, with Anastrozole in Clinical Stage II or III PIK3CA-Mutant ER-Positive and HER2-Negative Breast Cancer

            【外文期刊】 Ma, Cynthia X. ; Suman, Vera ; 等 《Clinical cancer research: an official journal of the American Association for Cancer Research》 2017年23卷22期 6823-6832页 SCISCIEMEDLINE

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            28. Immunogenomic profiling and pathological response results from a clinical trial of docetaxel and carboplatin in triple-negative breast cancer

            【外文期刊】 Ademuyiwa, Foluso O. ; Chen, Ina ; 等 《Breast cancer research and treatment.》 2021年189卷1期 187-202页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Breast cancer; Clinical trials; Combination chemotherapy;

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            29. Modeling precision treatment of breast cancer (vol 14, R110, 2013)

            【外文期刊】 Daemen, Anneleen ; Griffith, Obi L. ; 等 《Genome Biology》 2015年16卷5期 MEDLINE

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            30. Mutant U2AF1 Expression Alters Hematopoiesis and Pre-mRNA Splicing In Vivo

            【外文期刊】 Shirai, Cara Lunn ; Ley, James N. ; 等 《Cancer Cell》 2015年27卷5期 631-643页 SCISCIEMEDLINE

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            31. Estimation of intrafamilial DNA contamination in family trio genome sequencing using deviation from Mendelian inheritance

            【外文期刊】 Yoon, Christopher J. ; Kim, Su Yeon ; 等 《Genome research》 2022年32卷11/12期 2134-2144页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 CHIMERISM;

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            32. Neoantigens in immunotherapy and personalized vaccines: Implications for head and neck squamous cell carcinoma

            【外文期刊】 Zolkind, Paul ; Dunn, Gavin P. ; 等 《Oral oncology》 2017年71卷 169-176页 SCISCIEMEDLINE

            【关键词】 Neoepitope; Next generation sequencing; Immunogenomics;

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            33. Interaction of Cyclin-Dependent Kinase 12/CrkRS with Cyclin K1 Is Required for the Phosphorylation of the C-Terminal Domain of RNA Polymerase II

            【外文期刊】 Cheng, S. -W. Grace ; Kuzyk, Michael A. ; 等 《Molecular and Cellular Biology》 2012年32卷22期 4691-4704页 SCISCIEMEDLINE

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            34. CIViC is a community knowledgebase for expert crowdsourcing the clinical interpretation of variants in cancer

            【外文期刊】 Griffith, Malachi ; Spies, Nicholas C. ; 等 《Nature Genetics》 2017年49卷2期 170-174页 SCISCIEMEDLINE

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            35. Error-Corrected Circulating Tumor DNA Sequencing in Non-Hodgkin Lymphoma

            【外文期刊】 Riley, Meghan ; Tiska, Grace ; 等 《Laboratory investigation》 2017年97卷Suppl.1期 373A-373A页 SCISCIEMEDLINE

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